KEGG   Helicobacter pylori 51: KHP_0790
Entry
KHP_0790          CDS       T02082                                 
Symbol
cagW
Name
(GenBank) cag pathogenicity island protein W
  KO
K12094  cag pathogenicity island protein 9
Organism
hpd  Helicobacter pylori 51
Module
hpd_M00564  Helicobacter pylori pathogenicity signature, cagA pathogenicity island
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hpd00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:hpd02044]
    KHP_0790 (cagW)
Secretion system [BR:hpd02044]
 Type IV secretion system
  Cag pathogenicity island (PAI) protein
   KHP_0790 (cagW)
SSDB
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACX97994
UniProt: A0AAI7ZW29
LinkDB
Position
841868..843475
AA seq 535 aa
MFNIKRTFLITIMSFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILT
GYTSIGASGSGKSSGQGVIEALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGF
ALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSMLDNLSNKIRNFTKGGVEDNVKGNVLLQIISSIT
AQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQINIGFEYMRFIGGTLFKMAMV
SFIAYAGFGYLYKISYSIYFGLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGN
NAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAGAFSGIVFPIAVCLIVLDWFK
DSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMIGRVGGSMFKG
NT seq 1608 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttaatattaaaaggacttttttaataacgatcatgagtttttttctcattgttcct
aattggttgaaagctattgatttgcccattgtttcaaatctcaaaatttaccaaacagtt
tattgcatgctgataccgagttatgttttaaccaacaaaagttttgcagatattttgaca
ggctatacatctattggtgcatcagggagtggaaagagttcagggcagggtgtgattgaa
gcgcttagcacaccattagccacaagtttagccgctagcaatctggtgaaatatttgaat
actttaggtcctttatggggatcggcatgggcaagtgttgctacagctatacaaggtttt
gctctaacgccatcaagtggctgtaattttggttggaatgcattgataaataaaaacata
gatgtatccatggatagcatgctagacaatttgagcaacaagattcggaattttaccaaa
ggcggtgttgaggacaatgtgaaaggcaatgttcttttacaaataattagctcaataacc
gctcaagcttctacgaatattacagctgatggtttaatttggctgattggcaaagaattc
actgcaaataaactgcaaaacaacactacagccatgcttgcttttgccgcattggaatct
gttgtcaaaggagcggacgctgctgttcttcctgcatatggtgtagtcaatctgcctgat
attattatagggcaagggtcatatcttgattttgtttcttacttgatttatattgttttt
gggatttttgtttttatttcttttatgaaattgagggatatttcaaatggcattcagatt
aacataggttttgaatacatgcgatttattggggggacattattcaaaatggcgatggtc
tcttttatcgcctatgcaggttttggttatctttataaaatctcttattccatttatttt
ggtttagcaggtgcttttgggttgaatcaagttcttttttgggctttagatttagtgctg
aattacactgttaattcaattttacctgcggtaagagctgttttttctaatgttggcaac
aacgctcctagtttgttacaaggcttgcaagtggcaggtatttctttattcgctattttt
atgcaagtaactatcattatgagaataagcactgttgttgttaaacctttgatagcgggg
gcttttagcggtattgtgttccctattgcggtatgtttgatcgtgctagattggttcaaa
gattctatgaaaaacatattgatatggtttattaataatttgtttatcttggttctagct
attcctattttgctctttggtgttttggcattattggcattcaatttgaccataacgccc
tctgttgctatacaaaacatcaatcaagggggactgggtatcgattcaactattgcgagt
ttgatcactttatttattttaaaaggtttcatagagacgattattgagagtgtcaatgcg
atcgttaataccattttcagctctgtatctatggatggtagcagaatggatagagaaaga
gatgccttaatgataggaagagttggtggatctatgtttaaaggataa

DBGET integrated database retrieval system