Helicobacter pylori Cuz20: HPCU_01060
Help
Entry
HPCU_01060 CDS
T01894
Name
(GenBank) mosaic CUP0956/HP1116/jhp1044-like protein
Organism
hpu
Helicobacter pylori Cuz20
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3519
ddrB-ParB
PBECR1
PBECR2
NYD-SP28
Uteroglobin
HCV_NS4b
DUF6861
Rick_17kDa_Anti
LPD3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADO03396
UniProt:
A0AB32X6J8
LinkDB
All DBs
Position
complement(201459..207299)
Genome browser
AA seq
1946 aa
AA seq
DB search
MQAENMDIDLKNLPSTPLYPLKNPTLTPEQLEQKRKELIVDLNQKSKELTELGLLDKLGG
FVGYQTQNAKDREKQLTDLKTQAIDNKLDFKDLPNALKDEYYNNAETSLFNPLKTKNEIA
KEDYQKDLQRKEILKKTSQELTKSDKDLIDNDNGFFNNAMDLLTGTSEADKLKEYKEKEK
AKDITKEIQKAYSAFSNIDKNKDFFSLFTSEDKEAQEKAKKDFETIAKNLYHFDSVIYNE
KNEPFVVKGDKVYKINDGFIDNFTQSLLNNKFSIAGSVTGGLAGAKYGKSAGALGLVGGA
IAGAALGATTGAATDAIITNLALDRENKADEIIRHALSEGALSLATDTLMLGAGKVLKPL
AKAPLKLAEMSMPFQFTKNFFTGNAKRASEIIETTLSKEQQQALKEFSARFGGETKINTN
NANDFLREKIKSVFKGDESKLNAYDKVKEILTLDNHKEQQQAFIRAIRSDETGNTLAFLV
EAANLSPKANANLKSILNQTTENLTKSLKQFDLKDYEIKSVFDNLEQGTKESYDKALNEI
IGKLYDDSYKVNLRESVQDATNLEKFLNDLKAQGEIDPQAKSFLRQIEENVYNPNGVTYA
QLKNSRQLINAYLRNVKDPSTLGYIQKASANFLKNDIDNAIDSLLKQNNSAYEKISELQK
SAISDYREMKQALELVDKAKIRDKNTQASDAVNSLIKIIKAQGQKDLSNYHALTKGLNES
DKERLELSILNRLAEESLKQDETLKVFDSAHFFNKLNEFKDEVFSTPKAKEYIDIASGFH
KLFKNDAKIALSLKPATTKNLSQGLATTLSGALKYQWTKFTLGTLYRNAPDRILGIKLPK
ALNEATAGAALKYHIKRALERSHTISDFSKQLELSAKNSQFTNNTLKIIEELNNGVKQAS
DELKEATKPSNLVKSIREQDARPFEVIKDKEAFFKDLNQNLNDNATALPKGMSVEEFKQT
LESVENKERFLEHLQTRENSDERLKALNLVEHTLREPHIEIFTKDKNNATDKKEYIKAFK
DENQARLYMLITQDNDTILRTFIPDIPERYVRNHVRNADIIHSFIQPNRTAKSDDALDAV
VVYGENTTKKPLTSQEDLLKTQENLKETTQDLSPIELAKAEKLAKLEHAITPLKEFGKNY
PEFALKPKEALEKLLQEKNGQVAGAAYRDDLGGIDFVWGNKDYGLEHILQRREGQAIAKG
LNEAEAKEYALNVVKSIPEIIEKGIKVDNNGRIAIEYQNIRVGLKDNWKGEKLPNHWVIT
SYEKLENSESLYTSPLITKSEILPLNSNENLTTNPLKTQENTQKNQDLSPLELAKAEKLA
KLESEKLESEKEFLKAKEQEQARKAALKKKLEHERGNAGNIESQTKIEVGEDIPTHMQAQ
IPKSRVRLNEREIYDLDYAIVKAKDLKPSFTTGGTQKRTDMNEEQIKSISENFDPNKIFG
SGGFEDLPIILHDGQVIAGNHRIQGMLNFTPKSRFSYEKAIKEYYHIDLKPDELLVRLPS
NRLNNTEINNLAASSNQGRFNSESDHAIAVLSHYESKLKELESQLNADSVYSLKNMVAKN
LNFDKATHPNVTDSNLSLLMYNMPRTKTQGIELLNRWQKEFSNDIKSYEKVKKMFVDNAG
SFHNLIHDMNFPNVSLNAYLSDIMDRSFANLKNYQSTSESLKDLSEKFYKTHSLEMFEKS
DQNTSDISEILGGAIARFARFDDPSKALFEALRSDNIKKGLKEFKIADVTKDMFDPNSKE
FKDIDIYDFTHYLLMVNREPNETNPALNRLIEAVKDMQKESKKEASKKSAEKTQKGIKER
AFTVIEDKEAFFKDLNAIKPMQLPREIDTDSFLNAFNGVENKENFIKHLKNKPDSKHRLA
YLNLVEPTLKEPDITLIFKNQGKEVKKERIKAFQGDPKTIYYFLVTQDNDNKLITGLKVK
PNYIKAEIDKADIIHSFIPQARTLKE
NT seq
5841 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagcagaaaacatggacattgacttaaaaaacttaccaagcacgccgctatatccg
ttaaaaaatcctactttaacgcccgaacaattagaacaaaaacgaaaagaacttattgta
gatctcaaccaaaaatcaaaagaactcaccgaattaggtttattagataagttaggaggt
tttgtaggttaccaaacacaaaacgccaaagatcgagaaaaacagctaactgaccttaaa
acgcaagctatagacaacaagctagattttaaagatttacctaatgcgcttaaagatgaa
