KEGG   Helicobacter pylori B8: HPB8_1273
Entry
HPB8_1273         CDS       T01262                                 
Symbol
vacA5
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
hpl  Helicobacter pylori B8
SSDB
Motif
Pfam: VacA2
Other DBs
NCBI-ProteinID: CBI66830
UniProt: D7FF73
LinkDB
Position
complement(1241225..1249990)
AA seq 2921 aa
MKKFKKKPKSIKRSHQNQKTILKRPLWLTPLLIGGFAGGVYADGTDILGLSWGEKSQRVC
VHHPWYALWSCDKWEEKTQQYTGNQLITKTWAGGNAANYYHTQNNQNITANLKNDNGTYF
LSGLYNYTGGEYNGGNLNIELGSNATFNLGASSGNSFTSWYPNGHTNVTFSAGTINVNNS
VEVGNRVGSGAGTHTGTATLNLNANKVTINSNISAFKTSQVNIGNANSAITINSVSLNGD
TCSSLASVGVGANCSSLGPSYSFKGTTNATNTTFSNANGSFTFEENATFSGAKWNGGTYT
FNKEFNATNNTAFNSGSFNFKGASSFNGDSFSNASYTFENQATFQNSSFNGGTFTFNNQT
NQSAQHPQIQNSSFSGGDTTLKGFVNFQQAFNNSNHQLTIQNASFNNANFNNTGKITINE
GASFNNTSFNTSINTNNMSVTGGVTLSGKNDLKNGSTLDFGSSQVTLTQGTTFNLTSLSS
EKSVTILNSSGGITYNNLLNHAINGLTNALKTTESPSKPQSFAQGLWDMITYNGVTGQLL
SENATTPKPADSSPSAPTKDSPQVYQVGYKIGDTIYKLQETFSPNSIIIQALESGTYTPP
PVINGSKFDLSASNYINADMPWYDHKYYIPKSQNFTESGTYYVPSVQIWGSYTNSFKQTF
SANGSNLVIGYNATWTGNSVSSSGTVSFGDTSGSALNGHCGPWPYYQCTGTTNGAYSAYH
VYITANLRSGNRVGTGGAANLVFNGVDSINIANATITQHNAGAYSSSMTFSTQNMDNSQN
LNGLNANGTLSVYGTTFTNEAKDGKFIFNAGQAVFENTNFNGGSYQFSGDSLNFSNSNQF
NSGSFEISAKNASFNNANFNNSASFNFNNSSATTSFVGDFTNAHSNLQIAGNAVFGNSTN
SDGSQNTANFNNTGSVNIAGNATFDNVVFNSPTNTSVKGKVTLNNITLKNLNAPLSFGDG
TIVFSAHSVINIDQTITNGNPITLVSSSKEIEYNNAFSKNLWQLINYQGHGASSEKLVSS
AGNGIYDVVYSFNNQTYNFQEVFSPNSISIRRLGVGMVFDYMDMEKSDHLYYKDVVGFMT
YMPNSYNNNLGNSNNTIYYYDKSIDFYASGKTLFTKAEFSQTFTGQNSTIVFGAKSIWTN
ASDAPQSNTIIRFGDNKGAGSNDASGHCWNLQCIGFITGHCWNLQCIGFITGHYEAQKIY
ITGSIESGNRISSGGGASLNFNALQGILLTNATLYNRAAGTQSSSMNFISNGANIQAQNS
YFIDDTAQNKGNPNFSFNALNLDFSNSSFRGYVGATQSVFKFNAKNAINFTNSTNLSSGL
YQMQAQSVLFDNSNLSVSVGTSSIKANAINLSQNASINASNHSTLELQGDLNLNDTSSLN
LNQSTINVSNNATINDYASLIASNGSHLNFNGAANFNSANITTSLSDSSIVFKGAVSLGG
QFNLSNNSSLDFQGSSAITSNTAFNFYDNAFSQSPITFHQALDIKAPLSLGGNLLNPNSS
SVLNLKNSQLVFGDQGSLNIANIDLLSDLNDNKNRVYNIIQADMNSNWYERISFFGMRIN
DGIYDAKNQTYSFTNPLNNALKITESFKDNQLSVTLSQIPGIKNTLYNIGSEVFNYQKVY
NNANGVYSYSDDAEGVFYLTSNVKGYYNPNQSYQANGSNNTTKNNNLTSEPSVISQTYNA
QGNPISALHIYNKGYNFNNIKALGQMALKLYPEIKKILGNDFSLSSLSDLKGDALNQLTK
LITPSDWKNINELIDNANNSVVQNFNNGTLIIGATKIGQTDTNSAVVFGGLGYQKPCDYT
DIVCQKFRGTYLGQLLESSSADLGYIDTTFNAKEIYLTGTLGSGNAWGTGGSASVTFNSQ
TSLILNQANIVSSQTDGIFSMLGQEGINKVFNQAGLANILGEVAMQSINKAGGLGNLIVN
TLGSDSVIGGYLTPEQKNQTLSQLLGQNNFDNLMNDSGLNTAIKDLIRQKLGFWTGLVGG
LAGLGGIDLQNPEKLIGSMSINDLLSKKGLFNQITGFISANDIGQVISVVLQDMVKPSKA
LQSDVAALGKQMIGEFLGQDALNSLESLLQNQQIKSVLDKVLAAKGLGSIYEQGLGDLIP
