Helicobacter pylori oki673: HPOKI673_04670
Help
Entry
HPOKI673_04670 CDS
T03727
Name
(GenBank) toxin outer membrane protein
Organism
hpyg
Helicobacter pylori oki673
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VacA2
DUF6252
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHN42119
UniProt:
X2I9P3
LinkDB
All DBs
Position
934823..942013
Genome browser
AA seq
2396 aa
AA seq
DB search
MAFKKAGLISKFISKGSFKLNKISKKIFKLNQILKREKPLKRHKKTKFVKKPFNKNKSFL
KASVLLIGALGGLSHLRASECRYWSWSSWSYHDNIESGSNSPTHNSYCLFSSTQGSGTYY
LNTLTTYSPGGASFTQKFNNGTLNVGGNIRFGGTGVNGGDVGYITGTYDAQTINFNSSRI
TTGNSISTGGGATLNFNATNHITINQASFDNSDAGTQHSYMNFSGSNINVSGSSFTDDTN
GGFSFSGNGANSNLSFNKTNFNQGTYKFTNSANLNFNNSTFNQGTYNFSSAQSTFNNSAF
NQGTYNFTDNASFNNDTFNQGTYNFNTSKVSFSGANTLNSSSPFASLKGSVSFGSGAIFN
LNQTLNANQTYDILTTSGTIQYGVYQSYLWDLINYKGDKAISHVEVGSNTYDVTFDINGQ
DETLQETFSNQSITTQFLGDDLQAKAQATYQQDLSNSQSALNNAASDNKIASSDTSYTNN
QNTTIKQDAQSLESTSQQIAQDQKDLEQDLDKLQQLANSPTGFNEQAFNQAQSTEQQDLQ
TLQNEENTFSNEQEGLEKALANAKPASPTPSPTPTPTKHTAQNTPPNKVPTPSPTQNLPT
TNVWNGVYWLQNQTYSKQGVYYIDPNLSGQSGQSGNTLSTYTANLLGRSFSVNIQNGTLI
IGNNTESVNDNGLIWIGHGGFGYIIGTFNAANIYLTNNFKTGEGVSGSDGGGANITFKAS
DNITMDGLNYNDAETVTKMIQTGASQHSYATFDATNNISVTDSSFSDMTWGKFSFNAKNI
SFSNASFSGFTNPGGSSVISANAANSLSFNNSRLNGGAVYNLWANSLIFNNTQAVFNVLY
SRGTSNFNATTQLLGNTSFTLSSQSLLNFNGDTTLQNNANITLGNKSQATFKNSLTLDNN
SNLSLDNQSVLNANGTSTFNNQASLNIYNGSQATFNSLFFNGGTLSLNANSKLNASSASF
SNNTTINLDDSVLSASNTSSLNANINFQGASQANFGGNTTIDIASFNFDNASSLSFNNLT
ANGALNFNGYASSLTKALMSVSGQFVLGNNGDINLSDINIFDNITKSVTYNILNAQKGIT
GISGANGYEKILFYGMKIQNATYSDNNNIQTWSFINPLNSSQIIQESIKNGDLTIEVLNN
PNSASNTIFNIAPELYNYQASKQNPTGYSYDYSDNQAGTYYLTSNVKGLFTPKGSQTPQT
PGTYSPFNQPLNSLNIYNKGFSSGNLKTLLGILSQNSATLKEMIESNQLDNITSINEVLQ
LLDKIKITPAQKQALLETINHLTDNINQTFSNGNLVIGATQDNVTNSTSSIWFGGNGYSS
PCALDSATCSSFRNTYLGQLLGSTSPYLGYINADFKAKSIYITGTLGSGNAFESGGSADV
TFQSANNLVLNKANIEAQATDNIFNLLGQEGIDKIFNQGNLANVLSQVAMEKIKQAGGLG
NFVENALSPLSKELPASLQNETLGQLIGQNNLDDLLNNSGVMNAIQNIISKKLSIFGNFV
TPSIIENYLAKQSLKSMLDDKGLLNFIGGYIDASELSSILSVILKDITNPPTSLQKDIGV
VANDLLNEFLGQDIVKKLESQGLVNNIINNIISQGGLSGIYDQGLGSVLPPSLQNALKEN
DLGALLSPRGLHDFWQKGYFNFLSNGYVFVNNSSFSNATGGSLNFVANKSIIFNGDNTID
FSKYQGALIFASNGVSNINITTLNATNGLSLNAGLNNVSVQKGEICINLADCPTTKNSSS
TNSSVTPTNESLSVRANNFTFLGTIASNGAIDLSQVKNNSVIGTLNLNENATLQANNLTI
TNAFNNASNSTANINGNFTLNQQATLSTNASGLNVMGNFNSYGDLVFNLSHSTSHAIINA
QGTATIMANNNNPLIQFNTSSKETGTYTLIDSAKAIYYGYNDQIIGGNSLDNYLKLYTLI
DINGKCMVMTDNGLTYNDQAVNIKDGGLVVGFKDSQNQYIYTSILYNKVKIAVSNDPINN
LQAPTLKQYIAQIQGVQSVDSIDQAGGTQAINWLNKIFETKGSPLFAPYYLESHSTKDLT
TIAGDIANTLEVIANPDFKNDAANILQINTYTQQMSRLAKLSDTSTFASADFHERLEALK
NKRFADAIPNAMDVILKYSQRNRVKNNVWATGVGGASFINGGTGTLHGINIGYDRFIKGV
