Helicobacter pylori J99: jhp_1363
Help
Entry
jhp_1363 CDS
T00020
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA POLYMERASE I
Organism
hpj
Helicobacter pylori J99
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
BPA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAD06938
UniProt:
Q9ZJE9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1492476..1495169)
Genome browser
AA seq
897 aa
AA seq
DB search
MEQPVIKEGTLALIDTFAYLFRSYYMSAKNKPLTNDKGFPTGLLTGLVGMVKKFYKDRKN
MPFIVFALESQTKTKRAEKLGEYKQNRKDAPKEMLLQIPIALEWLQKMGFTCVEVGGFEA
DDVIASLATLSPYKTRIYSKDKDFNQLLSDKIALFDGKTEFLAKDCVEKYGILPSQFTDY
QGIVGDSSDNYKGVKGIGSKNAKELLQRLGSLEKIYENLDLAKNLLSPKMYQALIQDKGS
AFLSKELATLERGCIKEFDFLSCAFPSENPLLKIKDELKEYGFISTLRDLENSPFIVENV
PILNSTPILDNTPALDNAPKKSRMIVLESAEPLSMFLEKLENPNARVFMRLVLDKDKKIL
ALAFLLQDQGYFLPLEEALFSPFSLEFLQNAFSQMLQHACIIGHDLKPLLSFLKAKYQVP
LENIRIQDTQILAFLKNPEKVGFDEVLKEYLKEDLIPHEKIKDFKTKSKAEKSELLSMEL
NALKRLCEYFEKGGLEEDLLTLARDIETPFVKVLMGMEFQGFKIDAPYFKRLEQEFKNEL
NVLERQILDLIGVDFNLNSPKQLGEVLYDKLGLPKNKSHSTDEKNLLKILDKHPSIPLIL
EYRELNKLFNTYTTPLLRLKDKDDKIHTTFIQTGTATGRLSSHSPNLQNIPVRSPKGLLI
RKGFIASSKEYCLLGVDYSQIELRLLAHFSQDKDLMEAFLKGRDIHLETSKALFGEDLAK
EKRSIAKSINFGLVYGMGSKKLSETLSIPLSEAKSYIEAYFKRFPSIKDYLNGMREEILK
TSKAFTLLGRYRVFDFTGVNDYVKGNYLREGVNAIFQGSASDLLKLGMLKVSERFKNNPS
VRLLLQVHDELIFEIEEKNAPELQQEIQRILNDEVYPLRVPLETSAFIAKRWNELKG
NT seq
2694 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcagccagtcattaaagaagggactttagctttaattgatacctttgcgtatttg
tttagaagctattacatgagcgctaaaaataagcctttaaccaacgataagggctttcct
acagggcttttaacggggcttgtgggcatggttaaaaaattttataaagacagaaaaaac
atgccttttatcgtgttcgccctagaaagccagactaaaactaaaagagctgaaaaactg
ggcgaatacaaacaaaatcgtaaagacgcccctaaagagatgcttttacaaatccctatc
gccttagaatggttgcaaaaaatgggttttacttgcgtggaggtgggagggtttgaagcc
gatgatgtgatcgcaagtttagccacgctaagcccttataaaacccgcatttattctaaa
gataaggattttaaccagcttttgagcgataaaatcgcgctttttgatggcaaaacggag
tttttggcgaaagattgcgtggaaaaatacgggattttgccgagtcaattcacggattat
cagggcattgtgggggatagcagcgataattacaagggggttaaaggcattgggagcaag
aacgctaaggaattgttgcagcgattagggagcttggaaaaaatctatgaaaatttagac
ttggcgaaaaatttactcagccctaaaatgtatcaagccttgatacaagacaaaggaagc
gcctttttaagcaaagaattagccactttagaaagaggatgcattaaagaatttgatttt
ttaagttgcgcttttccgagcgaaaaccccttgttgaaaatcaaagatgaattgaaagaa
tatggtttcatttctaccttaagggatttagaaaattcccctttcattgtagaaaacgtg
cccatattaaacagcacgcctatattagacaatacccccgccttagacaacgcccctaaa
aaatcgcgcatgattgttttagaaagcgctgagcctttgagcatgtttttagaaaaatta
gaaaaccctaacgctagggtttttatgcgtttggttttggataaagacaaaaaaattcta
gccctagcgtttttattacaagatcaaggctattttttacctttagaagaggcgttgttt
tcgcccttttctttggaatttttacaaaacgctttttctcaaatgttacagcatgcgtgt
atcattgggcatgatttaaagcctttattaagctttttaaaagccaaatatcaggtgcct
ttggaaaatatccgcatccaagacactcagattttagcgtttttaaagaatccggaaaaa
gtggggtttgatgaggttttaaaggaatatttaaaagaagatttaatcccgcatgaaaag
atcaaagattttaagacaaaaagtaaggcggaaaaatcagaacttttaagcatggaatta
aacgccttaaagcgtttgtgcgaatactttgaaaaaggggggctagaagaggatttgctc
actttagctagagacattgaaacgccgtttgtgaaagttttaatgggcatggaatttcaa
ggctttaagattgatgcgccttatttcaagcgcttagagcaggagtttaagaatgaatta
aacgttttagagcgccaaattttggatctaatcggcgtggatttcaacctcaattcgccc
aagcaacttggcgaagtcttgtatgataaattagggcttcctaaaaataaaagccactct
accgatgaaaaaaacttgttaaaaatcctagacaagcacccaagcatccctttgatttta
gaatacagggaattgaataagctttttaacacttacacgacccccttattgcgcttaaaa
gacaaagacgataaaatccataccactttcatccaaaccggcacagctaccgggcgttta
agctcgcattcgcctaatttgcaaaatatcccggtgcgatcgcctaaaggcttactcatt
cgtaagggttttatcgctagctctaaagaatattgtttattaggggtggattattcgcag
attgaattacgcttgttggcccatttcagccaggataaggatttaatggaagcgttttta
aaggggcgagacatccatttagaaacttctaaggcgttgtttggagaagatttagccaaa
gaaaaacgatccatcgctaaaagcattaattttgggctggtgtatggcatggggagtaag
aaattgagcgaaactttaagcatccctttaagtgaggctaaaagttacatagaagcgtat
ttcaagcgattccctagcattaaagattatttgaatggcatgcgagaagagattttaaaa
acttctaaagcttttactttgctggggcgttaccgggtgtttgattttaccggcgtgaat
gattatgtcaagggcaattatttgcgagagggcgtgaatgcgatttttcaagggagtgcc
agcgatttattgaaattaggcatgcttaaagtgagcgagcgtttcaaaaacaacccttcg
gtgaggctgcttttgcaagtgcatgacgaattgatttttgaaattgaagaaaaaaacgcc
ccagagttgcagcaagaaatccaacgcattcttaatgatgaagtctatcctttgagggtg
ccgttagaaacaagcgcgtttatcgctaagcgttggaatgaattaaaaggttag
DBGET
integrated database retrieval system