KEGG   Helicobacter pylori 908: hp908_0935
Entry
hp908_0935        CDS       T01893                                 
Symbol
vacA4
Name
(GenBank) putative vacuolating cytotoxin like protein
Organism
hpi  Helicobacter pylori 908
SSDB
Motif
Pfam: VacA2 DUF6252
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADN80061
LinkDB
Position
916693..923892
AA seq 2399 aa
MAFKKARLISRFISKGSFKLNKISKKFFTLNQILKREKPLKRHKKTKSIEKPFNKSKSFL
KASVLLIGALGGLSHLRANECRYWSWSSWSYQDNIESGPNSPTHNSYCLFSSTQGSGTYY
LNTLTTYSAGGASFTQKFNNGTLDIGGNIRFGGTGINGGDVGYITGTYDAQTMNFNSSHI
TTGNSYADGGGATLNFNATNNITINQASFDNSDAGTQKSYMNFKGSNIKISGSSFTDDTD
GGFNFSGNNNNSTISFNQTSFNQGTYNFSNSASSSFGNSSFNQGTYHFNSAQSTFENSNF
NQGTYNFNDNTSFNNDTFNQGTYNFNSSKVSFSGANTLNSSSPFASLKGSVSFNSNAIFN
LNQTLSGNQTYDILTTNGAIQYGVYQSYLWDLINYKGDKAISHVEVGNNTYDVTFDINGQ
DETLQETFDKQSIITQFLGDDLQQQAQQTYQEDVAHSQNALRGVTSDNTIASNDTSYTQS
SNPTILKDAQNLENTNQKIQQDEQALEKDLAQIQQLANSTTGFNEQAFTQAQKQEQQEEQ
TLQNEENAFNTEQEGLEQAIANAKHVSPTPNLTPSPTPTPTKHTAPNTPPSQVPPTPTQN
PPAESVWSGVYWLQNKNYSNKGIYYIDPNLSGQSGQSGNTLSTYTANLLGRSFGVNANNG
TLIIGNNTENVNDNGLIWIGHGGFGYITGTFNAANIYLTNNFKTGEGVSNSDGGGANITF
KASDNITMDGLNYNNAETVTKMIQTGASQHSYTTFDATNNISVTDSNFSDMTWGKFSFNA
ENISFSNASFSGFTNPGGSSTISANASNSLSFIDSRLNGGAVYNLQANSLIFNNTQAVFN
VLYSRGTSNFNATTQLLGNTSFTLSSQSLLNFNGDTTLQNNANITLGNKSQAAFKNSLTL
DNNSNLSLDNQSVLNANGTSTFNNQASLNIYNGSQAVFSSLLFNGGTLSLNASSKLNASS
ASFSNNTTINLDDSVLNANNTSSLNANINFQDASQADFGGNTTIDTASFNFDSTSSLNFN
NLTANGALNFNGYVPSLTKALMSVSGQFVLGNNGDINLSDINIFDNITKSVTYNILNAQK
GITGISGANGYEKILFYGMKIQNATYSDNNNIQTWSFINPLNSSQIIQESIKNGDLTIEV
LNNPNSASNTIFNIAPELYNYQASKQNPTGYSYDYSDNQAGTYYLTSNIKGLFIPKGSQT
PQAPGTYSPFNQPLNSLNIYNKGFSSENLKTLLGILSQNSATLKEMIESNQLDNITNINE
VLQLLDKIKITQAQKQALLETINHLTDNINQTFNNGNLVIGATQDNVTNSTSSIWFGGNG
YSSPCTLDSATCSSFRNTYLGQLLGSTSPYLGYINADFKAKSIYITGTIGSGNAFESGGS
ADVTFQSANNLVLNKANIEAQATDNIFNLLGQEGIDKIFNQGNLANVLSQMAMEKIKQAG
GLGNFIENALSPLSKELPASLQDETLGQLIGQNNLDDLLNNSGVMNEIQNIISQKLSIFG
NFVTPSIIENYLAKQSLKSMLDDKGLLNFIGGYIDASEISSILSVILKDITNPPTSLQKD
IGVVANNLLNEFLGQDVVKKLESQGLVSNIIINIISQGGLSGVYNQGLGSVLPPSLQNAL
KENDLGALLSPRGLHDFWQKGYFNFLSNGYVFVNNSSFSNATGGSLNFVANKSIIFNGDN
TIDFSKYQGALIFASNGVSNINITTLNATNGLSLNAGLNNVNVQKGEICINLANCPTTKN
SSSANSSVTPTNESLSVHANNFTFLGAIASNGAIDLSQVTNNSVIGTLNLNENATLQANN
LTITNAFDNASNSTADINGNFTLNQQATLSTNASGLNVMGNFNSYGDLVFNLSHSVSHAI
INAQGAATIMANDNNPLIQFNASSKETGTYTLIDSAKAIYYGYNNQITGGSSLDNYLKLY
ALIDINGKHMVMTDNGLTYNGQAVSVKDGGLVVGFKDSQNQYIYTSILYNKVKIAVSNDP
INNLQAPTLKQYIAQIQGVQSVDSIDQAGGNQAINWLNKIFETKGSPLFAPYYLESHSTK
DLTTIAGDIANTLEVIANPNFKNDATNILQINTYTQQMSRLAKLSDTSTFARSDFLERLE
ALKNKRFADAIPNAMDVILKYSQRNRVKNNVWATGVGGASFISGGTGTLYGINIGYDRFI
