Helicobacter pylori oki112: HPOKI112_01735 Help Entry HPOKI112_01735    CDS       T03723                                  Name (GenBank) toxin outer membrane protein Organism hpyc  Helicobacter pylori oki112 SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  VacA2 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AHN35818 LinkDB All DBs Position 339540..348248 Genome browser AA seq 2902 aa AA seqDB search MKKFKKKPKSIKRSHQKIILKRPLWFVPLLIGGFASGVYADGTDILGLSWGEKSQKVCVH HPWYAIWSCDKWEEKTQQYTGNQLITKTWAGGNAANYYHTQNNQNITANLKNDNGTYFLS GLYNYTGGEYNGGNLDIELGSNATFNLGASSGNSFTSWYPNGHTNVTFSAGTITVNNSVE VGNRVGSGAGTHTGTATLNLNANKVNINSNISAFKTSQVNVGNTNSTITIGSVSLSGDTC SSLASVGVGANCSTSGPSYSFKGTTNATNTAFSNASGSFTFEENATFSGAKWNGGTYTFN KEFNATNNTAFNSGSFNFKGTSSFNGASFSNASYTFNNQATFQNSSFNGGTFTFNNQTNQ SAQHPQIQNSSFSGNATILKGSVIFQQAFNNSNHQLTIQNASFNNANFNNTGKITINESA SFNDTTFNTSVDTNNMSVTGSVTLSGKNDLKNGSTLDFGSSKITLTQGTTFNLTSLSSEK SVTILNSSGGITYNNLLNHALNSLTNALKTNESSSLPQSFAQGLWGMITYNGVTGQLLNK NAATSKNTDSSPSKSSSNPTQVYQVGYKIGDTIYKLQETFSTNSIIIQALESGTYTPPPT ISGSQFDLSASNYINADMPWYDHKYYIPKSQNFTESGTYYLPSVQIWGSYTNSFKQTFSA SNSNLVIGYNSTWTGNSVSSSDTVSFGDTSGSVLNGHCGPWPYYQCTGTTNGTYSAYHVY ITANLRSGNRIGTGGAANLIFNGVDSINIANATITQHNAGTYSSSMTFSTQNMDNSQNLK GLNSNGTLSVYGTTFTNQAKYGKFIFNAGQATFENTSFNGGSYQFSGDSLNFSNNNQFNS GSFEISAKNASFNNAHFNNSTSFNFNNSNATTSFMGDFTNAHSNLQIAGNAVFGNSTNGS QNNANFNNTGSVNILGNATFYNVVFNGPTNTSVKGQVTLNNITLKNLNAPLSFGDGTIVF NAHSVINIGEAITNGNPITLVSSSKEIEYNNAFSKNLWQLINYQGHGASSEKLVSSVGNG VYDVVYFFNNQTYNFQEVFSPNSISIRRLGVGMVFDYMDMEKSDHLYYKDVVGFMTYMPN SYNNNLGNSNNTIYYYDKSIDFYASGKTLFTKAEFSQIFTGQNSAIVFGAKSIWTDASDA PQSNAIIRFGDNKGAGSNDASGHCWNLQCIGFITGHYEAQKIYITGSIESGNRISSGGGA SLNFNGLQGILLTNATLYNRVAGTQSSSMNFVSNSANIQVQNSYFIDDTAQNGGNPNFSF NALNLDFSNSSFRGYVGKTQSVFKFNAVNAISFTNSTNLSSGLYQMQAKSVLFDNSNLSV SVGTSSIKANAINLSQNASINASNHSTLELQGDLNLNDTSSLNLNQSAINVSNNATINDY ASLIASNNAHINFNGAVNFNSANITTSLNDSSIVFKGAISLGGQFNLSNNSSLDFQGSSA IISNTAFNFYDNAFSQSPITFHQALDIKAPLSLGGNLLNPNNSSVLNLKNSQLVFSDQGS LNIANIDLLSDLNDNKNRVYNIIQAGMNNNWYERINFFGMHISDGIYDAINQTYSFTNPL NNALKITESFKDNQLSVTLSQIPGIKNTLYNIGSEVFNYQKVYNNANGVYSYSDDAEGVF YLTSNVKGYYNPNQSYQANGSNNTTKNNNLTSESSIISQTYNAQGNPISALHIYNKGYNF NNIKALGQMALKLYPEIKKVLGNDFSLSSLSDLNPNALNQLTKLITPNDWKNINELIDNA NNSVVQNFNNGTLIIGATKIGQTDTNSAVVFGGLGYQTPCDYTDIVCQKFRGTYLGQLLE SSSADLGYIDTTFNAKEIYLTGTLGSGNAWGTGGSASVTFNSQTSLILNQANIVSSQTDG IFSMLGQEGINKVFNQAGLANILGEVAVQSINKAGGLGNLIVNTLGSGSVIGGYLTPEQK NQTLSQLLGQNNFDNLMNDSGLNTAIKDLIRQKLGFWTGLVGGLAGLWGIDLQNPEKLIG SMSINDLLSKKGLFNQITGFISANDIGQVISVMLQDIVKPSNALKNDVMALGKQMIGEFL