Helicobacter pylori 26695: HP_0922
Help
Entry
HP_0922 CDS
T00008
Name
(GenBank) toxin-like outer membrane protein
Organism
hpy
Helicobacter pylori 26695
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VacA2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAD07969
UniProt:
O25579
LinkDB
All DBs
Position
979432..987021
Genome browser
AA seq
2529 aa
AA seq
DB search
MAFKKARLISKFISKGSFKLNKISKKIFTLNQILKCEKPLKRHKKALKPIKKLSNRNKSF
LKASVLLIGALGGLSHLRANECRYWSWSSWSYQDNIESGPNSPTHNSYCLFSSTQGSGTY
YLNTLTTYSAGGASFTQKFNNGTLNVGENIRFGGTGINGGDVGYITGTYDAQTINFNSSH
LTTGNSYADGGGATLNFNAANNITINQASFDNSHAGTQKSYMNFKGSNIKVSGSSFTDDT
DGGFSFSGNSNNSTISFNQTSFNQGTYHFSNSATLSFNHSAFNQGTYNFNSTQSAFNNSA
FNQGTYHFNGNASFDNDTFNQGTYSFNTSKVSFSGINTLNSSSPFASLKGSVSFGSDAIF
NLNQTLNNQTYDILTTNGAIQYGVYQSYLWDLINYKGDKAISHVEVGNNTYDVTFDINGQ
DETLQETFNKQSIITQFLGDDLQQQAQKTYQQDLSNSQSALNNAASDNKIANSDTDYTKN
KNATIKKDAQGLENTNQQIAQDEQALQGDLDKLKQLANSPTGFSEQAFNQAQKQEQQDEQ
TLQNEEKTFNSEQEGLKQAIQQAQAQQQKQQQKQEQQQAQQTYQEDLTHSQSALNDVASD
NTIASNDTNYTNNQNTAIKEDAQGLENTNQQIAQDEQALQGDLDKLKQLANSPTGFSEQA
FNQAQKQEQQDEQTLQNEEKTFNSEQERLKQAIANAKPTSPTPSHAPTPTKHTAPNTPPN
KVPPTPPTQNPPAESVWSGVYWLQNKTYSNKGIYYIDPNLSGQSGQSGNTLSTYTANLFG
RSFSVNIQNGTLIIGNNTESVNSNGLIWIGHGGFGYITGTFSAANIYLTNNFKTGEGVSN
SDGGGANITFKASDNITMDGLNYNDAETVTKMIQTGASQHSYATFDALNNISVTNSSFSD
MTWGKFSFSAKNISFSNASFSGFTNPGGSSVISANATNSLSFINSRLNGGAVYNLQANSL
IFNNTQAVFNVLYSRGTSNFNATTQLLGNTNFTLSSQSLLNFNGDTTLQNNANITLGNKS
QAAFKNSLTLDNNSNLSLDNQSVLNANNTSAFNNQASLNIYNGSQATFNSLFFNGGTLSL
NASSKLNASNASFSNNTTINLDDSVLSASNTSSLNANINFQGASQADFGGNTIIDTASFN
FDSASSLNFNNLTANGALNFNGYTPSLTKALMSVSGQFVLGNNGDINLSDINIFDNITKS
VTYNILNAQKGITGISGANGYEKILFYGMKIQNATYSDNNNIQTWSFINPLNSSQIIQES
IKNGDLTIEVLNNPNSASNTIFNIAPELYNYQASKQNPTGYSYDYSDNQAGTYYLTSNIK
GLFTPKGSQTPQAPGTYSPFNQPLSSLNIYNKGFSSENLKTLLGILSQNSATLKEMIESN
QLDNITNINEVLQLLDKIKITQVQKQALLETINHLTDNINQTFNNGNLIIGATQDNVTNS
TSSIWFGGNGYSSPCTLDSATCSSFRNTYLGQLLGSTSPYLGYINADFKAKSIYITGTIG
SGNAFESGGSADVTFQSANNLVLNKANIEAQATDNIFNLLGQKGIEKIFNQGNLANVLSQ
VAMEKIKQAGGLGNFIENALSPLSKELPASLQNETLGQLIGQNNLDDLLNNSGVMNAIQN
IISKKLSIFGNFVTPSIIENYLAKQSLKSMLDDKGLLNFIGGYMNASELSSILSVVLKDI
TNPPTSLQKDIGVVANDLLNEFLGQDVIKKLESQGLVSNIINNIISQGGLSGVYNQGLGS
VLPPSLQNALKENDLGTLLSPRGLHDFWQKGYFNFLSNGYVFVNNSSFSNATGGSLNFVA
NKSIIFNGDNTIDFSKYQGALIFASNDVSNINITTLNATNGLSLNAGLNNVSVQKGEICV
NLANCPTTKNSSSTNSSVTPTNESLSVRANNFTFLGAIASNGAIDLSQVKNNSVIDTLNL
NENAALQANNLTITNAFNNASNSTANINGNFTLNQQATLSTNASGLNVMGNFNSYGDLVF
NLSHSVSHAIINAQGSATIMANNNNPLIQFNTSSKEVGTYTLIDSAKAIYYGYNNQITGG
SSLDNYLKLYTLIDINGKHMVMTDNGLTYNGQAVSVKDGGLVVGFKDSQNQYIYTSILYN
KVKIAVSNDPINNLQAPTLKQYIAQIQGTQGVDSIDQAGGSQAINWLNKIFETKGSPLFA
PYYLESHSTKDLTTIAGDIANTLEVIANPNFKNDATNILQINTYTQQMSRLAKLSDTSTF
ASADFHERLEALKNKRFADAIPNAMDVILKYSQRNRVKNNVWATGVGGASFINGGTGTLY
