Helicovermis profundi: HLPR_07640
Help
Entry
HLPR_07640 CDS
T09891
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
hprf
Helicovermis profundi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hprf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hprf02000
]
HLPR_07640
Transporters [BR:
hprf02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and toxin extrusion (MATE) family
HLPR_07640
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BEP28433
UniProt:
A0AAU9E294
LinkDB
All DBs
Position
complement(887925..889274)
Genome browser
AA seq
449 aa
AA seq
DB search
MSLNNKRDLILNGNINRMILILALPVMANNLIQTIYNLTDTYFVSKLGTTQIASIQFIWP
VIFFMISIGMGVSIAGTSLISQYIGANELENAKKVTGQVISFSFLISIFLGVVGFFLTSP
LLKFMGAKGEFLLYSTSFLKIIFIGSPTMFAMFSYNAIRSGLGDTVKPMIIGLLSVILNI
ILDPVLIFYFHMGVKGAAIATVISRAIFGLYAILTLFNQNNDFYISYKHLLIDKSLLSKI
IKIGIPSSIGQSTTAVGFMVLNIFIVSFGEATLTAFAIGNRINSLILMPAMGIGSALATI
VGQNLGADNPKRAKKAVFSSTVITTAFLVLGGMILIYFASPIVKLFSSDPSVISQGTYYL
ILVTLSIPLMGFFQILIGTFQGSGHTLSAMIMMMGRLWALRIPMIIIFKNYTNLGTNSVW
YAMILSNLIICIVGYIIYKTGKWQRKKIK
NT seq
1350 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtttaaataacaaaagagatttaatactaaatggcaatattaacagaatgattcta
attttagctcttcctgtaatggctaacaatttaatacaaactatttataatcttactgac
acgtattttgtaagtaaacttggaactacacaaattgcatctattcagtttatctggcca
gttatattttttatgatttcaataggaatgggagtatctattgctggtacaagtcttata
tctcaatatataggcgcaaatgaattagaaaatgctaaaaaggtaactggacaagttatt
tctttttcattcttgatttcaatatttcttggagtcgtaggtttttttctaactagccca
cttctaaaatttatgggtgcaaaaggtgagtttctactatactctacttctttcttgaaa
ataatatttattggttcaccaacaatgtttgccatgttctcatataacgcaattagatct
ggtcttggagatacagtgaaacctatgataatcggtttattatctgtgatacttaatatt
atacttgaccccgttttaatattctattttcatatgggagttaaaggtgctgcaattgct
actgttatctcaagagcaatttttggactttacgctattttaactttatttaatcaaaat
aatgatttttacatttcatataaacatctactaattgataaatccttattaagtaaaatt
attaaaatcggtataccttcatcaattggtcaatctacaacggcagtaggatttatggtt
ctcaatatttttattgtttcatttggagaagctactctaactgcatttgctattggaaat
agaataaatagtcttatacttatgcctgcaatgggaattggtagcgcacttgcaacaata
gtaggacaaaacctaggagctgataaccctaaaagagcaaaaaaagctgtattttcaagc
actgtaattactactgcttttttagttcttggtggaatgatactaatttattttgcttca
ccaattgtaaaattattttctagtgatccttcagttatttctcaaggaacatactatttg
atactagtcactctttctattcctcttatgggattttttcagatattaattggaactttt
caaggctctggtcatacgctttcagctatgattatgatgatgggaagactctgggctctt
aggataccaatgataattatttttaaaaattatacaaatcttggaacaaactctgtatgg
tatgctatgatacttagtaacctaataatctgtatagtaggatatataatatataaaaca
ggtaagtggcaaagaaaaaaaatcaaatag
DBGET
integrated database retrieval system