Helicobacter pylori 83: HMPREF0462_1112
Help
Entry
HMPREF0462_1112 CDS
T01915
Symbol
edd
Name
(GenBank) phosphogluconate dehydratase
KO
K01690
phosphogluconate dehydratase [EC:
4.2.1.12
]
Organism
hpx
Helicobacter pylori 83
Pathway
hpx00030
Pentose phosphate pathway
hpx01100
Metabolic pathways
hpx01120
Microbial metabolism in diverse environments
hpx01200
Carbon metabolism
Module
hpx_M00008
Entner-Doudoroff pathway, glucose-6P => glyceraldehyde-3P + pyruvate
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hpx00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00030 Pentose phosphate pathway
HMPREF0462_1112 (edd)
Enzymes [BR:
hpx01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.1 Hydro-lyases
4.2.1.12 phosphogluconate dehydratase
HMPREF0462_1112 (edd)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ILVD_EDD_N
ILV_EDD_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEE70716
UniProt:
F4D282
LinkDB
All DBs
Position
complement(1116459..1118402)
Genome browser
AA seq
647 aa
AA seq
DB search
MAKSPVAPKRTKSKSNINNPFRVFLSYYYILKILIKGVFMPKHSLEQIKEKITERSKKTR
ELYLENIFNPKNQPKIESLGCANIAHVTASMPEHLKMPLGSHKRKHFAIITAYNDMLSAH
QPFKNYPDWIKKELQEHNAYASVASGVPAMCDGITQGYDGMELSLFSRDVIALSTAVGLS
HNVFDGAFFLGVCDKIVPGLLIGALSFGNLASVFVPSGPMVSGIENYKKAKARQDFAMGK
ISREELLKVEMQSYHDVGTCTFYGTANSNQMMMEFMGLHVANSSFINPNNPLRKVLVEES
AKRLASGEVLPLAKLIDEKSILNALIGLMATGGSTNHTLHLIAIARSCGVILNWDDFDAV
SNLIPLLAKVYPNGSADVNAFEACGGLAFVIKELLKEGLLFEDVHTIMDTKTQKGMQNYT
KTPFLENGQLVYKDAVNHSLNTDILRPVSEPFAANGGLKILKGNLGRSVIKISAIKDEHR
KVKARAIVFKTQSEFLERFKNKELERDFVAVLPFQGPKSNGMPELHKLTTNLGALQDMGY
KVALVTDGRMSGASGKVPSAIHLSPEGALNGAIIKIIDGDLIELDAPNNALNVLEKDFED
RGINPLFLETLENLEKPSFGLGRELFTSLRLNVNTAEEGAMSFGIKV
NT seq
1944 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaaatccccagtcgcaccaaaaagaaccaaatcaaaatctaacatcaataaccct
tttagagtgtttttgagttattattatatattaaaaatcttaattaaaggggtgttcatg
cctaagcattctttagaacaaatcaaagaaaaaattacagagcgtagcaaaaaaaccaga
gagctttatttagaaaatatctttaaccctaaaaaccagcccaagattgagagcttgggt
tgcgcgaatattgcgcatgttacagcgagcatgccagagcatttaaaaatgcctttaggt
tcgcataaaagaaagcattttgcgattatcacggcttataatgacatgctttcagcccac
caaccttttaaaaattaccctgattggattaaaaaagaattgcaagagcataacgcttat
gcgagcgtcgctagtggggtgccagcgatgtgtgatggtatcacgcaaggttatgatggc
atggaattgagcttattcagtagagatgtgatcgccttaagcaccgccgtggggttgagt
cataatgtttttgacggggcgttttttttgggcgtgtgcgataaaatcgtgccaggcttg
ctcataggagcgttaagttttgggaatttagcgagcgtgtttgtgccaagcgggcctatg
gtgagcgggatagaaaattataaaaaagccaaagcgcgccaggattttgcaatgggaaag
atcagcagagaagagcttttaaaagtggaaatgcaaagctatcatgatgtgggcacttgc
actttttatggcacggctaattccaatcaaatgatgatggagtttatggggttgcatgtg
gctaattctagctttatcaaccctaacaaccccttacggaaagttttagtagaagagagc
gcgaaaagattagcgagcggggaagttctgcctttagccaaactcattgatgaaaaaagc
attcttaacgctcttataggcttaatggcaaccggaggttctactaaccacactttacat
ttgatcgctatcgctagatcttgtggggtgattctcaattgggacgattttgacgctgtt
tccaatctcataccccttttagctaaagtctatcctaacggatcggcggatgtgaatgct
tttgaagcgtgtgggggattagcgtttgtgatcaaagaattgttaaaagaggggcttttg
tttgaagatgtgcatacgattatggataccaaaacgcaaaaaggcatgcaaaattacacc
aaaaccccctttttagaaaacggccaattggtgtataaggacgctgttaatcatagctta
aatacggatattttacgccctgttagcgagccttttgccgctaatggggggcttaaaatc
ttaaagggtaatttagggcgctccgtgattaaaatttcagccattaaagatgagcatagg
aaagtcaaggctagagcgattgtttttaaaacccaaagcgaatttttagaacgctttaaa
aataaagaattagaaagggactttgtggctgtcttgcctttccaagggcctaagtctaac
ggcatgccagaattgcacaaactcaccacgaatttaggggctttgcaagatatgggctat
aaggtcgcgctggttacggatgggcgcatgagcggggcgagcgggaaagtgcctagcgcg
atccatttaagccctgagggagcgttaaacggggcgatcattaagattatagatggcgat
ttgatagaattagacgctcctaataatgctttgaatgtgcttgaaaaggattttgaagat
agaggcatcaaccccttgtttttagaaaccttagaaaatttagaaaagcctagttttggg
ttgggtagggaattatttacgagtttgagattgaatgttaatacggctgaagagggtgct
atgagttttggcataaaggtataa
DBGET
integrated database retrieval system