GINVGYDRFIKGVIVGGYAAYGYSGFHANITQSGSSNVNMGVYSRAFIKRSELTMSLNET
WGYNKTFINSYDPLLSIINQSYKYDTWTTDAKINYGYDFMFKDKSVIFKPQIGLAYYYIG
LSGLRGIMDDPIYNQFRANADPNKKSVLTINFALESRHYFNKNSYYFVIADVGRDLFINS
MGDKMVRFIGNNTLSYRDGGRYNTFASIITGGEIRLFKTFYVNAGIGARFGLDYKDINIT
GNIGMRYAF
NT seq
7590 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtttaaaaaggccaggttgatttccaagtttatttcaaagggatctttcaaattg
aataagatctcaaagaaaattttcacattgaatcaaatcttaaaatgtgaaaagccctta
aaacgccataaaaaagctttaaaacctattaaaaagctctctaatcgcaacaaatctttt
ttaaaagcttcggttttattgataggagcgttaggggggttatcccacctaagggctaac
gaatgccgttattggtcatggtcgtcttggagttaccaagataatattgaaagcggtcct
aattcgcccacgcacaactcttattgcctttttagtagcactcaaggctctgggacttat
tatttaaacactcttaccacttatagcgctggtggggctagtttcacgcaaaaattcaat
aacggcacgcttaatgtgggagagaatatccgctttggaggcacaggtattaatgggggt
gatgtcggctatatcacaggaacttatgacgctcaaacgattaattttaattctagccat
ttaacaaccggaaactcatacgctgatggtggtggggccacgctcaattttaatgcggcc
aataatatcactatcaatcaagcgagttttgacaatagccatgcagggacgcaaaaatct
tacatgaattttaaaggctctaatatcaaggtcagtggctctagttttacagatgatact
gatgggggctttagtttcagcggtaatagtaataacagcaccatctcctttaatcaaacg
agcttcaatcaagggacttatcactttagtaatagcgccactttaagcttcaatcatagc
gctttcaatcaagggacttataactttaatagcactcaatctgcttttaataacagcgct
ttcaatcaagggacttatcatttcaatggcaacgccagctttgataacgacaccttcaat
caaggcacttatagctttaataccagcaaggtgagtttctcaggcatcaacactttaaat
tcaagttcgccttttgctagccttaaaggcagtgtgtcttttggttctgatgcgattttt
aacctcaatcaaacccttaataatcaaacctatgatattctcactacaaacggggcgatc
cagtatggggtttatcaaagctatttgtgggatctaatcaactataagggcgataaagcc
attagccatgttgaagtgggcaataacacttatgatgtaacctttgatattaacgggcaa
gatgaaaccttacaagaaacctttaacaaacaatccattattacccaatttttaggagat
gatttacaacaacaagcccaaaaaacctaccaacaagacttgagcaactcccaaagcgct
ttaaataacgctgctagtgataataagatcgcaaatagcgatacagactacaccaagaat
aaaaacgccactatcaaaaaagacgctcaaggtttagaaaacaccaaccaacaaatcgct
caagatgaacaagcgttacaaggagatttagacaagctcaaacaattagccaactcccca
acaggctttagtgaacaagctttcaatcaagctcaaaaacaagaacaacaagatgaacaa
accttacaaaacgaagaaaagacttttaatagcgagcaagagggattgaaacaagcgata
caacaagcacaagcccaacaacaaaaacaacaacaaaaacaagaacaacaacaagcccaa
caaacctatcaagaggatctcactcattcccaaagcgctttgaatgatgtggctagcgac
aacacgatcgcaagcaatgatacaaactacaccaacaatcaaaacaccgctatcaaagaa
gacgctcaaggtttagaaaacaccaaccaacaaatcgctcaagatgaacaagcgttacaa
ggagatttagacaagctcaaacaattagccaactccccaacaggctttagtgaacaagct
ttcaatcaagctcaaaaacaagaacaacaagatgaacaaaccttacaaaacgaagaaaag
acttttaatagcgagcaagagagattgaagcaagcgatagctaacgctaagcctacaagc
cccacaccaagccatgcacccactcctacaaaacacaccgcgccaaacactcctcctaat
aaagttccacccacaccccctactcaaaatccacctgcagaaagcgtgtggagtggggtt
tattggcttcaaaacaaaacctactcaaacaaaggcatttattatattgatcccaatctt
tcaggacagagcggtcaaagcggcaacacgctcagcacttatacagctaatttgtttgga
