Helicobacter pylori Aklavik86: HPAKL86_02315
Help
Entry
HPAKL86_02315 CDS
T02353
Name
(GenBank) outer membrane protein HopL
Organism
hpyk
Helicobacter pylori Aklavik86
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
NfrA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFX89476
UniProt:
K7Y7B8
LinkDB
All DBs
Position
complement(467157..470891)
Genome browser
AA seq
1244 aa
AA seq
DB search
MIKKFKKFIPLFLASSLLAEDNGWYMSVGYQIGGTQQFVNNKQLLENQNIINSVAQSAIN
IAGPTTGLITLSSQTVAEALSYGVTNTVGNQLEGISNILSQIGKDRKDFFSNRQLSSISQ
QLVGLKGSSNPLRAHSSQITARLLSNTQSAFDQGITLSSNIISAVNSLNPSNNSREVKKQ
LQNTAQSMASLLVQIENNITKTTSTTYAFSLLTNLTQAVNSSTNNTAYVSALKNALNTLG
VGYFPATTPTRLVLNPPGQVSYYPPNSILGSTSSNSNNQQQYNDTLLMNTLQGTLNTTNG
SSGQNDGGCSNQVQCLQQFIQDLNPLTNAPSSANPANEQVKTLAQRLQGLAMDVLDNNAI
NNTTYNLNNLHNALNFQAYQSTIDKYNSVLKQISWNKFAEPKDLLKNTSNNHQIGTVTNA
QGQNVSAYDCLSATGSISTPSGLTPSSNTGISCKATSSNTTNNTDVTSSFDNSLVATSKI
QTINGKEQIGVNSFNLVSQVWSVYNSLKTSEANLQKNAQILCPNGSNGSQNTCNNNNSGG
LSISGNSQLQNILSSNGVSSNTSKNAQAMVSVNNEAAKTAQNSATNNSNSAPQSSAISAL
NTVLQNVSNFQQSIQSAFQNQKSNIEAWANAIYNTNGSQSQEMTSNNNQNLRIQLRANFY
QLINTINQQVPTDMSALIAQSQQTQQTSGSASATNNACANGMGSGGNWCNQQWSDSKAYY
SGLQSALGYQTQATTQSGSNGMNNITYNVQQITLTSNGLLNNIISSLKGFSSSGNNGGSG
NGTSQISTAYQMLTDASEGKLGTYNSSGSGGSGESSSNNNGYQTCNKTNGSNGTSESNCY
EPNKQQSATTANTATTTDSNLQKVYNDAQKIANIIASSGNNKGVENGLKQFFEALKSNSS
SLSNLCNGSSGSSSTCSGGLINLLGAIPTNGVSDTNNLINLLTEFIKTAGFIQNNDANVS
TSLTSAFQAITSAISQGFQALQNDISPNAILTLLQALTTNTTTIQSFSQTLRQLLGDQKF
FAVQQKLLNAMSNARNAVQNAQNQANSYGSQPILSQYAAAKSTQHGMSNGLGVGLGYKYF
FGKARKLGFRHYLFLDYGYSQIGVANQSVKTNIFAYGLGTDFLWNLFRRTFNTKALNFGI
FTGVQLGGTTWLSSLRQQIIDNWGNDKNIQPVNFQVAFNFGFRTNFAEFKRFVKGFHDQG
VLSQKSVEFGIKVPLINQAYLRSAGADVSYRRLYTFYINYIMGF
NT seq
3735 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcaaaaaatttaaaaaattcataccactttttttagccagctcccttttagccgaa
gacaacggctggtatatgtctgtaggctatcaaatcggcggcacgcagcaattcgtcaat
aacaaacagcttttagaaaatcaaaacatcatcaacagcgtggctcaaagcgcgatcaac
attgcagggcctactactggtcttatcactttaagctctcaaaccgtcgctgaagcttta
agctatggcgtgactaacactgttggcaaccaattagagggcatttctaatattttaagt
caaatcggtaaagacaggaaggactttttttctaaccgccagctttctagcatttcccaa
caactcgtggggcttaaaggaagctccaaccccctaagagcccactcttcacagatcaca
gccagactcctttctaacacccagagcgcgtttgatcagggcatcacgctaagctctaac
atcattagtgcagtcaatagcctaaaccctagcaacaactctagagaggtgaaaaaacag
ctccaaaacaccgcgcaatccatggcaagcttgttggtgcagattgaaaacaatatcact
aaaaccactagcaccacttacgcgttttccttactcactaatttaacccaagccgtgaat
tcctccacgaacaacaccgcttatgtgagcgctttaaaaaacgctttaaacactcttggg
gtggggtatttccccgcaacgaccccaacgcgcctggtgctaaacccgcccgggcaagtc
tcctactaccctcctaactccattttaggctccacttcttcaaacagcaataaccaacaa
caatacaacgacacccttttaatgaacaccttacaagggacattaaacactactaatggt
tcttctggccagaatgatggcggctgctccaatcaagtccagtgcctacagcaattcatc
caagacctaaaccctttaactaacgctccttcttcagctaacccggctaacgaacaggtc
