Halothermothrix orenii: Hore_20170
Help
Entry
Hore_20170 CDS
T00838
Name
(GenBank) transcriptional antiterminator, BglG
KO
K03483
mannitol operon transcriptional activator
Organism
hor
Halothermothrix orenii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hor00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
hor03000
]
Hore_20170
Transcription factors [BR:
hor03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
Hore_20170
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
PTS_EIIA_2
HTH_11
Mga
HTH_DeoR
PuR_N
PTS_IIB
DUF2102
SpoIIID
MerR
HTH_Mga
TPK_catalytic
HTH_10
Put_DNA-bind_N
HTH_20
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACL70762
UniProt:
B8CZR0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2173706..2175931)
Genome browser
AA seq
741 aa
AA seq
DB search
MSLKPRVCQLLKYLIDQEKAVSIKQLADRFNVSSRTIRYDLDDIESSISSYDAKLIRKTR
IGVYLEGKEEELNKIQEELANLYGLERILSPKERQHLILFRLFQANEPIIIKELEIMLRI
SKSTIIKDLDEVENWLSKHNLILIRKTNYGLEIKGDEIDIRHAMMNVLEETANEKELVGF
LRQIQKKALEERNLEPGFFKEFDKLVSGIDLTKIESVISFAEKQLGFQFADEAYASLLVH
LALAISRLLEGKDIQLPEERLKVIKKSDEYKIAKKIGKIMEQIFDISIPDSEIGYVTLHL
MGAKLWQKIGDDDYKKLINQDLDQELIILTKEMVKVAEDYLGVKLIDDTQLIIGLALHLK
PTINRIKYDLPLKNPLLLDVKSRYGEIFKAAKRAAKILQSKLQKSISSDEIGYITLHLGA
ALERSKSSRKLRVVLVCSSGVGTTNLLSSRLSKEFSEIKICNVVSVIQLENNEVDLKNID
LIITTIPLDIDDILVLQVNPLLSQKDKKNVKAIIQSKRDIFDSTEIKEDSESITDYSFDI
EEVIEVIEQEAIVGDKDSLKKDLRDFFASKGVKVLDKIDDTADRQSIEESGKGLLELLTE
NNIAVIDKVDNWRTGVRVAAKPLVDQGHILEEYVERTIEVIEQKGAYVVISPHISLIHAR
PEDGVVKKSMGLGIIKEGVNFGHDYDPVHLIFTLAPIDEVSHLSALSELLKLINEYGFVE
KMLTVDNQHDVLIKIEEMLIK
NT seq
2226 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagtttaaaaccccgggtttgtcaattattgaaatatttaattgaccaggagaaagct
gtctctattaaacaattggctgatagatttaatgttagtagtagaacgatcaggtatgat
ctagatgatattgaatctagtatctcttcctatgatgctaaattaataagaaaaacacga
attggggtttatttagagggaaaagaagaagagttaaataagatacaagaagaattagct
aatctttatggccttgaaagaattttatctcctaaagagcgtcagcatctaattttattt
agactatttcaggctaatgaaccgattattatcaaagaattagaaataatgttacgcatc
agtaagtcaacaataattaaagatttagatgaagttgaaaactggttatcaaagcacaat
ttaattcttattagaaagaccaattatggtttagaaataaaaggtgacgagatagatatt
agacatgccatgatgaatgttttagaagaaacagcaaatgaaaaagaattagttggattt
ttacgacaaattcagaaaaaagcattggaagaaagaaatttagagccggggttttttaaa
gaatttgataaattagtatctggtattgatttgaccaagattgaaagtgtaatttctttt
gccgaaaagcaattaggatttcaatttgctgatgaagcgtatgctagtttgttagttcat
ttagctttagcaataagcagattattagaaggaaaagatattcagctacccgaggaacga
ttaaaggttattaaaaaaagtgatgaatataagatagccaagaagataggaaagatcatg
gagcaaatttttgacataagcattccagattcggagataggttatgttaccttacattta
atgggggctaaattatggcaaaagataggtgatgacgattataaaaaacttatcaaccag
gatttagaccaggagctgattattttaactaaagaaatggttaaggtagctgaagactat
ttaggggttaagttaattgatgatactcaattaataattggtctggcgttacatttaaaa
ccaactattaatcgtataaaatatgacctaccattaaaaaatcccttactgttagatgtt
aaaagcaggtacggggaaatatttaaagcagctaaaagggcagctaagatattacagagc
aagttgcaaaaatcaattagttcagatgaaattgggtatattacccttcatcttggagct
gctttagagaggagtaaatctagcagaaaattaagggtagtcttagtttgttcaagtgga
gtaggaacaactaacttgttatcttctagattaagtaaagaattttctgagatcaaaatt
tgtaatgttgtttctgttattcaattagagaataatgaagttgatttaaaaaacattgat
ttaattattacaactatcccgttagatattgatgatattttagtattacaggttaatcct
ctattaagccagaaggataagaaaaatgttaaagctattattcaaagtaagcgagatatt
tttgattccactgaaattaaagaggactctgaatctataacagattattcctttgatatt
gaagaagtaattgaggttatagagcaagaagcaattgtaggagataaagatagcctaaaa
aaagatttaagagatttttttgcttctaaaggagttaaagttttagataaaatagatgat
acagctgacaggcaaagtatagaagagagtggtaaaggactattagaattgttaactgaa
aataatatagcagtaattgataaggtagataattggagaacaggagttagagtagcagca
aagcctttagtagatcagggtcatatattagaagaatatgttgagcgaacgatagaagtc
attgaacaaaaaggtgcttacgtagtaatatcccctcatattagtttaatacatgctaga
cctgaagatggagttgtaaaaaagagtatgggattagggattataaaagagggagttaat
tttggtcatgattatgatcctgttcatttaatttttacattagctcctatagatgaagtt
tcccatctctctgctttatctgaacttttgaaattaattaatgaatatggttttgtagag
aaaatgctgacagtagataaccaacatgatgttttaattaagatagaagaaatgttaatt
aagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