IVGGYAAYGYSGFHANITQSGSNNVNMGVYSRAFIKRSELTMSLNETWGYNKTFINSYDP
LLSIINQSYKYDTWTTDAKINYGYDFIFKDKSVIFKPQIGLAYYYIGLSGLRGIMDDPIY
NQFRANADPNKKSVLTINFALESRHYFNKNSYYFVIADVGRDLFINSMGDKMVRFIGNNT
LSYRDGARYNTFASIITGGEIRLFKTFYVNAGIGARFGLDYKDINITGNIGMRYAF
NT seq
7191 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtttaaaaaggctggattgatttctaagtttatttcaaagggatcttttaaatta
aataagatctcaaagaaaattttcaaattgaatcagatcttgaagcgtgaaaagccctta
aaacgccacaaaaaaacaaaattcgttaaaaagccctttaataaaaacaaatctttttta
aaagcttcggttttattgataggagcattggggggattatcccacctaagggctagcgag
tgccgttattggtcatggtcgtcttggagttatcatgacaatattgaaagcggttctaat
tcccccacgcacaactcttattgcctttttagcagcactcaaggctctgggacttactat
ttaaacacccttaccacttatagccctggtggggctagtttcacgcaaaaattcaataat
ggcacgcttaatgtgggagggaatatccgctttggaggcacgggtgttaatggaggtgat
gtagggtatatcacaggcacttatgacgctcaaacgattaattttaattctagccgtatc
acaaccggcaactcaatttctactggcggtggggctactctcaattttaatgcaactaac
catatcactatcaatcaagccagctttgataacagcgatgcaggaacacaacactcttac
atgaatttcagtggttctaacatcaatgtgagcggctctagttttacagatgacaccaat
gggggctttagtttcagcgggaatggggctaacagcaatctctcttttaacaaaacaaac
ttcaatcaaggcacttacaaattcactaacagcgcgaacttaaacttcaacaacagcacc
ttcaaccaagggacttacaactttagtagcgctcaatccacttttaacaacagcgctttc
aatcaagggacttacaactttactgacaacgccagcttcaataacgacaccttcaatcaa
ggcacttataactttaatacaagcaaggtgagtttttcaggcgctaacactttaaattca
agttcgccttttgctagccttaaaggcagtgtgtcttttggttctggtgcgatttttaac
ctcaatcaaacccttaatgccaatcaaacctatgacattctcaccacaagcgggactatc
caatatggggtttatcaaagttatttgtgggatttgatcaactataagggcgataaagcc
attagccatgttgaagtgggcagtaacacttatgatgtaacctttgacattaacgggcaa
gatgaaaccttacaagaaacctttagcaatcagtccattaccacccaatttttaggggat
gatttacaagccaaagctcaagcaacctaccaacaagacttgagcaactcccaaagcgct
ttaaataacgctgctagtgataataagatcgcaagcagtgatacaagctacaccaacaat
caaaacaccactattaaacaagacgctcaaagtttagaaagcactagccaacaaatcgct
caagatcaaaaagacttagaacaagatttagacaaactccaacaattagccaactcccca
acaggctttaatgagcaagctttcaatcaagcccaaagcacagaacaacaagacttacaa
accttacaaaacgaagaaaatacttttagtaacgagcaagaggggttagaaaaagcgtta
gctaacgctaagcctgcaagccctacaccaagccctacacccactcctacaaaacacaca
gcgcaaaacactccccctaataaagttccaacaccaagccctactcaaaatttacccaca
acgaatgtgtggaatggggtttattggcttcaaaatcaaacttactcaaaacaaggcgtt
tattatattgatcccaatctttcaggacagagcggtcaaagcggcaacacgctcagcact
tatacagccaatttgttaggaagaagttttagcgtgaatatccaaaatggcactttgatc
atagggaataacacagagagcgtgaatgataatggtttgatttggatagggcatggaggc
tttggctatatcattggaacttttaatgcggctaacatttacttgaccaataattttaaa
accggtgaaggcgtttcaggatccgatggtgggggagcgaacattacttttaaagcaagc
gataatatcactatggatggcttgaattataatgacgctgaaaccgttactaaaatgatc
