Helicobacter pylori SJM180: HPSJM_06665
Help
Entry
HPSJM_06665 CDS
T01323
Name
(GenBank) putative heavy metal efflux pump CzcA
KO
K07787
copper/silver efflux system protein
Organism
hpm
Helicobacter pylori SJM180
Pathway
hpm02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hpm00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
HPSJM_06665
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hpm02000
]
HPSJM_06665
Transporters [BR:
hpm02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
HPSJM_06665
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
DUF5367
Med15_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADO02897
LinkDB
All DBs
Position
1331773..1334880
Genome browser
AA seq
1035 aa
AA seq
DB search
MIEKIIDLSVKNKLLTTLVTLLIFLASLWAIKSVRLDALPDLSPAQVVVQITYPNQSPKI
VQEQVTYPLVSTFMSIANIDTVRGISSYESALIYIIFKDGVNLYWARDRVLEQLNRVGNL
PKDAKVEIGSDSTSIGWAYQYALSSGSKNLSDLKVLQDFYYRYALLGVDGVSEVASVGGF
VKDYEVTLQNDSLIRYNLSLEQVANAIKNSNNDTGGGVILENGFEKIIRSHGYIQSLKDL
EEIVVKKEGAIPLKIKDIASVRLVPKPRRGAANLNGDKEVVGGIVMVRYHADTYKVLKAI
KEKIATLQASNPDVKITSVYDRSELIEKGIDNLIHTLIEESVIVLIIIAIFLLHFRSALV
VIITLPLSVCISFLLMRYFNIEASIMSLGGIAIAIGAMVDAAIVMVENAHKHLQRIDTKD
DIQRVNAIMQGVKHVGGAIFFALMIIVVSFLPIFALTGQEEKLFAPLAYTKTFAMLVGAL
LSITMVPILMVWLIKGRILEESKNPINAFFMKIYGVSLNIVLKFRYAFLIASVLGLGGLY
LAYKKLNWEFIPQINEGVIMYMPVTINGVGIDTALEYLKKSNAAIKQLDFVKQVFGKVGR
ANTSTDAAGLGMIETYIELKPQNEWKEKLSYKEVRDKLEKTLQLKGLTNSWTYPIRGRTD
MLLTGIRTPLGIKLYGNDTDKLQELAILMEQQLKTLKESLSVFAERSNNGYYITLDLNDE
NLARYGINKSAVLDAIKFALGGATLTTMIKGVESYPISLRLEDTERNTIEKLKNLYVKTA
YNYMPLRELAHVYYDNSPAVLKSEKGLNVNFIYIVPQNGISSDTYRQLAIKALEKIQLPN
GYYYEFSGESQYLEEAFKTLQYIVPVSVFIIFILIVFALKNFTNSLLCFFTLPFAFLGGL
IFMNLMGFNMSVAALVGFLALLGVASETAIVMIIYLEDAFQKFIKTPLKEQTTTALKEAI
MHGAVLRVRPKLMTFFSILASLIPIMYSHGTGSEIMKSIAAPMLGGMISSVVLTLFIIPT
AYFVIKNARIRKHEY
NT seq
3108 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagaaaaaatcattgatttaagcgttaaaaacaaactccttaccactttagtcact
ctactcatttttttagcctctttgtgggcgataaaaagcgttcgtttagacgctttgcca
gatttaagccccgctcaagtggtcgtgcaaatcacttaccccaatcaaagccctaaaatc
gtgcaagagcaggttacttacccgctggtttctactttcatgagtatcgctaacattgac
acggttagggggatttctagctatgaaagcgctctgatttacatcatttttaaagacggc
gtcaatttgtattgggctagggatagggttttagagcaattaaaccgagtgggcaatttg
cctaaggacgctaaagtggaaatagggagcgattccacttctattggctgggcgtatcaa
tacgctctatctagcggcagcaagaatttaagcgatttgaaagtcttgcaagatttttat
taccgctatgcgcttttaggggttgatggggtgagtgaggtcgcaagcgtggggggcttt
gtaaaagattatgaagtaacgcttcaaaacgattctttgatccgttataacttgagtttg
gagcaagtcgctaacgcaattaaaaattccaataacgataccggtgggggggttatttta
