Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 124810504
Help
Entry
124810504 CDS
T01080
Symbol
LOC124810504
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC124810504 isoform X1
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_12
TPR_1
TPR_10
TPR_2
TPR_8
TPR_7
TPR_NPHP3
TPR_16
TPR_17
CFAP70_TPR_C
TPR_6
TPR_11
TPR_MalT
TPR_19
MIT
RPN7
ARM_TT21_4th
TPR_3
ANAPC3
HEAT_Nup120
DUF294
DUF294_C
SPO22
DUF627
TPR_21
MIT_ATG38
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124810504
NCBI-ProteinID:
XP_047131441
LinkDB
All DBs
Position
01:10303119..10313563
Genome browser
AA seq
1975 aa
AA seq
DB search
MDYLKNVLEARKELQKEQRQKFDFTEYLFTEMTGSSVAENFKDDYEMINVLASNSWSSSV
IKRLKEKEFDLLYFDSFRNPISYNLTNEESLKQHLQNFTINENLSYKQIKNNSDLSLFAA
FNLHSLATTKKLANNISEHQCNILGLQQLEEFRYKPLLHQLAYKTSLKHLKKLVIVLNQI
GNLTIKLGELSGKLTHYNEAAVIYQYITTILEDKLNEKLISTEDKLEFKNKNKIDPASRL
SQIQEFIFSLIGGDKVKMPVVQDEAEINKNLLLVLRDKVETEMRNIDCFEKLSRKEEKNK
ILYVNTAKRLFKVIAEEMKTLLAKLHRDSEQQMFTRAPCKYAVMGLGSMALEQMTPYSDL
EFAILTENEDYKKDLDPMIRNYFKNLSYLVSFKIINIGESIIPTSKYGLDMSHLVHVAVN
SDLGGKVPTGRLGADKPYDLIKTIKWMIHYMRDKDDKASHIDKNLPHILENVCYVYGHKE
LVEKYQHKVKTFLKKNNTNDPKNRLNCEIRAIKLLEIGAVEIDYLQKTSGQELKTILFKG
DLDKLEPNLFDSEGKFFNVKQEIYRLTDRMVYNFCLYYGVVGGNTWDAIDALAGQGYINK
EAAINIKSALTFSNTLRLKTYAHYKAQKEDMGVFSGSISYDIKDQAINIFCLSEENIEEN
GGLFQYYYTALPLYEKIKKFCNLHKRINDFKNSKYFNDTSFYENDFANKGFINYRLARYK
EAQICLENSLNNLENKDKLYQIQNILGDIYRNFGDNDQAIKQYQNCLNLCKQISNVADSD
IIISLNKLGLSYASKGQYDQAISYFKKGVNSKEFMYKNLLPQIDADSLNNLGTAFYSKGE
YDKAIDYLKESLNIEKNIYKDLPQLSVAYILNNLGLVYDSKGVFNQAVSYYQNSLNMKKL
IFKNQPHLSICTSLNNLGLVYVALGKYSKAIKYYENCLKLLKYIFKNNELHPAIAGLLNN
LGSAYQFLGIYDQAIQYYDDSLIMSKTIYKDQTHPSIAKTINSIGTCYHSQGLFDKALIC
YRQSLLMNKIIFHDEPHPSVSNILNNIGSAFHAVGQYDRAIKYYEDSLKINKLIYADKPH
FSVASLYNNLGLAYYDKGQYDKAINFYNNSLNIKKLIYKDNHPSFAESLNNLGIAYDAKG
QHDEAKRCYEKGLSITKIIFQSEPHSSNAALFTNLGLNYFFKGLYDQAIMYYNDSLNLSK
RIHRDQPHPDIVYSLNNLGLVNTIKGNYAHALSYYNQGLNMTELIYQDHLHPEVAAFLNN
LGSIYHVNGQYNEAIHFYEESIKVKELIYHNENHPSIADSLNNIGLSYISKGLYEQALDY
FEKSLKMKKDLYREEQHPSIATSLNNLGLVYDYMAKYDQAIKYYEESLKISNLIYQKEPH
SLIASSLNSLGLLYNSVGQYDQAINHLQESLKITKYLHDDENHADIAPILNNLGLVHNSM
GLYKQAIDYFKGSIAIKKLIFSNEHHPSIADSLNNLGLAYHAVGNHNQAIEYFENSLKIF
EMIYGSKQHPSIATCLNNLGSVYDSKKNYDCASHYYKESLKIRNIIYKDPHPDVAETLNN
LGVSYFSKGEYENAVVYHENCLNLKRLIYKNLSHPSVAISLNNLGSVYSTMGQHDRVITY
FDENLTLNKTIYKNEIHPSIAASLNNLGLSYADMEQYDKAISYYVESVKIAKLIYQDEPQ
SDLADYLNNIGSAYYAKKQYNKAIIFYRDSLNMKKKIYKDEAHQSVVVTLNNLGFVYHDE
KQYNMAINCFEESLKMSKLMNQDKPNKDLADCLNNLGSIYATIKQYDQAIKYLRLSLEMK
KSLYHDDPSQNNSDSFYNIGSAYRAAGQYDQAIIYYSQALQTASVFHDNSFTLLIKDVLF
ETVFLFSEKYCLNPHNIALKIFKLASQKVNFADLYHFLTQSHNNININEQSKHHNNDLSE
HNKHNIKDASENSKYLNKNASRKGKQNIKKANEHSKYNNNDPYKHSKEENNNESE
NT seq
5928 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattacctgaaaaatgtacttgaagctaggaaggaattacaaaaagaacagagacaa
aaatttgattttacagaatatctttttactgaaatgactggcagctctgttgcagaaaac
tttaaagacgattatgaaatgattaatgtgcttgcaagtaattcttggagtagttcggta
attaagagattaaaagaaaaagaatttgatctgctatattttgattcattcagaaatccc
