Helicobacter pylori SJM180: HPSJM_04655
Help
Entry
HPSJM_04655 CDS
T01323
Name
(GenBank) outer membrane protein HopC
KO
K15843
outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hpm
Helicobacter pylori SJM180
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADO02514
LinkDB
All DBs
Position
935414..936961
Genome browser
AA seq
515 aa
AA seq
DB search
MMKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGTKRDELARELNADV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPEKLNGNDVSANALLGGAVGSGTCAAAG
TAGSNSLTTQSACTAAGYYWLPSLSDRVLSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAANVF
FNAMNKALEAKNGTSGASGATGQNGQTYSQDAIKYLQGQQNILNNAANLLKQDELLLEAF
NSAVAANIGNKEFNSAVFTGLVQGIIDQSRSVYNELSKNPISGSAANSAGIDSNQANAVQ
GRANQLSNALYNAQVTLDKINALNNQVRSMPYLPQFRAGNSRATNIMNGFYTKVGYKQFF
GKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMGFF
SGIQLAGETVQSTLRDDPNVKLHGKVNNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHTVEF
GVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq
1548 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagatgatggagggttcttcaccgtcggttatcagctcggacaggttatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcactaaaagagacgaactcgcaagagagcttaacgctgatgta
acgaacaacattttaaacaacaacactggaggcaatgtcgcaggggcgttgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggggcgtatccagagaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttagggggcgcggtaggcagtgggacttgcgcggctgcaggg
acggctggtagcaattctcttaccactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctccctagcctttctgacagggttttaagcacaatcggcagccagactaactacggcacg
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcggcgaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaagctttagaggccaaaaatggaactagtggagctagtggtgcg
actggtcaaaatggtcaaacttactctcaagacgctattaaataccttcaaggccaacaa
aatatcctcaataacgcagctaacttgctcaagcaagatgaattgcttttagaagctttc
aactctgccgtagccgccaacattgggaataaggaattcaattcagccgtttttacaggt
ttggtgcaaggcattattgatcaatctcgatcggtttataacgaactgagtaaaaacccc
attagcgggagcgcggctaatagcgctgggatagatagcaaccaagctaacgctgtgcaa
gggcgcgctaatcagctctctaacgctctttataatgcgcaagtaactttggataaaatc
aatgcgctcaataatcaggttaggagcatgccttacttgccccaattcagggccgggaac
agccgtgcaacgaatatcatgaacgggttttacactaaagtgggctataagcaattcttc
gggaagaaaaggaatatcggtttgcgctattatggtttcttttcttataacggagcgagc
gtgggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtggggactgat
gtgttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatgggttttttt
agcggtatccaattagccggtgagaccgtccaatccacgctcagagatgaccccaatgtg
aaattgcatgggaaagtcaataacacgcacttccagttcctctttgacttcggtatgcgg
atgaacttcggtaagttggacgggaaatccaaccgccacaaccagcacacggtggaattt
ggcgtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggactaccgtgaag
tatttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