GQDTLNSLESLLQNQQIKSVLDKVLAAKGLGPIYEQGLGDLIPNFGKKGLFAPYGLSQVW QKGDFNFNAQGNVFVQNSTFSNANGGTLSFNAGNSLIFAGNNHIAFTNHSGTLQLLSNQV SNINITTLDASNGLKINAGSNNISVSQGDLFINASCTQQSDPTAADATNPCALSAQSTNG ASNASNNMQIALNNNDESLMVTANDFNFSGNIYANGVVDFSKIKGSANIKNLYLYNNAQF QANNLIISNQAVLEKNASFTANNLNIQGAFNNNATQKIEVLQNLTIASNASLSTGIYGLE VGGSLNNFGTIHFNLENIQTPTPLIQAEGIINLNTTQTPFINVNNSMANNTTYTLLKSSR YIDYNINPNSLQSYLKLYTLININGNHIEEKNGVLTYLGQRVLLQDKGLLLSVALPGSNN AHQNNILSLSVLHDQIKMSYGNKIMDFTPPTLQDYIVGIQGQSALNQIEAIGGNNAIKWL STLMMETKENPLFAPIYLKNHSLNEILGVTKDLQNTASLISNPNFRDNATNLLELASYTQ QTSRLTKLSDFRAREGESAFSERLLELKNKRFSDPNPGEVFVKHSQLSKHPNNLWVQGVG GASFISGGNGTLYGLNVGYDRLVKNVILGGYVAYGYSDFNGNIMHSLGNNVDVGMYARAF LKRNEFTLSANETYGGNATSINSSNSLLSVLNQRYSYNTWTTSVNGNYGYDFMFKQKSVV LKPQVGLSYHFIGLSGMKGKMNDAAYKQFLMHSNPSNESVLTLNMGLESRKYFGQNSYYF VTARLGRDLLVKSKGGNTVRFVGENTLLYRKGEVFNTFASVITGGEMHLWRLMYVNAGVG LKMGLQYQDINITGNVGMRVAF NT seq 8709 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaaaagtttaaaaagaaaccaaaaagtatcaaacgatcgcatcaaaaaatcatctta aagcgtcctttatggtttgtgcctttactcatcggtgggtttgctagtggggtgtatgca gatggaacagatattttggggcttagctggggggaaaaaagccaaaaggtatgcgtgcat catccatggtatgctatatggagttgcgataaatgggaggaaaaaacacaacaatacaca ggaaaccaactcatcacaaaaacttgggcagggggtaatgcggctaattactaccacact caaaacaaccaaaatattacagccaatttaaaaaatgataacggcacttattttttaagc ggtctgtataactacaccggaggggaatataatggggggaatttagacattgaattaggc agtaacgctacttttaatctaggtgcgagtagtgggaatagcttcacttcttggtatcct aatgggcatactaatgttacttttagcgctgggactatcactgtgaataacagcgtagaa gtgggcaatcgtgtgggatcgggagctggcacgcacaccggcacagccactttaaacttg aacgctaataaggtcaatatcaattctaatatcagcgcgtttaaaacttcgcaagtgaat gtgggtaatactaacagcactattactatcggttcggtttctttaagtggggatacttgc agttctttagctagtgtgggcgtaggggctaactgctccacttctgggcctagctattct tttaaagggacgactaacgctacgaatacggcttttagtaatgcaagcggcagtttcact tttgaagagaacgccacttttagtggggcaaaatggaatggggggacttatacttttaat aaagagtttaacgctaccaataataccgcctttaatagcggtagttttaattttaaaggc acaagttcctttaatggcgcttcgtttagtaacgcttcctatacttttaacaatcaagcc acctttcaaaacagctcctttaatggggggacttttacttttaataaccagaccaatcaa agcgctcagcacccccaaattcaaaacagctcttttagtggtaatgctaccattcttaag ggttctgtaattttccagcaagcctttaacaattcaaaccaccaattgacgatacaaaac gcctctttcaataacgctaattttaacaataccggtaaaatcaccattaatgagagtgcg agttttaacgacacgacattcaacacttctgttgatacaaacaacatgagtgttaccggt agcgttactttaagcggtaagaatgacttgaaaaatggctcaacccttgattttgggagt tctaaaatcactctcactcaagggacgactttcaatctcacaagtttaagcagtgagaag agcgtaacgattttaaattctagcggtgggatcacttataacaatcttttaaaccatgcg