KEGG   Helcococcus ovis: EQF90_002870
Entry
EQF90_002870      CDS       T09706                                 
Name
(GenBank) PD-(D/E)XK nuclease family protein
  KO
K16899  ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
hov  Helcococcus ovis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hov00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:hov03400]
    EQF90_002870
Enzymes [BR:hov01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     EQF90_002870
DNA repair and recombination proteins [BR:hov03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     EQF90_002870
SSDB
Motif
Pfam: ADDB_N PDDEXK_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: WNZ01797
LinkDB
Position
617805..621146
AA seq 1113 aa
MKVLLSRYINDSKKYLYNLIEQKLIEGKTIYIVVPEQFTLGTELEAYQTLNIDSTLNLRI
KSFKTIINEILHLNGGRTLNFLSDSAKFLIIQSILLEVKDELRIFQKNIYNKDFIELLLG
FMEQIISNKINIYDLKNILESDQIQNELKQKLEDIFLIFEKFQKYKLYSNYHSIDRTDVA
INSIENIEKYKNISFFFYKFNDMSKQEIEIVSKIDKISEFTLINITIDDRLLNNRKENVE
DYEVFDISMKFLNSLNKKEFNNKIEYIKPDEKKFYTKNELFLDKLFSYNLYSVNQITNKL
DNIYLTRTNNTNQEIESLALNIKKDIINEKYKYSDIAIIVTNRGEYFEKIKKVFQINEIP
YFIDESINLLRNPMIKYIKSMINMLNTNLSTASISQFLKASFLQDLDNEINIFISFISRR
KIFGKMIFEDKYFNVSENSKFYVEEDLENLNKILMIRKVLLNIIGEIYENSIIYRIRKKN
DFKYFTNEIYKIFFNETLINSYNKYEQNLNEDEKDENKLIWDNFVLLLDDIYKLISEKEI
EFEKFSDILTSAIDNFKIGIIPPSQDQIIIGDIKRSRFNSVKKIYIVGMSNLYYPILNND
IDIFLDDEKQILINSGIDLNNTSENINSNDLLSFYELLYTSSEKLHFSYSLVNSSNESMN
KASILDWVIAMMCSENYNKDELKYNDVIYSKTLINKYLPLKLLDIKNKVYISNDETIFIK
KLLEKISKYEGYQNVKNAIQLLRKDKTRKNISREVAGKIYNLNKFSISQLESFNANPYEH
FIKYGIKPREFNTYDISKLDTGNFMHEYMKYSIENLYHKKGIENDVIFNKALDITFDGYK
KEDYKNKYFINQLMRHSKSYLDIISEQIDFSSISKIFLEERYGNNAVFPAIKIKLDDGKI
VNIEGKIDRVDEYDYNGFKYFRVIDYKTGNKTFDIAKIYHGIDLQLMLYLEATVNSDKNG
KAIGAFYQKLNNEISYEIMKNNEDESKMFKDFKLEGIINNNQNLFKILDCETDVTRVNNS
KIFKFDGRAYALEKKDNAVNDEFFKNMFDHNKRNIKQTVEKIKNGDISLRPYKMNNFSPY
DYSKLKTISKDEDLRYEYLDNIDWKFVKEKLGD
NT seq 3342 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgaaagtattattgtctagatatataaatgatagtaaaaaatatttatataatttaata
gaacaaaaattaatagaaggtaaaactatatatattgttgttccggagcaattcacatta
ggaacagagttagaagcttatcagacgcttaatatagattcaacattaaatttaaggatt
aaaagttttaagacaataataaatgaaattctacatttaaatggaggcagaacgcttaat
ttcttaagtgattctgctaaatttttaattattcagtccattttattagaagtaaaggat
gaattaagaatatttcaaaaaaatatttataataaagattttattgaattattgttagga
tttatggaacagattatttccaataaaattaatatttatgatcttaaaaatattttagaa
tccgatcaaattcaaaatgaattaaaacaaaaattagaggatattttccttatttttgaa
aaatttcaaaagtacaaattgtattcaaattatcattcaatagatagaacagatgtcgca
attaatagtatagaaaacattgaaaagtataaaaatatatcatttttcttttataaattt
aatgatatgtcaaaacaagaaatagaaatagtatcaaaaattgataaaatatcagaattt
acattaataaatatcacaatagatgatagactgttgaataacagaaaagaaaatgttgaa
