Haemophilus parainfluenzae: PARA_08630
Help
Entry
PARA_08630 CDS
T01605
Name
(GenBank) unnamed protein product
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
hpr
Haemophilus parainfluenzae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hpr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hpr02000
]
PARA_08630
Transporters [BR:
hpr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PARA_08630
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_head
YadA_anchor
ESPR
Collagen
Trp_ring
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBW14970
UniProt:
A0AB33QL80
LinkDB
All DBs
Position
857033..863710
Genome browser
AA seq
2225 aa
AA seq
DB search
MNKVFKVIWNHATQTWTAVSELGHAKGKTKSKKIVKLTALAGAVIGSLAASQSVMAATDL
RTNDAVNIAADNVANPTAGREAIAVGQNANASHQHSIAIGRNATANWTNTISIGKDTVST
KDHAVAIGTSANASGIQAVTVGSYARTDANSSIALGQNATVSGTGSTAAVAVGFLANASA
ANTVAAGKSATATVDNAVALGVSSSATDRNALALGGYAAASGERAAAVGAASKASGTASF
AGGTSANASGANSVAVGGSMTPAEAAQASGENSIAVGANSNASGDNSIAQGKGANAAVEN
SIAIGTNASATGISIGNEASTNVDYSIAIGHKSNVVGDQGVAVGNNATNSAASFAAAVGA
DSAANANYSAALGYSAVADAEHSVSLGAASKANAEYSVSLGAASEAGEDFVESRSAEING
VKYEGFAASTSDFGAGAVVSVGKAGSERQIKNVAAGRVKSNSTDAINGSQLYAVADVLAT
KINKQHWNVGNNDGAVVNGVYHEDQVNFVNGNVTTVKVVKAPSKSSTPDGGPNITNVSYD
VNVGKGLKIEDKKIVANFVAGTGITFDTKGDEITINAKSTGGAASSVVSGDNNTLSVKQN
ATNPSEYIVTPITGSLSISKDEKGKVGDDADGNKDNGKKLTTIQTTRDMINKAHWNLQIG
TSSDPKNSGESEIASADQNAEPIHAGDTVNFFAGKNIKLKRQGSDITISATDTAVDKGEI
IPATNTTNTNNNGTVMAKDGDGDKFANITNVVNAINSAFWKIGEENSGTVTPKGNVTAGS
QVNFSNGVGTIAKVTADEANKTYKVQYDINAGPGIEIPATGDNKGKVTVKVDNSTVTIND
DGQLVANSAWNANATGNVDGTAAAKAVKANATVNFDAGENLKVKQTGNEANQVYSFSLNQ
TLTNITSIQNKATGPKLTFGDNSINITGGNLDMGGNKITNLKPGTNGTDAVNLNQLNASR
TIVKSTDGSVTVTPSENGLTKTYDLSVDLSKLDLSKAKSSWNVKSSAAEGGNVTDAHNAT
EKNIADKNTVEFKAGKNLTVEQVNGDNGANVTFALSNNITLDNSGSINIGGTTVKDGDIK
IGDTHITNGAVSNLTHHIENATTVVDGSVLNISDEKKKEAATVRDVLNSGWNLQANGDAV
DAVTHGNNVNFASDGSVKITPTTDGNTSTISLSVNATNVVNQVTGNVSANTTTGKAVVGK
DGNEDTTPNAGNKVATVGDVANTINNTGWITKAKDNTGAEKNVTVNPGDRVEYVDGKGTK
ANVTVTTTNGQDVVNVTYDVKTDGTTVTVNNNGNLTVVTGNITKASDDATQPNAGKVTVD
TADENKVATVKNVADAINSAGWIVNTGKADDQNSFKTETGTAKKVGAGNKVNFQAGKNLE
VKRVGDNIIYATSDDLSVNNITVADNGSIKIGDTAVKNGDIKIGDTHITNGAVSNLTHHI
ENATTVVDGSVLNISDEKKKEAATVRDVLNSGWNLQANGDAVDAVTHGNNVNFASDGSVK
ITPTTDGNTSTISLSVNATNVVNQVTGNVSANTTTGKAVVGKDGNEDTTPNAGNKVATVG
DVANTINNTGWITKAKDNTGAEKNVTVNPGDRVEYVDGKGTKANVTVTTTNGQDVVNVTY
DVKTDGTTVTVNNNGNLTVVTGNITKASDDATQPNAGKVTVDTADENKVATVKNVADAIN
SAGWIVNTGKADDQNSFKTETGTAKKVGAGNKVNFQAGKNLEVKRVGDNIIYATSEDLEV
