Helicobacter pylori oki128: HPOKI128_05490
Help
Entry
HPOKI128_05490 CDS
T03724
Name
(GenBank) membrane protein
Organism
hpyd
Helicobacter pylori oki128
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Alpha-E
DUF5610
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN37954
LinkDB
All DBs
Position
1116770..1120429
Genome browser
AA seq
1219 aa
AA seq
DB search
MIKKAKKFIPFFLIGSLLAEDNGWYMSVGYQIGGTQQFINNKQLLENESSINSITQSAIN
IAGPTTGLITLSSQSVIDALGYGVSNTVGNQLEGISNILNQIGKRKDFYSSRQISSISQQ
IIGLKGSSDPLKAHSSQITAKLLSNTQSAFDQGIALNSSIISSINGLNPSSTKEVKAQLQ
NTVQSMAELLQQIEHSITKTTSTTYAQSLLSNLTDAVNASSDNTAYVSALKNALTTLGVG
YFPTTTTTHVVLNPPGQIVFYPTNSILGSTSSNSNNQQQYNNTLLMNTLQGTLSANNQNN
PNGCANQIQCLEQFIQNLAPLAATPTSNNQANQQVQTIAQKLQSVAINTLDNNAINNTTY
NLNNLHNALNFQAYESTIEQYNNALKQISWISFTEPKNLLKNTSNNYQIGTVTNAQGQNI
SAYDCASTTGSLSSDSGISCSATSSTNNTSSFDNSLVATSKIQTIGGKEQIGVNSFNLVS
QVWSVYNSLKTSEENLQKNAQILCPNGSNGSQDTCNNNNSSGGLSISGNSQLQNILSSTS
GTSATTQTKSNASKLKATVVVNNEEEAKTTNFNQSSEATTQSPNSTVMGALNAVLQNVSN
FQQSIQSAFQSQSDNINAWANAIYNTNGSQSQEMTTNNQDLRIQLRANFYQLINTINQQV
PTDMSTLIAQSQQTQQTSGATSNNNPCASGMSGSGSNWCYQQWSDSKAYYSGLQSALGYQ
TQATTQSGSSGGNSITYNVQQITLTSGGLLNNIISSLKSFNSSGNNGGSSGSGNGTSQIT
TAYQMLTDASDGKLGTYTNSTYQTCTNKANENSSNCYTPSKTQNTTTATTNETNLQKVYN
DAQKIANIIASSGNNKGVENGLKQFFEALKNNSSSLSNLCNGSSGTSTTCSGGLINLLGA
IPTNGVSDTNNLINLLTEFIKTAGFIQNNNNNSSSASLTSTFQAITSAISQGFQALQNDI
SPNAILTLLQEITSNTTTIQSFSQTLRQLLGDKTFFMVQQKLIDAMINARNQVQNAQNQA
NNYGSQPILSQYVAAKSTQHGMSNGLGVGLGYKYFFGKARKLGLRHYFFFDYGFSEIGLA
NQSVKANIFAYWVGTDFLWNLFRRTYNTKALNFGLFAGVQLGGATWLSSLRQQIIDNWGN
ANDIHSTNFQVALNFGVRTNFAEFKRFAKKFHNQGVISQKSVEFGIKVPLINQAYLRSAG
ADVSYRRLYTFYINYIMGF
NT seq
3660 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaaagctaaaaaatttataccattctttttaattggctctctcttagctgaa
gacaatggctggtatatgtctgtaggctatcaaatcggcggcacgcaacaatttatcaat
aacaaacaactcttagaaaatgaaagcagtatcaatagcatcactcaaagcgcgatcaat
attgcagggcctactaccggtcttatcactttaagctctcaaagcgtcattgacgcttta
ggctatggcgtgagtaacaccgtgggcaaccaattagagggcatttctaatatcttaaat
caaattggcaaaagaaaagacttttattctagccgtcaaatctctagcatttcccagcaa
atcatagggcttaaaggaagctctgatcccttgaaagcccattcttcacaaatcacagcc
aaactcctctctaacacccagagcgcgtttgatcaaggcatcgcgctaaactctagcatc
attagctctatcaatggccttaatcctagcagcaccaaagaagtcaaagcccagctccaa
aacaccgtgcaatccatggcagaattgttgcaacaaattgaacacagcatcactaaaacc
actagcaccacttacgcgcaatccttactctccaatctaaccgatgcggtgaatgcctct
agcgataataccgcttatgtgagcgccttaaaaaacgctttaaccactcttggggtgggg
tatttccctacgacaaccacaacgcatgtggtactaaacccaccgggacaaatcgtattt
tatcccactaattccattttaggctctacttcttcaaacagcaataaccaacaacaatac
aacaacacccttttaatgaacaccttacaagggacattaagcgctaacaatcaaaataat
cccaatggttgcgctaatcaaatccaatgcttagagcaattcatccaaaatttagcccct
ttagccgcaacccccacttcaaataaccaagccaaccagcaagtccaaaccatcgctcaa
