Helicobacter pylori PeCan4: HPPC_05635
Help
Entry
HPPC_05635 CDS
T01322
Name
(GenBank) outer membrane protein HopL
Organism
hpc
Helicobacter pylori PeCan4
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
X92_C
Alpha-E
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADO07337
LinkDB
All DBs
Position
1145307..1148984
Genome browser
AA seq
1225 aa
AA seq
DB search
MIKKAKKFIPFFLIGSLLAEDNGWYMSVGYQIGGTQQFINNKQLLENQNIINSITQSAIN
IAGPTTGLITLSSQSVIDALGYGVSNTVGNQLEGISNILNQIGKRKDFFSSRQISSISQQ
IIGLKGSSDPLKAHSSQITAKLLFNTQSAFDQGIALSSNIISSINSLNPSNNAKEVKAQL
QNTTQSMAELLQQIEHSITKTTSTTYAQSLLSNLTDAVNASSNNTTYVSALKNALTTLGV
GYFPTTTTTHVVLNPPGQIVFYPTNSILGSTSSNSNNQQQYNNTLLMNTLQGELSANNQN
NPNGCANQVQCLEQFIQNLAPLAATPTSNNQANQQVQAIAQKLQSIAINTLDNNAINNTT
YNLNNLHNALNFQAYESTIEQYNNALKQISWISFTEPKNLLKNTSNNYQIGTVTNAQGQN
ISAYDCTSATGSLSGDTSSGISCKATSSTNNTNSFDNSLVATSKVQTINGKEQIGVNSFN
LVSQVWSVYNSLKTSEENLQKNAKILCPNGSNGSQDTCNNNNSLGGLSISGNSQLQNILS
SGTSTNTQAKSNASKLKATVVVNNEEEAKTTNFNQSSGATTQSPNSTVMGALNTVLQNVS
NFQQSIQSAFQNQESNIQAWANAIYNTNGSQSQEMTPNTNQDLRIQLRANFYQLINTIDQ
QTPTSMQAMINQSQQTQQTSGSASNNNPCASGMNGSGNNWCNQQWSDSKAYYSGLQSALG
YQTQATTQSGSSGGNSITYNVQQITLTSNGLLNQIITNLKGVNGGNGGSSGNGTSQINTA
YQMLTDASDGKLGTYANNAYQTCNSGANGNSSNCYTPNKQSTTSTTTATTTTTTTDSNLQ
KVYNDAQKIANIIASSGNNKGVENGLKQFFEALKNNSSSLSNLCNGSSGSSGTSSTCSGG
LINLLGAIPINGVSDTNNLINLLTEFIKTAGFIQNNDTNVSTSLTSAFQAITSAISQGFQ
ALQNDISPNAILTLLQEITSNTTTIQSFSQTLRQLLGDKTFFMVQQKLIDAMINARNQVQ
NAQNQANNYGSQPVLSQYAAAKSTQHGMSNGLGVNLGYKYFFGKARKLGLRHYFFFDYGF
SEIGLANQSVKANIFAYGVGTDFLWNLFRRTYNTKALNFGLFAGVQLGGATWLSSLRQQI
IDNWGNANGIHSTNFQVALNFGVRTNFAEFKRFAKKFHNQGVISQKSVEFGIKVPLINQA
YLRSAGADVSYRRFYTFYINYIMGF
NT seq
3678 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaaagctaaaaaatttataccattctttttaattggctctctcttagctgaa
gacaatggctggtatatgtctgtaggctatcaaatcggtggcacgcaacaattcatcaat
aacaaacaacttttagaaaatcaaaatatcatcaatagcatcactcaaagcgcgatcaat
attgcagggcctactaccggccttatcactttaagctctcaaagcgtcattgacgcttta
ggctatggcgtgagtaacaccgtgggcaaccaattagagggcatttctaatatcttaaat
caaattggcaaaagaaaagactttttttctagccgtcaaatctctagcatttcccagcaa
atcatagggcttaaaggaagctctgatcctttaaaagcccattcttcacaaatcacagcc
aaactcctctttaacacccaaagcgcgtttgatcaaggcatcgcgctaagctctaacatc
attagctctatcaatagccttaatcctagcaacaacgccaaagaagtcaaagcccagctc
caaaacaccacgcaatccatggcagaattattgcaacaaattgaacacagcatcactaaa
accactagcaccacttacgcgcaatccttactctccaatctgaccgatgcggtgaatgcc
tctagcaataataccacttatgtgagcgctttaaaaaacgctttaaccactcttggggtg
gggtatttccctacgacaaccacaacgcatgtggtgctaaacccaccgggacaaatcgta
ttttatccaactaattccattttaggctctacttcttcaaacagcaataaccaacaacaa
tacaacaacacccttttaatgaacaccttacaaggggaattaagcgctaataatcaaaat
aaccccaatggttgcgccaatcaagtccagtgtttagagcagttcatccaaaatttagcc
cctttagccgcaacccccacttcaaataaccaagccaaccagcaagtccaagccatcgct