TTVKVGKDGKDGKDGSIGVTGKDGAAVAINGKDGSIGLTGPKGADGKDGASVTIKPEKGT
TTVAERDGGKEINRVTYTDKDKDGNDIKREIATLDDGLKFTGDDGKTVNRTLGSNLNIKG
GAADSTTAKNIRVTKAADGEGLDVNLANNIKLDNNGSLNIGGTTVKDGDIQIGDTHIKNG
AVTNLEHHIENPTTVVDDSVLNITDDKKKDAATVRDVLNSGWNLQANGKPVDAVTHDNNV
NFASDKGTVTVTANSDGKTSVVNLDVNVDNDTITVNNKGQLVASGATNFNVATKDGGNKV
AKKGGSSTTKITSGKTITYTAGKNIAIEQNGGDILVSTTEDVDHNSVTTNNLTVKEGGNV
TVGPNSTVNMGGNQVHNVKAGTADTDAVNVSQLRSNVTHLNNRINKVGKEARGGIAGANA
AAGLPQVYIPGKSMVAASAGTFKGESAVAVGYSRSSDNGKVIFKLQGNANTQGDVGGSVG
VGYQW
NT seq
6678 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaagtgtttaaagttatttggaatcatgctacacaaacgtggactgctgtttct
gaacttgggcatgctaagggtaaaaccaagtctaaaaagatcgttaaattgaccgcactt
gcaggtgctgtgattggctcattggctgcatctcaatcagtaatggctgcaacagatctt
agaactaatgacgcagtgaatattgcagcggataatgtggcaaatccaacagctggtcgt
gaagcgattgcggtaggtcaaaatgcaaatgcgtcccaccaacattctattgcgattggt
agaaatgcaacggcgaactggactaacactatttctatcggtaaagataccgtatcaacg
aaagaccatgctgttgcaattggtacgagtgcaaatgcatcaggtattcaggctgttact
gtgggttcatatgctagaactgatgcaaactcttcaattgcgcttggtcaaaatgcaacc
gtttctggtacaggttcgacagcagcagtagcggtgggctttttagcaaatgcatcagca
gcaaatactgttgcagcaggtaagagtgcgactgcaacggttgataacgcggtagcactt
ggtgtgagctctagtgcgaccgatcgtaatgctttagcgctaggtggatatgctgcggct
tctggtgaacgtgcagctgcagttggtgcggcctcaaaagcatcaggcactgcttcattt
gcgggtggtacgtctgctaatgcttcaggtgctaattctgtagctgtcggcggttcaatg
actccagcagaagccgctcaagcatcaggcgagaactctattgcggtgggtgcaaactct
aatgcatcgggtgataactctatcgctcaaggtaaaggtgctaatgcagcagttgaaaac
tcaattgcaattggtacaaatgcatctgctaccggtatttctatcggtaatgaggcgtca
acaaatgttgattactctatcgctatagggcataagagtaatgtagtaggtgaccaaggt
gttgctgttggtaataatgcaactaatagtgccgctagttttgctgctgcagtgggtgct
gattcagcggcaaatgcaaattattctgcagcgttgggttatagtgctgtagctgatgca
gaacattctgtgtcattgggcgcagcttctaaagctaatgcagaatattctgtgtcattg
ggcgcagcttctgaagcgggtgaagattttgttgagagccgtagtgcagaaattaatggc
gttaagtatgagggttttgcggctagtaccagtgactttggagcaggtgctgtcgtttct
gttggtaaagcaggtagtgagcgtcaaattaaaaatgttgcagcaggtcgagtgaaaagc
aattcaacagatgcgattaatggttctcaactttatgctgtagcggatgtactagcaacc
aaaatcaataaacaacattggaatgtcggtaacaatgacggtgcagtagtaaatggcgtt
taccatgaagatcaagtgaactttgtgaatggtaatgtaacaactgttaaagtcgttaaa
gcaccaagtaaatccagcacgccagatggtggcccaaatattactaatgtttcttatgat
gtgaacgtgggtaaaggcttaaaaattgaggacaagaaaattgttgctaacttcgttgct
ggtacgggcataacctttgatacaaaaggtgacgaaatcacaattaatgcgaaatcaact
ggtggcgcagcatcttcagttgtttctggtgacaataatactttatctgtaaaacagaat
gcaactaatccatcagaatatattgttacacctataacaggttctttatcaatatcaaag