KGVIVGGYAAYGYSGFHANITQSGSSNVNVGVYSRAFIKRSELTMSLNETWGYNKTFINS
YDPLLSIINQSYRYDTWTTDAKINYGYDFMFKDKSVIFKPQVGLSYYYIGLSGLRGIMDD
PIYNQFRANADPNKKSVLTINFALESRHYFNKNSYYFVIADVGRDLFINSMGDKMVRFIG
NNTLSYRDGGRYNTFASIITGGEIRLFKTFYVNAGIGARFGLDYKDINITGNIGMRYAF
NT seq 7200 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcgtttaaaaaggccagattgatttccaggtttatttcaaaaggatctttcaaattg
aataagatctcaaagaaatttttcacattgaatcaaatcttaaagcgtgaaaagccctta
aaacgccataaaaaaacaaaatccattgaaaaaccctttaataaaagcaaatctttttta
aaagcttcggttttattgataggagcgttaggggggttatcccacctaagggctaacgaa
tgccgttattggtcatggtcgtcttggagttatcaagacaatattgaaagcggtcctaat
tcgcccacgcacaactcttattgtctttttagcagtactcaaggctctgggacttattat
ttaaacactcttaccacttatagtgctggtggggctagtttcacgcagaagttcaataat
ggcacgcttgatataggggggaatatccgctttggaggcacaggtattaatgggggtgat
gtagggtatatcactggaacttatgacgctcaaacgatgaattttaattctagccatatc
acaaccggaaactcatacgctgatggcggtggggccacgctcaattttaacgcaaccaat
aatatcactatcaatcaagcgagttttgataacagcgatgcagggacacaaaaatcttac
atgaattttaaaggctctaatatcaagatcagtggctctagctttacagatgacactgat
gggggctttaatttcagcggtaataacaataatagcaccatctccttcaatcaaaccagc
ttcaatcaagggacttataattttagcaatagtgcaagttcaagctttggtaatagtagt
ttcaatcaagggacttatcactttaacagcgcccaatccacttttgaaaacagcaatttc
aatcaaggcacttataattttaatgacaatactagctttaataacgacaccttcaatcaa
ggcacttataattttaatagcagcaaggtgagtttctcaggcgctaacactttaaattca
agttcgccttttgctagccttaaaggcagtgtgtcttttaattctaatgcgatctttaac
ctcaatcaaacccttagcggtaatcaaacctatgacattctcactacaaacggggcgatc
cagtatggggtttatcaaagctatttgtgggatctaatcaactataagggcgataaagcc
attagccatgttgaagtgggtaacaacacttatgatgtaacctttgacattaacgggcaa
gatgaaaccttacaagaaacctttgacaaacaatccatcattacccaatttttaggagac
gatttacaacaacaagcccaacaaacctatcaagaggatgtagctcattcccaaaacgct
ttaaggggtgtgactagcgataacacgatcgcaagcaatgatacaagctacactcaaagc
agtaaccccactatccttaaagacgctcaaaacttagaaaacaccaaccaaaaaatccaa
caagatgagcaagcgttagaaaaagatttagcccaaatccaacaattagccaactccacc
acaggctttaacgaacaagctttcactcaagctcaaaaacaagaacaacaagaggaacaa
accttacagaatgaggaaaacgcttttaatacggaacaagagggattagaacaagcgata
gctaacgctaaacatgtaagccccacaccaaatctgacaccaagccccacacccactcct
acaaaacacacagcgccaaacactccccctagtcaagttccgcccacgcctactcaaaat
ccacctgcagaaagcgtgtggagtggggtttattggcttcaaaacaaaaattactcaaac
aaaggcatttattatattgatcctaacctttcaggacagagcggtcaaagcggcaacacg
ctcagcacctatacagctaatttgttagggagaagttttggcgtcaatgctaacaatggc
actttgatcatagggaataacacagagaacgtgaatgataacgggttgatttggatagga
catggaggctttggttatattaccgggacttttaatgcggctaacatttacttgaccaat
aattttaaaaccggtgaaggcgtttcaaactcagatggtgggggagcgaacatcaccttt
aaagcaagcgataatatcactatggatggcttgaattacaataacgctgaaaccgttact
