KEGG   Helicobacter pylori UM037: K750_04335
Entry
K750_04335        CDS       T02659                                 
Name
(GenBank) toxin outer membrane protein
Organism
hpyi  Helicobacter pylori UM037
SSDB
Motif
Pfam: VacA2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AGL69816
UniProt: A0AB33Z864
LinkDB
Position
733755..741278
AA seq 2507 aa
MAFKKTRLISKFISKGSFKLNKISKKIFKLNQILKCEKPLKCHKKTKSIKKPFNKNKSFL
KASILLIGALGGLSHLRASECRYWSWSSWNYQDNIESGPNSPTHNSYCLFSSAQGSGTYY
LNTLTTYSAGGASFTQKFNGGTLNVGGNIRFGGTGINGGDVGYITGTYDAANIYLTSHLT
TGNSYADGGGATLNFNAANNITINQASFDNNDAGTQKSYMNFKGSNIKVSGSSFKDDTDG
GFNFSGNNNHSTISFNQTNFNQGTYNFSNSASSSFDNSSFNQGTYNFNGNASFNNDTFNQ
GTYNFNTSKVSFSGINTLNSSSPFASLKGSVSFGSDAVFNLNQTLNSNQTYDILTTNGAI
QYGVYQSYLWDLINYKGDKAISHVGVGNNTYDVTFDINGQDETLQETFNKQSIITQFLGD
DLQQQAQQTYQEDVANSQNALNNVTSDNTIANNDTSYTQSKNTTVAKDAQNLENTNQQIQ
QDEQALEKDLAQIKQLANSTTGFNEQTFNQAQKQEQQDLKTLQSEESTFNTEQDSLNKAI
QQAQAQQQKQEQQQAQKTYQQDLSNSQTALNNATSDNKIASNDTSYTQSKNTTVAKDAQG
LENTNQEIQQDEQALEKDLAQIKQLANSTTGFNEQAFNQAQKQEQQDEQTLQNDENAFNN
EQEGLKQAIAKAKHTSPTPSHAPTPTKHTAPNTPPNKVSPTPTPPTQNLPTTNVWNGVYN
LQNQTYSNKGIYYIDPNLSGQSGQSGNTLSTYTANLFGRSFGVNIQNGTLIIGNNTESVN
DNGLIWIGHGGFGYITGTFNAANIYLTNNFKTGEGVSNSDGGGANITFKASDNITMDGLN
YNDAETVTKMIQTGASQHSYAAFDALNNISVTNSSFSDMTWGKFSFSAKNISFSNASFSG
FTNPGGSSTISANASNSLSFINSRLNGGAVYDLQANSLIFNNTQAVFNVLYSRGTSNFNA
TTQLLGNTSFTLSSQSLLNFNGDTTLQNNANITLGNKSQAAFKNSLTLDNNSNLSLDNQS
VLNANGASAFNNQASLNIYNGSQAAFNSLFFNGGTLSLNASSKLNASSASFSSNTTINLD
DSVLSANNTSSLNANINFQGASQADFGGNTTIDTASFNFDSASSLNFNNLTANGALNFNG
YAPSLTKALMNVSGQFVLGNNGDINLSDINIFDNITKSVTYNILNAQKGITGISGANGYE
KILFYGMKIQNATYSDNNNIQTWSFINPLNSSQIIQESIKNGDLTIEVLNNPNSASNTIF
NIAPEFYNYQASKQNPTGYSYDYSDNQAGTYYLTSNIKGLFTPKGSQTPQAPGTYSPFNQ
PLSSLNIYNKGFSSENLKTLLGILSQNSATLKEMIESNQLDNITNINEVLQLLDKIKITQ
AQKQALLETINHLTDNINQTFNNGNLIIGTTQDNVTNSTSFIWFGGNGYSSPCALDSATC
SSFRNTYLGQLLGSTSPYLGYINADFKAKSVYITGTVGSGNAFESGGSADVTFQSANNLV
LNKANIEAQATDNIFNLLGQEGIDKIFNQGNLANVLSQVAMEKIKQAGGLGNFIENALSP
LSKELPSSLQNETLGQLIGQNNLDDLLNNSGVMNEIQNIISKKLSIFGNFVTPSIIENYL
AKQSLKSMLDDKGLLNFIGGYIDASELSSILSVVLKDITNPPTSLQKDIGVVANDLLNEF
LGQDVVKKLESQGLVSNIINNIISQGGLSGVYNQGLGSVLPPSLQNALKENDLGALLSPR
GLHDFWQKGYFNFLSNGYVFVNNSSFSNATGGSLNFVANKSIIFNGDNTIDFSKYQGALI
FASNGVSNINITTLNATNGLSLNAGLNNVSVQKGEICVNLANCPATKNSSSTNSSVTPTN
ESLSVHANNFTFLGAIASNGAIDLSQVTNNSVIGTLNLNENATLQANNLTITNAFNNASN
STANINGNFTLNQQATLSTNASGLNVMGNFNSYGDLVFNLSHSASHAIINAQGNATIMAN
NNNPLIQFNTSSKEAGTYTLIDSAKAIYYGYNNQITGGSSLDNYLKLYALIDINGKHMVM
TDNGLTYNGQAVNIKDGGLVVGFKDSQNQYIYTSILYNKVKIAVSNDPINNPQAPTLKQY
IAQIQGVQSVDSIDQVGGSQAINWLNKIFETKGSPLFAPYYLESHSTKDLTTIAGNIANT
LEVIANPDFKNDATNILQINTYTQQMSRLAKLSDTSTFASADFHERLEALKNKRFADAIP
NAMDVILKYSQRNRVKNNVWATGVGGASFINGGTGTLYGINVGYDRFIKGVIVGGYAAYG