NLGKKGLFAPYGLSQVWQKGDFSFNAQGNVFVQNSTFSNANGGTLSFNAGNSLIFAGNNH
ISFTNHAGTLQLLSDQVSNINITTLNASNGLKINAANNNVSVSQGNLFVNASCAQQSEPT
AANAANPCTLTTQSANNASSNNASNNAPIALNNNDESLMVTANDFNFSGNIYANGVVDFS
KIKGSANIKNLYLYNNAQFQANNLTISNQAVLEKNASFMANDLNIQGAFNNNATQKIEVL
QNLTIASNASLSTGIYGLGVGGALNNLGTIHFNLENSQTPVNPLIQAEGIINLNTTQTPF
INVNNVMANNTTYTLLKSSRYIDYNINPNSLQSYLKLYTLININGNHIEEKNGALTYLGQ
RVLLQDKGLLLSVALPNSNNASQNHILSLSVLHNQIKMSYGNKIMDFTPPTLQDYIVGIQ
GQSALNQIEAVGGNAIKWLSTLMMETKENPLFAPIYLKNHSLNEILGVTKDLLNTASLIS
NPNFRDNATNLLELASYTQQTSRLTKLSDFRAREGESDFSERLSELKNKRFSDPNPGEVF
VKYSQPSKHKNNLWVQGVGGASFISGGNGTLYGLNVGYDRLVKNVILGGYVAYGYSGFNG
NIMHSLGNNVDVGMYARAFLKRNEFTLSANETYGGNATSINSSNPLLSVLNQRYNYNTWT
TSVNGNYGYDFMFKQKSVVLKPQVGLSYHFIGLSGMKGKMNDAAYKQFLMHSNPSNESVL
TLNMGLESRKYFGKNSYYFVTARLGRDLLIKSKGGNTVRFVGENTLLYRKGEVFNTFASV
ITGGEMHLWRLMYVNAGVGLKMGLQYQDINITGNVGMRVAF
NT seq 8766 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaagtttaaaaagaaaccaaaaagtatcaaacgatcgcatcaaaatcaaaaaaca
atcttaaagcgtcctttatggcttacacctttactgatcggtgggtttgctggtggggtg
tatgcggatggaacggatattttagggcttagttggggggaaaaaagccaaagggtatgc
gtgcatcatccatggtacgctttatggagctgcgacaaatgggaggaaaaaacccaacaa
tacacaggaaaccaactcatcacaaaaacttgggcagggggtaatgcggctaactactac
cacactcaaaacaaccaaaacatcacagccaatttaaaaaatgataacggcacttatttt
ttaagcggtctgtataactacaccggaggggaatataatggggggaatttaaatattgaa
ttaggcagtaacgctacttttaatctaggtgcgagtagtgggaatagcttcacttcttgg
tatcctaatgggcatactaatgttacttttagcgctgggactatcaatgtgaataacagc
gtagaagtgggcaatcgtgtgggatcgggagctggcacgcacaccggcacagccacttta
aacttgaacgctaataaggttactatcaattctaatatcagcgcgtttaaaacttcgcaa
gtgaatataggcaatgctaacagcgccattaccattaattcggtttctttaaatggggat
acttgcagttctttagctagtgtgggcgtaggggctaattgctccagtttagggcctagc
tattcttttaaaggcacgactaacgctactaacacgacttttagcaatgcaaacggcagt
ttcacttttgaagagaacgccacttttagcggggcgaaatggaatggggggacttatact
tttaataaagaatttaacgctaccaataacaccgcctttaatagcggtagttttaatttt
aaaggcgcaagttcctttaatggcgattcgtttagtaacgcttcctatacttttgagaat
caagccacctttcaaaacagctcctttaatggggggacttttacttttaataaccaaacc
aatcaaagtgctcagcacccccaaattcaaaacagctcttttagtggtggcgataccact
cttaagggctttgtgaatttccaacaagcctttaacaattcaaaccaccaactaacgatc
caaaacgcttcctttaataacgctaattttaacaataccggtaaaatcaccattaatgag
ggtgcgagttttaacaacacttcgttcaacacttctattaatacaaacaacatgagtgtt
accggtggcgttactttaagcggtaagaatgatttgaaaaatggctcaacccttgatttt
gggagttctcaagttaccctcactcaagggacgactttcaacctcacaagtttaagcagt
gagaagagcgtaacgattttaaactctagcggtgggatcacttataacaatcttttaaac
catgcaatcaacggcttgacaaacgccttaaaaacaactgaaagcccttcaaagccgcaa