attagctacaatttaaccaatgaagaaagcttaaaacaacatttacaaaattttacaata
aacgaaaatttgagttataaacaaataaaaaataatagtgaccttagcttgtttgctgca
tttaatcttcattctttagcaacaacaaaaaaattagcaaataatatatcagagcatcaa
tgcaacatactaggtcttcagcaacttgaggaatttagatataaacctctgcttcatcaa
ctagcttataaaacaagtctaaagcatttaaaaaagcttgtaatcgtacttaaccaaata
ggtaatttaacaattaagcttggagaattaagcggaaaattgacacattataacgaagct
gcagtaatttatcaatatataactacaatattagaagataaactaaacgagaaactgata
agtaccgaggataaacttgagtttaaaaataaaaacaaaatagatccggcttcaagactt
tctcaaatacaagagtttatattttcgttaattggaggagataaagtaaaaatgccagtt
gttcaagatgaagcagaaataaataaaaatttattattagtgttgagagacaaagttgaa
actgaaatgcgtaatatagattgttttgaaaaactgtcaagaaaagaagaaaaaaataaa
atactttatgtaaatactgcaaaaaggttatttaaagtaattgctgaagaaatgaaaaca
cttttagcaaagttgcatagagatagtgaacaacaaatgttcactcgcgcaccttgtaaa
tatgcagtaatgggtcttggttcaatggctcttgagcaaatgacgccgtattcagactta
gaatttgccattcttacagaaaatgaagattacaaaaaagatttagatcctatgataaga
aattattttaaaaatttaagctacttagttagttttaagataatcaatattggtgaaagc
attattcctactagtaaatatggtttagatatgagccacttagttcacgtagcagttaac
tcagaccttggaggcaaagttccaacaggaagattaggagctgacaaaccatatgatctt
ataaaaacaatcaaatggatgattcattatatgcgtgataaagatgacaaagcaagtcac
attgataaaaacttaccgcatattttagagaatgtttgttatgtgtatggtcacaaagaa
cttgttgaaaaataccaacataaagtgaaaacatttttgaaaaaaaacaatacaaatgat
ccaaaaaacagattgaactgtgaaatcagagcaattaaactgttagaaataggtgcagtt
gaaattgactatcttcaaaagacttctggtcaagagttgaaaacgattttgttcaaagga
gaccttgataagttagaacctaatttatttgactctgaaggaaaattttttaatgtaaaa
caggaaatatacagattaacggatcgtatggtgtacaatttttgtctctattatggtgtt
gttgggggaaatacttgggatgcaatagatgcacttgcaggtcaaggatatataaataaa
gaagcagcaatcaatataaaaagtgcattaacattttctaatacgttgagattaaaaaca
tatgcacattataaagcccaaaaggaagatatgggcgtgttttcaggttctattagttat
gatattaaagatcaagccataaacatattttgtttatctgaagagaacattgaagaaaat
ggtggattatttcagtattattatacagctttaccattgtatgaaaaaataaaaaagttt
tgcaaccttcataaacgcataaatgatttcaagaacagtaaatactttaatgataccagc
ttttatgaaaatgattttgcaaataaaggttttataaactatcgattagcaagatacaag
gaagctcaaatctgtttagaaaactcattaaacaatttagaaaataaagataaattgtac
caaatacaaaatattttaggagacatatatagaaattttggcgataacgatcaggctatt
aaacaatatcaaaattgtttaaacttatgtaaacaaatttcaaatgttgcagactccgat
attatcatttctttaaataaactaggtttaagctatgcgtcaaaaggacaatacgatcag
gcaatcagttattttaaaaaaggggtaaatagtaaagagtttatgtataaaaatttactt
cctcagattgacgcagattctttgaataatttaggaacagcattttacagtaaaggtgaa
tatgataaagcaattgactacttaaaggaaagtcttaatatagaaaaaaatatttataaa
gatttaccacaattatctgtggcatacattctaaataatctagggttagtttatgattcc
aaaggagtttttaatcaagcagtatcatactatcagaacagtctaaacatgaaaaaatta
atattcaaaaatcaaccacatttgtccatttgtacttctttaaataaccttgggttagtt
tatgtagctttgggaaaatacagtaaagctattaaatattatgaaaattgtctaaagttg
ttaaagtatatctttaaaaataatgaacttcatccagctattgctggtttattaaataat
cttgggtcagcctatcagtttttgggaatatatgatcaagcaattcaatactatgacgat
agtttaataatgagtaaaacaatctataaggatcaaactcacccgtcaattgctaaaacc
attaatagcattgggacatgttatcattctcaaggtctgtttgataaagcattaatatgc
tatagacaaagccttttaatgaataaaattatctttcacgatgaacctcacccgtcggtt
