Helicobacter pullorum: NCTC13154_01065
Help
Entry
NCTC13154_01065 CDS
T08673
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin family N-terminal domain
Organism
hpul
Helicobacter pullorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEJ07809
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1060801..1064208)
Genome browser
AA seq
1135 aa
AA seq
DB search
MGGGGANKPLINSLNTLNTLKNSNPKELAKNLNKIQNSNQLDLNHLNELKDSRLDLIQLE
SKIQDTKNLNQLKESKNLNKIQEINLSKESKNLNKIQMKSSKTALGKISISIIASVLLSQ
NLAALPAGGKFTHGSGSIKVNGKVMNITGNNINHIIAWGGGFNINKGESVNFLGNNKSYL
NLDYTNKASQILGNLNGNGNNIYLVNPSGVLIGKDASINANKFVASNTIDNTTLNNFKTQ
TKLVESFSPVFQPNKGNIVNLGSIRAKEIVLIGNEVRNQAIIKENGKETIITGSFSGYDD
KNPNSKTKNDSITLVGNIVDININTGMIDTKQVWIAAKDKARINQSTSDIYFNGNRLVGN
NALKTSNDLNASNIEWIAYNGITNPKSIETYASIANLEDWAYFAMGWNEVGSSNQYESIQ
NVKNYELINDIDFMANCQNGVCTGQNYADFNFTKLGIDIGRDGNTQNDRVSMIVGEAKMY
EGKYSGRFNGNGHTLKNINIEVTNPDVGVAGIFGSTSHYSEGYVSFENLIVDYQGGSIKS
SGNSGGLLGDSYYNQKGVFFNNIKIKNINEISGNAAGGFIGSFDSGKYFLESLSNISVSN
INKIIGLEAGGFAGSFLTNLTKEGVINNVYINNIGMIEGKLRAGGFIGSYTEHYWTGFNL
YDKIVIGNIDSIKGEVAGGIFGDASLGANDRYCSGSGCVQENGVEDGLVIAYNIKSIQGS
KVDGLFAGYLSQIATASGQQARDSIIDNIYMFFDNKNYNNLPNSFAEVKIFEDSLPYDSH
FIKGSNVHIYLTDTAKMKEINFSSGGHGFGVENKPFLSEKLNNFEEFQEIVKEKMDISTP
TPPNINDSTTNTLPTLDMDNLFNKGGYFDSSSWLTKDDFNQSILNEILENLSFDILSLIT
DTNSLESALQSLDFLLHFINADKSGESGISLGNGIYGLMGYALNQSQIDLLNSNNLLITQ
KLISSINSLSLEDKHYIQEYKQKLESYQAKAKEFEESLKVISSDKHQALIEAFKQENGYY
SLLDDRDRAEKIIKTAINNNGEFNLNNPYKIANGINVSFNLNTIEGINDKDGLNPDFTLP
SANSSLFVKEDIEDVLILPVQEKQEAIVEDGKERGRLCIVSDNAKTNNPCMAITY
NT seq
3408 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggggggggggggcaaataagcctttaattaactctttaaatactctcaatactctt
aaaaactcaaatcctaaagaacttgcaaagaatctcaataagattcaaaactcaaatcaa
ttagatttaaaccatctaaatgaattaaaagattcaagattagatttaattcaattagaa
tcaaagattcaagatacaaagaatctaaatcaactaaaagaatctaaaaatctaaataag
attcaagagattaatttatctaaagaatctaaaaatctaaataagattcaaatgaaatcc
tctaaaactgctcttggcaaaatcagtatttctattattgctagtgtgttattgtctcaa
aacttagcagctttacctgctgggggtaaattcactcatggtagtggaagtattaaagta
aatggtaaagtaatgaatatcacaggcaataatataaaccatattattgcttggggtggt
ggatttaatatcaataaaggagaaagtgttaatttcctaggtaataataaaagctatcta
aaccttgattatactaataaagcttcacaaatattaggtaatcttaatggcaatggcaat
aatatctatttagttaatcctagtggtgtcttaataggaaaagatgcaagtattaatgca
aataaatttgtagcaagtaatactattgataatacaacacttaataattttaaaactcaa
actaaattagtagaatctttctctccagtgtttcaacctaataaggggaatattgttaat
ctagggagtattagagctaaagagatagtgctaatagggaatgaggtaagaaatcaagct
atcatcaaagaaaatggaaaagagacaattattacaggaagctttagtgggtatgatgat
aagaatccaaatagtaaaactaaaaatgattctattactttagtaggaaatattgtagat