gatgagaaaggaaaagttggtgatgatgccgatggtaataaagataatggtaaaaaatta
actactatccaaactacacgtgacatgattaataaggctcactggaatttacaaattggt
acatcaagtgatccgaagaattctggtgaatcagagattgcaagtgcagatcaaaatgct
gagcctattcatgcgggtgatacagttaatttctttgcaggcaaaaatatcaagttgaaa
cgtcaaggttctgatattactatcagtgcgacagatactgcagttgataaaggtgaaatc
attcctgcaacaaatacaactaataccaataacaatggtactgtaatggctaaagatggt
gatggtgataaattcgcgaacatcacgaatgttgtaaatgcaattaacagtgcattctgg
aaaattggtgaagaaaattcaggtactgttacacctaaaggtaatgttactgcaggtagc
caagtgaacttctcaaatggtgttggcacgattgcaaaagtcactgcagatgaagcgaac
aaaacctataaagttcaatatgatatcaatgcaggccctggtattgaaattcctgctacc
ggtgataacaaaggcaaagtaacggttaaggttgataattcaactgtgacaattaacgat
gatggtcaattagtcgctaactcagcatggaatgcgaatgcaacgggtaatgttgacggt
actgcagctgcaaaagctgtgaaagctaacgcaacagtgaattttgatgcgggtgaaaac
ttaaaagtgaaacaaactggtaatgaagcaaaccaagtttatagtttctctttaaaccaa
acattaaccaacatcacaagtattcaaaataaagcaactggtccaaaacttacctttggt
gataactcaatcaatattaccggcggtaatcttgatatgggcggtaacaagatcactaac
ttaaaaccaggtactaatggtactgatgcggttaatcttaatcagttaaatgcatctcgt
acgattgtcaaatcaactgatggctctgttacagtgactccttcagaaaacggtctcact
aaaacttatgatttaagtgttgatttatcaaaacttgatttaagcaaagcgaagtcatct
tggaatgtgaaatcatctgctgctgagggcggtaatgtaacggatgctcataatgcaaca
gaaaaaaatattgcagataaaaatactgttgaatttaaagcaggtaaaaacttaaccgta
gaacaagttaatggtgataacggtgcaaatgttacttttgctttaagtaataatatcaca
cttgataatagtggtagcatcaacattggtggcacaacagttaaagatggcgatatcaaa
attggtgatacacatattaccaatggtgcagtaagtaatttaacccatcacatcgagaac
gcaacaactgttgtggatggcagtgtgttaaatatctctgatgagaagaaaaaagaagcg
gcgacagttcgtgatgtattgaactcaggctggaacttacaagcaaatggtgacgctgtt
gatgccgtaacacacggtaacaacgtgaactttgcaagtgacggttcagttaagattacc
ccaacgactgatggcaataccagcacaattagtctttctgtaaatgcaacgaatgttgtt
aaccaagtaacaggtaatgtttcagcaaataccactacaggtaaagcagttgtaggtaaa
gatggtaatgaagatacaactcctaatgcaggcaataaagttgccacagtaggtgatgta
gcgaataccattaacaacacaggttggattacaaaagcaaaagataatactggtgctgag
aaaaatgtcacagttaacccaggtgaccgtgttgaatatgtagatggtaaaggcacaaaa
gctaacgtgactgtaaccaccacaaatggtcaagacgttgtaaatgtaacctatgatgtg
aaaactgatggtacaactgttactgttaacaataatggtaacttaactgtagttacaggt
aacattactaaagcatcagatgatgcaacacaacctaacgcaggaaaagttacagttgat
acagcagacgagaataaagttgcaacagttaaaaatgtagcggatgcaatcaacagtgca
ggctggattgttaacacaggtaaagcagatgaccaaaactcattcaaaactgaaactgga
acagccaaaaaagtgggtgctggtaataaagttaacttccaagcaggtaaaaacttagaa
gtgaaacgtgttggtgacaatatcatctatgctacatctgacgacttaagtgtgaacaac
attacagtcgctgataacggcagtatcaaaattggtgatacagcagttaaaaatggtgat
atcaaaattggtgatacacatattaccaatggtgcagtaagtaatttaacccatcacatc
