Helicobacter pylori 2018: hp2018_1329
Help
Entry
hp2018_1329 CDS
T01914
Name
(GenBank) type IIS restriction enzyme R protein
Organism
hpw
Helicobacter pylori 2018
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
CusS
HATPase_c_5
Sod_Fe_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ52047
LinkDB
All DBs
Position
complement(1333452..1335857)
Genome browser
AA seq
801 aa
AA seq
DB search
MPKLEKILLEITQLDPSKECLKFLANRIKSSDYRSLHLSQHNRYDQNKIKIIIQAIFNEV
GENFLQIRTTDMSKRPSNIIGEEIYAKVVDNICKSEMPQDNLKKKNQVTQDSLRKNLFVD
MHRMGLIERYNKNKEPTSPYIQSNIKYISLTPLAIEFLNAQDLLRKNFCYTQALENLLQG
FGAECREVMIELENHYLDIEEMMFFVTFLNIENFTRSEIIEYVREYRSLSRIQKEKLKEL
AQDYCNPNHFNGNKLDKRDYHNWKNQAQQIFSLLEQSVFFETNKERLILKTLNEENKQND
KKLKRSIKEKALYFEKHGVKKEKGFELHHIVPLCLARSIEEFDLLDKWENLIYIDAFNHA
KISQTQNKHLCLYFENCDVILSKGLKEEQESLYFTYIENVLYKLDLQNIMLKYKKSLKLF
LGTYLGSSFVLMLVISVLAFNYEKNEKIKMIRMDMDKMASKIASEIIQLHMQTHADYHNA
LNALISRYKDASIALFDSKKRVLYSNIPESADLIKTHKEADFFSFKGEYYLFSDETFAHL
GVAKMLFKNSKPLHFYSLYRNMVLVFVVAFLCVIGVSVFLGRLFLKPIRNEIIRIDHFLK
NTTHELNTPMSALVLSLKTLEDNQQHRRIKIAIQRMSFLYRSLSYLVMQDIERESFVLLD
LKALIIKENTLFSEMIDYHKLEFKSDLVGVELKAKEQDFISLYSNLLMNAIKYSVMHGYI
HIELTPEFLKVKNLGYEIPKDKITELSVRYARFNSSVLGYGIGLDLVKKVCEKYKMRLEI
HSEPSLKGSFHENSFCIHFQG
NT seq
2406 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaaaattagaaaaaattttgctagaaatcacacagcttgatcctagtaaagagtgt
ttgaaattcttagctaatcgtataaaaagctctgattataggagcttacacttatcccaa
cacaatcgttacgatcaaaataagattaaaatcattattcaagctatttttaatgaagtg
ggagagaattttttgcaaattcgcaccaccgatatgagcaaacgccctagcaatatcata
ggcgaagagatttatgcaaaagtggttgataatatctgcaagtctgaaatgcctcaagat
aatttaaaaaaaaagaatcaagtaacccaagatagcttgagaaaaaatctttttgtagat
atgcatagaatgggattgattgaacgctacaataaaaataaggaacctacaagcccctac
atccaaagcaatattaaatatatcagtttaactcccttagctatagaatttttaaacgcg
caggatttgttaagaaaaaatttttgttacacgcaagctttagaaaatcttttacaaggt
tttggggcagaatgcagagaggtgatgatagagcttgaaaatcattatttagacattgaa
gaaatgatgttttttgttacatttttaaatattgaaaattttactagaagtgaaattata
gaatatgttagagagtataggagtttaagccgtatccaaaaagaaaaattaaaagagtta
gcgcaagattattgcaatcctaaccattttaacggaaacaagttagacaagagagattat
cataattggaaaaatcaagcccaacaaatttttagcttgctagaacaaagcgtgtttttt
gaaaccaataaagagaggcttattttaaaaacgctcaatgaagaaaacaaacaaaacgat
aaaaaactcaaacgctccattaaagaaaaagccctttattttgaaaaacatggcgtaaaa
aaagaaaagggctttgagttgcaccatattgtgcctttatgtttggctcgctctatagaa
gagtttgatcttttggataaatgggaaaatttaatctatattgacgcttttaaccatgcg
aaaatatctcaaacgcaaaataaacatctttgtttgtattttgaaaattgcgatgtgatt
ttatctaaaggcttaaaagaagaacaagaaagcctttattttacttacattgaaaatgtg
ttatataaacttgatttacaaaatatcatgctgaaatacaaaaaatcccttaaactcttt
ttagggacttatttaggctcttcgtttgtgttaatgctagtgattagcgttttagcgttt
aactatgaaaaaaacgaaaaaatcaaaatgatacgcatggacatggacaaaatggcttct
aagattgctagtgaaattatccaattgcacatgcaaacgcatgcggattatcacaacgct
ttaaacgctctgatttcacgctataaagacgcttccatagccctttttgatagtaaaaag
cgtgttttatattccaatatccctgaaagcgcggatctgattaaaacccataaagaggcg
gatttttttagttttaagggggagtattacttattcagcgatgaaactttcgctcattta
ggcgtggctaaaatgctttttaaaaattctaaaccccttcatttttattctttgtatcgt
aatatggttttagtgtttgtcgtagcgtttttatgcgtgataggggtttctgtgtttttg
gggcgtttgtttttaaagcccattaggaatgaaatcattcgcatcgatcatttcttaaaa
aacaccacgcatgaattaaacacccccatgagcgctttagtcttgtctttaaaaacttta
gaagacaaccaacaacaccgccgcattaaaatcgctatccagcgcatgagttttttatac
cgctctctctcttatttggtgatgcaagacattgagcgcgaatcctttgtgcttttggat
ttaaaagccctaattattaaggaaaacacgctttttagcgagatgatagactaccacaag
ctggaatttaaaagcgatctagtgggagtggaattgaaggctaaagagcaggatttcatt
tcgctttatagcaatttgctcatgaatgcgatcaaatacagcgtcatgcatgggtatatc
cacatagagctaacgcctgagtttttgaaagtgaaaaatttagggtatgaaatccctaaa
gacaagatcacagaattaagcgttcgttacgcgcgtttcaattctagcgtgttgggttat
ggtatagggttagatttagtgaaaaaagtgtgtgaaaagtataaaatgcgtttagaaatt
catagcgaaccctctttaaagggatcgtttcatgaaaattcgttctgtattcattttcaa
ggataa
DBGET
integrated database retrieval system
