KEGG   Helicobacter pylori Aklavik86: HPAKL86_02315
Entry
HPAKL86_02315     CDS       T02353                                 
Name
(GenBank) outer membrane protein HopL
Organism
hpyk  Helicobacter pylori Aklavik86
SSDB
Motif
Pfam: HP_OMP NfrA_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFX89476
UniProt: K7Y7B8
LinkDB
Position
complement(467157..470891)
AA seq 1244 aa
MIKKFKKFIPLFLASSLLAEDNGWYMSVGYQIGGTQQFVNNKQLLENQNIINSVAQSAIN
IAGPTTGLITLSSQTVAEALSYGVTNTVGNQLEGISNILSQIGKDRKDFFSNRQLSSISQ
QLVGLKGSSNPLRAHSSQITARLLSNTQSAFDQGITLSSNIISAVNSLNPSNNSREVKKQ
LQNTAQSMASLLVQIENNITKTTSTTYAFSLLTNLTQAVNSSTNNTAYVSALKNALNTLG
VGYFPATTPTRLVLNPPGQVSYYPPNSILGSTSSNSNNQQQYNDTLLMNTLQGTLNTTNG
SSGQNDGGCSNQVQCLQQFIQDLNPLTNAPSSANPANEQVKTLAQRLQGLAMDVLDNNAI
NNTTYNLNNLHNALNFQAYQSTIDKYNSVLKQISWNKFAEPKDLLKNTSNNHQIGTVTNA
QGQNVSAYDCLSATGSISTPSGLTPSSNTGISCKATSSNTTNNTDVTSSFDNSLVATSKI
QTINGKEQIGVNSFNLVSQVWSVYNSLKTSEANLQKNAQILCPNGSNGSQNTCNNNNSGG
LSISGNSQLQNILSSNGVSSNTSKNAQAMVSVNNEAAKTAQNSATNNSNSAPQSSAISAL
NTVLQNVSNFQQSIQSAFQNQKSNIEAWANAIYNTNGSQSQEMTSNNNQNLRIQLRANFY
QLINTINQQVPTDMSALIAQSQQTQQTSGSASATNNACANGMGSGGNWCNQQWSDSKAYY
SGLQSALGYQTQATTQSGSNGMNNITYNVQQITLTSNGLLNNIISSLKGFSSSGNNGGSG
NGTSQISTAYQMLTDASEGKLGTYNSSGSGGSGESSSNNNGYQTCNKTNGSNGTSESNCY
EPNKQQSATTANTATTTDSNLQKVYNDAQKIANIIASSGNNKGVENGLKQFFEALKSNSS
SLSNLCNGSSGSSSTCSGGLINLLGAIPTNGVSDTNNLINLLTEFIKTAGFIQNNDANVS
TSLTSAFQAITSAISQGFQALQNDISPNAILTLLQALTTNTTTIQSFSQTLRQLLGDQKF
FAVQQKLLNAMSNARNAVQNAQNQANSYGSQPILSQYAAAKSTQHGMSNGLGVGLGYKYF
FGKARKLGFRHYLFLDYGYSQIGVANQSVKTNIFAYGLGTDFLWNLFRRTFNTKALNFGI
FTGVQLGGTTWLSSLRQQIIDNWGNDKNIQPVNFQVAFNFGFRTNFAEFKRFVKGFHDQG
VLSQKSVEFGIKVPLINQAYLRSAGADVSYRRLYTFYINYIMGF
NT seq 3735 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatcaaaaaatttaaaaaattcataccactttttttagccagctcccttttagccgaa
gacaacggctggtatatgtctgtaggctatcaaatcggcggcacgcagcaattcgtcaat
aacaaacagcttttagaaaatcaaaacatcatcaacagcgtggctcaaagcgcgatcaac
attgcagggcctactactggtcttatcactttaagctctcaaaccgtcgctgaagcttta
agctatggcgtgactaacactgttggcaaccaattagagggcatttctaatattttaagt
caaatcggtaaagacaggaaggactttttttctaaccgccagctttctagcatttcccaa
caactcgtggggcttaaaggaagctccaaccccctaagagcccactcttcacagatcaca
gccagactcctttctaacacccagagcgcgtttgatcagggcatcacgctaagctctaac
atcattagtgcagtcaatagcctaaaccctagcaacaactctagagaggtgaaaaaacag
ctccaaaacaccgcgcaatccatggcaagcttgttggtgcagattgaaaacaatatcact
aaaaccactagcaccacttacgcgttttccttactcactaatttaacccaagccgtgaat