caaaagcttcaaagcattgctatcaacactttagacaacaatgcgatcaacaacaccacc
tataatttaaacaacttgcacaacgctttgaatttccaggcctatgaaagcacgatagaa
caatacaataacgctttaaagcaaatttcgtggattagttttactgagcctaaaaacctg
ctcaaaaacacttctaataactaccaaatcggcaccgttaccaacgctcaagggcaaaat
atcagcgcctatgactgcacaagcgctaccgggagcctttctggcgatacttctagtggg
atttcatgcaaagccacaagctccacaaacaacacaaatagttttgacaattctttagtc
gctacctccaaagtccaaaccatcaacggcaaagagcagatcggcgtgaattcttttaac
ttggtttctcaagtgtggagcgtttataactctttaaaaacttcagaagaaaatttgcaa
aaaaacgccaagatactatgcccaaatggcagtaacggctcgcaagatacatgcaataac
aacaattctttggggggtttgagcatcagcgggaactcccaattgcaaaatattttaagc
tctgggactagcactaatactcaagctaaaagcaacgcttccaaactaaaagcgacagtg
gtggtgaataatgaagaagaagctaaaacgactaacttcaatcaaagcagtggggcaacc
actcaatcccctaacagcacggtaatgggcgctttaaacaccgtattgcaaaatgtcagc
aatttccaacaaagcattcaaagcgcttttcaaaaccaagaaagcaatatccaagcctgg
gcgaatgcgatttataacactaatgggagtcagtcgcaagagatgactcctaacactaac
caagatttacgcatccaattaagagcgaatttttaccagctcatcaataccattgaccaa
caaacgcccacttcaatgcaagccatgatcaatcaaagccaacaaacccagcaaacaagc
ggatcagcaagcaataataacccatgcgcgagcggaatgaatgggagtggtaataactgg
tgcaatcagcaatggtcggattctaaggcttattacagcgggttacaaagcgctttaggg
tatcaaacacaagcaacaactcaaagtgggagcagtggtgggaacagcatcacctacaat
gtccaacaaatcacgctcactagtaatgggttgctcaatcaaattatcacaaatcttaag
ggcgttaatgggggtaatggaggaagcagtggaaatggaactagtcaaatcaacacagcc
taccaaatgctcacagacgctagcgatgggaaattagggacttatgctaataatgcctat
caaacatgcaatagcggagcaaatggaaatagcagtaattgctacacccccaacaaacaa
agcaccacaagcaccaccaccgctaccacaaccaccaccacaaccgacagcaatttacaa
aaagtttataatgacgcccaaaaaatagccaacattatcgccagctctgggaataataaa
ggcgttgaaaacggcttaaaacaattctttgaagcgctaaaaaataatagtagcagtctc
agcaatttgtgtaatggtagtagtggtagtagtggcaccagctctacttgctccggtggg
cttatcaaccttttaggggcaatccctataaatggggtgagcgatacgaataatttaatt
aatttgctcaccgaattcattaaaaccgccgggtttatccaaaataatgatactaatgta
tctactagtcttacaagcgcttttcaagccattacgagcgctatttctcaagggtttcaa
gccttacaaaacgacattagccctaacgcgattttaaccttactccaagaaatcacttct
aacaccaccaccattcagtcattctcgcaaaccttacggcagcttttaggggataaaacc
ttctttatggtgcaacaaaagctcattgatgcgatgattaatgctagaaatcaggttcaa
aacgcgcaaaatcaagccaataactacggctctcaacccgttttaagccagtatgcggcc
gctaaaagcacccaacacggcatgagcaacggcttaggggttaatttgggctataaatac
ttctttggtaaggctaggaaattgggccttaggcattattttttctttgattacggattt
agtgaaataggcctagccaatcaaagcgtgaaagcgaatatctttgcttatggggtaggc
acggattttttatggaatctattcaggaggacttacaacactaaggcgttgaattttggt
ctatttgctggggtccaactgggcggcgcaacttggcttagctctctaaggcaacaaatc
attgacaactgggggaacgctaatggcattcattcaacgaattttcaagtggcgctgaat
tttggggtgcgcaccaactttgcggagtttaagcgttttgccaagaaattccacaatcaa
ggggttataagccaaaagagcgtggaatttgggatcaaagtgcctctcatcaatcaagcg
tatttaagaagcgctggggctgatgtgagctacaggaggttttatactttctatatcaat
tacatcatggggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