YSGFHGNITQSGSSNVNMGVYSRAFIKRSELTMSLNETWGYNKTFINSYDPLLSIINQSY
RYDTWTTDAKINYGYDFMFKDKSVIFKPQVGLAYYYIGLSGLRGIMDDPIYNQFRANADP
NKKSVLTINFALESRHYFNKNSYYFVIADVGRDLFINSMGDKMVRFIGNNTLSYRDGDRY
NTFASIITGGEIRLFKTFYVNAGIGARFGLDYKDINITGNIGIRYAF
NT seq 7524 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtggcgtttaaaaagactagattgatttctaagtttatttcaaagggatctttcaaatta
aacaagatctcaaagaaaattttcaaattgaatcaaatcttaaaatgtgaaaagccctta
aaatgccataaaaaaacaaaatccattaaaaagccctttaataaaaacaaatctttttta
aaagcttcgattttattgataggagcgttggggggattatcccacctaagggctagcgaa
tgccgttattggtcatggtcgtcttggaattatcaagataatattgaaagcggccctaat
tcacccacgcacaactcttattgcctttttagtagcgctcaaggctctgggacttattat
ttgaacactcttaccacttatagcgctggtggggctagtttcacgcaaaaattcaatggc
ggcacgcttaatgtgggagggaatatccgctttggaggcacaggtattaatgggggtgat
gtcggctatatcacaggcacttatgatgcggctaatatttacttgacaagccatttaaca
accggaaactcatacgctgatggtggtggggccacgctcaatttcaatgcggccaataat
atcactatcaatcaagcgagttttgataataacgatgcagggacgcaaaaatcttacatg
aattttaaaggctctaatatcaaggtgagtggctctagctttaaagatgacactgatggg
ggctttaatttcagcggtaataataatcatagcactatctcctttaatcaaactaacttc
aatcaaggcacttataattttagtaacagcgcaagttcaagctttgataatagtagtttc
aatcaaggcacttataactttaatggcaacgccagctttaataacgacaccttcaatcaa
gggacttataactttaataccagtaaggtgagtttctcaggcatcaacactttgaattca
agttcgccttttgctagccttaaaggtagcgtgtcttttggttctgatgcggtttttaac
ctcaatcaaacccttaatagcaatcaaacctatgacattctcaccacaaacggggcgatc
caatatggggtttatcaaagctatttgtgggatctaatcaactataagggcgataaggct
attagccatgttggagtgggtaataacacttatgatgtaacctttgatattaatgggcaa
gatgaaaccttacaagaaacctttaacaaacaatccatcattacccaatttttaggagac
gatttacaacaacaagcccaacaaacctatcaagaggatgtagctaattcccaaaatgct
ttgaataatgttactagcgacaacacgatcgcaaataatgatacaagctacactcaaagc
aaaaatactactgtcgctaaagacgctcagaatttagaaaacaccaaccaacaaatccaa
caagatgagcaagccttagaaaaagatttagctcaaatcaaacaattagccaactccacc
acaggctttaacgagcaaaccttcaatcaagctcaaaaacaagaacaacaagatttaaaa
accttacagagtgaagaaagcacttttaatactgagcaagatagtttaaataaagcgata
caacaagcgcaagcccaacaacaaaaacaagaacaacaacaagcccaaaaaacctaccaa
caagacttgagtaactcccaaactgctttaaataacgctactagtgataataagatcgca
agcaatgatacaagctacactcaaagcaaaaatactactgtcgctaaagacgctcaaggt
ttagaaaacaccaaccaagaaatccaacaagatgagcaagccttagaaaaagatttagct
caaatcaaacaattagccaactccaccacaggctttaacgagcaagccttcaatcaagct
caaaaacaagaacaacaagatgaacaaaccttacaaaacgatgaaaacgcttttaataac
gagcaagagggattaaaacaagcgatagctaaagctaagcacacaagccccacaccaagc
catgcacccactcctacaaaacacaccgcgccaaacactccccctaataaagtttcacca
acgcccacaccccctactcaaaatttacccacaacgaatgtgtggaatggagtttataac
ctccaaaatcaaacttactcaaacaaaggcatttattatattgatcccaatctttcagga
cagagcggtcaaagcggcaacacgctcagcacttatacagctaatttgtttggaagaagt
tttggcgtgaatatccaaaatggcactttgatcatagggaataacacagagagcgtgaat