gaaaacgggtttgaaaaaattataagatcgcatggctatatccaatctttgaaggattta
gaagaaattgtggttaaaaaagaaggggctatccctttaaaaatcaaagatatagccagc
gttaggctagtgccaaaaccacgcagaggagcggctaatctcaatggcgataaggaagtg
gtaggcgggattgtgatggtgcgctatcacgctgacacttataaggtgcttaaagccatt
aaagaaaaaatcgccaccttacaagcgagtaaccctgatgtgaaaatcaccagcgtgtat
gacaggagcgaattgattgaaaaaggcattgacaatttgatccacacgctcatagaagaa
agcgtaattgtgttaatcattattgcgattttcttactgcatttcaggagtgctttagtg
gtgattatcactctgcctttaagcgtgtgcatcagtttcttgctcatgcgttatttcaat
attgaagcgagtatcatgagtttaggtggcattgcgatcgctataggggcgatggtggat
gcggctattgtgatggtagaaaacgctcataagcatttgcagcgcattgatacaaaagat
gatatccaaagggttaatgctatcatgcaaggggttaagcatgtggggggcgcgatattt
tttgctttaatgattattgtggtttctttcttgccaatttttgcgctcaccggccaagaa
gaaaagctttttgcccctttagcttacaccaaaacctttgccatgctagtgggagcgttg
ctttctatcaccatggtccctattttaatggtatggctcattaaagggcggattttagaa
gagtctaaaaaccccattaacgcttttttcatgaaaatttatggcgtgagtttgaatatt
gtgcttaagttcagatacgcttttttgatagcgagcgtcttaggtttagggggcttgtat
ctagcgtataaaaaacttaattgggaatttatccctcaaatcaatgaaggggtaatcatg
tatatgcctgtaaccattaatggcgtgggtattgataccgctttagaatatttgaaaaaa
agcaatgccgctatcaaacaactggattttgtcaaacaggtttttggtaaagtggggcgc
gctaacaccagcaccgatgctgccggtttaggaatgatagaaacctacattgaattaaag
ccgcaaaacgagtggaaagaaaagctcagctataaagaagttagggacaaattggaaaaa
accttacaattaaaaggcttgactaattcatggacttaccccattcgtgggagaacggac
atgctcttaaccggcattagaacgcccctaggcatcaagctctatggcaatgacacggac
aaattacaagaattggcgatccttatggagcaacagctcaaaaccctaaaagagagttta
tccgtctttgccgagcgatccaataatggctactacatcacgctggatttgaacgatgaa
aatttagctcgctatggcatcaataaaagtgccgtgttagatgcgattaaattcgctttg
ggcggagccacgctcacgaccatgattaaaggcgtagaaagctaccctatttccttacgc
ttagaagacacagaaagaaacaccattgaaaaattaaaaaatctctatgtcaaaaccgct
tacaattacatgcccttaagggaattagcccatgtgtattacgacaactcgccggcggtg
ttaaagagcgaaaagggcttgaacgtgaattttatctatattgttccgcaaaatggtatc
agctctgacacttacagacaactagcgataaaagcactagaaaaaatccaattgcctaac
gggtattattatgaattcagcggcgaaagccagtatttagaagaagcgtttaaaacctta
caatacatcgtgccggtgagcgtgtttatcatttttattttaattgtctttgcgttaaag
aatttcactaattccttattatgctttttcactctgccttttgcgtttttgggggggttg
atttttatgaatctcatgggatttaacatgagcgtggcagcgctagtgggctttttagcc
cttttgggggtagcgagcgaaacggctattgtgatgattatttatttagaagacgcattt
caaaaattcatcaaaacccccttaaaagagcagacgactaccgccttaaaagaagctatc
atgcatggggcggtgcttagggtaaggcccaagctgatgaccttttttagcattttagct
tcgctcattcctatcatgtatagccatggcacaggtagtgagatcatgaaatccatcgct
gcgcccatgctagggggcatgataagcagcgttgttttaacgctttttattatccctacg
gcgtattttgtgattaagaacgctaggatcaggaaacatgaatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
