Helicobacter pylori 26695: HP_0912
Help
Entry
HP_0912 CDS
T00008
Name
(GenBank) outer membrane protein (omp20)
KO
K15843
outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hpy
Helicobacter pylori 26695
Pathway
hpy05120
Epithelial cell signaling in Helicobacter pylori infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hpy00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05120 Epithelial cell signaling in Helicobacter pylori infection
HP_0912
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAD07960
UniProt:
O25570
LinkDB
All DBs
Position
965177..966724
Genome browser
AA seq
515 aa
AA seq
DB search
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGAKSDELARELNADV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPTKLNGNDVSANALLSGAVGSGTCAAAG
TAGGSTLNTQSACTAAGYYWLPSLTDRILSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAGNVF
FNAMNKALEAKNGSSGASGATGSDGQTYSTQAIQYLQRQQNILNNAANLLKQDELLLEAF
NSAVAANIGNKEFNSAAFTGLVQGIIDQSQLVYNELTKNTISGSAVNGAEINSNQANAVQ
GRASQLPNALYNAQVTLDKINALNNQVRSMPYLPQFRAGNSRSTNILNGFYTKIGYKQFF
GKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMGFF
SGIQLAGETFQSTLRDDPNVKLHGKINNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHTVEF
GVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq
1548 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagatgatggagggtttttcaccgtcggttatcagcttgggcaggtcatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcgctaaaagcgacgaactcgctagagagcttaacgctgatgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcgttgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggggcgtatcccacgaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttaagtggtgcggtaggctctgggacttgcgcggctgcaggg
acggctggtggctcaactcttaacactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctccctagcttgactgacaggattttaagcacgatcggtagccagactaactacggcacg
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcggggaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaggctttagaggccaaaaatggaagtagtggcgctagcggtgcg
actggttcagatggtcaaacttactccacacaagctatccaataccttcaacgccaacaa
aatatcttaaataacgcagccaacttgctcaagcaagatgaattgctcttagaagctttc
aactctgccgtagccgctaacattgggaataaggaattcaattcagccgcttttacaggt
ttggtgcaaggcattattgatcaatcccaattggtttataacgagctcactaaaaacacc
attagcgggagtgcggttaatggtgctgagataaactccaaccaagctaacgctgtgcaa
gggcgcgctagtcagctccctaacgctctttataacgcgcaagtaactttggataaaatc
aacgcgctcaacaatcaggtgagaagcatgccttacttgccccaattcagagccgggaac
agccgttcaacgaatattttgaatgggttttacaccaaaataggctataagcaattcttc
gggaagaaaaggaatatcggtttgcgctattatggtttcttttcttataacggagcgagc
gtgggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtggggactgat
gtgttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatgggctttttt
agcggtatccaattagccggtgagaccttccaatccacgctcagagatgaccccaatgtg
aaattgcatgggaaaatcaataacacgcacttccagttcctctttgacttcggtatgagg
atgaacttcggtaagttggacgggaaatccaaccgccacaaccagcacacggtggaattt
ggcgtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggactaccgtgaag
tatttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
