Helicobacter pylori J99: jhp_1084
Help
Entry
jhp_1084 CDS
T00020
Name
(GenBank) putative Outer membrane protein
Organism
hpj
Helicobacter pylori J99
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Alpha-E
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAD06666
UniProt:
Q9ZK57
LinkDB
All DBs
Position
1202095..1205808
Genome browser
AA seq
1237 aa
AA seq
DB search
MIKKAKKFIPFFLIGSLLAEDNGWYMSVGYQIGGTQQFINNKQLLENQNIINSITQSAIN
IAGPTTGLITLSSQTVIDALGYGVSNTVGNQLEGISNILNQIGKRKDFYSSRQISSISQQ
IIGLKGSSDPLKAHSSQITAKLLSNTQSAFDQGIALSSNIISAVNSLNPSNNSQEVKAQL
QNTAQSMAELLQQIEHSITKTTSTTYAQSLLSNLTDAVNASSNNTTYVSALVNALNTLGV
GVFPTTTSTHVVLNPPGQVVFYPTNSLLGSTSSNSNNQQQYNNTLLMNTLQGELSTNNQN
NPNGCANQIQCLEQFIQNLTPLAATPTSTNQANQQVQAIAQKLQSVAINALDNNAINNTT
YNLNNLHNALNFQAYQSTIEQYNNALKQISWISFSEPKNLLKNTSNNYQIGTVTNDQGQN
ISAYDCTSATGSLSSDASSGISCSATSSTNNTNSFDNSLVATSKVQTINGKEQIGVNSFN
LVSQVWSVYNSLKTSEENLQKNAKILCNNGSQSGTSPCNSSSGGLSISGNAQLQNILSPT
NGTTTNTQAKSNASKLKAMVMVNNEEEAKTTNFNQSSGPTTQSSNSTVMGALNTVLQNVS
NFQQSIQSAFQNQENNIQAWANALYNTSNPNGNQSQNLTTNNNQDLRIQLRANFYQLINT
INQQVPTDMNALINQSQQTQQTSGSASTTNNACASGMGSSGNWCYQQWSDSKAYYSGLQS
ALGYQTQATTQNGSSGGSNITYNVQQITLTSGGLLNQIITNLKSVNGGSNGGSSGNGTSQ
INTAYQMLTDASDGKLGTYNSSNSSNSSNSGNNNGYTPCNSTNGSNGTSGSNCYEPNKQQ
NATTATTTTDSNLQKVYNDAQKIANIIASSGNNKGVENGLKQFFEALKSNSSSLSNLCGN
GSSGSSSTCSGGLINLLGAIPTNGVSDTNNLINLLTEFIKTAGFIQNKDSNVSTSLTSAF
QAITSAISQGFQALQNDISPNAILTLLQEITSNTTTIQSFSQTLRQLLGDKTFFMVQQKL
IDAMINARNQVQNAQNQANNYGSQPVLSQYAAAKSTQHGMSNGLGVGIGYKYFFGKARKL
GLRHYFFFDYGFSEIGLANQSVKANIFAYGVGTDFLWNLFRRTYNTKALNFGLFAGVQLG
GATWLSSLRQQIIDNWGNANDIHSTNFQVALNFGVRTNFAEFKRFAKKFHNQGVISQKSV
EFGIKVPLINQAYLNSAGADVSYRRLYTFYINYIMGF
NT seq
3714 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaaagctaaaaaattcataccattctttttaattggctccctcttagctgaa
gacaatggctggtatatgtctgtaggctatcaaatcggtggcacgcagcaattcatcaat
aacaaacaacttttagaaaatcaaaatatcatcaatagcatcactcaaagcgcgatcaac
attgcagggcctactaccggccttatcactttaagctctcaaaccgtcattgacgcttta
ggctatggcgtgagtaacactgttggcaaccaattagagggcatttctaacatcttgaat
caaattggcaaaagaaaagacttttattctagccgtcaaatctctagcatttcccagcaa
atcatagggcttaaaggaagctctgatcccttaaaagcccattcttcacaaatcacagcc
aaactcctttccaacacccaaagcgcgtttgatcagggcatcgctctaagctctaatatc
attagtgcagtcaatagcctaaaccctagcaacaactcccaagaagtcaaagcccagctc
caaaacaccgcgcaatccatggcggaattattgcaacaaattgaacacagcatcactaaa
accactagcaccacttacgcacaatccttactctccaatctgaccgatgcggtgaatgca
tctagcaataataccacttatgtgagcgctcttgttaacgctttaaacactttaggggtg
ggggttttccccaccacaacctcaacgcatgtggtgctaaacccaccgggacaagtcgta
ttctatccaactaattcccttttaggctctacttcttcaaacagcaataaccaacaacaa
tacaacaacacccttttaatgaacaccttacaaggggaattaagcactaacaatcaaaat
aaccccaatggttgcgccaatcaaatccagtgtttagagcaattcatccaaaatttaacc
cctttagccgcaacccccacttcaactaaccaggccaaccagcaagtccaagccatcgct
caaaaacttcaaagcgttgctatcaacgctttagacaacaatgcgatcaacaacaccacc