gagaacgcaacaactgttgtggatggcagtgtgttaaatatctctgatgagaagaaaaaa
gaagcggcgacagttcgtgatgtattgaactcaggctggaacttacaagcaaatggtgac
gctgttgatgccgtaacacacggtaacaacgtgaactttgcaagtgacggttcagttaag
attaccccaacgactgatggcaataccagcacaattagtctttctgtaaatgcaacgaat
gttgttaaccaagtaacaggtaatgtttcagcaaataccactacaggtaaagcagttgta
ggtaaagatggtaatgaagatacaactcctaatgcaggcaataaagttgccacagtaggt
gatgtagcgaataccattaacaacacaggttggattacaaaagcaaaagataatactggt
gctgagaaaaatgtcacagttaacccaggtgaccgtgttgaatatgtagatggtaaaggc
acaaaagctaacgtgactgtaaccaccacaaatggtcaagacgttgtaaatgtaacctat
gatgtgaaaactgatggtacaactgttactgttaacaataatggtaacttaactgtagtt
acaggtaacattactaaagcatcagatgatgcaacacaacctaacgcaggaaaagttaca
gttgatacagcagacgagaataaagttgcaacagttaaaaatgtagcggatgcaatcaac
agtgcaggctggattgttaacacaggtaaagcagatgaccaaaactcattcaaaactgaa
actggaacagccaaaaaagtgggtgctggtaataaagttaacttccaagcaggtaaaaac
ttagaagtgaaacgtgttggtgacaatatcatctatgctacatctgaagacttagaagtg
actactgttaaagttggcaaagatggcaaagatggcaaagatggttctatcggtgtaacc
ggtaaagacggtgcagctgtagcgattaacggaaaagatggttcaatcggcctaactgga
ccgaaaggtgcagatggtaaagatggtgcatcagttactatcaaaccagaaaaaggcaca
accacagtcgcagaacgtgatggtggtaaagagattaaccgtgttacctatacagataaa
gataaagatggcaatgacatcaaacgtgaaattgcaacacttgatgatggcttgaaattc
accggtgatgatggcaaaacagttaatcgtactttaggttctaaccttaatattaaaggt
ggtgctgcagattcaacaacagcgaaaaacattcgtgtgaccaaagctgcggatggtgaa
ggtttagatgtgaatcttgcaaataacattaagttagataacaatggtagccttaacatt
ggtggtacaacagttaaagatggtgatatccaaattggtgatactcatattaaaaatggt
gcagtaaccaatttagaacatcacattgaaaacccaacaacagttgtggatgacagcgtg
ttaaatatcactgatgataagaaaaaagacgcagcaacagttcgagatgtattgaactca
ggctggaacttacaagcaaatggtaaaccagttgatgcggtaacacacgacaacaatgtg
aactttgcaagtgataaaggtactgtgacagttacagcgaactcagacggtaaaacatct
gttgtaaaccttgatgttaacgttgataacgataccatcactgtgaataataaaggccaa
ttagtcgctagcggtgcaaccaactttaatgttgcaactaaagatggtggcaacaaagtt
gctaagaaaggtggtagctcaacaacgaaaattacttcaggtaaaacaattacttacact
gcaggtaaaaacattgcgattgagcaaaatggtggcgatatccttgtttcaacaactgaa
gatgtagatcacaacagcgtaaccactaataacttaacggttaaagaaggtggtaacgtg
acagtgggtccaaactcaacagttaatatgggtggcaaccaagttcacaacgtgaaagca
ggtactgcagatactgatgcggtgaatgtttcacaattacgtagtaatgtgactcacttg
aataaccgcattaataaagtaggcaaagaagctcgcggtggtatcgcaggtgctaacgca
gcagcaggtttaccacaagtttacatcccaggtaaatcaatggttgctgcttctgcaggt
actttcaaaggtgaaagcgctgtagcagtaggttactcacgttcaagcgacaatggtaaa
gttatcttcaaacttcaaggtaacgcaaatacccaaggcgacgtaggtggctctgtgggt
gttggttaccaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