agtttcgctcaaggtttgtgggatatgatcacttacaatggggttaccggacagcttttg
agcgaaaacgctacgacacctaaacccgctgactcttcgccctctgcacccactaaagac
tccccacaagtctatcaagtgggctataaaataggggatactatctacaaactgcaagaa
acttttagccctaattccattattatccaggctttagagagcgggacttacacgccaccc
cctgtcattaacggctccaaatttgacttatccgcttcaaattatattaatgctgacatg
ccttggtatgatcataaatattacatccccaaatcccaaaattttacagagagcgggact
tattacgtgccgagcgttcaaatatgggggagctacactaactcgtttaaacagaccttt
agtgcgaatggtagtaatctggtgattgggtataacgcaacatggactggaaatagcgtt
tcttctagcggcacggtgtcttttggggacacttcagggagcgctcttaacgggcattgc
gggccttggccctattaccaatgcacaggcacgactaatggcgcttatagcgcctatcat
gtgtatatcacagcgaatctgcgttctggcaatcgtgtaggcaccggtggggcagccaat
ctcgtctttaatggggtagatagtattaatatcgccaacgctactatcacgcagcataac
gccggggcttattcaagctccatgactttttccacgcaaaacatggacaattcgcagaat
ttgaatggcctaaacgctaacggcacgctttcggtgtatggcaccactttcactaacgaa
gctaaagatgggaaattcattttcaatgcagggcaagcggtttttgaaaacaccaacttt
aatggagggagttatcaattcagcggcgatagcttgaatttttcaaacagcaaccagttc
aatagcggttcgtttgagattagcgcaaaaaacgcttcgtttaataacgctaactttaac
aatagcgcttcttttaatttcaataattctagcgcgaccacttcgtttgtgggggatttc
actaacgctcattcaaatttgcaaatcgctgggaacgctgtttttgggaactctaccaat
agtgatggctctcaaaataccgctaattttaataataccggctctgttaatattgcaggg
aatgcaacttttgataatgtggtatttaacagccctacgaacacgagcgtgaaagggaaa
gttactctcaataacatcactttaaaaaacctgaacgcccctttgtcttttggcgatgga
acgattgtttttagcgctcattcggttatcaatattgatcagactatcacaaatggcaac
cctatcacccttgtaagctcttctaaagaaattgaatacaacaacgcttttagtaaaaat
ctgtggcagctcatcaactaccaagggcatggggctagcagtgaaaaactcgtctctagc
gcgggtaatggtatttatgatgtggtgtattctttcaataaccaaacctacaatttccaa
gaggttttttcacccaacagcatttctatccggcgtttgggcgttggcatggtgtttgat
tatatggatatggaaaaatcggatcatttgtattataaagatgttgtcggttttatgact
tacatgcccaatagctataacaataatttagggaattcaaacaacaccatttactattac
gacaagagcattgatttttatgcgagcgggaaaactttattcactaaggcggaattttct
caaacattcaccgggcaaaacagcacgatcgtttttggggctaaaagcatatggacgaat
gcgagcgatgcaccacaatctaacaccatcattcgctttggggacaataagggagcaggg
agtaatgatgcgagcgggcattgctggaatttgcaatgcataggctttatcacagggcat
tgctggaatttgcaatgcataggctttatcacagggcattatgaagcgcaaaagatttac
atcaccggcagtattgaaagcgggaatcgcatttctagcggtgggggcgcgagccttaat
tttaacgcccttcaaggcattcttttaacgaacgcgactttgtataaccgcgccgctggg
acgcaaagctcatctatgaattttatctctaacggtgcgaacattcaggctcaaaactcc
tattttatagatgataccgcgcaaaataaaggcaaccctaatttcagtttcaacgctttg
aatctggatttttccaacagctcttttagaggctatgtgggggcaacgcaatctgttttt
aaattcaatgccaagaatgcgatcaatttcaccaacagcacgaatttaagctctggtttg
