Helicobacter pylori B8: HPB8_1681
Help
Entry
HPB8_1681 CDS
T01262
Symbol
pcrA
Name
(GenBank) putative ATP-dependent helicase
Organism
hpl
Helicobacter pylori B8
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
Cas_Cas4
ResIII
AAA_30
DEAD
Phage_Mu_Gam
XRCC4_CC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBI67238
UniProt:
D7FGD1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1639942..1642779)
Genome browser
AA seq
945 aa
AA seq
DB search
MDTKRQCMALKASAGSGKTFALSVRFLALLFKGANPSEILTLTFTKKATAEMKERILDYL
KILQKENLENEKEKSQNILKELEEKYHLDPSLVRNSAPKIYQRFLNAEVRISTIDAFFQS
ILRKFCWFVGLSANFEVNEDTKVHQRQLNEGFLSALNNEQLEELSAFIVQCLSYDSYTSD
SILERLRFLKNKLYLFDPNKKEPVFDEESFLEKLRSLNNQIQSIETASDRAKEAIKCDSF
RGFLNSSLTWLEKKSEYIYFKKLKDEIPTLESECEEIENDLKRYYEARETALFKKFPKFI
QLYDKATSKIQALDFDAIKDKVHVLLNGYEEMPAEFFYFRLDSKIAHILIDEFQDTSLND
YKILAPFIDEIKAGIGQAKWHRSVFFVGDVKQSIYAFRGSFSSLFESVSKDFYHDNLQFN
HRSAPLIINYVNTIFKKAYQNSPTAYLEQKYPKTSQNKHVTEGYVKVSLVADERELLLDQ
VLQEAQNLLDHHIDPKDITILCATNKDALEIKNYLQENLSAIRPSTESSAKLSQFVESKI
IKNALRYALAEEPYKPFYKHSVLKLAGYLHDDVIALAGFNPKKESVAGFVWKIMELFELY
GEPAQICLELAVGCEDADGFLEKLEAKSIASFNAKGAQIMTIHKSKGMQFPYVIVCERLG
KPNSSHSNQLLEEYDGAELLRLYYRMKNREVVDKDYARALDKEEAAKDHEETNVYYVAFT
RAELGLIVVAKDKKESKKESKNKTMREQLDLVPLEEGEIMPVISPQKEPLITSALIKPHA
YGEQVQEIEEEPSDYEKNNDQEAINFGIALHKGLEYQYAYNIPKKSVLEYLNYHHGFYGL
DYQALEESLELFENDAEIQALFKNHALKGEAAFLFEGVVSRIDVLLWDKGQNLCVLDYKS
SQNYQQSHKAQVSHYAEFLKTQAPHFKIQAGIIYAHKRLLEKLWV
NT seq
2838 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatacaaaaagacaatgcatggctttaaaggcttcagcagggagcgggaagactttc
gctttgagcgtgcggtttttggccctattgtttaagggggctaatcctagcgagatttta
acgctcactttcactaaaaaagccaccgccgaaatgaaagagcgcattttagactattta
aaaattttgcaaaaagaaaaccttgaaaatgaaaaagaaaaatcccaaaatatcctaaaa
gaattagaagaaaaataccatttagaccctagtttggtgcgaaatagcgctccaaaaatc
taccaacgctttttaaacgctgaagtgagaatcagcactattgatgcgttttttcaaagc
attttaaggaaattttgctggtttgtggggttgagcgcgaattttgaagtcaatgaagac
accaaagtgcaccagcgacagcttaatgagggttttttgagcgctttaaataacgaacag
cttgaggaattgagcgcttttatcgtccaatgcttaagctatgatagttacacaagcgat
tctattttagagcggttgcgttttttaaaaaacaagctctatttatttgatcccaataaa
aaagagcctgtatttgatgaagagagttttttagaaaaactaagaagcttaaacaaccaa
attcaaagcatagaaacagcgtcagatagggctaaagaagccattaaatgcgatagtttt
aggggatttttaaacagctctttaacctggcttgaaaaaaagagcgaatacatctatttc
aaaaaattaaaagatgaaatccccactttagagagcgaatgcgaagagattgaaaacgat
ctaaaacgctattatgaagccagagaaaccgcattatttaaaaaattccctaaattcatc
cagctttatgataaggccacctctaaaatccaagccttagattttgatgcgattaaagat
aaggttcatgtcttattgaatggttatgaagaaatgccggcggagtttttttatttcagg
ttggacagcaagatcgcgcacattttgattgatgaatttcaagacacgagcttgaacgat
tataagattttagccccttttattgatgagattaaagccggaatagggcaagctaaatgg
cacaggagcgtgttttttgtgggcgatgtcaagcagagcatttatgcctttagggggagt
tttagttctttgtttgaaagcgtttctaaggatttttaccacgataatttacaattcaac
caccgcagtgcgcctttgattattaattatgtgaataccatttttaaaaaggcttatcaa
aattcccccaccgcttatttggagcaaaaataccctaaaacttctcaaaataaacatgtt
acagaaggctatgttaaagtctctttagtggctgatgaaagagaattgctattagatcag
gtcttacaagaagcccaaaaccttttagatcatcatattgatcctaaagacattaccatt
ttatgcgccaccaataaggacgctttagaaatcaaaaattatttgcaagagaatttgagc
gccattcgcccaagcacggaatctagcgcaaaattgtctcaatttgtagagtctaaaatc
attaagaacgctttaagatacgctctagcggaagaaccttacaagcccttttataagcac
agcgttttaaaactcgctggatacttgcatgatgatgtgatcgctttagctggttttaac
cccaaaaaagagagcgtggcaggctttgtgtggaaaattatggaattgtttgagctttat
ggagagcctgcacaaatctgcctagaattggcggttgggtgcgaagacgccgatggattt
ttagaaaaattagaggctaaatcgatcgcttctttcaatgcaaaaggtgcacaaatcatg
accattcacaaatctaaaggcatgcaattcccttatgttatcgtatgcgaacgcttgggc
aagcctaattcaagccattccaatcaactccttgaagaatatgacggcgcagagcttctt
cgcctttattacagaatgaaaaatcgtgaggtcgtggataaagattacgctagggcttta
gacaaagaagaagcggccaaagatcacgaagaaaccaatgtgtattatgtcgcattcact
agggctgagttagggctgattgtcgtagccaaagacaaaaaagaaagcaaaaaagaaagc
aaaaacaaaacaatgcgcgaacaattggatcttgtgcctttagaagagggagaaattatg
ccggttatttctcctcaaaaagagcctttaattacaagcgctctcatcaagccccatgcc
tatggcgagcaagtccaagagatagaagaagagcctagcgattatgaaaagaataacgac
caggaagcgatcaattttggtatcgctttgcacaaggggttagaataccaatacgcttat
aatattcctaaaaaaagcgttttagaatatttaaactaccatcatggtttttatggtttg
gattatcaagcgttagaagagagtttagagctttttgaaaacgatgcagagatacaagct
ctttttaaaaatcatgccttaaaaggcgaagcggcttttttatttgaaggggttgtgtct
aggattgatgttttattgtgggataaggggcaaaatttgtgtgttttagattataaaagc
tctcaaaattaccagcaaagccataaggctcaagtgtctcattacgctgagtttttaaaa
actcaagccccccattttaagatacaagcgggcattatttacgctcataaaagactgctt
gaaaaattatgggtctga
DBGET
integrated database retrieval system