ctcaatagcttgacaaacgccctaaaaacgaacgaaagctcttcattgccgcaaagtttc gctcaaggtttatggggcatgatcacttacaatggggttaccgggcagcttttgaataaa aacgctgcaacatctaaaaatactgactcttcgccctctaaatcctcttcaaaccctacg caagtctatcaagtgggctacaaaataggggatactatctacaaactgcaagaaactttt agcactaattccattatcatccaagctttagagagcgggacttacacgccaccccctaca atcagcggatcacaatttgatttatccgcttcaaattatattaatgctgacatgccttgg tatgatcataaatattatattcctaaatcccaaaattttacagagagcgggacttattac ttgccgagcgttcaaatatgggggagctacaccaactcgtttaaacaaacctttagcgcg agtaatagtaatctggtgatcgggtataactcaacatggactggaaatagcgtttcttct agcgacacggtgtcttttggggacacttcagggagcgttcttaatgggcattgcgggcct tggccctattaccaatgcacaggcacgactaatggcacttatagcgcttatcatgtgtat atcacagcgaatctgcgttctggcaatcgtataggcaccggtggggcagccaatctaatc tttaatggggtagatagtatcaatatcgctaacgctaccatcacgcaacataacgccgga acttattcaagctctatgactttttccacgcaaaacatggacaattcgcagaatttgaag ggtttaaattctaacggcacgctttcggtgtatggcaccactttcactaaccaagctaaa tacgggaaattcattttcaatgcagggcaagcgacttttgaaaacaccagctttaatgga gggagttaccaattcagcggtgatagcttgaatttttcaaataacaaccagttcaatagc ggttcgtttgaaattagtgcaaaaaacgcttcgttcaataacgctcacttcaacaacagc acttcttttaatttcaataattctaacgcaaccacttcgtttatgggggatttcactaac gctcattcaaatttgcaaatcgccgggaacgctgtttttgggaactctactaatggctct caaaataacgctaattttaataataccggctctgttaatattttagggaatgcaaccttt tataatgtggtgtttaatggccctacgaatacgagcgtgaaagggcaagttactttaaat aacatcactttaaaaaacttgaacgctcctttgtcttttggcgatgggacaattgttttt aacgctcattcggtgattaatattggtgaagctatcactaatggcaaccctatcaccctt gtaagctcttctaaagaaattgaatacaacaacgctttcagtaaaaatctatggcagctc atcaactaccaagggcatggggcaagcagtgaaaagctcgtctctagcgtgggtaatggc gtctatgatgtggtgtattttttcaataaccaaacctacaatttccaagaggttttttca ccaaacagcatttctatccggcgtttgggtgttggcatggtgtttgattatatggatatg gaaaaatcggatcatttgtattataaagatgttgtcggttttatgacctacatgcctaat agctataacaataatttagggaattcaaacaacaccatttactattacgacaagagcatt gatttttatgcgagcgggaaaactctattcactaaggcggaattttctcaaatattcact gggcaaaacagcgcgatcgtttttggggctaaaagcatatggacggatgcgagcgatgcg ccgcaatctaatgcaatcattcgctttggggacaataagggagcagggagtaatgatgcg agcgggcattgctggaacttgcaatgcataggctttattacagggcattatgaagcgcaa aagatttacatcaccggcagtattgaaagcgggaatcgcatttctagtggtgggggcgcg agccttaattttaacgggcttcaaggcattcttttaacgaacgcgactttgtataaccgc gtcgctggcacgcaaagctcgtctatgaattttgtctctaacagcgcgaacattcaggtt caaaactcctattttatagacgataccgcgcaaaatggcggtaaccctaatttcagtttc aacgctttgaatctggatttttctaacagctcttttagaggctatgtggggaaaacgcaa tctgtttttaaattcaatgccgttaatgcgatcagtttcaccaacagcacgaatttaagc