agaagttttagcgttaatatccaaaatggcactttgatcatagggaataatacagagagc
gtgaatagtaatgggttgatttggatagggcatggaggttttggctatattacgggaact
tttagtgcggctaacatttacttgaccaataattttaaaaccggtgaaggcgtttcaaat
tcagatggtgggggagcgaacattacctttaaagcaagcgataatatcactatggatggc
ttgaattataatgacgctgaaaccgttactaaaatgattcaaacaggggctagccagcat
tcctatgccacttttgacgctctaaataatatcagcgtgactaattccagttttagcgat
atgacttggggaaaattcagttttagcgctaagaatatttcgttttctaacgcttcgttc
agcggctttacaaaccctggaggatcaagcgttattagcgctaacgctactaattcttta
agctttatcaattctcgtttgaatgggggagcggtttataatttgcaggctaatagcctt
attttcaataacacgcaagcggtttttaatgtcttgtattctagggggacaagcaatttt
aacgccaccacacagcttttaggcaacacgaattttacgctcagttctcaaagtttgttg
aattttaatggcgatacaaccttgcaaaacaacgccaatatcacgcttggcaataaaagt
caagccgcttttaaaaattctttaacgcttgataataattctaatttgagtttagacaat
caaagcgttttgaatgcgaataacacaagcgcttttaacaatcaagcgagtctcaatatt
tataacgggagtcaagcgacctttaatagcctcttttttaatggcgggacactcagtctt
aacgctagtagcaagctcaacgcttctaacgctagtttttcaaacaacaccactatcaat
ttagacgatagcgttttatcggctagtaacacaagctctttaaacgctaatatcaatttt
caaggcgcaagccaggctgattttggaggcaacacgattattgatacagcgagctttaat
tttgacagcgcaagttcattgaattttaacaaccttacggctaatggagcgttaaatttt
aatggttatacgccctctttgactaaggctttaatgagcgttagcgggcagtttgtttta
gggaataatggggatattaatttatctgacatcaatatttttgataacatcacaaaatct
gtaacctacaacatcctaaacgctcaaaaagggattactggcatcagtggggctaatggc
tatgaaaaaatccttttttatggcatgaaaatccaaaacgctacctatagcgacaacaat
aacatccaaacttggtcgtttataaaccctctcaattcttctcaaatcattcaagagagc
attaaaaatggggatttaaccatagaagttttaaataaccccaactcggcttccaacact
attttcaatatcgctcctgagctttataattaccaagcttctaagcaaaatcctaccggc
tatagctatgattatagcgacaatcaagcaggcacttattacttgacaagcaacattaaa
ggtcttttcacccctaaaggctctcaaactcctcaagccccaggcacttatagcccgttt
aaccagcctttgagtagtttgaatatctacaataagggtttttctagcgagaatttaaaa
acgcttttagggatcctttctcaaaattccgctaccttaaaagaaatgattgaatccaac
caactagacaatatcactaacattaatgaagtgttgcaactcttagacaagattaaaatc
acccaagtgcaaaagcaagcactcctagaaacgatcaaccatttgactgacaacatcaat
caaacctttaataatgggaatctaattataggcgctactcaagataatgttacaaactct
actagctctatatggtttgggggcaatggctatagcagtccttgcacgctagatagcgcc
acttgttcttcttttagaaacacttacttagggcaattattaggctcaacttccccctat
ttaggctacattaacgctgattttaaagctaaaagcatttatattaccggaacaattgga
agtggtaacgcctttgaaagcggagggagcgcggatgtaacctttcaaagcgctaataac
ttagtgttgaataaagccaacatagaagctcaagctacagacaatatctttaatcttttg
ggccaaaaagggattgagaaaatctttaatcaagggaatttagcgaatgttctcagtcaa
gtggctatggaaaaaatcaagcaagccggcggtttaggaaactttatagaaaacgctcta
agccctttgagtaaggaattgcccgctagcttgcaaaatgaaaccttaggccaacttata
ggtcaaaataacttagatgatttattgaataatagcggggtcatgaatgcaatccaaaat
attatcagtaaaaaactaagcatttttggtaattttgttaccccatccatcatagaaaac
taccttgctaagcagtctttaaaaagcatgctagacgataaagggcttttgaattttatc
