Helicobacter pylori 35A: HMPREF4655_21146
Help
Entry
HMPREF4655_21146 CDS
T01892
Name
(GenBank) outer membrane protein
KO
K15843
outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hpo
Helicobacter pylori 35A
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADU41239
LinkDB
All DBs
Position
1136223..1137776
Genome browser
AA seq
517 aa
AA seq
DB search
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGTKRDELARELNADV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPEKLNGNDVSANALLGGAVGSGTCAAAG
TAGGNSLNTQSACTAAGYYWLPSLSNRVLSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAANVF
FNAMNKALEAKNGTNGASGATGQNGQTYSQNAIKYLQGQQNILNNAANLLKQDELLLEAF
NSAVAANIGNKEFNSAVFTGLVQGIIDQSQSVYSELNKNPISGSAFNNATNNQLTNQANA
VQGRANQLSNALYNAQVTLDKINALNNQVRSMPYLPQFRAGNSRSTNILNGFYTKVGYKQ
FFGKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMG
FFSGIQLAGETFQSTLRDDPNVKLHGKVNNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHTV
EFGVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq
1554 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagatgatggagggtttttcaccgtcggttatcagcttgggcaagtcatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcactaaaagagacgaactcgcaagagagcttaacgctgatgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcgttgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggggcgtatcctgagaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttagggggtgcggtaggcagtgggacttgtgcggctgcaggg
acggctggcggcaattctcttaacactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctcccaagcctttctaacagggttttaagcacgatcggcagccagactaactacggcacg
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcagcgaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaagctttagaggccaaaaatggaactaacggagctagtggtgcg
actggtcaaaatggtcaaacttactctcaaaatgctattaaatatcttcaaggccaacaa
aatattctcaataacgcagccaacttgctcaagcaagatgaattgctcctagaagctttc
aactctgccgtagccgccaacattgggaataaggaattcaattcagccgtttttacaggt
ttggtgcaaggcattattgatcaatcccaatcggtttatagcgagctcaataaaaacccc
attagcgggagcgcgtttaataacgctacaaataaccaactaactaaccaagctaacgct
gtgcaagggcgcgctaaccagctctctaacgctctttataacgcacaagtaactttggat
aaaatcaatgcgctcaacaatcaggttagaagcatgccttacttgccgcaattcagagcc
gggaacagccgttcaacgaatattttaaacgggttttacactaaagtgggctataagcaa
ttcttcgggaagaaaaggaatatcggtttgcgttattatggtttcttctcttataacgga
gcgagcgtgggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtgggg
actgatgtgttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatgggc
ttttttagcggtatccaattagccggtgagactttccaatccacgctcagagatgacccc
aatgtgaaattgcatgggaaagtcaataacacgcacttccagttcctctttgacttcggt
atgcggatgaacttcggtaagttggatgggaaatccaaccgccacaaccagcacacggtg
gaatttggcgtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggactacc
gtgaagtatttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
