Haemophilus pittmaniae: NCTC13334_00983
Help
Entry
NCTC13334_00983 CDS
T06001
Name
(GenBank) large adhesin
Organism
hpit
Haemophilus pittmaniae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNV72370
LinkDB
All DBs
Position
1:975646..982041
Genome browser
AA seq
2131 aa
AA seq
DB search
MNKIFKVIWNHATQTWTAVSELGHAHGKTKSQKLAKLTAVAGVVIGALAVSQDAMAAVDV
TGSKINVAPNGLPGNTVTDNSIVVGYQNTVQRPGNGNGMTIVGANNTVSGDSALAVGNQN
KAMNGAALAVGAGNTASGEASIAVGNLANATAIRSAAVGNNANAAADGASAYGSRANATG
QDSVAISTNTTASGKNAVAVGSYSTASGRNATAVGTTSKATEERASAFGVLANAEGVNST
ALGQSAHASAQFATAVGDRTQAGAAAVAVGTQANASKQDSIAIGNNATGAWTNTVAVGKD
TIASQDHAIAMGTSANTSGVQAIGIGSYSKAEANSSIAIGQNATVSGVAATAAVAVGYLA
EATAANTFAGGKSAKASVDNAVALGVQSNASARNAAALGAYSAASGERAAAVGAAANASG
KHSTALGTGSSASIENAVALGSDSETAENFVPTNNATVGTVTYSNFAGNTSALGNGAVVS
VGKAGSERQIQNVAAGRINSTSTDAINGSQLYSVTNALVSNPFKFEGLQGSAQVGSTYNY
TPSSSANAILQLVAGTGLKMTEGTVTTDASTGKSYHKFVLSVDPSYVGATGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGETGATGATGATGATGETGATGATGATG
ATGATGATGATGATGETGATGATGATGATGATGATGETGATGATGETGATGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGETGATGATGATGATGATGETGATGATGATGETGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGETG
ATGATGATGATGATGETGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGETGATGATGATGATGATGETGATGATGATG
ATGATGATGATGATGETGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGETGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ETGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ETGATGATGATGATGETGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGETGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGETGATGATGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGATGATGETGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGPKGDTGPEEHVSVVAKDNTVNVDNTARNANGTVKYEVSANTT
NVTVNPNGTTKVDTTNGGTGDNLVNATTVVNAINNASFNVTTGAHVDAVVTDTAGGVTTQ
VKPGSTVTITSGKNVAVNQTVDAQGNPTFVISTTNDVSHNNVTANNVTATNVTAQNVTAN
NVTANNVTAGNTTTTNLTVKNGGNIDMGGNQVHNVANGTNPTDAVNLSQLNATKTVVKEG
NQTKVTATPNATTGGTDYKVDVNTTNLSNNTTDGKITVPSDGGLVTAIDVANAINAAYWK
VGDNAGTVKHNVSAGHQVNFVNGKATSSNVTVEANGVSTVTYDVNAGDGLHIDGNNKLVA
NVTDIQAGDNVTVNNNNGVYTISANNTQASVSTDPNKGITVTPTTNANGTTNYKVTVDID
NDTITVNNQGKLVATASGSTNFNVSTSNAGNKVANKESGTKTTHITGGKTINYAAGKNIA
IDQNNGDILISTTEDVSHNSVTTNDLTVNEGGNINMGGNQVHNVKAGTEDTDAVNVSQLR
SNITNVNNRINKVQKEARGGIAGANAAAGLPQVYIPGKSMVAASAGTFKGESALAVGYSR
SSDNGKVVLKIQGNANTQGDLGGSVGVGYQW
NT seq
6396 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaagatattcaaagttatttggaaccatgccacgcaaacttggaccgcggtgtct
gagttgggtcatgcgcacggcaaaaccaaatcacaaaaacttgccaaattaaccgcagtt
gccggtgtagtgatcggtgcgttggctgtatcacaagatgccatggctgcggtggatgtg
acaggctcaaaaattaacgttgcaccaaatggtttaccgggaaatacggtcaccgataat
tcaattgttgttggttatcaaaatactgtacagcgtccaggcaatggcaatggtatgacc
attgttggtgcaaataacacggtaagtggtgactctgctttagctgtgggtaaccaaaac
aaagcaatgaatggcgctgctttagctgttggtgctggaaatactgcaagtggtgaagcc
tctattgccgtgggtaatcttgctaatgcgacagcaattcgttctgcagcggtaggtaat
aatgctaatgcagcagctgatggtgcgagtgcgtacggtagccgtgcaaatgcaaccggc
caagattctgttgctatttcaactaatactaccgcatcaggtaaaaatgcagttgctgta