tcaaatattttaaataatataggatcagcatttcatgctgtgggacaatatgatcgggca
attaaatactacgaggatagcttaaagataaataaattaatttatgcagataaacctcat
ttttctgtagcttctttatacaataatcttgggttagcatactatgataaaggtcaatat
gataaagcaataaatttttataataacagccttaatataaaaaaattaatctataaagac
aatcacccaagttttgctgaatctttaaataatctgggtatagcttacgatgctaaagga
caacacgatgaagcaaaacgttgctatgaaaaaggtttatcgattacaaaaatcattttt
caaagtgagcctcattcaagtaatgctgctctattcactaatcttggtttgaattacttt
tttaaaggtttatatgatcaagccattatgtactataacgacagcttaaatttaagcaaa
cgtattcaccgagatcaacctcatccagatattgtatattctttaaacaatctaggatta
gttaatacaattaaaggaaattatgctcatgcacttagttactataatcaaggtcttaat
atgactgaattgatttatcaagatcacttacacccagaagttgctgcatttttgaacaat
cttggctcaatttaccacgttaatggacaatataatgaagcgattcatttctatgaggag
agcataaaagtaaaagagcttatataccataatgaaaatcatccttctattgctgattct
ctaaataacataggtttatcatatatttccaaaggactatatgagcaggctcttgattac
tttgagaagagccttaaaatgaaaaaagacttgtacagagaagaacaacatccatctatt
gcaacatctttgaacaatttagggttagtttacgactatatggcaaagtatgatcaggca
attaaatactatgaagaaagcttaaagattagcaatctaatctatcaaaaagaacctcat
tcgttaattgcttcttctttgaatagtttaggattattgtataattctgtaggacaatat
gatcaagcaattaatcaccttcaagaaagccttaaaataacaaaatatcttcacgatgat
gaaaatcatgcagacattgctccaatattgaacaatcttggattagttcataactccatg
ggactttacaaacaggccattgattattttaagggcagtatagctataaaaaaacttatc
ttcagtaatgaacaccatccttctattgctgattcgctaaataatctaggcttagcttac
catgctgtaggaaaccataatcaggcaattgagtactttgaaaacagtctaaagatattt
gaaatgatatatggtagtaaacaacacccatcaattgcaacttgtttaaataatctagga
tcagtttatgattctaaaaaaaattacgattgtgcaagtcactactataaagagagctta
aaaataagaaatattatttataaagacccccatccagacgtagctgaaactttaaataat
cttggggtatcttatttttctaaaggagaatacgaaaatgcagttgtttatcatgaaaac
tgcttaaacttaaaaagacttatatacaaaaacctatctcatccttctgttgcaatttct
ttaaataatttagggtcagtatacagtactatgggacaacacgaccgggtaattacttat
tttgatgaaaatctaactttaaacaaaaccatctataaaaatgaaattcatccgtcgatt
gctgcttccttaaacaatcttggattatcctatgctgatatggagcaatatgataaagct
atcagctattatgttgagagtgtaaaaatagcaaaacttatctatcaagatgaaccgcaa
tctgatttggctgattatttaaataatatcggttcagcttattatgcgaaaaaacaatat
aacaaagccattattttttatagagatagcttaaatatgaaaaagaaaatctacaaagat
gaggctcatcagtccgtagttgttactttaaataatcttgggtttgtttatcatgatgaa
aagcaatataatatggcaataaactgctttgaggaaagcttaaaaatgagcaaacttatg
aaccaagataaaccaaataaagatttagctgattgtttgaataatctaggatccatttat
gctactataaaacaatatgatcaagcaattaaatatctacggttaagcttagagatgaaa
aaatctctttaccatgatgatcctagccaaaataattctgattctttttacaacattgga
tcagcttatcgtgctgcagggcaatatgatcaagcaattatatactatagccaagctttg
caaacagcttcagtttttcatgataattctttcacgcttttaattaaggatgttttattt
gaaacagtttttttattttcagaaaaatactgtttaaatccacataacatagctttaaaa
atatttaaacttgcttcgcaaaaagttaattttgcagatctttaccattttcttactcaa
tctcataataatatcaatataaacgaacagagtaaacaccataataacgacctaagtgaa
cacaataaacacaatataaaagatgcaagcgaaaacagtaaatacttaaataaaaatgca
agtagaaagggtaaacaaaatattaaaaaggcaaatgaacatagtaaatacaataacaac
gatccatacaaacacagtaaagaagaaaataacaatgaaagtgaataa
DBGET
integrated database retrieval system