aaaatgattcaaacaggggccagtcagcattcctataccacttttgacgctaccaataat
atcagtgtaactgattctaattttagcgatatgacttgggggaaattcagttttaacgct
gagaatatttcgttttctaacgcttcgttcagcggctttacaaaccctggaggatcaagc
actatcagcgctaacgcttctaattctttaagctttatagattctcgtttgaatggcggg
gcagtttataatttgcaggctaatagccttattttcaataacacgcaagcggtttttaat
gtcttgtattctagggggacaagcaattttaacgccaccacacagcttttaggcaacacg
agttttacgcttagctctcaaagtttgctgaactttaatggcgatacaaccttgcaaaac
aacgctaatatcacgcttggcaataaaagtcaagccgcttttaaaaattctttaacgctt
gataacaattctaatttgagtttagacaatcaaagcgttttgaatgcgaatggcacaagc
acctttaacaatcaagcgagtctcaacatttataacgggagtcaagcggtctttagcagc
ctcttatttaatggcgggacactcagtcttaacgctagtagcaagctcaacgcttctagc
gctagtttttcaaacaacaccactattaatttagacgatagcgttttaaatgcgaataac
acaagctctttaaacgctaatatcaattttcaagacgcaagccaagctgattttggaggc
aacacgactattgatacagcgagctttaattttgacagcacaagttcattgaattttaat
aaccttacggctaatggagcgttaaattttaatggttatgtgccctctttaactaaggct
ttaatgagcgttagcgggcagtttgttttagggaataatggggatattaatttatctgac
atcaatatctttgacaacatcacaaaatctgtaacttacaacatactaaacgctcaaaaa
gggattactggcatcagtggggctaatggctatgaaaaaatccttttttatggcatgaaa
atccaaaatgctacctatagcgacaataacaacatccaaacttggtcgtttataaaccct
ctcaattcttctcaaatcattcaagagagcattaaaaatggggatttaaccatagaagtt
ttaaataaccctaactcggcttccaacactatttttaatatcgcccctgagctttataat
taccaagcttctaagcaaaatcctaccggctatagctatgattatagcgacaatcaagca
ggcacttattacttgacaagcaacattaaaggtcttttcatccctaaaggctctcaaacg
cctcaagccccaggcacttatagcccgtttaaccagcctttgaatagtttgaatatctac
aacaagggcttttctagcgagaatttaaaaacgcttttagggattctttctcaaaattcc
gccaccttaaaagaaatgattgaatccaaccaattagacaatatcactaacatcaatgaa
gtgttgcaactcttagataagattaaaatcacccaagcgcaaaagcaagcgctcctagaa
acgatcaaccatttgactgacaacatcaatcaaacctttaataacgggaatctcgttata
ggcgctactcaagataatgttacaaactctaccagctctatatggtttgggggcaatggc
tatagcagcccttgcacgctagatagcgccacttgttcttcttttagaaacacttacttg
gggcaattattaggctcaacttccccttatttaggctacattaacgctgattttaaagcc
aaaagcatttatattaccgggacaattggaagtggtaacgcctttgaaagcggagggagc
gcggatgtaacctttcaaagcgctaataacttagtgttgaataaagctaatatagaagct
caagccacagacaatatctttaatcttttgggtcaagaagggattgataaaatctttaat
caagggaatttagcgaatgttcttagtcaaatggctatggaaaaaatcaagcaagccggc
ggtttaggaaactttatagaaaacgctctaagccctttgagtaaggaattacccgctagc
ttgcaagatgaaaccttaggccaacttataggtcaaaataacttagatgatttattgaat
aacagtggagtcatgaatgaaatccaaaacattatcagtcaaaaactaagcatttttggt
aattttgttaccccatccatcatagaaaactaccttgctaagcagtctttaaaaagcatg
ctagacgataaagggcttttgaattttatcggtgggtatatagacgcttctgagataagc
tctattttaagcgtgattttaaaggatattactaacccccctacaagcctacaaaaagac
attggtgtggtagcgaacaacttgttgaacgagtttttaggacaagatgtggtcaaaaag
