KEGG   Helicobacter pylori P12: HPP12_0454
Entry
HPP12_0454        CDS       T00786                                 
Symbol
virD4-1
Name
(GenBank) VirD4 coupling protein
Organism
hpp  Helicobacter pylori P12
Pathway
hpp03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hpp00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    HPP12_0454 (virD4-1)
SSDB
Motif
Pfam: T4SS-DNA_transf TrwB_AAD_bind TraG-D_C ART-PolyVal DEAD
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACJ07610
UniProt: B6JL32
LinkDB
Position
complement(476105..477832)
AA seq 575 aa
MREKFKTLRDKFKDKTSNLFHKLNSIQKDYYTKTLPKACKDVFTLGSSKSYPMTLNFNKG
FCVGLYKGLNSLKPTYYDAPLSTLIIAPPGSGKTAAVAVPNLLSVPSSCVVLDIKGELFD
LTAGYRQQVLKNKIFVFDPLGNDNTLKFNPFDKRIVEKLDFNRKRRLVDEVGNTIFAEDG
ANKDPHWTQQAKNLFVFYALYDLCVHNTSTFFEIASAPIKNYVPLINPQSRFYTELYECQ
SSDNGFVKENGRYMAKVENGVKKMKPNANVELLWYKQVAEQVYTDPENPKNYDGSVNHLE
KDDQGNVIMKEGMLDPIIRNEANKWAKANDKEFASIKSVYSRFMQVFTSYQVKSATDSMS
FEYEDLRADNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRILLESIAKNLLLKESKKFEERVYLFLDEFV
RFGKLPFLLEMPALSRSYGVVLIFITQPNALIEKYYGREDARIVNSTVAYKIIFKMDDLE
YAKQVSEEVGKMTRKTRSHSTEKGQLITGGTSSIGKEAWDLLSAQDIMNIDKDEVIVLVS
GHKAKPLKLKANYYFKNKELLSRINWEVKPNEEVF
NT seq 1728 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagagaaaaattcaaaacattaagagataaatttaaggataaaaccagcaatttattc
cataagcttaatagcattcaaaaagattattacactaaaactctccctaaggcttgcaaa
gatgtctttacgctaggttcttctaagagttatcctatgaccttaaattttaacaaaggt
ttttgtgtggggctgtataaaggtttaaattcgcttaagcctacttattatgatgctccg
ctttctactttaattatcgctcctcctggaagtggtaaaaccgcagctgtggctgtgcct
aatcttttaagtgtgcctagctcttgtgtggtgttagatattaaaggggagttgtttgat
ttaacggctggttacagacaacaagttctaaaaaataaaatttttgtatttgatccttta
ggaaatgataacacgcttaaattcaatccgtttgataaacgcattgtagaaaaattagat
tttaacagaaagcgaaggcttgtagatgaagtgggtaatactatttttgctgaagatggg
gcaaataaagaccctcattggacacagcaagctaaaaatttatttgtcttttacgctctt
tatgatttgtgtgtgcataacactagcaccttttttgaaattgcaagcgctcctataaaa
aattatgtccccttaatcaatccacaaagccgattttatactgaattatatgaatgccaa
agtagcgataatggttttgttaaagagaatgggcgttatatggctaaagtagaaaatggc
gttaaaaaaatgaaacctaatgccaatgtggaattgctatggtataaacaagtagccgaa
caagtctatactgacccagaaaatcctaaaaattatgatggatctgtgaatcatttagaa
aaagacgatcaaggcaatgttataatgaaagagggtatgttagatcctattattagaaac
gaagcgaacaaatgggctaaggcgaatgataaagagtttgcgagcattaaatcagtttat
agccgttttatgcaagtctttacaagctatcaagttaaaagcgctacagatagcatgagt
tttgaatacgaggatttaagggctgacaatatttcactctatattaaaatcgctcaaaca
gatattgacacactcgcaccgcttatccgtatccttttggaaagtattgctaaaaatctt
ttattgaaagagagtaagaaatttgaagaaagggtttatctctttttagatgaatttgtg
cgttttggtaaattgccttttttattagaaatgccagcattaagtaggagctatggtgtg
gttttaatttttatcacgcaacccaacgctcttattgaaaaatattatggcagagaagat
gcaagaattgttaatagcaccgtggcttacaaaataattttcaaaatggatgatttagaa
tatgctaaacaagtgagcgaagaagtcggtaagatgactagaaaaacacgaagccactct
acagaaaaaggacaactcattaccggagggacttctagcataggtaaagaggcgtgggac
ttattgagcgcgcaagatattatgaatattgataaagatgaagtgatcgttttagtaagc
ggtcataaggctaaacccttaaaattaaaagcgaattattatttcaaaaacaaagaatta
ctctctcgtattaactgggaagtcaagcccaatgaagaagtgttttga

DBGET integrated database retrieval system