KEGG   Helicobacter pylori v225d: HPV225_0932
Entry
HPV225_0932       CDS       T01899                                 
Name
(GenBank) outer membrane protein HopC
  KO
K15843  outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hpv  Helicobacter pylori v225d
SSDB
Motif
Pfam: HP_OMP
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADI34996
LinkDB
Position
917391..918947
AA seq 518 aa
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGTKRDELARELNADV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPEKLNGNDVSANALLGGAVGSGTCAAAG
TAGSSSLNTQSACTAAGYYWLPSLSDRVLSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAANVF
FNAMNKALEAKNGTSETSGTSGATGQNGQTYSASAIQYLQGQQTILNNAANLLKQDELLL
EAFNSAVAANIGNKEFNSAVFTGLVQGIIDQSQKVYNELNTNPISGSAVNSAGINSNQAN
AVQGRANQLSNALYNTQVTLDKINALNNQVRSMPYLPQFRAGNSRSTNILNGFYTKVGYK
QFFGKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDM
GFFSGIQLAGETVQSTLRDDPNVKLHGKVNNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHT
VEFGVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq 1557 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagacgatggagggtttttcaccgtcggttatcagctcgggcaagtcatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcactaaaagagacgaactcgcaagagagcttaacgctgatgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcgttgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttgggggcgtatccagagaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttagggggtgcggtaggcagtgggacttgcgcggctgcaggg
acggctggtagtagctctcttaacactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctccctagcctttctgacagggttttaagcacgatcggcagccagactaactacggcacg
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcggcgaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaggctttagaggccaaaaatggaactagtgaaactagtggaact
agtggtgcgactggtcaaaatggtcaaacttactctgcatccgctattcaataccttcaa
ggccaacaaactattctcaataacgcagctaacttgctcaagcaagatgaattgctccta
gaagctttcaactctgccgtagctgctaacattgggaataaggaattcaattcagccgtt
tttacaggtttggtgcaaggcattattgatcaatctcaaaaagtttataacgaactcaat
acaaaccccattagcgggagcgcggttaatagcgctgggataaatagcaaccaagctaac
gctgtgcaagggcgcgctaatcagctctctaacgctctttataacacgcaagtaactttg
gataaaatcaatgcgctcaataatcaggttaggagcatgccttacttgccccaattcaga
gccgggaacagccgttcaacgaatattttaaacgggttttacactaaagtgggctataag
caattcttcgggaagaaaaggaatatcggtttgcgctattatggtttcttttcttataac
ggagcgagcgtgggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtg
gggactgatgtgttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatg
ggcttttttagcggtatccaattagccggtgagaccgtccaatccacgctcagagatgac
cccaatgtgaaattgcatgggaaagtcaataacacgcacttccagttcctctttgacttc
ggtatgcggatgaacttcggtaagttggacgggaaatccaaccgccacaaccagcacacg
gtggaatttggcgtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggact
accgtgaagtatttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa

DBGET integrated database retrieval system