ctagaaagtcaaggtttagtgagcaatatcatcattaatattatttctcaaggcgggttg
agcggtgtttataatcaaggtttagggagcgtgttgccgccctctttacaaaacgcgctc
aaagaaaacgatttaggcgctcttttatcgcctagaggcttgcatgatttttggcaaaaa
gggtattttaactttttaagcaatggctatgtttttgtcaataacagctcttttagcaac
gctactgggggtagtttgaattttgtcgccaacaagtctattatctttaatggcgataat
acgattgactttagcaagtatcagggtgcattgatttttgcttctaatggtgtttctaat
atcaatatcaccaccctaaacgccactaatggcttaagccttaatgcgggcttgaataac
gtgaacgttcaaaaaggagaaatttgtatcaatttagccaattgccctacaaccaaaaac
agctcttctgcaaattctagcgtaacccccaccaatgagtctttaagcgtgcacgctaat
aacttcactttcttaggcgcaatcgcttctaatggggctattgatttgtctcaagtaaca
aataatagcgtcataggcacgctcaatctcaatgaaaacgcgaccttgcaagccaataat
ttaacgatcactaacgcttttgacaacgcctctaactctacggctgatattaatggtaat
ttcactttaaaccaacaagcgactttaagcactaacgctagtggtttgaatgtcatgggg
aattttaacagctatggcgatttggtgtttaacctcagtcattcagttagtcatgccatt
atcaacgctcaaggcgcagcgacgatcatggctaatgacaataaccccttaatccaattc
aacgcttcttcaaaagaaacaggcacttacacgctgattgatagcgctaaagccatttat
tacgggtataacaaccaaatcacaggaggcagcagcctggataattaccttaagctttat
gcactcattgatattaatggcaagcacatggtgatgactgacaacggcttaacctataac
gggcaagccgtgagcgttaaagatggcggtttagttgtaggctttaaggattctcaaaat
caatacatttacacttccattctttataataaagtgaaaatcgctgtttctaatgatcct
atcaataacctacaagcccccactttaaaacaatatatcgctcaaattcaaggcgttcaa
agcgtggatagcatcgatcaagctggaggcaatcaagcgattaattggctcaataaaatc
tttgaaactaaaggaagccctttattcgctccttattatttagaaagccactccacaaaa
gatttaaccacgatcgctggagatattgctaacactttagaagtcatcgctaaccctaat
tttaaaaatgacgccactaatattttacagatcaacacctacacgcagcaaatgagtcgt
ttagccaagctctctgacacttcaactttcgcccgttctgatttcttagaacgcttagaa
gcccttaaaaacaagcggtttgctgatgcgatccctaacgctatggatgtgattttaaaa
tactctcaaaggaatagagttaaaaataatgtgtgggcgacaggagttggaggggctagt
ttcattagtggaggcactggaactttatatggtatcaatatagggtatgaccgattcatt
aagggcgtgattgtggggggttatgccgcttatgggtatagcgggttccatgcaaacatc
actcaatcaggctctagcaatgtcaatgtgggcgtttatagccgagcgtttatcaaaaga
agcgaattaaccatgagcttgaatgagacttggggatacaataaaactttcatcaactcc
tatgaccccctactctcaatcatcaatcagtcttacagatacgacacttggacgactgac
gctaaaatcaattatggctatgatttcatgtttaaagataaaagcgttatttttaaaccc
caagtaggcttaagctattattacattggcttgtccggtttaaggggtattatggatgat
cctatttacaaccaattcagagccaatgctgaccctaataaaaaatccgttctaacgatc
aattttgccctagaaagtcggcattatttcaataaaaactcttattattttgtgattgcg
gatgtgggcagagacttattcattaattctatgggggataaaatggtgcgtttcatcggt
aataacaccctaagctatagagatggtggcagatacaacacttttgccagcattatcaca
ggcggggagataaggttattcaaaaccttttatgtgaatgccggcattggggctaggttt
gggcttgattataaagatattaatattaccggaaatattggtatgcgctatgctttttaa

DBGET integrated database retrieval system