Helicovermis profundi: HLPR_11160
Help
Entry
HLPR_11160 CDS
T09891
Name
(GenBank) ATP-dependent DNA helicase
KO
K03657
ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:
5.6.2.4
]
Organism
hprf
Helicovermis profundi
Pathway
hprf03420
Nucleotide excision repair
hprf03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hprf00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
HLPR_11160
03430 Mismatch repair
HLPR_11160
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
hprf03400
]
HLPR_11160
Enzymes [BR:
hprf01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
HLPR_11160
DNA repair and recombination proteins [BR:
hprf03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
HLPR_11160
MMR (mismatch excision repair)
Other MMR factors
HLPR_11160
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
Cas_Cas4
DUF2800
DEAD
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BEP28785
UniProt:
A0AAU9E488
LinkDB
All DBs
Position
complement(1306781..1309552)
Genome browser
AA seq
923 aa
AA seq
DB search
MNLKNYNDVQKECIQEINQNLQIIACAGSGKTKTVVARNINILVNKKAKPSEIVSITFTK
KAAAELKQRIYTEFELEFQTTQNLAEMYIGTIHSFCLNTLQEISASYKKFDILEGIQRVL
LVKKFLSDDSISKVEYTDLKGKTKTPFKKYDSQQLKLLLNSCDFIREEMIDISSNSSELI
KFYNKYIELIESKYFFDYAHVQYKFLNELKTSKKLKEYIKKIKYITIDEYQDTNTIQENI
LQEMYKINPSLNICVVGDDDQSIYGWRGSNLENFKSFNNKYKNVVQRTLAINYRSTEGIV
QLGKGIIEHNKTHLDKPFESNDTYSYESGDIIVQTDFNSISEENDAIIKTIKKLYNSEII
NKNGDSKIIGYDDMAILVHSTNKLKEFNQDLLTALEANNIPFIVDGTKQLFEQNEVQLLF
DLFLYFAKKYLNYRGTFDYYDSNNLKIIDNTLESFFNDFHKKITKIYYDNTIQDFYIQLM
QQLDLFSKSDDKTMYNLAVFSDIINDYETINFSDRFEYRFKNFVGFLHHDASSIYPEGWL
SPKFEDTKCLKIITIHSSKGLEFPVVFMPHLCKDYLFPTKAAGGFSIKGVFKKALPIGYN
IFEKRYQSSDESLTRLFYVALTRSKKYLFLTKAKSYRKKATSKRENKKVPIQLEYAQASQ
FINCSINSFLNKTLNYSNSKLNEINQLVFDFSTLKDIFECPQKFQYSSIFGFYSPLNIRM
GYGKSLHNMMDDLHSTYMNEKLIKRTEDLVNTHIHLPLAPPTGQLYKDVSKSATKIIDEY
VDRNRNLLDYISYVEKPIDYKLNDMIFINGRVDLITNIKSKDVSIIDFKSDSNTMSHELR
NKQLLIYALGYYKLTGKYPNAVISYDLKTNTRHPQSIEPSDVHSIEKEIKTAYTMIKNNT
FPRCKDKVLCKNCQFENLCSQKK
NT seq
2772 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttaaaaaactataatgatgttcaaaaagaatgtatacaagaaataaatcaaaat
ttacaaattattgcttgtgccggatctggaaagacaaaaactgtagtagcaagaaatatt
aatattttagttaataaaaaggcaaaacctagtgaaatagtaagtatcacattcacaaaa
aaagctgctgctgaactaaagcaaagaatttatactgaatttgaacttgaatttcaaaca
actcaaaatttagcagaaatgtatattggcactattcacagtttttgtttaaatacactt
caagaaatttctgcaagttacaaaaaatttgatattctagaaggtattcaaagagtttta
ttagtaaaaaaatttttaagtgatgatagcatttccaaagttgaatatactgacttaaaa
ggaaagaccaaaactccttttaaaaaatatgattctcaacagttaaaattattattaaat
tcttgcgattttattagagaagaaatgatagatatttcttctaatagctctgaacttatt
aaattttataacaaatacatagaattaatagaaagtaaatatttctttgattacgcacac
gtacaatacaagtttcttaatgaattaaaaacttcaaagaaattaaaagaatatataaaa
aaaataaaatatattactatcgatgaatatcaagatacgaatacaatacaagaaaacatc
cttcaagagatgtataaaattaatccaagtttaaatatttgcgtcgttggtgatgatgat
caatctatatatggatggagaggtagtaatcttgaaaactttaaatcttttaataataaa
tacaaaaatgtagtacaaagaactctagctattaattatagatctacagaaggtattgtg
caattaggtaaaggaattattgaacataataaaactcacttagacaagccatttgaatcc
aatgatacatattcctatgaatctggtgatataattgttcaaactgactttaactctatt
tctgaagagaatgatgcaattataaaaactataaaaaaattatataatagtgaaatcata
aataaaaatggtgattctaaaataattggttatgatgatatggcaattcttgttcattca
acaaataaattaaaagaatttaatcaggacttattgacagctttagaagctaataacatt
ccttttatagttgatggtactaaacaacttttcgagcagaatgaagttcaattactattt
gatttattcctttattttgcgaaaaagtatttaaattatagaggaacttttgattattat
gattcaaataatttaaaaattattgataatacacttgaatcttttttcaatgattttcat
aaaaaaattactaaaatatattatgataatactattcaagatttttatatacaattaatg
caacaacttgatttattttcaaaaagcgatgataaaacaatgtataatcttgctgtattt
agtgatataataaacgactacgaaacaataaatttctcggatagatttgaatatagattt
aaaaattttgtaggttttttacatcatgatgcaagtagtatttatcctgaaggatggtta
tctcctaaatttgaagatactaaatgtttaaaaattattactattcatagttcaaaaggt
cttgaatttccagttgtttttatgcctcatctttgtaaggattatttatttcctactaaa
gcagcaggtggtttttcgattaaaggagtttttaaaaaagctttacctattggatataat
atatttgaaaaaagataccaaagttcagatgaatctttaactagactattctacgtagct
ttgacaagaagtaaaaaatatttatttttaacaaaagctaaaagttatagaaaaaaagcc
acttcaaaaagagagaataaaaaagttccaattcaacttgaatatgctcaagcttcacag
ttcataaactgtagtatcaactcatttttaaataaaactttaaattatagtaattctaaa
ctgaacgaaataaatcaactagtttttgatttttctacgcttaaagatatttttgagtgt
cctcaaaaattccaatattcatctatatttggattttattcacctttaaatataagaatg
ggttatggtaaatctcttcataatatgatggatgatttgcattcaacatatatgaatgaa
aaattaataaaacgaacagaagatttagtaaatacgcatattcatttacctcttgctcct
ccaacaggtcaattatataaggatgttagcaaaagtgcgacaaaaataattgatgaatat
gttgaccgaaatagaaatctacttgattatatttcatatgtcgaaaaaccaattgattat
aaattaaatgatatgatatttattaatggaagagttgacttaataactaatattaaatca
aaagatgtatccataattgattttaaaagtgattcaaacacaatgagtcatgaattacgg
aataaacaattacttatttacgcattaggttactacaaacttactggaaaatatcctaac
gccgttatatcatatgatttaaaaactaatacgagacatcctcaatcaattgaacctagt
gatgtacatagtattgaaaaagaaatcaaaactgcttatacaatgattaaaaacaatact
tttcccagatgcaaagataaagtactatgtaaaaattgtcagtttgaaaatttatgttca
caaaaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
