Helcococcus ovis: EQF90_000080
Help
Entry
EQF90_000080 CDS
T09706
Symbol
istA
Name
(GenBank) IS21 family transposase
Organism
hov
Helcococcus ovis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Mu-transpos_C_2
rve
HTH_11
DUF4143
GP3_package
HTH_28
NUMOD1
HTH_72
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNZ01282
LinkDB
All DBs
Position
19847..21136
Genome browser
AA seq
429 aa
AA seq
DB search
MKYSLILNNINFEIKNLEDLSTLKTIMDANNLKVNYSQLANELNVDRRTIKKYYEGYEKK
KTRNKSSKIDNFKNIIEELLDENSIQRFYSKSILYRYLKENHNLNVSESSFRRYILNNDK
FQKYFSKKKYKDGAKIRFETSPGEQAQIDWKEDMTFITSDCEIIKLNIFVFQLSYSRYRI
FHVSLDKKQDVVLDFLTRSFELIQGVPKTILSDNMKTIMDEPRTKDSDGKINNKFNQFLN
DFNISLKPCMARRPQTKGKVESSMKILEEIYAYQTKINYEQLLKLVEKINNRVNLNIHQG
TNNIPLSLLEIEKDSLMPLPNESLRNLYKISSTILKVNSSCMISYKSNQYSLPPEYKNKR
VNLIVKDNKLHIYDNTKVITVHNISKNKLNYHKSHYLEIFKNNLPSYDEKKVQILVNENL
SKIGGNYGK
NT seq
1290 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatattcattaattctaaataatataaattttgaaattaaaaatttagaagactta
tcaacattaaaaacaattatggatgcaaacaacttaaaagttaattactcacaattagct
aatgaactaaatgtggatagaagaacaataaaaaaatattacgaaggatatgaaaagaaa
aaaactagaaataaatcttcaaaaatagacaattttaagaatataatcgaagaactttta
gatgaaaattcaattcaaagattttactctaaatcaatactttacagatatttgaaagaa
aatcataacttaaatgtaagcgaatcaagttttagaagatatatattaaacaatgataaa
ttccaaaaatatttttctaagaaaaaatataaagatggtgcaaaaattagatttgaaact
tctccaggtgaacaagctcaaattgattggaaagaagatatgacctttatcactagtgat
tgtgaaataattaaattaaatatttttgtatttcaactttcatactctagatatagaatt
tttcatgtatctttagataaaaagcaagatgtggttttagactttttaacaagatctttt
gaattaatacaaggggttccaaaaacaattttatcagataatatgaaaacaattatggat
gaaccaagaactaaggattctgatggaaaaattaataataaatttaatcaattcttaaat
gattttaatataagcttaaaaccatgtatggctagaagacctcaaactaaaggcaaagtt
gaatcaagtatgaaaatacttgaagaaatttatgcttatcaaacaaaaattaattatgaa
caattattaaaattagtagaaaaaattaataatagagtaaacttaaatattcatcaaggc
acaaataatataccattaagtttgttagaaattgaaaaagattccttaatgccattacca
aatgaatcactaagaaatctttacaaaatatcttcaacaattcttaaagttaactctagt
tgtatgatttcatacaaaagtaatcaatattctctaccaccagaatataaaaataaaaga
gttaatttaatagttaaagataataaactacacatatatgataacacaaaagtaataaca
gttcacaatatttctaaaaataaattaaactatcataaaagccattatctagaaattttc
aagaataatttacctagttatgatgagaaaaaagttcaaattttagtaaatgaaaattta
agtaaaattggaggaaattatggaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system