gataatgggttgatttggatagggcatggaggctttggctatatcacgggaacttttaat
gcggctaacatttacttgaccaataattttaaaaccggtgaaggcgtttcaaattcagat
ggtgggggagcgaacatcacctttaaagcaagcgataacatcactatggatggcttgaat
tataatgacgctgaaaccgttactaaaatgattcaaacgggggctagtcagcattcctat
gccgcttttgacgctctaaataatatcagcgtaaccaattccagttttagcgatatgact
tgggggaaattcagttttagcgctaagaatatttcgttttctaacgcttcgttcagcggt
tttacaaaccctggaggatcaagcactatcagtgctaacgcttctaattctttaagcttt
atcaattctcgtttgaatggtggggcagtttatgatttgcaggctaatagccttattttc
aataacacgcaagcggtttttaatgtcttgtattctagggggacaagcaactttaacgct
acgacacagcttttaggcaacacgagttttacgctcagctctcaaagtttgttgaatttt
aatggcgatacaaccttgcaaaacaacgctaatatcacgcttggcaataaaagtcaagcc
gcttttaaaaattctttaacgcttgataataattctaatttaagtttagacaatcaaagc
gttttgaatgcgaatggcgcaagtgcttttaacaatcaagcgagtctcaatatttataac
gggagtcaagcggcctttaatagtctcttttttaatggcgggacactcagtcttaacgct
agtagcaagctcaacgcttctagtgctagtttttcaagcaacaccactatcaatttagac
gatagcgttttatcagccaataacacaagctctttaaacgctaatatcaattttcaaggc
gcaagccaggctgattttggaggcaacacgactattgatacagcaagctttaattttgac
agcgcaagttcattgaattttaataaccttacggctaatggagcgttgaattttaatggt
tatgcgccctctttgactaaagctttaatgaatgttagcgggcagtttgttttagggaat
aatggggatattaatttatctgatatcaatatttttgacaacattacaaaatctgtaacc
tacaatatcctaaacgctcaaaaagggattactggcattagtggggctaatggctatgaa
aaaatccttttttatggcatgaaaatccaaaacgctacctatagcgataataacaacatt
caaacttggtcgtttataaaccctctcaattcttctcaaatcattcaagagagcattaaa
aatggggatctaaccatagaagttttaaataaccctaactcggcttctaacactattttt
aatatcgctcctgagttttataattaccaagcttctaagcaaaatcctaccggctatagc
tatgattatagcgacaatcaagcaggcacttattacttgacaagcaacattaaaggtctt
ttcacccctaaaggctctcaaacgcctcaagccccaggcacttatagcccgttcaaccag
cctttgagtagtttaaatatctacaataagggtttttctagcgagaatttaaaaacgctt
ttagggatcctttctcaaaattccgctaccttaaaagaaatgattgaatccaaccaatta
gacaatatcactaacattaatgaagtgttgcaactcttagacaagattaaaatcacccaa
gcacaaaagcaagcgctcctagaaacgatcaaccatttgactgacaacatcaatcaaacc
tttaataacgggaatctaattataggcactactcaagataatgttacaaactctactagc
tttatatggtttgggggcaatggctatagcagtccttgtgcgctagatagcgccacttgt
tcttcttttagaaacacttacctagggcaattattaggctcaacttccccctatttgggc
tatatcaacgctgattttaaagctaaaagcgtttatatcactggcacagtgggaagtggt
aatgcgtttgaaagcggagggagcgcggatgtaacctttcaaagcgctaataacttagtg
ttgaataaagctaacatagaagctcaagctacagacaatatctttaatcttttgggtcaa
gaagggattgataaaatctttaatcaagggaatttagcgaatgttctcagtcaagtggct
atggaaaaaatcaagcaagccggcggtttaggaaactttatagaaaacgctctaagccct
ttgagtaaggaattgccctctagcttgcaaaatgaaaccttaggccaacttataggtcaa
aataacttagatgatttattgaataatagtggagtcatgaatgaaatccaaaatattatc
agtaaaaaactaagcatttttggtaattttgttaccccatccatcatagaaaactacctt
gctaagcagtctttaaaaagcatgctagacgataaagggcttttgaatttcatcggtggg