tatcaaatgcaagctcaaagcgtgttgtttgacaattccaatttaagcgtttcagtgggg
acaagcagcattaaagccaatgcgatcaatctttctcaaaatgcctctatcaatgcgagc
aaccattcaaccttagaacttcagggcgatttgaatttaaacgacaccagctcgctcaac
ctcaaccaaagcacgattaatgtttccaataacgccacgatcaacgattatgcgagcttg
attgcgagtaatggctctcaccttaattttaacggagcagccaatttcaattcagcgaat
attactacgagtttgagtgattcctctatcgtgtttaagggagcggtctctttaggaggg
cagtttaatttaagcaataactcttctttagattttcaaggctctagcgctattacctct
aacacggcgtttaatttctatgataacgctttttctcaaagccccattactttccatcaa
gcccttgacattaaagcgcccttaagtttgggaggcaaccttttaaaccctaacagcagt
agcgtgttgaatttgaaaaacagccagcttgtttttggcgatcaagggagtttgaatatc
gctaacattgatttactaagcgatctaaacgataataaaaatcgtgtgtataacatcatt
caagcggacatgaatagtaattggtatgagcgtatcagcttctttggcatgcgcatcaat
gacgggatttatgatgctaaaaaccaaacttatagtttcactaacccccttaataacgcc
ctaaaaatcactgagagctttaaagacaaccagctaagcgttacgctctctcaaatcccg
ggcattaaaaacacgctttataacattggctctgaagtctttaactaccaaaaagtttat
aacaacgctaatggcgtgtattcttatagcgatgacgcagaaggcgtgttttatctcact
agcaatgtgaaaggctattacaaccccaaccaatcctatcaagctaacggcagcaataac
accacgaaaaataacaatctaacctctgagccttctgtcatttcgcaaacctataacgcg
caaggcaaccctattagcgcgttgcacatctataacaagggctataattttaataatatc
aaagcgttaggccaaatggccctcaaactctaccctgaaatcaaaaagatattggggaat
gatttttcgctttcaagtttgagcgatttaaaaggcgatgcgctaaaccagcttaccaaa
ctcatcacgcctagcgattggaaaaacattaacgagttgattgataacgcaaacaattcg
gtggtgcaaaatttcaataacggcactttgattataggagcgactaaaatagggcaaaca
gacactaatagcgcggtggtttttgggggcttgggctatcaaaagccttgcgattacacc
gatattgtgtgccaaaaattcagaggcacttatttagggcagcttttggagtctagctcg
gctgatttgggctatattgacacgacttttaacgctaaagaaatttatcttaccggcact
ttagggagcgggaacgcatgggggactggggggagcgctagcgtaacttttaacagccaa
acttcgctcattctcaaccaggctaatatcgtaagctcgcaaaccgatgggatctttagc
atgctgggtcaagagggtattaataaggttttcaatcaagccgggctcgctaatatttta
ggcgaagtggcaatgcaatccattaataaagccgggggattagggaatttgatagtaaat
acgctagggagtgatagcgtgattggggggtatttaacgcctgaacaaaaaaatcaaacc
ctaagccagcttttggggcagaataattttgataacctgatgaacgatagcggtttgaat
acagcgattaaggatttgatcagacaaaaattaggcttttggaccgggctagtgggggga
ttagccggactagggggcattgatttgcaaaaccctgaaaagctcatagggagcatgtcc
atcaatgatttattgagtaaaaaagggttgtttaatcagatcaccggctttatttccgct
aacgatatagggcaagtgataagcgtggtgttgcaagatatggtcaaaccgagtaaggct
ttacaaagtgatgtagcggctttaggcaaacaaatgattggcgaatttttaggccaagac
gcgctcaattctttagaaagcttgttgcaaaaccagcagattaaaagcgttttagacaaa
gtcctagcagctaaaggtttggggtctatttatgaacaaggcttgggggatttgatacct
aatcttggtaaaaaagggcttttcgctccttatggcttgagtcaagtgtggcaaaaaggg