ggtgggtatatgaacgcttctgaattaagttctattttaagcgtggttttaaaagatatt
actaatccccctacaagcttgcaaaaagacatcggtgtggtagcgaacgacttgttgaac
gagtttttaggacaagatgttatcaaaaagctagaaagtcaaggcttagtgagtaatatc
attaataatatcatttctcaaggcgggttaagcggcgtttataatcaaggtttagggagc
gtgttgccgccctctttacaaaacgcgctcaaagaaaacgatttaggcactcttttatcg
cctagaggcttgcatgatttttggcaaaaagggtattttaactttttaagcaatggctat
gtttttgtcaataacagctcttttagcaacgctacaggaggcagtttgaattttgtcgcc
aacaagtctattatttttaatggcgataatacgattgactttagcaagtatcagggcgca
ttgatttttgcttctaatgatgtttctaatatcaatatcaccaccctaaacgctactaat
ggcttaagccttaatgcgggtttgaataacgtgagcgttcaaaaaggggaaatttgtgtc
aatttagccaattgccccacaaccaaaaacagctcttctacaaactctagcgtaaccccc
actaatgaatctttaagcgtgcgcgctaacaacttcactttcttaggcgcaatcgcttct
aatggggctattgatttgtctcaagtgaaaaataatagcgttatagacacgctcaatctt
aatgaaaatgcggccttgcaagccaataatttaacgatcactaacgcttttaacaacgcc
tctaactctacagctaacattaatggtaatttcaccttaaaccaacaagcgaccttaagc
actaacgctagtggcttgaatgtcatggggaattttaatagctatggcgatttggtgttt
aacctcagccattcagttagccatgccattatcaacgctcaaggcagtgcgacaatcatg
gctaataacaataaccccttaatccaattcaacacttcttcaaaagaagttggcacttac
acgcttattgatagcgctaaagccatttattacgggtataacaaccaaatcacaggaggc
agtagcctagataattaccttaagctttacactcttattgatattaatggcaagcacatg
gtgatgactgacaacggcttaacctataacgggcaagccgtgagtgttaaagatggcggt
ttagttgtgggctttaaagactctcaaaatcaatatatttacacttccattctttataat
aaagtgaaaatcgctgtttctaatgatcctatcaataacctacaagcccccactttaaaa
caatacatcgctcaaattcagggcactcaaggcgtggatagcattgatcaagctggaggc
agccaagcgattaattggctcaataaaatctttgaaactaagggaagtcctttattcgct
ccctattatttagaaagccattccacaaaagatttaaccacgatcgctggagatattgct
aacactttagaagtcatcgctaaccctaattttaaaaatgacgccaccaatattttacag
atcaacacctacacgcagcaaatgagccgtttagccaagctctctgacacttcaactttt
gctagcgctgattttcacgagcgattagaagcccttaaaaacaagcgattcgctgatgcg
atccctaacgctatggatgtgattttaaaatactctcaaagaaacagagtcaaaaataat
gtatgggcgacaggagttggaggggctagtttcattaatggaggcactgggactttatat
ggtatcaatgtagggtatgaccgatttattaagggcgtgattgtggggggttatgccgct
tatgggtatagcgggtttcatgcaaacatcactcaatcaggctctagcaatgtcaatatg
ggtgtttatagccgagcgtttatcaaaagaagcgaattaacgatgagcttgaatgagact
tggggatacaataagactttcatcaactcttatgaccccctactctcaatcatcaatcag
tcttacaaatacgacacctggacgactgacgctaaaatcaattatggctatgatttcatg
tttaaagataaaagcgttatttttaaacctcaaataggcttagcctattattacattggt
ttgtctggtttaaggggcattatggatgatcctatttacaatcagttcagagccaatgct
gatcctaataaaaaatccgttctaacgattaattttgctctagaaagtcggcactacttc
aataaaaactcttattattttgtgattgcggatgtgggcagagatttatttattaattct
atgggggataaaatggtgcgttttattggtaataacaccctaagctatagagatggcggc
agatacaacacttttgctagcattatcacaggcggggagataaggttattcaaaaccttt
tatgtgaatgcgggcattggggctaggtttgggcttgattataaagatattaatatcacc
ggaaatattggtatgcgctatgctttttaa
DBGET
integrated database retrieval system