Helicobacter pylori Lithuania75: HPLT_08359
Help
Entry
HPLT_08359 CDS
T01896
Name
(GenBank) conjugal transfer protein (traG)
Organism
hph
Helicobacter pylori Lithuania75
Pathway
hph03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hph00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
HPLT_08359
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4SS-DNA_transf
TrwB_AAD_bind
TraG-D_C
Taxilin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADU84024
LinkDB
All DBs
Position
unnamed:complement(10071..12278)
Genome browser
AA seq
735 aa
AA seq
DB search
MHKYRPFIYLLSIVLAPIVFLIALFYLMDMKSFHSTILLSQEIFANLKHFKSFKLQIHLA
FIYALTPLIFTIYLFFNGVNMNIYGKAKWASIKDIETYKYSLVSWVKSICALFFLSLFAP
LSIFAIFKRHLIIFCNERVFEDKTGFRIFDFKTYYNTLKIIIRQIFYENFLSGLMLMLKN
QKTYYQNLLEHLKGSMLLGLKKENPITLNFDNGLPLGVYNAMTRAKVVYYNSPLSTLIVA
PPGAGKTSAVAIPTLLSVPSSCVVLDIKGELCDLTAGYRQKHFKNKIFIFNPYGTDNSLY
FNPFDKNIVSKMSFSEKRRLVEEIANTIFNEKSQDPHWVEQAKNVFTFHALYELCVNEET
TLFEIALSLDKNYTPLINKRGRFYPQVFKCVEKSKEEGGGFEMNNDGTYMLDKDANGKPI
QIADVDVRKLWYQQVAEQIYIDIDKKENYDGTINKLELKLDKDKMPILEEGMLDPFMRSY
ANRWANANDKEFSSIKSTFDRFMQVFTDYRVKRATSKMSFEYEDLRKDNITLYIKIAQTD
IDIIAPLIRVLLESMGKNLLLKESKRFDERIYFILDEFVRFGKLSFLLEMPALSRSYGVV
LLYITQSNAMIEKYYGKEDAKILNGTVNYRVLFRMNDYEYAQQISNEIGKMTRKTRSHST
EKGQLIMGGTSSIGKEAWDLVSPQDILNIDKDEVIILVGGHQAKPLKLKANYYFRNPKMT
KCLNWEVKPNEKVFS
NT seq
2208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcataaataccgcccttttatttacttgttaagtattgtattagcacctattgtattt
ttaattgcgttattctatttaatggacatgaaaagctttcactctaccattttgctcagt
caagaaatttttgcaaatttaaagcattttaaatcctttaagctccaaattcacttggcc
tttatctacgctcttactccgttgattttcactatctatttgttttttaacggcgtgaat
atgaatatttatggtaaggccaaatgggctagtattaaagatattgaaacctacaaatac
tcgcttgtttcttgggttaaatccatttgtgctttgttttttctgtctttattcgctcca
ttaagcatctttgccattttcaaaaggcacttaataatcttttgtaatgaaagagtgttt
gaagataaaacaggttttaggatttttgatttcaaaacctactataacaccttaaagatt
ataataagacaaattttttacgaaaattttttaagcggtttgatgttgatgcttaaaaat
caaaaaacttattaccaaaacttattggaacacctaaaaggctctatgttattaggttta
aaaaaagaaaatcccatcaccttaaattttgataatggactgcctttaggcgtgtataat
gcgatgactagagctaaagtagtgtattacaattctccactttctactttaattgttgct
cctcctggtgctggtaaaacttctgcagtagctatcccaacacttttgagcgtgcctagc
tcttgtgtggtgttagacatcaaaggcgaattgtgcgatttaacggctggatacagacaa
aagcattttaaaaataagattttcattttcaatccttatggaactgataatagtttatat
ttcaatccttttgacaagaatattgtttctaaaatgagctttagcgaaaaacgccgtttg
gttgaagagattgctaacactatctttaacgaaaaatctcaagaccctcattgggtagag
caagctaagaatgtctttactttccatgcattgtatgagctatgcgtcaatgaagagacc
accctttttgaaattgctctatcattagacaaaaactacactcctttgatcaataaaaga
gggcgtttctatccacaagtttttaaatgtgttgaaaaaagcaaagaggaaggtggtggt
tttgagatgaataatgatggcacttacatgttagataaagacgctaatggaaaacctata
caaattgctgatgttgatgttaggaaattatggtatcaacaagtggctgaacaaatttat
attgatattgataaaaaagaaaactatgatggcacaattaacaagttagaattgaagcta
gataaagacaaaatgcctattttagaagaaggcatgttagatcctttcatgcgttcttat
gcaaacagatgggcgaatgctaacgacaaggaatttagctctatcaaatctacttttgac
agatttatgcaagtattcacggattatagagttaaaagagcgacctctaaaatgagtttt
gaatatgaagatctaagaaaagacaatatcactctttacattaaaatagctcaaacagat
attgacattattgctccattgattagagtgcttttagaaagcatgggcaaaaacttactt
ttaaaagaaagcaaaagatttgatgaaagaatttatttcatactggacgagtttgttaga
tttggaaaactcagtttcttgttagaaatgccagcattgagtagaagttatggagtggta
ttactttacatcactcaaagcaatgcaatgattgaaaaatactatggcaaagaagacgct
aagattttaaacggcacggtgaattatagggtcctttttagaatgaacgattatgaatat
gcacaacaaatttctaatgaaatcggcaagatgactagaaaaacacgaagccactctaca
gaaaaaggacaactcattatgggagggacttctagtataggaaaagaggcgtgggatttg
gtcagtccgcaagatattctaaatattgataaagatgaagtgattatattagtaggcggt
catcaagccaaacctttaaaactaaaagcgaattactattttagaaatcccaaaatgaca
aaatgtttgaattgggaagtcaagcctaatgaaaaagtgttttcctaa
DBGET
integrated database retrieval system