Halanaerobium praevalens: Hprae_0026
Help
Entry
Hprae_0026 CDS
T01941
Name
(GenBank) two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family
Organism
hpk
Halanaerobium praevalens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
Response_reg
Sigma54_activ_2
AAA_5
HTH_8
AAA_2
HTH_28
AAA
HTH_29
HTH_23
Mg_chelatase
AAA_3
HTH_17
AAA_PrkA
AAA_19
bpMoxR
nSTAND3
AAA_16
HTH_Tnp_IS630
SLFN-g3_helicase
HTH_Tnp_1_2
HTH_30
AAA_7
MerR
Peripla_BP_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADO76187
UniProt:
E3DLK7
LinkDB
All DBs
Position
36213..37520
Genome browser
AA seq
435 aa
AA seq
DB search
MKKILIVDDKKNICRVLTAILAAENYLVDSANDPLKAVEKAKKFKPDLIISDIKMPGLNG
LEFYQLLLQNNLDLKLIFMTAFGSIPMAVEAIKMGASEFLTKPIDYEELKLKIRNLLFDN
QSNIASHYTEKYPKIIGQSQAIIDLIEKIDLAADYSSTVLIQGESGTGKELVAQALHYHS
QRATEKFVAVNCAALGRNLIESELFGHRKGAFTGAISDKKGKFEIADGGSILLDEISEID
LDIQAKLLRVLQEKEFEKVGENRTIKSDVRVIATTNQNLAEMVKNNKFREDLYYRLNVIP
IFMPPLRARKEDIKLLVDFFIDKICEKEKIVKKTISQEAIDVLKQHNWPGNVRELEHVIE
RLIITNRSEKISALAVYNELPKSKLEAAKSGLTEKEKLIEALKIAKGNKTEAAKILAISR
RTLYNWLQKYGLEEA
NT seq
1308 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattctaatagttgatgacaaaaagaatatctgtcgagttttgactgcaatt
ttggcagctgaaaattatcttgttgactctgctaatgatcctttaaaagctgttgagaaa
gctaagaaatttaagccagatttaattatttcagatattaaaatgcctggtttaaatggt
ttagaattttaccaacttctattgcaaaataatttggatttaaaattaatatttatgact
gcttttggtagtattccaatggctgttgaggcaattaaaatgggggcttcggaattttta
actaaaccaattgattatgaagagttaaaattaaaaattcgtaatttattatttgataat
caaagtaatattgcttctcattatactgaaaaatatcctaaaattattggtcagagtcag
gcaattatagatttaattgaaaaaatagatttagcagcagattatagttcaacagtttta
attcaaggagagagtggaactggcaaagagcttgtagctcaagctttacattatcacagt
cagagagctaccgaaaagtttgttgctgttaattgtgctgctttaggtaggaatttaatt
gaatcagagttatttggccaccgtaaaggagcttttacaggtgctataagtgataagaaa
ggaaaatttgaaatagcagatggtggtagtatacttttagatgaaatcagtgaaattgat
ttagatattcaggcaaaacttttacgtgttttacaagaaaaagaatttgaaaaagttggt
gaaaataggacaattaaaagtgatgtgagagtaattgcaactactaatcaaaatttagct
gaaatggtaaaaaataataaatttagagaagacctttattatcgtttaaatgtgattccg
atttttatgcctcctttaagagccagaaaagaagatattaaattattagttgattttttt
atagataaaatttgtgagaaagaaaaaattgtaaagaaaacaattagccaagaagctatt
gatgtcttaaaacagcataattggccagggaatgtaagagaattagaacatgtaatagag
cgtttaataattacaaacagaagtgagaaaatatctgctttagctgtttataatgagctg
ccaaagagtaaattagaggctgctaaatctggtttaacagaaaaagagaaattaattgag
gctttaaaaatagcaaaagggaataaaacagaagcagctaaaattttggcaatctcgaga
aggactctttataactggctgcaaaaatatggtttagaagaagcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