gattatgaagtatttgatatttcaatgaagtttttaaattcattaaataaaaaagagttt
aacaataaaatagagtatattaaacccgatgaaaaaaaattctatacaaaaaatgaattg
tttttagataaattattttcatataatttatattcagtaaatcaaattacaaataaatta
gataatatctacctaacaaggacaaataatactaatcaagaaattgaaagtttagcttta
aatataaaaaaagatataataaatgaaaaatataaatattcagatatagcaattattgta
acaaatagaggggaatattttgaaaagataaaaaaagtatttcaaataaatgaaatacca
tattttatagatgaatcgataaacctacttagaaatccgatgataaaatatattaaatct
atgataaatatgttaaatacaaatttaagtacggcttccatttctcaatttcttaaagct
tcatttttacaagatttagataatgaaataaatatttttatatcatttatttcacgtaga
aaaatatttgggaaaatgatttttgaggataaatattttaatgttagtgaaaattcgaaa
ttttatgttgaagaggatcttgaaaatcttaataaaattttaatgattagaaaagtgtta
ttaaatataattggagaaatatatgaaaatagcattatttatagaataagaaaaaagaat
gattttaaatattttacaaatgaaatttataagatattttttaatgaaactctaattaat
tcatataataaatatgaacaaaatctaaatgaagatgaaaaagacgaaaacaaattgata
tgggataattttgttttgttactagacgatatttataaattaatatcagaaaaagaaatt
gaatttgaaaaattttcagatattttaacatctgcaattgataattttaagataggaatc
attcctcctagccaagatcaaataataattggagatataaaaagatcaagatttaattct
gttaaaaaaatatatatagttggaatgtcaaatttatattatccaatacttaataatgat
atagatatttttttagatgatgaaaaacaaattttaataaatagtggaatagatttaaat
aatacatctgaaaatattaattcaaatgatttattatctttttatgaacttttgtatact
tcatcagaaaaactacattttagttatagtttagttaattcatcaaatgaatctatgaat
aaagcatcaattttagattgggttatagctatgatgtgttctgaaaattacaataaggat
gaactaaaatataatgatgttatatattctaaaacacttataaataaatatcttccatta
aaattgttagatataaaaaataaagtttatatttcaaatgatgaaaccatatttataaaa
aaattattagagaaaatttctaaatatgagggatatcaaaatgtgaaaaatgctatacaa
ttattaagaaaagataaaactagaaaaaatattagtagagaagttgctggaaaaatatat
aacttaaataaatttagtataagtcaattagaatcatttaatgccaatccttatgaacac
tttataaaatacgggattaaaccaagagaatttaatacatatgatatatctaaattagac
acagggaatttcatgcatgaatatatgaaatattcaatcgaaaatttatatcataaaaaa
ggcattgaaaatgatgtgatatttaataaagcattagacatcacctttgatggttataaa
aaagaagactataaaaataaatattttataaatcaacttatgaggcattctaaatcatat
ttagatataataagtgaacaaatagatttttcttctatatctaagatttttttagaagaa
agatatggaaataatgctgtatttccagctataaaaattaaattagatgatggtaaaatt
gtaaatatagaaggtaaaatagatagggttgatgagtatgattacaatggtttcaagtat
tttagagttattgattataagacgggcaataaaacctttgatatagctaaaatttatcat
ggaattgacttgcaattaatgctttatcttgaagcgacggtaaatagtgataaaaatgga
aaagctataggtgcgttttatcaaaaattaaataatgaaattagttatgaaataatgaaa
aataatgaagatgaaagtaaaatgtttaaggattttaagcttgagggtataataaataac
aatcaaaatttgtttaagatattggattgtgaaactgatgtaacaagagtaaacaattct
aagatatttaagtttgatggtagggcatatgctttggaaaagaaggataatgctgtgaat
gatgaattctttaaaaatatgtttgatcataataagagaaatattaaacaaacggttgaa
aaaataaaaaatggtgatatttcattaagaccttataaaatgaataattttagtccatat
gattattcaaaactaaaaactatttctaaagatgaagatttgagatatgaatatttagat
aacattgattggaaatttgtaaaagaaaaattaggagattag

DBGET integrated database retrieval system