caaacgggggctagtcagcattcctatgccacttttgacgctacaaacaatattagcgta
actgattctagctttagcgatatgacttgggggaaattcagttttaacgctaagaatatt
tcgttttctaacgcttcgtttagtggctttacaaaccccggaggatcaagcgttatcagc
gctaatgccgctaattctttaagctttaacaattctcgtttgaatgggggagcggtttat
aatttgtgggctaatagccttattttcaacaacacgcaagcggtttttaatgtcttgtat
tctagggggacaagcaattttaacgctaccacacagcttttgggcaacacgagttttacg
ctcagctctcaaagtttgctgaactttaatggcgatacaaccttacaaaacaacgccaat
atcacgcttggcaataaaagtcaagccacttttaaaaattctttaacgcttgataataat
tctaatttaagcttagacaatcaaagcgttttgaatgccaatggcacaagcacttttaac
aatcaagcgagtctcaatatttataacgggagtcaagcaacctttaatagcctctttttt
aatggtgggacactcagtcttaacgctaatagcaagcttaacgcttctagcgctagtttt
tcaaacaacaccactatcaatttagacgatagcgttttatcggctagtaacacaagctct
ttaaacgctaatatcaattttcaaggcgcaagccaggctaattttggaggcaacacgact
attgatatagcaagctttaattttgataacgcaagctcattgagttttaataaccttacg
gctaatggggcgttaaattttaatggttatgcgtcctctttgactaaggctttaatgagc
gttagcgggcagtttgttttagggaataatggggatattaatttatctgacatcaatatt
tttgacaacattacaaaatctgtaacctacaacatcctaaacgctcaaaaagggattact
ggcattagtggggctaatggctatgaaaaaatccttttttatggcatgaaaatccaaaac
gctacctatagcgataataataacattcaaacttggtcgtttataaaccctctcaattct
tctcaaatcattcaagagagcattaaaaatggggatttaaccatagaagttttaaataac
cctaactcggcttctaacactatttttaatatcgctcctgagctttataattaccaagct
tctaagcaaaatcctaccggctatagctatgattatagcgataaccaagcaggcacttat
tacttgacaagcaacgttaaaggtcttttcacccctaaaggctctcaaacgcctcaaacc
ccaggcacttatagcccgtttaaccagcctttgaatagtttgaatatctacaataagggt
ttttctagtgggaatttaaaaacgcttttagggatcctttctcaaaattccgctacctta
aaagaaatgattgaatccaatcaattagacaatatcactagcatcaatgaagtgttgcaa
ctcttagataagattaagatcaccccagcgcaaaagcaagcgctcctagaaaccatcaac
catttgactgacaacatcaatcaaacctttagtaacgggaatctcgttataggcgctact
caagataatgttacaaactctactagctctatatggtttgggggcaatggctatagcagt
ccttgcgcgctagatagcgccacttgttcttcttttagaaacacttacttggggcaatta
ttaggctcaacttccccctatttaggctacatcaacgctgattttaaagctaaaagcatt
tatatcactggaacgctgggaagtggtaacgcttttgaaagcggagggagtgcggatgta
acctttcaaagcgctaataacttagtgttgaataaagctaacatagaagctcaagccaca
gacaatatctttaatcttttgggtcaagaagggattgataaaatctttaatcaagggaat
ttagcgaatgtcctcagtcaagtggctatggaaaaaatcaagcaagccggcggtttaggg
aactttgtagaaaacgctctaagccctttgagtaaggaattgcccgctagcttgcaaaat
gaaaccttaggccaacttataggtcaaaacaatttagatgatttattgaataatagtgga
gtcatgaatgcaatccaaaatattatcagtaaaaaactaagcatttttggtaattttgtt
accccatcaatcatagaaaactaccttgctaagcagtctttaaaaagcatgctagacgat
aaagggcttttgaattttatcggtgggtatatagacgcttctgaattaagctctatttta
agcgtgattttaaaagatattactaatccccctacaagcttacaaaaagacattggtgtg
gtggcgaacgacttgttgaacgagtttttaggacaagatattgttaaaaagctagaaagt