tatatagacgcttctgaattaagctctattttaagcgtggttttaaaagatattactaac
ccccctacaagcctgcaaaaagacatcggcgtggtggcgaacgacttgttgaacgaattt
ttaggacaagatgtggttaaaaagctagaaagtcaaggcttagtgagtaatatcatcaat
aatatcatttctcaaggcgggttaagcggcgtttataatcaaggtttagggagcgtgttg
ccgccctctttacaaaacgcgctcaaagaaaacgatttaggcgctcttttatcgcctaga
ggcttgcatgatttttggcaaaaagggtattttaactttttaagcaatggctatgttttt
gtcaataacagctcttttagcaacgctacagggggcagtttgaattttgtcgccaacaag
tctattatctttaatggcgataatacgattgactttagcaagtatcaaggcgcattgatt
tttgcttctaatggtgtttctaatatcaatatcacaaccctaaacgctacgaatggctta
agccttaatgcaggtttgaataacgtgagcgttcaaaaaggggaaatttgtgtcaattta
gccaattgccccgcaaccaaaaacagctcttctacaaactctagcgtaacccccactaat
gaatctttaagcgtgcacgctaacaacttcactttcttaggtgcaatcgcttctaatggg
gctattgatttgtctcaagtaacaaataatagcgttataggcacgctcaatcttaatgaa
aacgcgactttgcaagccaataatttgacgatcactaacgcttttaacaacgcctctaac
tctacggccaatattaatggtaatttcaccttaaaccaacaagcgactctaagcactaac
gctagtggtttgaatgtcatggggaattttaatagctatggcgatttggtgtttaatctc
agccattcagctagccatgccattatcaacgctcaaggcaatgcgacaatcatggctaat
aacaataaccccttaatccaattcaacacttcttcaaaagaagccggcacttacacgctt
attgatagcgctaaagccatttattatgggtataacaaccaaatcacaggaggcagtagc
ctagataattaccttaagctttatgcactcattgatattaatggcaagcacatggtgatg
actgacaacggcttaacttataacgggcaagccgtgaatattaaagatggcggtttagtt
gtgggctttaaagactctcaaaatcaatatatttacacttccattctttataataaagtg
aaaatcgctgtttctaatgatcctatcaataacccacaagcccccactttaaagcaatac
atcgctcaaattcagggcgttcaaagcgtggatagcattgatcaagttggaggcagtcaa
gcgattaattggctcaataaaatctttgaaactaagggaagtcctttattcgctccctat
tatttagaaagccattctacaaaagatttaaccacgatcgctggaaatattgctaacact
ttagaagtcatcgctaaccctgattttaaaaatgatgccactaatattttacagatcaat
acctacacgcaacaaatgagccgtttagccaaactctctgacacttcaacctttgctagt
gctgattttcacgagcgcttagaagcccttaaaaacaagcgattcgctgatgcgattcct
aacgctatggatgtgattttaaaatattctcaaagaaacagagtcaaaaataatgtgtgg
gcgacaggagttggaggggctagttttattaatggaggcactgggactttatatggtatc
aatgtagggtatgataggtttattaagggcgtgattgtggggggctatgccgcttatggg
tatagcgggtttcatggaaatatcactcaatcaggctctagcaatgtcaatatgggtgtt
tatagccgagcgtttatcaaaagaagcgaattaaccatgagcttgaatgagacttgggga
tacaataagactttcatcaactcctatgaccccctactctcaatcatcaatcagtcttac
agatacgacacttggacgactgacgctaaaatcaattatggctatgatttcatgtttaaa
gataaaagcgttatttttaaaccccaagtaggcctagcttattattacattggtttgtct
ggtttaaggggcattatggatgatcctatttacaaccaattcagagccaatgctgaccct
aataaaaaatccgttctaacgattaattttgccctagaaagtcggcactacttcaataaa
aactcttattattttgtgattgcggatgtgggcagagacttatttattaattctatgggg
gataaaatggtgcgttttattggtaataacaccctaagctatagagatggcgacagatac
aacacttttgccagcattatcacaggcggggagataaggttattcaaaaccttttatgtg
aatgcgggcattggggctaggtttgggcttgattataaagatattaatatcaccggaaat
attggtatacgctatgctttttaa

DBGET integrated database retrieval system