ggttcatattctacagcctcaggccgtaatgcaacggcggttggtacaacttctaaggct
actgaagaaagagcttcagctttcggtgttttagccaatgcggaaggtgttaattcgact
gccttgggtcaaagtgcgcatgcttcagcgcagtttgcgaccgctgtgggtgatagaact
caggcgggtgctgcagcagttgcagtaggtacccaagccaatgcttcaaaacaagattct
atcgcaattggtaacaatgcgaccggtgcttggactaatactgttgctgtaggtaaagat
actatcgcaagtcaagaccacgcgattgcaatgggtacaagtgcaaatacttcaggtgtt
caagctatcggtattggttcatacagtaaagcagaagcaaattcatcaattgctattggt
caaaatgcaaccgttagcggtgtagctgcgacagcggcagttgccgttggttatttagct
gaagcaacagcagccaatacctttgcaggtggtaagagtgcgaaagcgagcgttgataac
gctgttgcattgggtgtgcaatccaatgctagcgcacgtaatgcggctgcattaggtgca
tattctgcagcttctggtgagcgtgcagcggctgtaggtgctgcagcaaacgcttctgga
aaacattcaaccgctttaggtacaggttcttctgcaagtatcgaaaatgcggtggctcta
ggttcagattctgaaaccgcagaaaacttcgttccaaccaataatgcaaccgtaggtact
gttacttatagtaactttgcgggtaatactagtgcgttaggtaatggtgcggttgtttct
gtaggtaaagcaggcagcgaacgtcaaattcaaaacgtggcagcaggccgtattaactca
acatcaaccgatgcgatcaacggttctcaactttattctgtaactaatgctcttgtaagc
aatccattcaaattcgaaggtttacaaggttctgctcaagtgggatcaacctataactac
acaccatctagtagtgcgaatgcgatcctacaattagtagccggtaccggtttaaaaatg
accgagggtacagttactacagatgcgagtactggaaagtcataccacaaatttgtgtta
agtgtagatcctagctatgtaggtgcaactggtgctacaggcgcaactggtgctacaggc
gctactggtgctacaggtgcaactggtgctacaggcgcaactggtgctacaggcgcaaca
ggtgcaaccggtgctacaggcgcaaccggtgctacaggcgcaaccggtgcgacaggtgca
accggtgctacaggcgcaaccggtgcgacaggcgcaactggtgctacaggcgcaactggt
gctacaggtgcaactggtgctacaggcgcaacaggtgcgacaggtgctactggtgctaca
ggcgcaaccggtgctactggtgctacaggcgcaaccggtgcgacaggcgcaactggtgcg
acaggcgctacaggtgctacaggcgcaactggtgcgacaggtgctacaggtgcaaccggt
gctacaggcgcaacaggtgcgacaggtgctactggtgcaacaggcgcaactggtgctaca
ggcgcaactggtgctacaggcgcaacaggtgcgacaggtgctactggtgctacaggcgca
accggtgcgacaggcgcaactggtgcgacaggcgctacaggtgctacaggcgcaactggt
gcgacaggtgctacaggcgcaactggcgctacaggtgctacaggcgcaactggtgctact
ggtgcaacaggtgctacaggtgcaaccggtgcaacaggtgaaacaggcgctacaggtgct
actggtgctactggtgcaacaggtgaaactggtgctacaggcgcaactggtgctactggt
gcgacaggtgctactggtgcaacaggtgctacaggtgctacaggtgaaacaggtgctaca
ggtgctacaggtgcaactggtgctacaggtgctacaggcgcaaccggtgaaactggtgca
accggtgcgacaggtgaaactggtgctacaggcgcaactggtgctacaggcgcaactggt
gctactggtgctacaggcgcaactggtgcgacaggtgcaacaggtgcaacaggtgcaaca
ggtgaaactggtgctaccggcgcaacaggtgctacaggcgcaaccggtgcgacaggtgaa
acaggtgcaacaggtgctactggtgcaacaggtgaaactggtgcgacaggtgcgacaggt
gcaactggtgctacaggcgcaacaggtgcaacaggtgcaaccggtgctacaggtgctaca
ggtgcgacaggtgcaactggtgctacaggtgcaaccggtgcgacaggtgcaactggtgct
acaggcgctaccggtgctacaggtgctacaggtgcaaccggtgcaacaggtgaaacaggc
gctacaggtgctactggtgctactggtgctactggtgcaacaggtgaaactggtgctaca
ggcgcaactggtgctactggtgcgacaggtgcgacaggtgcaactggtgctacaggcgca
acaggtgcaacaggtgcaaccggtgctacaggtgctacaggtgcgacaggtgcaactggt
gctacaggtgcaaccggtgcgacaggtgcaactggtgctacaggcgctaccggtgctaca
ggtgctacaggtgcaaccggtgcaacaggtgaaacaggcgctacaggtgctactggtgct
actggtgctactggtgcaacaggtgaaactggtgctacaggcgcaactggtgctactggt
gctacaggtgctacaggtgcaacaggtgctacaggtgctacaggtgaaacaggtgctaca
