Helcococcus ovis: EQF90_006335
Help
Entry
EQF90_006335 CDS
T09706
Name
(GenBank) phage tail protein
Organism
hov
Helcococcus ovis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Prophage_tail
Peptidase_S74
Collagen
bZIP_1
Prophage_tailD1
Cobalamin_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNZ00879
LinkDB
All DBs
Position
complement(1368600..1371923)
Genome browser
AA seq
1107 aa
AA seq
DB search
MSKVYLYKSNEKNFLHRGLGVLKDISDTVITEQINGVFDLSFYYPLNGRLIKKIKEGNIV
RAKTKKGYQAFRINSITKNDDFLGIFVHAFHISYDLAYNFIEDTFVQNKGGEAALSQVLE
KAIIPHNFKSTSTVQEFISTRLVRKNLLSAIMGNDENSLLSRGGGEFERDNFQINWKPSI
GKDRGVKIKYRKNLVGLHFKSDEFNVITQIMPQGYDGLLLPEKYVKSPIIDNYHMPKIAK
IEYSDVISNEKSKDNENAIDHNQALEKLRIKAKKEFEKGVDKPKITCDVEFVDLSQTVEY
EQYKQLEEVYIGDTVTVYHPKLDVDVKIKIESYQYDPLSDSYINLTLGNSENTMLKAFSN
ADKALSSVEELKNNIQKSLLEKAIETSTNLINNGFGGFVKYYPDKILIMDIDSETAAKNV
WQINKNGIGHSSTGINGPYKFSWTIDGQFNTEFIGAHSITANKLASDIGQSLDLSSNKSI
ISSVKGQVTEYVTANKAILKGDPGINGKDGVSTYVHIAYARNADGSLDFSLKPGEREYIG
ILVDNNSEQSKDYQKYIWSRLRGERGPRGLQGLQGENGKDGIKGADGTSSYTHIAYANSE
DGRQDFSISDSRGKSYIGMYVDDMKKDSENPYKYKWSLIKGADGTKGIQGAPGKNGKTPY
LHIAYANSEDGRRGFSISDSAGKSYIGQYTDFNEYDSFYPDRYKWTKIKGEDGKDADYTQ
FRQQYSSELKQLQNSIELKVSRDIYDRNNTRIDSKFTSFKLSSTQIEAIAKEFIIKGFLK
ADEGRLGNWYISKNYIMPRDESVGIGTAANSEHQAVFWAGYKRIANENIYNFVVRKNGKL
TAREAEIQGRIKSGSIIEVGEYGKIQATTNGLQINVPRSLASKGGIGLQIVGRKIEQKSG
MFIPQGLYIYKDDDFSSGSLPQDSNDFLMSIRGYADIKGIGYIKFNRGKHGGEDYASIGF
WESKNVALGFGGDNNDIYYEYNNTTYSLWKVVKNQSSDRKLKENIIDTPHNAIDIISKLR
FREYDWKKGKFYAKHTIIGLIAQEVEEVDESFVYEDGDILKLDTLRLASLALKGVKELDE
ENKKLKEEISEIKKMIEEIKNEKHNNN
NT seq
3324 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaggtatatttatataaatctaacgaaaaaaacttcttacacagaggattgggt
gtcttaaaagatatatcagatacagttattaccgaacaaataaatggagtgtttgactta
tctttttactatcccttaaatggtaggttaataaaaaagattaaagaaggtaatatagtt
agagcgaagacaaaaaaaggatatcaagcttttagaattaattctataacaaaaaatgat
gattttttaggaatatttgtccatgcttttcatatttcgtatgacttagcttataacttc
atcgaagatacatttgttcaaaataaaggtggagaggctgcattaagtcaagtgttagaa
aaggctataataccacataattttaagtcaacatcaactgttcaagaatttataagtact
agattagttagaaaaaacctattatctgcaataatgggaaatgatgaaaattctttatta
tctagaggtggtggagaatttgaaagggataattttcaaataaattggaaaccgtctatt
ggtaaagatagaggggttaaaattaaatacagaaaaaatcttgtcggattacactttaag
agtgatgaatttaacgtaattactcaaataatgccacaaggatatgatgggttattgctc
cctgaaaaatatgtaaaatctccaattatcgataattatcacatgcctaaaatcgctaaa
atagagtatagtgatgtaatctcaaacgaaaaaagcaaagataatgaaaatgctatagac
cataaccaagctttggaaaaactaagaattaaagctaaaaaagaatttgaaaaaggagtt
gataagccaaaaataacatgtgatgtagaatttgtagatttaagtcaaactgttgaatat
