KEGG   Helicobacter pylori Cuz20: HPCU_04805
Entry
HPCU_04805        CDS       T01894                                 
Name
(GenBank) outer membrane protein HopC
  KO
K15843  outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hpu  Helicobacter pylori Cuz20
SSDB
Motif
Pfam: HP_OMP
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADO04118
LinkDB
Position
972569..974122
AA seq 517 aa
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGTKRDELARELNADV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPEKLNGNDVSANALLGGAVGSGTCAAAG
TAGGSSLTTQSACTAAGYYWLPSLSDRVLSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAANVF
FNAMNKALETKNGTNGTSGATGQNGQAYSQQAIQYLQGQQNILNNAANLLKQDELLLEAF
NSAVAANIGNKEFNSAVFTGLVQGIIDQSQSVYNELSKNPISGSTFNSATNGRLTNQANA
VQGRANQLSNALYNAQVTLDKINALNNQVRSMPYLPQFRAGNSRATNIMNGFYTKVGYKQ
FFGKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMG
FFSGIQLAGETVQSTLRDDPNVKLHGKVNNTHFQFLFDFGMRMNFGKLGGKSNRHNQHTV
EFGVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq 1554 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagatgatggagggtttttcaccgtcggttatcagctcgggcaagtcatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcactaaaagagacgaactcgcaagagagcttaacgctgatgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcgttgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggagcgtatccagagaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttagggggtgcggtaggcagtgggacttgcgcggctgcaggg
acggctggtggtagctctcttaccactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattattgg
ctccctagcctttctgatagggttttaagcacgatcggcagccagactaactacggcacg
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcggcgaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaggctttggagaccaaaaatggaactaatggaactagtggtgcg
actggtcaaaatggtcaagcttactctcaacaagctattcaataccttcaaggccaacaa
aatattctcaataacgcagctaacttgctcaagcaagatgaattgctcctagaagctttc
aactctgcggtagctgctaacattgggaataaggaattcaattcagccgtttttacaggt
ttggtgcaaggcattattgatcaatcccaatcggtttataacgaactcagtaaaaacccc
attagcgggagcacgtttaatagcgctacaaatggccgactaactaaccaagctaacgct
gtgcaagggcgcgctaatcagctctctaacgctctttataacgcgcaagtaactttggat
aaaatcaatgcgctcaacaatcaggttaggagcatgccctacttgccccaattcagggcc
gggaacagccgtgcgacgaatatcatgaacgggttttacactaaagtgggctataagcaa
ttcttcgggaagaaaaggaatattggtttgcgctattatggtttcttttcttataacgga
gcgagcgtgggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtgggg
actgatgtgttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatgggc
ttttttagcggtatccaattagccggtgagaccgtccaatccacgctcagagatgacccc
aatgtgaaattgcatgggaaagtcaataacacgcacttccagttcctctttgactttggt
atgcggatgaacttcggtaagttgggtgggaaatccaaccgccacaaccagcacacggtg
gaatttggcgtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggactacc
gtgaagtatttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa

DBGET integrated database retrieval system