Helicobacter pylori HPAG1: HPAG1_0044
Help
Entry
HPAG1_0044 CDS
T00365
Name
(GenBank) transcriptional regulator
KO
K04656
hydrogenase maturation protein HypF
Organism
hpa
Helicobacter pylori HPAG1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hpa00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99975 Protein processing
HPAG1_0044
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sua5_yciO_yrdC
HypF_C
zf-HYPF
Acylphosphatase
TsaD
FAM72
LIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABF84111
UniProt:
Q1CVB1
LinkDB
All DBs
Position
complement(46542..48851)
Genome browser
AA seq
769 aa
AA seq
DB search
MQYLNQTAWKLALRNDATLLNKITLFGVVQGVGMRPFIYTLAQKLELVGFVRNTQAALEI
ILPAHQTESFLNALKKGLPPLALVEKITISPYDKALHFNGFRILESKNHPLNLLSQIPKD
LGVCKDCLHEIRDKNSPYFHYAFNSCAKCGARYSLLNALPYDRENSALKPFKLCEFCASI
YQDPTNKRFHIQGISCKKCGIVLNYKRFKNDDALLECAKDIQKGKIIALKGLGGFALLCD
ARNFQTIERLRLLKNRPLKPFALMFKDLNSVKQHAFLNALECESLSSISAPILLARKKPD
TQLAPNIAKNSSFYGVILPYTPLHALLLDLLDFPIVFTSANFSSLPLANDEAEIDALSFI
FDFKLTHNRAIIHRIDDSIAQCIDNAIRPMRLARGFAPLYLTLPKRSNGSQKKILALGAE
QKGHFSLLDSETSTLLLSPFCGDLSVLENEKHFKETLNFFLKTYDFKPTLLACDKHKNYT
TTKMAFDFNTPLLQVQHHHAHFLASILDALLQDPHLNHPFIGIVWDGSGAYENKIYGAEC
FVGDLERIEEMARFEEFLLLGGQKAIKEPKRLVLEIALKHQLNKLLKRVQKHFKEDELEI
FQQMHDKKIQSIATNSIGRLFDIVAFSLDLTGTISFEAESGQVLENLALQSDEIAFYPFT
IKNSVVCLKDFYQAFEKDLGVLEPKHIAKKFFNSLVEIITALIAPFKEHVVVCSGGVFCN
QLLCEQLAKRLRGLKRQYFFHKHFPPNDSSIPIGQALMAYFNPTIIKKG
NT seq
2310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcaataccttaatcaaacagcatggaagcttgcattgcgtaacgatgcaactttattg
aacaagatcacgctttttggcgtggttcaaggcgtgggcatgcgcccttttatttatacc
ctagctcaaaaattagagcttgtaggctttgtgcgtaacacccaagcggctttggaaatc
atcttgcccgctcatcaaacagagtcttttttaaacgctctcaaaaaagggttaccccct
ttagcgttggttgaaaaaatcactattagcccttatgataaggcgcttcatttcaatggt
tttaggattttagaaagcaagaaccaccctttaaatttgctcagtcaaatccctaaagat
ttaggcgtgtgcaaggattgcttgcacgaaattagagataaaaactccccttattttcat
tacgctttcaattcttgtgcgaaatgcggggcgagatacagccttttaaacgccctaccc
tatgacagagaaaactccgccttaaaacctttcaaactctgtgaattttgtgcttctatt
tatcaagaccctaccaataagcgcttccacattcaaggcatcagctgcaaaaagtgcggt
atcgtgctcaattataagcgattcaaaaacgatgacgctcttttagaatgcgctaaagac
attcaaaaaggtaaaatcatcgctcttaaaggtttgggaggctttgctctcttgtgcgat
gcgaggaattttcaaaccatagaaaggttacggcttttaaaaaaccgccccctaaagcct
tttgcgctcatgtttaaagacttaaactcagtcaaacagcatgcgtttttgaacgcgtta
gaatgcgaaagtttgagttcgataagtgcccccattcttttagcgcgtaaaaaacctgac
acccaattagcccccaatatcgctaaaaactcctccttttatggcgttatcttgccctat
acccctttgcatgctctattattggatttattggatttccctattgtgttcacgagcgcg
aatttcagctccctccctttagcgaacgatgaggctgagattgatgccttgagtttcatt
tttgatttcaagctcacacacaatcgcgctatcattcacaggattgatgacagcatcgca
caatgcatagacaacgcgattcgccccatgcgtttggctagggggtttgccccactttat
ctcactttgcctaaacgctctaatggttcgcaaaaaaagattttagcgcttggagcggag
caaaaagggcattttagcttactagatagtgaaacttctaccttgttactctcgcctttt
tgtggggatttgagcgttttagaaaatgaaaaacactttaaagaaactttgaattttttc
ttaaaaacctatgatttcaagcccacgctcttagcttgcgacaagcataaaaactacacc
accactaaaatggcttttgattttaatacgcccttattgcaagtccagcaccaccatgcc
cactttttagcgagtatcttagacgcattgttacaagatccgcatttaaaccaccctttt
ataggtattgtttgggatgggagtggggcttatgaaaataagatttatggggcggagtgt
tttgtgggggatttggaacgcattgaagagatggccaggtttgaagaatttctgctttta
ggggggcaaaaagcgatcaaagagcctaaacgcttggttttagaaatcgctttaaaacac
caactcaacaagcttttaaaacgcgttcaaaagcattttaaagaagacgaattagaaatt
ttccaacaaatgcatgacaaaaaaattcaaagcatcgccaccaattccatagggcgtttg
tttgatatagtagcgtttagtttggatttaacaggaacgattagttttgaagccgagagt
gggcaggttttagaaaatctagccttacaaagcgatgagatcgccttttacccttttaca
atcaaaaacagcgtggtgtgtttaaaagatttttatcaagcgtttgaaaaggatttgggc
gttttagaacctaaacatatcgctaagaaattttttaacagcctagtagaaatcattacc
gctttgattgcgccttttaaagagcatgtggtggtgtgcagtgggggcgtgttttgcaac
caattattgtgcgaacaattagccaaacgattgagggggctaaaaaggcagtattttttc
cacaagcatttcccccctaacgatagcagtatccctatcggtcaagccttaatggcgtat
ttcaaccctacaatcattaaaaaaggataa
DBGET
integrated database retrieval system