Halopseudomonas pelagia: EAO82_18070
Help
Entry
EAO82_18070 CDS
T07735
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
hpeg
Halopseudomonas pelagia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hpeg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
hpeg02044
]
EAO82_18070
02035 Bacterial motility proteins [BR:
hpeg02035
]
EAO82_18070
Secretion system [BR:
hpeg02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
EAO82_18070
Bacterial motility proteins [BR:
hpeg02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
EAO82_18070
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFY58107
LinkDB
All DBs
Position
complement(3910715..3914437)
Genome browser
AA seq
1240 aa
AA seq
DB search
MTLLMPKRLLSSSGSFLASFLLASSSAYASVDIEQQPLLVAQPVAANMSIIGSFEFPTMV
TRAYKGAYASAGEYVGYFDSGKCYKYRYSDTEANRHFYPSRVASNCSQTDEWSGKYLNWA
TMQSIDIFRHILTGGYRRLDTTTETWLEKGVQTGQGNSSSNYPDANINSGLVASTPIPGS
AWSAVNTRIGVANTRMGNVMRFTGSADLNSANRVAYNPAIHHNGTNFLPNVVYEVSVRVK
VCVAGMLEANCKKYGNNYKPEGLIQDNADNVRYSAFGYLNDNSSPNPNRDGGIMHARMKY
VGPEKISDQNLAVNNSNAEWSADTGVFVQNPDPLDASATTSRYPGLTPINHSGVISYINN
SGLIVPGTLFKRYDNVSELFYTAYRYMRGLPNRSEYINISQSGTALNQLVGGLPIINWSS
SEADDPIQFACQKNFFLGIGDTNTHPDTRVPKADDTVDVATRVSRISSLEGGLNITGGRS
ALIAGLAFDANTKDMRPDMEGKQTAATYWIDILEGGDLKARTSNQYWLAAKYGGLKVPEE
FNPDSDPIEENMWYTNGETLNSSGYKRPDNFYVVANAQDMVDGLTQAFTDIRSQQAGSSS
SVALNSRKLEAGSAAYQTVFNSAAWSGELNAFTLDPDTGEVSASPVWSASSRLPTPANRN
IKTWDGSSYVNFSTDTGGINNTTLTNALKVDSGTSASVSVAQIVNYLRGDRAAENNATGL
RVRQSALGDMVNSQPIFVGNPVPGRFGTRSFNGSDSYASWASSLNRAPTVYVGSNDGMLH
GFNATIGQDASGVETFAYVPRTVIENGMGELASPAYDHRYFVDGEIAVTDAYDGESQSWR
TVLVGTLGAGGVNKARTGTRNAIFALDVTNPSEVTFLWEKNSVDIPQLGNNLGRPVIAQT
GNGDWSLLLGNGPNSDSGRASLISLNLFSGDVKTTNMSTEVNNGLSAVRAWDSSGDGITD
TIYAGDLQGNLWKVTRLDRSNPTVVKLFRALDPNNDPQPITSAPLAGRSPFSNEVWLFFG
TGQYLNNADLADRQVQTWYGINDNGLTTTATVRRGDDASDLLERRILLEVPFSTDETARV
IEEGTREELSGKRGWFIDLYQVAQNGSRTAIGERMVTPNEFRGGALLGNSRIPDASDPCA
PTGRGVLMAIEPFTGARLSDTFFDLNRDRAFSVLDMIDIDGVMTVVSGRVFDGGISNPSS
MGGLDIISPYGGEPPISEPNPGGDQGSTRTSWRELINIGN
NT seq
3723 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccctcttaatgcccaagcgcttgctttcaagcagtggctcctttttggcatcgttc
ctattggcaagcagttcggcctacgccagcgtagatatagagcagcaaccgctgttagtg
gcgcagcccgttgcagccaatatgtcgattattgggtcattcgagtttcctactatggta
actcgggcgtataaaggtgcctatgctagtgctggtgagtacgtaggctatttcgatagc
ggcaaatgctacaaatacagatatagtgatacggaggctaatagacatttttacccctcg
cgcgtcgcctcaaactgtagtcaaacagatgaatggagtggtaaatatctaaattgggct
accatgcaatcaattgatatttttcgccatattttgacgggggggtacaggcgcttagat
acgacgaccgaaacgtggcttgaaaagggagtccagactggtcaaggtaatagtagtagt
aattatccagacgcgaacattaactctggtcttgtggcctcgaccccaattccggggtca
gcgtggtctgcagttaatactcgcattggcgttgccaatacccgcatgggtaacgtcatg
cgttttactggtagcgctgatcttaatagcgctaatcgtgtagcttacaatcctgcgata
catcataacggaacgaactttttgccgaacgtggtttatgaggtgtccgttagagttaag
gtttgtgttgcaggtatgttagaggctaactgtaaaaagtacgggaataattataaacct
gaaggattaatacaagataatgcggataacgtacgatatagtgcatttggatatttaaac
gataattcgtcgcctaatcctaatcgtgacggtgggatcatgcacgcccgtatgaagtac