aaaacccttgcccaaaggctccaaggcttagcgatggatgttttagacaacaatgcaatc
aacaacaccacctataatttaaacaacttgcacaacgctttgaatttccaagcctatcaa
agcacgatagacaaatacaacagcgttttaaagcaaatttcgtggaataagtttgctgag
cctaaagacttgctcaaaaacacctccaacaaccatcagatcggcaccgttaccaacgct
caagggcaaaatgtcagcgcctatgattgcctaagcgctaccgggagcatttccacccct
agcgggctaaccccctcttcaaatactgggatttcatgcaaagccacaagcagtaacaca
accaataacaccgatgttacaagcagttttgacaattctttagtcgctacctccaaaatc
caaaccatcaacggcaaagagcagatcggcgtgaattcttttaaccttgtttctcaagtg
tggagcgtttataactctttaaaaacttcagaagccaatttgcaaaaaaacgctcagata
ctatgcccaaatggcagtaacggctcgcaaaatacatgcaataacaataattcggggggt
ttgagcatcagcgggaactcccaattgcaaaatatcttgagttctaatggcgttagctct
aacacctctaaaaacgcacaagcgatggtctctgtcaataatgaagcggccaaaaccgct
caaaatagcgccaccaataacagcaatagcgccccacaatccagcgcgataagcgcgctc
aacaccgtattgcaaaatgtcagcaatttccaacaaagcattcaaagcgcttttcaaaac
caaaaaagtaatattgaagcttgggcgaatgcgatttataacactaatgggagtcagtcg
caagagatgacttctaacaataaccaaaatttacgcatccaactaagagcgaatttctac
cagctcatcaataccattaaccagcaagtgcctacagacatgagcgctctaatcgctcaa
agccaacaaacccagcaaacaagcggatctgcaagcgccacaaataatgcatgcgctaac
ggaatggggagtggtggtaactggtgcaatcagcaatggtcagattctaaggcttattac
agcgggttacaaagcgctttagggtatcaaacacaagcaacaactcaaagtgggagcaat
ggcatgaacaatatcacctacaatgtccaacaaatcacgctcactagtaatgggttgctc
aataacatcatttcatctcttaagggttttagcagtagcggaaataatggaggcagtggg
aacggaactagtcaaatcagcacagcctaccaaatgctcacagacgccagcgagggaaag
ctggggacttataacagcagtggcagtgggggtagcggagaaagtagcagtaataacaac
ggctatcagacttgcaataagaccaatgggagcaatggaacgagtgagagtaattgttat
gaacccaacaaacaacaaagcgccaccaccgcaaacacagccaccacaaccgacagcaat
ttgcaaaaagtctataatgacgcccaaaaaatagccaacattatcgctagttcagggaac
aataaaggcgttgaaaacggcttaaaacaattctttgaagcgctaaaaagtaatagcagc
agtctcagtaatttgtgtaatggtagtagtggtagtagctctacttgctccggtgggctt
atcaaccttttaggggcaatccctacaaatggggtgagcgatacgaacaatttaattaat
ctgctcactgaattcattaaaaccgccggctttatccaaaataatgatgctaatgtatct
actagtcttacaagcgcttttcaagccattacgagcgctatttctcaagggtttcaagcc
ttgcaaaacgacattagccctaatgcgattttaaccttgctccaagccctaaccacgaac
accaccaccattcagtcattctcgcaaaccttacggcagcttttaggggatcaaaaattc
tttgccgtgcaacaaaagctcttaaacgcaatgagtaacgccagaaacgcggtccaaaat
gcgcaaaatcaagccaatagttacggctctcaacccattttaagccagtatgcagccgct
aaaagcacccaacacggcatgagcaatggtttaggggttggtttgggctataaatacttc
tttggtaaggctaggaaattgggctttaggcattatcttttccttgattatggttatagt
cagatcggcgtggccaatcaaagcgtgaaaaccaatatctttgcttatgggctaggcacg
gattttttatggaatctattcaggaggacttttaacacaaaagcgctgaattttgggatc
tttactggggtccaactgggcggcacaacatggcttagctctttaaggcagcaaatcatt
gacaactgggggaatgacaaaaatatccagccggtaaatttccaagtggcgtttaatttt
ggattccgcaccaactttgcggagtttaagcgtttcgttaaaggctttcacgatcaaggg
gttttaagccaaaagagcgtggaatttgggatcaaagtgcctctcatcaatcaagcgtat
ttaagaagcgctggggctgatgtgagctacaggaggctttatactttctatatcaattac
atcatggggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system