tattacaataacgcagaaacgagcctttttaatccgcttaaaaccaagaacgagatcgcc
aaagaagactatcaaaaagacttacaaagaaaagaaatattaaagaaaactagccaagaa
ctcacgaaaagcgataaggacctaatagataatgataatggtttttttaataatgcgatg
gatttacttacaggcacaagcgaagcggataagcttaaggaatacaaggaaaaagaaaaa
gccaaagatataacaaaagaaatacagaaagcctattcagcttttagcaacattgacaag
aacaaggatttttttagcttattcactagcgaagataaagaagcgcaagaaaaagctaag
aaagattttgaaacgatcgctaaaaacctctatcattttgacagcgtgatctacaatgaa
aaaaatgaaccttttgtagtcaaaggcgataaggtttataaaattaacgacggctttata
gacaatttcacgcaaagccttttaaataataagttttctatagcaggaagtgttaccggt
ggtttagcaggagctaaatacggaaagagtgccggagctttaggattagtgggaggagcg
atcgcaggcgcagccttaggagcgaccacaggagcggctacggatgcgattataactaat
ctagcgctagatagagagaataaagccgatgaaatcataaggcatgcgttaagtgagggt
gctttatcgttagcgactgatacgcttatgttaggagccggtaaggttttaaaaccgctt
gctaaagcgccgttaaaattagccgagatgagcatgccttttcaattcactaaaaacttt
ttcaccggtaacgccaagcgcgccagcgagatcatagaaaccacgctatctaaagaacag
caacaagccttaaaagaatttagcgcacgatttggtggtgaaaccaagatcaacactaac
aacgctaacgactttttaagagagaagataaagagcgtttttaaaggcgatgaaagcaag
ttaaacgcttatgataaagtgaaagaaatcctaacgctagacaaccacaaagaacagcaa
caagcctttataagagcgatacgaagcgatgaaaccggcaacactttagcgtttttggtt
gaagccgctaatttaagtcctaaagctaacgctaatttaaaatctattcttaaccaaacg
actgagaacttaaccaaatccttaaagcagtttgatttgaaagattatgaaataaaaagc
gtttttgataatttagaacaaggcactaaggaaagttatgataaagccttgaacgaaatc
ataggaaagctatacgatgatagctacaaggtgaatttaagagaaagcgtgcaggatgcg
actaatcttgaaaagtttttgaacgatcttaaagcgcaaggcgagatcgatccgcaagct
aaaagctttttaaggcagattgaagaaaatgtttataaccccaacggcgttacttacgcg
caactaaagaactcacgccagctaattaatgcttatttgaggaatgttaaagatccctct
actttaggatatatccaaaaagcgagcgctaattttttaaaaaacgatatagacaacgcc
atagatagcttactcaagcaaaataatagcgcttatgaaaaaattagcgaattgcaaaaa
agcgctattagcgattatagagaaatgaaacaggctttagaattagtggataaggctaaa
atacgagacaagaacacgcaagcaagcgacgccgtgaatagcttaattaaaatcataaaa
gcccaaggtcaaaaggatttaagcaactaccacgctctaacaaaaggcttaaatgaaagc
gataaagaacgcctagaattaagcattttaaaccgcttagcagaagaaagcctaaaacaa
gatgaaaccttaaaagtgtttgacagcgcgcattttttcaacaagctcaacgagtttaaa
gatgaagtctttagcacgccaaaagctaaagaatacattgacatagcgagcggttttcat
aagctttttaaaaacgacgctaagatcgctttaagcttaaagccagccacgactaagaac
ttaagccaaggtttagcgaccactctaagcggagcgttaaagtatcaatggactaaattc
acgctagggactttataccgcaacgcgcccgatcgtattttagggattaaattacctaaa
gctttaaacgaagccaccgcaggagcggctttaaagtatcacattaaaagagcgttagaa
agaagccacaccataagcgattttagcaagcaattagaactaagcgctaaaaactcccaa
ttcaccaacaacacgcttaaaatcattgaagagcttaataatggcgttaaacaagctagc
gatgaactcaaagaagccacaaaaccgagtaatctagttaaaagcataagagagcaagat
gcgcgcccttttgaggtcataaaagacaaagaagctttttttaaagacttgaaccaaaat
ctaaacgataacgctaccgccttgcctaaaggcatgagcgttgaagaatttaagcaaact
ttagagagcgtggaaaacaaagaaaggtttttagaacatttacaaacaagagaaaacagc
gatgaaaggttaaaagcgcttaatttagtagaacacacccttagagagcctcacattgaa
attttcactaaagataaaaataacgctacagataaaaaagaatatatcaaagcgtttaaa
gatgaaaaccaagcgcgcctatatatgctaatcacacaagataacgatacgattttaagg
