Helicobacter pylori 83: HMPREF0462_0964
Help
Entry
HMPREF0462_0964 CDS
T01915
Name
(GenBank) outer membrane protein
KO
K15843
outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hpx
Helicobacter pylori 83
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEE70568
UniProt:
F4D6E3
LinkDB
All DBs
Position
956189..957742
Genome browser
AA seq
517 aa
AA seq
DB search
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGTKRDELARELNADV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPEKLSDNDVSANALLGGAVGSGTCAAAG
TAGGNSLNTQSACTAAGYYWLPSLSNRVLSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAANVF
FNAMNKALEAKNGTNGTSGATGSNGQTYPQNAIQYLQDQQTILNNAANLLKQDELLLEAF
NSAVAANIGNKEFNSAVFTGLVQGIIDQSQSVYNELSKNPISGSAFNNAANNQLTNQANA
VQGRANQLSNALYNAQVTLDKINTLNNQVRSMPYLPQFRAGNSRSTNILNGFYTKVGYKQ
FFGKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMG
FFSGIQLAGETFQSTLRDDPNVKLHGKVNNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHTV
EFGVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq
1554 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgtgctagcataagttat
gccgaagacgatggagggtttttcaccgtcggttatcagctcgggcaggtcatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcactaaaagagatgaactcgcaagagagcttaacgctgatgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcgttgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggggcgtatcccgagaaactcagtgataacgat
gtgtctgcgaacgctcttttagggggtgcggtaggcagtgggacttgcgcggctgcaggg
acggctgggggcaattctcttaacactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctcccaagcctttctaacagggttttaagcacgatcggcagccagactaactacggcacg
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcggcgaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaggctttagaggccaaaaatggaactaatggaactagtggtgcg
actggttcaaatggtcaaacttaccctcaaaatgctattcaataccttcaagaccaacaa
actattctcaataatgcagccaacttgctcaagcaagatgaattgctcctagaagctttc
aactctgccgtagccgccaacattgggaataaggaattcaattcagccgtttttacaggt
ttggtgcaaggcattattgatcaatcccaatcagtttataacgaactcagtaaaaacccc
attagcgggagtgcgtttaataacgctgcaaataatcaactaactaaccaagctaacgct
gtgcaagggcgtgctaaccagctctctaacgctctttataatgcgcaagtaactttggat
aaaatcaatacgctcaacaatcaggttagaagcatgccttacttgccccaattcagagcc
gggaacagccgttcaacgaacattttaaacgggttttacactaaagtgggctataagcaa
ttcttcgggaagaaaaggaatatcggtttgcgctattatggtttcttttcttataacgga
gcgagcgtgggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtgggg
actgatgtgttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatgggc
ttttttagcggtatccaattagccggtgagaccttccaatccacgctcagagatgacccc
aatgtgaaattgcatgggaaagtcaataacacgcacttccagttcctctttgacttcggt
atgcggatgaacttcggtaagttggacgggaaatccaaccgccacaaccagcacacggtg
gaatttggcgtcgtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggactacc
gtgaagtatttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system