Halanaerobium praevalens: Hprae_0868
Help
Entry
Hprae_0868 CDS
T01941
Name
(GenBank) type II secretion system protein E
KO
K02652
type IV pilus assembly protein PilB
Organism
hpk
Halanaerobium praevalens
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hpk00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
hpk02044
]
Hprae_0868
02035 Bacterial motility proteins [BR:
hpk02035
]
Hprae_0868
Secretion system [BR:
hpk02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
Hprae_0868
Bacterial motility proteins [BR:
hpk02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
Hprae_0868
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T2SSE
MshEN
AAA_22
AAA_23
nSTAND3
AAA_14
ResIII
AAA_16
AAA_11
cobW
AAA_7
AAA_19
AAA_29
ABC_tran
DEAD
NTPase_1
SLFN-g3_helicase
AAA_30
AAA
DUF87
Zeta_toxin
CbiA
AbiEii
Herpes_TK
NACHT
Yippee-Mis18
AAA_18
SRP54
RNA_helicase
SMC_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADO77022
UniProt:
E3DRI1
LinkDB
All DBs
Position
972047..973717
Genome browser
AA seq
556 aa
AA seq
DB search
MQSFYDFLINQYQIPTKAQVKLFNLTQNENLKSLIDFIKTKNIISEKNLLTAMANYFDFK
LYKDFKIKNNKIELPLLELEQVEKYKIIIINKTKSLISFGTLYPPDLFLEEKLKFKFKVQ
VKFYLMSKKEFYQLKDSIYSSYFKVDQQELLKEFSDFKKIDSRDIDSLKNIVEDAPIVKL
LNKILTEAIAVKASDIHLEKKENYFKIRYRVDGILKTYYKLPVKISAAVISRIKIISAMD
ITIRHLPQDGKMEFKFQGAIYDIRTSVIPTIYGEKAVLRLLLRNENLLQVKELNFSKHNL
KRFKQILKFNSGIILVSGPTGSGKTTTLFSILNELATEKNNIITVENPVEYKLDLLNQIE
INKAQGLKFPIILRSILRQDPDIIMIGEIRDQETAQIAVRAAVTGHLVLSTIHTVDSISA
VIRLIDMGIPPYLISSTLNAVIAQRLLLKLCSNCKEKIRLQPKYKTIFKEKDINYSYQPV
GCKKCNDGHLGRIPTAEILIINNQIRNIINQNSNYSKLKQAAVASGMMTLAQSSLEKLKN
GIVAKDELLRVINFSA
NT seq
1671 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaagcttttatgattttttaattaatcaatatcaaattccaactaaagcccaagta
aagttatttaatttaactcaaaatgaaaatttaaaaagtttaattgattttattaaaacc
aaaaacataatttcagaaaagaatttgttaacagcaatggctaattattttgattttaaa
ttatataaagattttaaaataaaaaataataaaattgaattacctcttttagaattagaa
caagtagaaaaatataaaattataataattaataaaacaaaatcactgatttcttttggc
actctttatcctccagatttatttttagaagagaaattaaagtttaaattcaaagtgcaa
gttaaattttatttaatgtcaaaaaaagaattttatcaactaaaagattctatttatagc
agttattttaaagttgatcaacaggaattattaaaagaatttagtgatttcaaaaaaatt
gatagtagagacattgatagtcttaaaaatatagtggaagatgctccaattgttaaatta
ttaaataagattttaacagaagcaatagctgtaaaagcaagtgatatacatttagaaaaa
aaagaaaattattttaaaattagatatagagttgatggtattttaaaaacttattataaa
ttaccagttaaaatttctgctgctgttatttcacgcatcaaaattatttctgcaatggat
ataacaattaggcatttaccccaagatggaaaaatggaatttaaattccagggagctatt
tatgatatcagaacttctgtaattcctacaatttatggagaaaaggcagttttgagatta
ttattgagaaatgaaaacttattacaagttaaagaattaaattttagtaaacataattta
aaaagatttaagcaaattttgaaatttaattcaggtattattttagtctctgggccaaca
ggaagtgggaaaacaactactttattttcaattttaaatgaattagccacagaaaaaaat
aatattattactgttgaaaatccagttgaatataaacttgatttattaaatcaaatagag
ataaataaagctcaaggattaaaattcccaataattttaagatcaattttaagacaagat
ccagatattataatgattggagagattagagatcaagaaacagctcaaattgctgtcaga
gctgcagttacaggtcatttggttttaagtactattcatacagtagatagtatatcagct
gtaattcgcttaatagatatgggaataccaccttatttaatcagcagtactttaaatgca
gttattgctcaaaggttattacttaagctttgctctaactgcaaagaaaaaataagactt
cagcccaaatataaaacgatatttaaagaaaaagatataaattatagttatcagcctgta
ggctgtaaaaaatgtaatgatggtcatttaggcagaatacctacagctgaaattttaatt
ataaataatcaaattagaaatataattaatcaaaattctaactattctaaattaaaacaa
gcagcagtggcttcaggaatgatgactttagctcaatcctctcttgaaaaattaaaaaat
ggaattgttgcaaaagatgagcttttgagagtaataaatttcagtgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