acttttataccagatatacccgagagatatgtaagaaatcatgtaagaaatgctgacatt
atccactctttcattcagccgaacagaaccgcaaagagcgacgacgcattagacgccgta
gtggtctatggagagaatactactaaaaaacccctaacaagtcaagaggatttactcaaa
acgcaagaaaatttaaaagaaaccacgcaagatttaagccccatagaacttgccaaagcc
gaaaagcttgccaaattagaacacgctataacacccctgaaagaatttggcaagaattac
cccgagtttgccctaaagcctaaggaagcgttagaaaaactcttgcaagagaaaaacgga
caagtcgcaggcgcagcgtatagggacgatttgggagggattgattttgtttggggtaat
aaagattacggactagaacacattttgcaacgccgagaaggacaagccatagctaaaggc
ttaaacgaagcagaagctaaggaatacgccttaaatgtagttaaatcaatccctgagatt
atagaaaaaggcattaaggttgataataacggacgaatagctattgaataccaaaatata
agagtaggtttaaaagataattggaaaggagaaaaattacctaatcattgggttataaca
agttatgaaaagttagagaatagtgaaagtttatatacatctccactaattacaaagagt
gagattctacccttaaactctaacgaaaatcttaccacaaacccgctaaaaacacaagaa
aacacgcaaaaaaatcaagatttaagccccctagaacttgccaaagccgaaaagcttgcc
aaattagaaagcgagaagcttgagagcgaaaaagagtttttgaaagccaaagagcaagaa
caagcacgaaaagccgctttaaaaaagaaattagaacacgagcgaggcaatgcaggcaac
attgaaagccagactaaaatagaagtgggagaagatatacctacacacatgcaagcgcaa
atccctaaaagccgagtgaggttaaacgaaagagagatttacgatctagattatgcgatc
gtgaaagctaaagacctaaaaccaagctttaccacaggcgggacgcaaaagcgcaccgac
atgaacgaagaacagattaaaagcatttcagagaattttgatcctaataagatatttggt
agcggaggttttgaagacttgccaatcattttacacgacgggcaagtgatcgcaggaaac
caccgaatccaaggcatgctaaatttcacgcctaaaagccgtttttcttacgagaaagcg
atcaaggaatactatcacatagatttaaagccggatgagttgttagtgcgcttgccgtct
aatcgtttaaataataccgagatcaacaatttagcggcttctagcaatcaaggacgcttc
aatagcgaaagcgatcacgccatagcggttttaagccactatgaaagcaaattaaaagaa
ttagaaagccaattaaacgctgatagcgtctattctttaaaaaacatggttgctaaaaac
cttaattttgataaagccacccaccctaatgtaaccgatagcaacttgagtcttttgatg
tataacatgccaaggacgaaaacgcaaggcatagagctattaaaccgctggcagaaagaa
ttttctaacgacattaaaagctatgaaaaagtaaaaaaaatgtttgtagataacgccggc
agttttcacaatttaatccatgacatgaactttcctaatgtaagcctgaacgcttattta
agcgatattatggatcgcagttttgcgaacttaaagaattatcaaagcacaagcgagagc
ttgaaagacttgagcgagaaattctataaaacgcattctttagaaatgtttgaaaagagc
gatcaaaatacaagcgatataagcgagattttaggaggagcgatcgcaaggtttgcgagg
tttgatgatccttctaaagcgttatttgaagccttaagaagcgataacattaaaaaaggt
ttgaaagaatttaagatcgcagatgttactaaggatatgtttgatcctaatagtaaggaa
tttaaggatattgatatttacgatttcacgcattaccttttaatggttaatagagaacct
aacgaaactaatccagccttaaatcgtttgattgaagccgtaaaggatatgcaaaaagag
agtaagaaagaagcaagcaaaaagagtgcagagaagacacaaaaagggattaaagaacga
gcctttacagtcatagaagacaaagaagcgttttttaaagatttgaacgctataaaacct
atgcaattaccgagagagattgatacggatagctttttaaacgcttttaatggagttgaa
aataaagaaaattttattaaacatttaaaaaataagcctgacagcaagcaccgattagct
tatttgaatttagtagaacctaccttaaaagaacccgatattacgcttatttttaaaaat
caaggtaaagaagttaaaaaagagcgcattaaagcttttcaaggcgatcctaaaacgatt
tattattttttagttacacaagataacgataataagcttattacaggattaaaagttaaa
ccaaattacattaaagcagagattgacaaggcggacattatccactctttcattccgcag
gcaagaacgcttaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