tataatttaaacaacttgcacaacgctttgaatttccaagcctatcaaagcacgatagaa
caatacaataacgctttaaagcaaatttcgtggattagttttagcgagcctaaaaacttg
ctcaaaaacacttccaataactaccaaatcggcacggttaccaacgatcaagggcaaaat
atcagcgcctatgattgcacaagcgctaccggaagcctttctagcgatgcttctagtggg
atttcatgctcagccacaagctccacaaataacacaaatagttttgacaattctttagtc
gctacctccaaagtccaaaccatcaacggcaaagagcagatcggcgtgaattcttttaat
cttgtctctcaagtgtggagcgtttataactctttaaaaacttcagaagaaaatttgcaa
aaaaacgccaaaatattatgcaacaatggatcgcaatctgggacaagcccatgcaatagc
tcttcagggggtttgagcatcagcgggaacgcccaattgcaaaatattttaagccctact
aatgggactaccactaatactcaagctaaaagcaacgcttccaaactaaaagcgatggta
atggtgaataatgaagaagaagccaaaacgaccaatttcaatcaaagcagtgggccaacc
acacaatcttctaacagcacggtgatgggagctttaaacaccgtattgcaaaatgtcagc
aatttccaacaaagcattcaaagcgcttttcaaaaccaagaaaataatatccaagcttgg
gcgaacgcactttataacactagtaaccctaatgggaatcaatcgcaaaatttaaccact
aacaataaccaagatttacgcatccaattaagggcgaatttttaccagctcatcaatacc
attaaccagcaagtgcctacagacatgaacgctttaattaatcaaagccaacaaacccag
caaacaagcggatcagcaagcaccacgaacaacgcatgcgcgagcggaatggggagtagt
ggcaactggtgctaccagcagtggtccgattctaaggcttattacagcgggttgcaaagc
gctttagggtatcaaacacaagcgacaactcaaaatgggagcagtggtgggagcaatatc
acctacaatgtccaacaaatcacgctcactagcggtggtttgctcaatcaaattatcaca
aaccttaagagcgttaatgggggcagtaatgggggaagcagtgggaatggcactagtcaa
atcaacacagcctaccaaatgctcacagacgctagcgatgggaaattagggacttataat
agtagcaatagtagcaatagtagcaatagtggcaataataacggctatacgccatgcaat
agcaccaacgggagcaatgggacgagtgggagcaattgttatgaacccaacaaacaacaa
aacgccaccaccgcaaccaccacgaccgacagcaatttacaaaaagtctataatgacgcc
caaaaaatagccaatattatcgccagctctgggaacaataaaggcgttgaaaacggctta
aaacaattctttgaagcgttaaaaagtaatagcagcagtcttagtaatttatgtggtaat
ggtagtagcggtagtagctctacttgctccggtgggcttatcaaccttttaggggcaatc
cccacaaacggagtgagcgatacgaataatttaattaatctgctcactgaattcattaaa
accgccgggtttatccaaaataaggatagtaatgtatctactagtcttacaagcgctttt
caagccattacgagcgctatttctcaagggtttcaagccttgcaaaacgatattagccct
aatgcgattttgaccttgctccaagaaatcacttctaacaccaccaccattcagtcattc
tcgcaaaccttacggcagcttttaggggataaaaccttctttatggtgcaacaaaagctc
attgatgcgatgattaacgccagaaatcaggttcaaaacgcgcaaaatcaagccaataac
tacggctctcaacccgttttaagccagtatgcggccgctaaaagcacccaacacggcatg
agcaatggcttaggggttggcataggctataaatacttctttggtaaggctaggaaatta
ggccttaggcattattttttctttgattacggctttagtgaaataggcctagccaatcaa
agcgtgaaagcgaatatctttgcttatggggtaggcacggattttttatggaatctattc
aggaggacttacaacactaaagcgttgaattttgggctatttgccggggtccaactgggc
ggtgcaacttggcttagttccttaaggcaacaaatcattgacaactgggggaacgctaat
gacatccattcaacgaattttcaagtggcgctgaattttggggtgcgcaccaatttcgcg
gagtttaagcgttttgctaagaaattccacaatcaaggggtcatcagccaaaagagcgtg
gaatttgggatcaaggtgcctctcatcaatcaagcgtatttgaatagtgctggggctgat
gtgagctacaggaggctttatactttctatatcaattacatcatggggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system