attaatatcaatacaggaatgattgatactaaacaagtatggattgctgctaaagacaaa
gctagaatcaatcaatccacaagtgatatttattttaatgggaataggctagtaggcaat
aatgctcttaaaacttccaatgatttaaatgcttcgaatattgaatggattgcttataat
ggaattacaaatccaaaatccattgaaacctatgcttcaattgcaaatttggaagattgg
gcatattttgctatgggttggaatgaagtgggttcctctaatcaatatgaatctatacaa
aatgtaaaaaactatgagttgattaatgatattgactttatggcaaattgtcaaaatgga
gtttgcactggacaaaattatgctgattttaattttacaaaattagggattgatataggg
agagatggcaatactcaaaatgatagagtaagtatgattgtcggtgaagcaaaaatgtat
gaaggaaagtatagtggaagattcaatggtaatgggcatacactaaaaaatatcaatatt
gaagttacaaatccagatgtaggggtagcgggtatttttggtagcacaagtcattattct
gaaggttatgtatcttttgagaatcttattgttgattatcaaggaggaagtataaaatct
tctggtaatagtggtggattattaggagatagttattataatcaaaaaggagttttcttt
aataatataaaaataaaaaatattaatgaaatttccggtaatgctgctggtgggtttata
gggtcttttgattctggaaagtattttttagaatctttaagtaatataagtgtaagcaat
attaataaaattattgggttagaggccggaggatttgctggaagttttctgactaatcta
acaaaagaaggggttataaataatgtttatattaataatataggaatgatagaaggaaaa
ttaagggcaggtggtttcataggaagttatacagaacattattggactggatttaatttg
tatgataagatagtgattggcaatattgattctattaagggggaagtagccggaggaatt
tttggtgacgcttcgcttggagcaaatgataggtattgtagtggtagtggatgtgtgcaa
gaaaatggggtagaagatggattggtaattgcttataacattaaatctatacaaggtagc
aaagtagatggattatttgcaggatatttatcgcagatagcaactgcttcaggacaacag
gcaagagattcaatcatagataatatctatatgttctttgataataaaaactataataat
ttaccaaatagttttgctgaagtaaagatatttgaagattctttgccatatgatagtcat
tttataaagggttcaaatgtgcatatctatttgacagatactgccaaaatgaaagagatt
aatttttcatctggtggacatggatttggagtggaaaataagccttttttatcagaaaaa
ttgaataattttgaagaatttcaagaaatagttaaagaaaaaatggatatttccacccca
acccctccaaacatcaatgattcaactacaaatactctccccaccctagatatggataat
ctctttaataaaggaggatattttgatagtagttcttggcttactaaagacgacttcaac
caatccatcttaaatgagattttagagaatctttcctttgatattttatctttaatcaca
gatactaattccttagaatctgccttgcaatctttagactttttattgcattttattaat
gcagataaaagtggagaaagtggaataagtctaggaaatggaatctatggattaatgggt
tatgctttaaatcaatctcaaattgatttattaaatagcaataatctcttaatcactcaa
aaactaattagctctattaattctctatctttagaggataaacactatattcaagaatat
aaacaaaagctagaatcttatcaagctaaggcaaaagagtttgaagaatctctaaaagtt
atctctagtgataaacaccaagctttgattgaagctttcaaacaagaaaatggctattat
agtttattagatgatagagatagggcagaaaagattatcaaaacagccattaataataat
ggagaatttaatcttaataatccctataagattgccaatggaattaatgtaagctttaat
cttaataccatagagggaattaatgataaagatggcttaaatcctgattttacactccct
tctgctaattcaagcctatttgttaaagaggatattgaagatgtcttaatcctcccagta
caagaaaaacaagaagctattgtagaagatggaaaagaaagaggtagattatgtattgta
agtgataatgctaagacaaataatccttgtatggctattacttattaa
DBGET
integrated database retrieval system