gattttagtttcaacgcgcaaggcaatgtttttgtgcaaaattccactttctctaacgcc
aatggaggcacgcttagctttaacgcaggaaattcgctcatttttgccggaaacaatcat
atctcattcactaaccacgctggaacgcttcaattattgtccgatcaagtttctaacatt
aacatcaccacgcttaacgctagcaacggccttaagattaacgccgctaataacaatgtt
tctgtgtctcaaggcaatctgtttgtcaacgctagttgcgcacaacaaagcgaaccaact
gcagctaacgctgcaaacccttgcacgcttaccacccaaagcgcaaataacgcttcttct
aataatgcgtcaaataacgcgccaatcgccttgaacaataacgatgagagtttgatggtt
acggcgaatgatttcaatttttcaggcaatatttacgctaacggggtggtggatttttca
aagattaaaggttctgcaaacattaaaaacctgtatctttacaataacgctcaattccaa
gccaacaacctcacgatttccaatcaagcggtgttagaaaaaaacgccagctttatggcc
aatgatttaaacattcaaggagcgtttaacaacaacgccacgcaaaaaatagaggtgctt
caaaatttaacgatcgcttcaaacgcttctttaagcaccgggatttatgggttaggagta
gggggggctttgaataatttgggaacgatccattttaatttagaaaattctcaaacgcct
gtaaatccgctcattcaagcagaggggatcatcaatctcaacaccacccaaacgcctttt
atcaatgtcaataatgtcatggccaataacacgacttacactttattaaaaagcagccgt
tacattgattacaatatcaaccctaatagcttgcaatcgtatttgaagctctatacctta
atcaatatcaacggaaaccatatagaggaaaaaaacggtgcattgacttatttgggtcaa
cgggttttgttgcaagataaggggttattattaagcgtagcgttgcctaactcaaataat
gcctctcaaaaccatattttaagcctttctgttcttcacaatcagattaaaatgtcttat
ggcaacaagatcatggattttaccccgcctaccttacaagattacattgtgggcattcaa
gggcaaagcgcgctcaatcaaattgaagctgttggggggaacgctatcaagtggctttca
acattgatgatggagactaaagaaaacccgctttttgcaccgatttatttaaaaaaccac
tctttgaatgaaatcttaggcgtaacaaaagatcttttaaacaccgcgagcttgatttct
aaccctaattttagggataacgctaccaaccttttagaattggcgagttacacccaacaa
accagccgtttaaccaaactttctgattttagggctagagagggagagtctgatttttct
gagcgcttgtcagagcttaaaaacaagcgtttcagcgatcctaatcctggagaggttttt
gtcaaatactctcaacctagcaaacacaaaaataacctttgggttcaaggggtgggagga
gcgagctttatttctgggggcaatggcacgctttatggcttgaatgtgggctatgatcgg
ttggttaaaaatgtgatccttgggggttatgtggcttatgggtatagcggttttaatggg
aacatcatgcattctttgggtaataatgtggatgtggggatgtatgctagggctttttta
aaaaggaacgaattcactttgagcgcgaatgaaacttatggaggcaatgcaactagtatc
aattcttctaatcctttgctttctgtgttgaaccaacgctacaactacaacacctggaca
acgagcgtgaatgggaattacggctatgatttcatgttcaaacaaaaaagcgtggtgtta
aaacctcaagtgggcttgagctatcattttataggcttgagtgggatgaaaggcaaaatg
aatgatgccgcttacaaacaatttctcatgcattcaaacccctctaatgaatcggtttta
acgcttaacatggggttggagagccgtaaatattttggtaaaaattcttattattttgta
acggcgagattgggtagggatcttttgatcaaatctaaaggcggcaatacggtgcgtttt
gtgggtgaaaacactttattgtatcgcaagggggaagttttcaacacttttgcgagcgtg
atcacaggaggcgaaatgcatttgtggcgtttgatgtatgtgaatgcgggggtggggctt
aagatgggcttgcaataccaagacattaatataactgggaatgtgggcatgcgagtggcg
ttttag

DBGET integrated database retrieval system