aaacttcaaagcgttgctatcaacactttagacaacaatgcaatcaacaacaccacctat
aatttaaacaatttgcacaacgctttgaatttccaagcctatgaaagcacgatagaacaa
tacaataacgctttaaagcaaatttcttggattagttttactgagcctaaaaacttgctc
aaaaacacttctaataactaccaaatcggcaccgttaccaacgctcaagggcaaaatatc
agcgcctatgattgcgcaagcactactgggagcctttctagcgatagtgggatttcatgc
tcagccacaagctccacaaacaacacaagcagttttgacaattctttagtcgctacctcc
aaaatccaaaccatagggggcaaagagcagatcggcgtaaattcttttaaccttgtttct
caagtgtggagcgtttataactctttaaaaacttcagaagaaaatttgcaaaaaaacgct
cagatactatgcccaaatggtagtaacggatcgcaagatacatgcaataacaacaattct
tcagggggtttgagcatcagcgggaactcccaattgcaaaatattttaagctctactagt
gggactagcgctactactcaaactaaaagcaacgcttccaaactaaaagcgacggtggtg
gtgaataatgaagaagaagctaaaacgactaacttcaatcaaagcagtgaggcaaccact
caatcccctaacagcacggtgatgggcgctttaaatgccgtattgcaaaatgtcagcaat
ttccaacaaagcattcaaagcgcttttcaaagtcaaagcgataacattaacgcctgggcg
aatgcgatctataacaccaatgggagtcagtcgcaagagatgacaactaataaccaagat
ttacgcatccaattaagagcgaatttctaccagctcatcaataccattaaccagcaagtg
cctacagacatgagcaccttaatcgctcaaagccaacaaacccagcaaacaagcggggca
acaagcaataataacccatgcgcgagcggaatgagtgggagtggtagtaactggtgctat
cagcaatggtcagattctaaggcttattacagcgggttacaaagcgctttagggtatcaa
acacaagcaacaactcaaagtgggagcagtggtgggaacagcatcacctacaatgtccaa
caaatcacgctcactagcggtgggttgctcaataacatcatttcatctcttaagagtttt
aatagtagcggaaacaatgggggaagcagtggaagcggaaatggaactagtcaaatcact
acagcctaccaaatgctcacagacgccagcgatgggaaattagggacttatactaatagc
acctatcaaacatgcaccaataaagcgaatgaaaatagcagtaattgctacacccccagc
aaaacacaaaataccaccaccgcaaccactaacgaaaccaacttgcaaaaagtctataat
gacgcccaaaaaatagccaacattatcgccagctctgggaataataaaggcgttgaaaac
ggcttaaaacaattctttgaagcgttaaaaaataatagtagcagtctcagtaatttgtgt
aatggtagtagtggcactagcactacttgctccggtgggcttatcaaccttttaggggca
atccccacaaatggggtgagcgatacgaataatttaattaatttgctcaccgaatttatt
aaaaccgccgggtttatccaaaataataataataatagcagtagtgctagcttaacaagc
acttttcaagccattacgagcgctatttctcaagggtttcaagccttacaaaacgatatt
agccctaatgcgattttaaccttgctccaagaaatcacttctaacaccaccaccattcag
tcattctcgcaaaccttacgacagcttttaggggataaaacattctttatggtgcaacaa
aaactcattgatgcgatgattaacgctagaaatcaggttcaaaacgcgcaaaatcaagcc
aataactacggctctcaacccattttaagccagtatgtggctgctaaaagcacccaacac
ggcatgagcaatggcttaggggttggtttgggctataaatacttctttggtaaggctagg
aaattaggccttaggcattattttttctttgattacggctttagtgaaataggcttagcc
aatcaaagcgtgaaagcgaatatctttgcttattgggtaggcacggattttttatggaat
ctattcaggaggacttacaacactaaagcgttgaattttgggctatttgctggggtccaa
ctgggcggtgcaacttggcttagctctctaaggcaacaaatcattgacaactgggggaac
gctaatgacattcattcaacgaattttcaagtggcgctgaattttggggtgcgcaccaac
tttgcggagtttaagcgttttgccaagaaattccacaatcaaggggttataagccaaaag
agcgtggaatttgggatcaaagtgcctctcatcaatcaagcgtatttgagaagtgctggg
gctgatgtgagttacaggaggctttatactttctatatcaattacatcatggggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system