tctggtttgtatcaaatgcaagctaaaagcgtgttgtttgacaattccaatttaagcgtt tcagtggggacaagcagtattaaagccaatgcgatcaatctttctcaaaacgcctctatc aatgcgagcaaccattcaaccctagagcttcaaggcgatttgaatttgaacgacaccagc tcgctcaacctcaaccaaagcgccatcaatgtttccaataacgccacgatcaacgattat gcgagcttgattgcgagcaataacgctcatattaattttaacggagcggtcaatttcaat tcagcgaatatcactacgagtttgaatgattcttctatcgtgtttaagggagcgatctct ttaggagggcagtttaatttaagcaataactcttctttagattttcaaggctctagcgct attatctctaacacggcgtttaatttctacgataacgctttttctcaaagccccatcact ttccatcaagcccttgacattaaagcacccttgagtttgggaggcaacctcttaaaccct aacaacagcagcgtgctgaatttgaaaaacagccagcttgtttttagcgatcaagggagt ttgaatatcgctaacattgatttactaagcgatctaaacgataataaaaatcgtgtgtat aacatcattcaagcgggtatgaataataattggtatgagcgcatcaacttctttggcatg cacatcagtgatgggatctatgacgctattaaccaaacttatagtttcactaaccccctt aataacgctctaaaaatcaccgagagctttaaagacaaccagctaagcgttacgctctct caaatcccgggtattaagaacacgctttataacattggctctgaagtctttaactaccaa aaagtttataacaacgctaatggcgtgtattcttatagcgatgatgcagaaggcgtgttt tacctcactagcaatgtgaaaggctattacaaccctaaccaatcctatcaagctaacggc agcaataacaccacgaaaaataataatctaacctctgaatcttctatcatctcgcaaacc tataacgcgcaaggcaaccctattagcgcattacacatctataacaagggctataatttc aataatatcaaagcgttagggcaaatggctctcaaactctaccctgaaatcaaaaaggta ttggggaatgatttttcgctctcaagtttgagcgatctaaaccctaatgccctaaaccag ctcaccaaactcatcacgcctaacgattggaaaaacattaacgagttgattgataacgca aacaattcggtggtgcaaaatttcaataacggcactttgattataggagcgactaaaata gggcaaacagacaccaatagcgcggtggtttttgggggcttgggctatcaaacaccttgt gattatactgatattgtgtgccaaaaatttagaggcacttatttagggcagcttttggag tctagctcggctgatttgggctatattgacacgacttttaacgctaaagaaatttatctt accggcactttagggagcgggaacgcatgggggactggggggagcgctagcgtaactttt aacagccaaacttcgctcattctcaaccaggctaatatcgtaagctcgcaaactgatggg atctttagcatgctagggcaagagggtattaataaggttttcaatcaagccgggcttgct aatattttgggcgaagtggcggtgcaatccattaataaagccgggggattagggaatttg atagtaaatacgctagggagtggtagtgtgattggggggtatttaacgcctgaacaaaaa aatcaaaccctaagccagcttttggggcagaataattttgataacctcatgaacgatagc ggtttgaatacagcgattaaggatttgatcagacaaaaattaggcttttggaccgggcta gtggggggattagccggactatggggcattgatttgcaaaaccctgaaaagcttataggc agcatgtcaatcaatgatttattgagtaaaaaagggttgttcaatcagatcaccggcttt atttccgctaacgatatagggcaagtgataagcgtaatgttgcaagatattgtcaaaccg agcaacgctttaaaaaacgatgtaatggctttaggcaaacaaatgattggcgaattttta ggccaagacacgctcaattctttagaaagcttgctgcaaaaccagcagattaaaagcgtt ttagacaaagtcctagcggctaaaggcttagggcctatttatgaacaaggtttgggggat ttgatccctaattttggtaaaaaggggcttttcgctccctatggtttgagtcaagtgtgg