gtgggacctgaaaagattagcgatcaaaatcttgctgttaataattctaatgcagagtgg
agcgcagataccggtgtttttgtacagaatccagacccgctagatgcaagcgctactact
tcaaggtatccggggctaacaccaatcaaccatagtggcgtgattagctatatcaataac
agcggcctgatcgtgcctggtacattattcaagcgatatgataacgtaagtgagcttttt
tacactgcttatcgttacatgcgtggtctgcccaatcgatctgaatatataaatatctcg
caaagcggtactgctttgaatcagctggtcggtggtttgccaattataaactggtcctca
agtgaagcagatgatcctattcagttcgcatgccagaagaactttttcttgggtattggt
gatactaacactcatcctgatactcgcgttccaaaggcagatgatacggttgatgtcgca
acacgggtttcaagaattagcagtctggaaggtgggctgaatattactggcggccgctca
gcattgatcgccggcttggcatttgatgcaaatacaaaagatatgcggcctgatatggaa
ggtaaacaaacggctgccacctattggatcgatattcttgagggaggagatctaaaagca
agaacatcgaatcaatactggcttgctgccaaatacggtggactgaaggttcctgaagag
ttcaaccccgatagcgatcctattgaggaaaacatgtggtacaccaacggggaaacactt
aattcttcaggatataagcggcctgataatttttacgtcgttgcaaatgctcaggatatg
gttgatgggcttacccaagcttttaccgatattcggtcacaacaagcaggcagtagctca
tcagtagcgctcaactccagaaagcttgaagcaggatctgctgcttaccagacggtgttc
aatagtgccgcatggtcgggggagttgaacgcatttacgctagacccagataccggtgag
gtgagtgcgagccccgtctggtctgcatcttccagactcccaactcctgccaatcgtaat
atcaaaacatgggatgggagctcttacgtcaattttagtaccgatactggcggcatcaac
aacacaacgttgaccaacgctttgaaggtcgatagcggtaccagtgccagcgtcagcgtt
gcacagattgttaactacctgcggggtgaccgagcggcagaaaacaatgctactggcttg
agagtgcgtcaaagtgctttgggagatatggtcaattctcaaccaatattcgtgggtaat
cctgtccctgggcgttttggcacccgatcatttaatggctccgacagttatgctagttgg
gctagtagtttgaacagagctcccaccgtctacgtaggaagcaatgacggaatgctgcat
ggatttaatgccactattggacaagatgcgagtggggtcgagacttttgcttatgttcct
cgtacggtcattgaaaatggcatgggtgagttagcgagtcctgcatatgaccaccgttat
tttgtcgatggtgaaattgctgtgaccgatgcatatgatggtgaaagtcagagttggcgc
actgttctcgtgggtaccctcggagctgggggcgttaacaaagctaggacgggcacccgt
aacgctatttttgcactggatgtgactaatccgtccgaggtcacttttctatgggagaag
aactctgtagatattccacagttagggaataatctcggtaggcctgtgatcgctcagaca
ggcaatggtgactggtcattattgttgggtaatgggcccaacagcgactcaggaagggca
tcgttgattagtctcaatctgttcagtggtgatgttaagaccactaatatgtctactgag
gttaataatgggctatctgcagtcagggcttgggacagtagtggcgacggtattacggac
accatttatgcgggcgaccttcaaggcaatctctggaaggttactcggctggataggagt
aacccaaccgtagtaaagcttttccgcgcgcttgatcctaataatgaccctcagccgata
acctctgcaccgttggccggtcggtctccctttagcaatgaagtctggctattttttggt
acggggcagtatctcaataatgccgatcttgcagatcgtcaggtgcaaacctggtatggc
attaacgacaatggtcttactaccacagcgacggtcagaaggggcgatgatgccagcgat
ctgctcgagcgtcggatattattggaggtcccgttttccaccgatgaaacagcacgggtc
atcgaagaaggaactcgtgaggaactcagtggaaagcgtgggtggtttattgacttgtat
caggttgcgcagaacggttccaggacggcgatcggtgagaggatggtaactcctaacgag
ttccgaggcggtgccttgcttggcaactcccgtattcccgacgctagcgatccttgcgcg
cccactggccgtggtgtgctcatggctattgagcctttcactggtgctagattatccgac
actttttttgacttgaatcgggatcgtgccttcagtgtcttagatatgatcgatatcgac
ggcgtgatgacggtcgtatcaggtagagtctttgatggaggtattagcaatccttcgtca
atgggtggtttagatatcattagtccttatggcggggagccgcccatatctgagcccaat
ccgggaggcgatcagggttccaccaggacgtcttggcgcgagctgatcaatattggaaac
tga
DBGET
integrated database retrieval system