Helicobacter pylori B8: HPB8_1539
Help
Entry
HPB8_1539 CDS
T01262
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
hpl
Helicobacter pylori B8
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ResIII
DEAD
SLFN-g3_helicase
BKACE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBI67096
UniProt:
D7FFY9
LinkDB
All DBs
Position
1508463..1511375
Genome browser
AA seq
970 aa
AA seq
DB search
MAKKKDLTTDNEIFVAQKLAEEELNTNEINEPLERLDFKSFDSNKELLDYQQQALINAFR
MLVAYFRDFKENKKEFYAFYQKHYSFAHCDFAKKKLNPLLKSHFKVENHCVSFENFINRL
AFYMATGSGKTIVIIKLVELLSVAIRMGLIPKKNIMFFSANENLIKQFEKEIEKYNRGKD
YFKQIDFKSLKSVTHKDFHHAPKGSFIEKIPLFYYRADLMNDEESKENLLNYKDYWDNGE
NYVILDEAHKGNKSESKRQAIFSLLSLKGFLFNFSATFTEESDLITAVYNLSVGEWVKLG
YGKESVLLKKNNLNAFKELKDLNDREKEIALLKALLLLGMQKRYQTEGYFYDPLMLVFTH
SVNVKNSDAEIFFKTLARVIENDDGSDFLKAKEDLLEELKNPEFLFSDDKDKGYKVKVFK
ESLKSMDFKGLKEEVFYANNGHIEVIINPKNNQEIAFKLNTSDKVFCLIRIGDITEWICE
KLKSVKVVSKNLSFKEESYFSQIDKSSINILVGSRTFETGWDSTRPSVILFLNIGLDDDA
KKLVKQSFGRGVRIESVKNQRQRLAYLDIDKAVKKALKPNAAMLETLFVIPTNYASLEAI
LKFQKESENKGENRGSWREIKLEKTPIKHALFVPCYRKEQTSILKLPESASFKMSAKNFK
DLKEYFNLMSEKHFILKHEIYDPKDYAQLKEMIQEAHFKKVSTWHYKDLDCMISEIKGKL
YPNQKVPKDEFNALDSEKIVHFKRIKVKADKKEELVKTIQEVKEYAPLDKETLIKKIAQG
EIDPYDTEKHKQDKTFKVGDDAELLKLKEHYYTPLIKAKNCDWLKHVVKVKSESDFLEEL
LKITETLQENYDFWAFSKIDEHLDNLFIPYIDNSTGERKFFPDFIFWLEKGDTQIICFID
PKGIKISDYQHKADAYKLFKDKVFSSKDDPNLKIKVVLKFYGNKDGVGERYRDDWIKEGE
LKDFFLTLIA
NT seq
2913 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaagaaaaaagatttaaccaccgataacgaaatttttgtcgctcaaaaactcgct
gaagaggaactgaacactaacgagattaacgagccattagaaaggctagactttaaaagc
tttgatagcaataaggagcttttagattaccaacagcaagccttgattaacgcttttaga
atgcttgtcgcttattttagagatttcaaagagaataaaaaagaattttacgcgttttat
caaaaacattattcattcgctcattgcgatttcgctaaaaagaaactcaatcctttgtta
aagagccattttaaggtggaaaatcattgcgtgagttttgaaaattttatcaaccgctta
gccttttacatggccacagggagcggtaaaacgattgtcattatcaaactggtagagctt
ttaagcgtggctataagaatgggtttaatccctaagaaaaatatcatgttttttagcgcg
aatgaaaatttgatcaagcaatttgaaaaagaaattgaaaaatacaaccggggtaaggac
tattttaagcaaattgatttcaaaagccttaaaagcgttacccataaggattttcatcac
gctccaaaaggttctttcatagaaaaaatccctcttttttattaccgcgcggatttaatg
aatgatgaagaaagcaaggaaaaccttttaaattataaggattattgggataatggggaa
aactatgtgattttagatgaagcgcataaggggaacaagtctgagagcaaaagacaagcg
atttttagcctgctgtctttaaaagggtttttattcaatttcagcgccactttcaccgaa
gagagcgatctcatcactgcggtgtataatttaagtgtgggcgagtgggtgaagcttggc
tatggtaaagagtctgttttattgaagaaaaacaacttaaacgcttttaaggaattgaaa
gatttaaacgatagggaaaaagaaatcgcgcttttaaaagcgttgttgcttttaggcatg
caaaaacgctatcaaacagaaggctatttttacgaccctttaatgctcgtgttcacgcat
tctgtgaatgttaaaaacagcgatgcggaaatcttttttaaaactttagcgcgcgtgatt
gaaaatgacgatggaagcgattttttaaaagctaaagaagatttattagaagaattaaag
aatccggaatttctttttagcgatgacaaagataaaggctataaggttaaggtttttaaa
gagagcttaaagagcatggattttaaaggcttaaaagaagaagttttttatgctaacaac
gggcatattgaagtgatcattaaccctaaaaacaaccaagaaatcgctttcaagctcaac
acaagcgataaagtcttttgcttgattagaataggcgacattaccgaatggatttgtgaa
aaattaaagagcgtgaaggtggtgagcaagaatttgagctttaaagaagagagctatttc
agccagattgataagagcagtatcaatatcttagtggggtctcgcacttttgaaaccggg
tgggatagcacaaggcctagcgtgattttatttttaaatatagggcttgatgatgatgct
aaaaagctggtgaaacaatcttttggcaggggcgtaaggattgaaagcgtcaaaaaccaa
cgccaaaggttagcgtatttagacatagataaagccgttaaaaaagccttgaaaccaaac
gctgcaatgctagaaacgctttttgtgatacccactaattatgcaagccttgaagcgatt
ttaaagttccaaaaagagagcgaaaataagggtgagaatagaggttcttggcgtgaaatc
aaattagaaaaaacgcccataaaacacgccttattcgtgccttgctaccgcaaagaacaa
acaagcattcttaaacttcctgaaagcgcttcgtttaaaatgagcgcaaaaaattttaag
gatttaaaagagtattttaatttaatgagcgaaaagcattttattttaaagcatgaaatt
tatgaccctaaagattatgcgcagttaaaagaaatgatacaagaagcgcattttaaaaag
gtatcaacttggcattataaagatttagattgcatgatttctgaaattaaaggcaagcta
taccctaatcaaaaagtgcctaaagacgagtttaacgccctagatagtgagaaaatcgtg
cattttaaaaggattaaagttaaggcggataaaaaagaagaattggttaaaaccattcaa
gaagtgaaagagtatgcgcctttggataaagaaaccctaataaaaaaaatcgcgcaaggc
gagatcgatccttatgatacagaaaagcacaaacaagacaaaacctttaaagttggtgat
gatgccgagctgttaaaactcaaagagcattactacaccccactcattaaagccaaaaac
tgcgattggcttaagcatgtggttaaagtaaagagcgagagcgattttttagaagaattg
ttaaagattacagaaacgctgcaagaaaactatgatttttgggcgttcagcaagattgat
gagcatttagacaatttgtttattccctatatagacaacagcactggagaaaggaagttt
ttccctgattttatcttttggctagaaaaaggcgatacgcagatcatttgtttcattgat
cctaaggggatcaaaatttctgattaccaacataaagcagatgcgtataaactttttaaa
gataaggtttttagctctaaagacgatcccaatctcaaaatcaaagtggttttaaaattt
tatggaaataaggatggtgtgggggagcgttatagagatgattggattaaagaaggggaa
ttaaaagatttttttctgaccttgatagcctaa
DBGET
integrated database retrieval system