ggtgcgacaggtgcaactggtgctacaggtgctacaggtgcaactggtgctacaggcgca
actggtgctactggtgctacaggcgcaactggtgcgacaggtgaaactggtgcaaccggt
gcaaccggtgcaacaggtgctacaggcgctaccggtgctactggtgcgacaggtgcaaca
ggtgcaaccggtgctacaggtgctacaggtgctacaggtgcaaccggtgcaactggtgct
acaggcgctaccggtgctacaggtgctacaggtgcaacaggtgctactggtgcaacaggt
gaaactggtgcgacaggtgcgacaggtgcaactggtgctacaggcgcaacaggtgcaaca
ggtgcaaccggtgctacaggtgctacaggtgctacaggtgcaaccggtgcaactggtgct
acaggcgctaccggtgctacaggtgctacaggtgctacaggtgcaaccggtgcaacaggt
gaaacaggtgctactggtgctactggtgctactggtgcaacaggtgaaactggtgctaca
ggtgcaaccggtgcgacaggcgcaactggtgctactggtgctacaggcgcaactggtgct
acaggcgctactggtgcaacaggtgaaactggtgctacaggtgcaaccggtgcgacaggc
gcaactggtgctactggtgctacaggcgcaactggtgcaacaggtgctacaggcgctact
ggtgctacaggcgcaaccggtgctacaggtgcgacaggtgctacaggcgctaccggtgcg
acaggtgaaactggtgctacaggtgctacaggtgctacaggcgcaacaggtgctacaggc
gcaacaggtgctacaggtgctacaggcgcaaccggtgctactggtgcgacaggtgctaca
ggcgcaaccggtgcgacaggtgaaactggtgctacaggcgcaactggtgctacaggcgca
accggtgcgacaggcgcaactggtgcgacaggcgctacaggtgctacaggcgcaactggt
gcgacaggtgctacaggtgcaactggtgctacaggcgcaactggtgcgacaggtcctaaa
ggtgatacaggtccagaagagcatgtaagtgttgtagctaaagataacaccgtaaatgtt
gacaatacggctagaaacgccaatggaacagttaagtacgaagtaagtgctaataccact
aacgtgaccgtaaatccaaacggaactacgaaagtagataccactaatggcggtacaggt
gataacttagtgaacgcaaccacagttgtgaatgcgattaacaatgcatcatttaacgtg
actactggtgctcatgtagatgcagtagtaactgatactgctggcggtgtaacgacacaa
gtgaaaccgggatcaaccgtaactatcacttccggtaaaaacgtagcagtaaatcaaact
gttgatgcacaaggtaatccgactttcgttatctcaacaacgaatgatgtaagtcataac
aatgtgactgcgaataatgtgactgcaaccaacgttacagcacaaaatgtaaccgcgaac
aatgtaactgcaaacaatgtaaccgcaggtaatacaaccacaactaacctaacagttaaa
aatggcggtaatatcgatatgggcggtaaccaagttcataacgtagctaacggtactaat
ccaactgatgcggtgaacttgagccaattgaatgcaaccaaaactgtggtgaaagaaggt
aaccaaactaaagttactgcaacacctaatgcaactaccggcggtacggattacaaagtg
gatgtaaacaccactaacttatccaacaatactaccgatggtaaaatcactgttccgagt
gatggtggtttagtgacagcaattgatgtggctaacgcaatcaatgcagcttactggaaa
gtgggtgataatgcaggtactgtgaaacacaatgtttctgctggtcaccaagtgaacttc
gtaaacggtaaagcaacaagctctaacgttactgttgaagcgaatggtgtaagtactgtg
acttacgatgtgaatgctggcgatggcttacatatcgatggcaataataaattagttgca
aatgttaccgacattcaagctggtgataatgttactgtgaacaataacaatggtgtttac
accatcagtgcaaacaatacgcaagctagcgtaagtactgatccaaacaaaggtatcact
gtaactccaaccactaacgcgaacggtacaactaactataaagtaaccgttgatatcgat
aacgacactattaccgtgaataatcaaggtaaattagtggcgacagcgagtggttcaact
aactttaacgtgtccacatccaatgcgggcaataaagtagccaataaagaaagtggtacg
aagacaacgcatattaccggcggtaaaaccatcaattacgctgcaggtaaaaacattgcg
attgaccaaaacaatggcgatatcctcatctcaacaactgaagatgtaagccataacagc
gtaaccactaacgacttaacagtgaatgaaggcggtaacatcaatatgggtggcaaccaa
gttcataacgtgaaagccggtacagaagatacggatgcagtaaatgtttctcaattacgt
agcaacatcactaacgtgaacaaccgtatcaataaagtacaaaaagaagcccgtggcggt
atcgctggtgctaacgctgcagctggtttaccacaggtttacatccctggtaaatccatg
gtggctgcttctgccggtactttcaaaggcgaaagcgcattagcagtgggttactcacgc
tctagcgacaacggtaaagtggttcttaaaatccaaggtaacgccaacacccaaggcgac
ttgggtggctctgtgggcgtcggttaccaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