caaggcttagtgaataatatcatcaataatattatttctcaaggcgggttaagcggcatt
tatgatcaaggtttggggagcgtgttgccgccctctttacaaaacgcgctcaaagaaaac
gatttaggcgctcttttatcgcctagaggcttgcatgatttttggcaaaaagggtatttt
aactttttaagcaatggctatgtttttgtcaataatagctcttttagcaacgctacaggg
ggcagtttgaattttgtcgccaacaagtctattatttttaatggcgataatacgattgat
tttagcaagtatcaaggtgcattgatttttgcttctaatggtgtttctaatatcaatatc
acaaccctaaacgcaactaacggcttaagccttaatgcgggtttgaataatgtgagcgtt
caaaaaggggaaatttgcatcaatttagccgattgccccacaacaaaaaacagctcttct
acaaattctagcgtaacccccactaacgaatctttaagcgtgcgcgctaacaacttcact
ttcttaggcacaatcgcttctaatggggctattgatttgtctcaagtaaaaaataatagc
gtcataggcacgctcaatcttaatgaaaatgcgaccttgcaagccaataatttaacgatc
actaacgcttttaacaacgcctctaactctacagctaacattaatggtaatttcacctta
aaccaacaagcgactttaagcactaacgctagtggtttgaatgtcatggggaattttaat
agctatggcgatttggtgtttaatctcagccattcaactagccatgccattatcaacgct
caaggcacagcgacgattatggctaataacaataaccccttaatccaattcaacacttct
tcaaaagaaacaggcacttacacgctcattgatagcgctaaggccatttattacgggtat
aacgaccaaatcataggaggcaatagcctagataattaccttaagctttacacgctcatt
gacattaatggcaagtgcatggtgatgactgataacggcttaacttataacgaccaagcc
gtgaatattaaagatggcggtttagttgtaggctttaaagattctcaaaatcaatacatt
tacacttccattctttataataaagtgaaaatcgctgtttctaatgatccgatcaacaac
ctacaagcccccactttaaaacaatatatcgctcaaattcagggcgttcaaagcgtggat
agcattgatcaagctggaggcactcaagcgattaattggctcaataaaatctttgaaact
aagggaagtcctttattcgctccctattatttagaaagccattccacaaaggatttaacc
acgatcgccggagacattgctaacactttagaagtcatcgctaaccctgattttaaaaat
gatgccgctaatattttacagatcaacacctacacgcaacaaatgagccgtttagccaag
ctctctgacacttcaacctttgctagcgctgatttccatgagcgtttagaagcccttaaa
aacaagcgattcgctgatgcgatccctaacgctatggatgtgattttaaaatactctcaa
agaaacagagttaaaaataatgtgtgggcgacaggagttggaggggctagttttattaat
ggaggcactgggactttacatggtatcaatatagggtatgacaggtttattaagggcgtg
attgtggggggttatgccgcttatgggtatagcgggtttcatgcaaacatcactcaatca
ggctctaacaatgtcaatatgggtgtttatagccgagcctttatcaaaagaagcgaattg
acgatgagcttgaatgagacttggggatacaataagactttcatcaactcttatgacccc
ctactctcaatcatcaaccagtcttacaaatacgacacctggacgactgacgctaaaatc
aattacggctatgatttcatatttaaagataaaagcgttatttttaaacctcaaataggc
ttagcctattattacattggtttgtctggtttaaggggtattatggatgatcctatctac
aaccaattcagagccaatgctgaccctaataaaaaatccgttctaacgattaattttgcc
ctagaaagtcggcactacttcaataaaaactcttattattttgtgattgcggatgtgggc
agagatttatttatcaattctatgggggataaaatggtgcgtttcatcggtaataacacc
ctaagctatagagatggcgccagatacaacacttttgctagcattatcacaggcggggag
ataaggctattcaaaaccttttatgtgaatgccggcataggggctaggtttgggcttgat
tataaagatattaatattaccggaaatattggtatgcgctatgctttttaa
DBGET
integrated database retrieval system