gagcaatataagcaattagaagaagtgtacattggcgataccgtaacagtttaccatcca
aaattagatgttgatgtaaaaataaaaattgaaagttatcaatacgatcctttatcagat
agttatataaatttaactctaggtaatagtgaaaatacaatgctaaaggcttttagtaat
gcggataaggctttaagttctgtagaagaattaaagaataatattcaaaaatctctttta
gaaaaagcgatagaaacttcaactaatttaataaataatggttttggtggttttgtgaag
tattatccagataagatattaatcatggacatcgatagcgaaaccgctgcaaagaatgta
tggcaaataaataaaaacggaataggacattcttcaacaggaataaacggaccttataaa
ttcagctggactattgatggtcaattcaacacagaatttataggagcacattcaatcacc
gcaaacaaactggcttcagacattgggcaaagtcttgatttgtcatcaaataaaagtata
ataagttcggtaaaaggtcaagtcacagaatatgtaacagcaaataaagcgattttaaaa
ggtgatccaggaataaacggaaaagatggagtaagcacttatgttcatattgcatatgca
aggaatgcagatggttctcttgattttagtcttaaaccaggtgaaagggagtatatagga
atattagtagataacaattctgaacaatctaaagattaccaaaaatatatttggagtaga
ctaagaggagaacgaggacctagggggcttcaaggattacaaggtgaaaatggtaaagat
ggaatcaaaggggcggatggaacttcttcatatacacatatagcatacgctaacagcgaa
gatggaagacaagacttcagcatatctgatagtagaggcaaatcatatatcgggatgtat
gtagacgacatgaaaaaagatagcgaaaacccatataaatataaatggagtttaatcaaa
ggggcggatggaactaaggggattcaaggggctccggggaaaaatggcaagaccccttat
cttcatatagcatacgctaacagcgaagatggaagaagagggttcagcatatctgacagt
gcgggtaaatcatacattggccaatatacagacttcaacgaatatgatagtttttatcct
gatagatataaatggacaaaaattaaaggtgaagatgggaaagatgctgactatacacaa
ttcagacaacaatactcttctgaacttaaacaactgcaaaactcaatagagttaaaagta
agtcgagacatatatgataggaataacacgagaatcgattctaaatttacgtcatttaaa
ttatcatcaacacaaatagaagctattgcaaaagaatttattataaaaggatttttaaaa
gcagacgagggaaggcttgggaattggtacatttctaaaaattatattatgccaagagat
gaatctgtaggaataggaactgcggcaaattcagaacatcaagctgtattttgggctggg
tataaaagaattgctaatgaaaatatttataattttgtggtgagaaaaaacggtaaatta
acagcaagagaagcagaaatacaaggaagaataaaatcgggttctataattgaagttgga
gaatatggaaaaattcaagctactactaatgggcttcaaatcaatgttccaagatcactc
gcatctaaaggaggaattggtcttcaaattgtgggacgtaaaattgaacaaaaatcaggc
atgttcattccacaaggtctctatatatataaagatgacgatttttcaagtggttcactt
ccgcaagattctaacgattttttaatgtcaatcagaggttatgctgatattaaggggata
ggatatattaaatttaacagaggtaagcatggaggtgaggattatgcaagcattggattt
tgggagtctaaaaatgtagcattgggatttggtggagataataacgatatatattatgaa
tacaataatactacttactctctatggaaagttgtgaaaaatcagtcgtctgatagaaaa
ttaaaagagaatatcattgacactccacataatgctattgatataatatctaaattaaga
tttagagaatacgattggaaaaagggaaaattctatgcaaaacatacaattattggactt
atagctcaagaagttgaagaagtagatgaaagttttgtatatgaagatggggatatactt
aagctagatacgctaaggttagcaagccttgcacttaaaggagttaaggaattagatgaa
gaaaacaaaaaattaaaagaagaaatttctgaaataaaaaaaatgatagaggagattaaa
aatgagaaacataacaataactaa
DBGET
integrated database retrieval system