caaaaaggggattttaatttcaacgcgcaaggcaatgtttttgtgcaaaattccactttc tctaacgccaatggaggcacgctctcttttaacgcaggaaattcgctcatttttgccgga aacaatcatatcgctttcactaaccattctggaacgcttcaattattgtctaatcaagtt tctaacattaatatcactacgcttgatgccagcaacggccttaagattaatgccggtagt aacaatatttctgtgtctcaaggcgatctgtttatcaacgctagttgcacgcaacaaagc gatccaactgcagctgacgctacaaacccttgcgcgcttagcgcccaaagcacgaatggt gcttctaatgcgtcaaataacatgcaaatcgccttgaataataacgatgaaagcttgatg gttacggcgaatgatttcaatttttcaggcaatatttacgctaatggggtggttgatttt tcaaaaattaaaggctctgcaaacattaaaaacctgtatctttacaataacgctcaattc caagccaacaacctcattatttccaatcaagcggtgttagagaaaaacgccagctttaca gccaataatttaaacattcaaggagcgtttaacaacaacgccacgcaaaaaatagaggtg cttcaaaatttaacgatcgcttcaaacgcttccttaagcaccgggatttacgggttagaa gtaggggggtctttgaataattttggaacgatacattttaatttagaaaacattcaaacg ccaacgccgctcattcaagcagaggggatcatcaatctcaacaccacccaaacgcctttt atcaatgtcaataacagcatggccaataatacgacttacactttattaaaaagcagccgt tacattgattacaatatcaaccctaacagcttgcaatcgtatttgaagctctatacctta atcaatatcaacggaaaccacatagaggaaaaaaacggcgtattgacttatttgggccaa cgggttttgttgcaagataaggggttattgttaagcgtagcgctgcctggctcaaacaac gcccatcaaaacaacattttaagcctttctgtccttcatgaccagattaaaatgtcttat ggcaacaagatcatggactttaccccccctaccttacaagattacattgtgggcattcaa gggcaaagcgcgctcaatcaaattgaagctataggggggaataacgctatcaagtggctt tcaacattgatgatggaaacgaaagaaaacccgctttttgcaccgatttatttaaaaaac cactctttgaatgaaatcttaggcgtaacaaaagatcttcaaaacaccgcaagcttgatt tctaaccctaattttagggataacgctaccaaccttttagaattggcgagttacacccaa caaaccagccgtttaacaaaactctctgattttagggctagagagggagagtctgctttt tctgagcgcttgttagagcttaaaaacaagcgttttagcgatcctaaccctggagaggtt tttgtcaaacactctcaacttagcaaacaccccaataacctttgggttcaaggggtgggg ggagcgagctttatttctgggggcaatggcacgctttatggcttgaatgtgggctatgac aggttggttaaaaatgtgatccttgggggttatgtggcttatggctatagcgactttaat gggaacatcatgcattctttgggtaataatgtggatgtggggatgtatgcgagggctttt ttaaaaagaaacgaattcactttgagcgcgaatgaaacttatggaggcaatgcaactagt atcaattcttctaattctttgctttctgtgttgaaccaacgctacagctacaacacctgg acaacgagcgtgaatgggaattacggctatgatttcatgttcaaacaaaaaagcgtggtg ctaaaacctcaagtgggcttgagctatcattttataggcttgagcgggatgaaaggcaaa atgaatgatgccgcttacaaacagtttctcatgcattcaaacccctctaacgaatcggtt ttaacgctcaacatggggttagagagccgtaaatattttggtcaaaattcctattatttt gtaacggcgagattgggtagggatcttttggtcaaatctaaaggcggcaatacggtgcgt tttgtgggcgaaaacactttattgtatcgcaagggggaagttttcaacacttttgcgagc gtgatcacaggaggcgaaatgcatttgtggcgtttgatgtatgtgaatgcgggggtgggg cttaagatgggcttacaataccaagacattaatataactgggaatgtgggcatgcgagtg gcgttttag

DBGET integrated database retrieval system