tcctccacgaacaacaccgcttatgtgagcgctttaaaaaacgctttaaacactcttggg
gtggggtatttccccgcaacgaccccaacgcgcctggtgctaaacccgcccgggcaagtc
tcctactaccctcctaactccattttaggctccacttcttcaaacagcaataaccaacaa
caatacaacgacacccttttaatgaacaccttacaagggacattaaacactactaatggt
tcttctggccagaatgatggcggctgctccaatcaagtccagtgcctacagcaattcatc
caagacctaaaccctttaactaacgctccttcttcagctaacccggctaacgaacaggtc
aaaacccttgcccaaaggctccaaggcttagcgatggatgttttagacaacaatgcaatc
aacaacaccacctataatttaaacaacttgcacaacgctttgaatttccaagcctatcaa
agcacgatagacaaatacaacagcgttttaaagcaaatttcgtggaataagtttgctgag
cctaaagacttgctcaaaaacacctccaacaaccatcagatcggcaccgttaccaacgct
caagggcaaaatgtcagcgcctatgattgcctaagcgctaccgggagcatttccacccct
agcgggctaaccccctcttcaaatactgggatttcatgcaaagccacaagcagtaacaca
accaataacaccgatgttacaagcagttttgacaattctttagtcgctacctccaaaatc
caaaccatcaacggcaaagagcagatcggcgtgaattcttttaaccttgtttctcaagtg
tggagcgtttataactctttaaaaacttcagaagccaatttgcaaaaaaacgctcagata
ctatgcccaaatggcagtaacggctcgcaaaatacatgcaataacaataattcggggggt
ttgagcatcagcgggaactcccaattgcaaaatatcttgagttctaatggcgttagctct
aacacctctaaaaacgcacaagcgatggtctctgtcaataatgaagcggccaaaaccgct
caaaatagcgccaccaataacagcaatagcgccccacaatccagcgcgataagcgcgctc
aacaccgtattgcaaaatgtcagcaatttccaacaaagcattcaaagcgcttttcaaaac
caaaaaagtaatattgaagcttgggcgaatgcgatttataacactaatgggagtcagtcg
caagagatgacttctaacaataaccaaaatttacgcatccaactaagagcgaatttctac
cagctcatcaataccattaaccagcaagtgcctacagacatgagcgctctaatcgctcaa
agccaacaaacccagcaaacaagcggatctgcaagcgccacaaataatgcatgcgctaac
ggaatggggagtggtggtaactggtgcaatcagcaatggtcagattctaaggcttattac
agcgggttacaaagcgctttagggtatcaaacacaagcaacaactcaaagtgggagcaat
ggcatgaacaatatcacctacaatgtccaacaaatcacgctcactagtaatgggttgctc
aataacatcatttcatctcttaagggttttagcagtagcggaaataatggaggcagtggg
aacggaactagtcaaatcagcacagcctaccaaatgctcacagacgccagcgagggaaag
ctggggacttataacagcagtggcagtgggggtagcggagaaagtagcagtaataacaac
ggctatcagacttgcaataagaccaatgggagcaatggaacgagtgagagtaattgttat
gaacccaacaaacaacaaagcgccaccaccgcaaacacagccaccacaaccgacagcaat
ttgcaaaaagtctataatgacgcccaaaaaatagccaacattatcgctagttcagggaac
aataaaggcgttgaaaacggcttaaaacaattctttgaagcgctaaaaagtaatagcagc
agtctcagtaatttgtgtaatggtagtagtggtagtagctctacttgctccggtgggctt
atcaaccttttaggggcaatccctacaaatggggtgagcgatacgaacaatttaattaat
ctgctcactgaattcattaaaaccgccggctttatccaaaataatgatgctaatgtatct
actagtcttacaagcgcttttcaagccattacgagcgctatttctcaagggtttcaagcc
ttgcaaaacgacattagccctaatgcgattttaaccttgctccaagccctaaccacgaac
accaccaccattcagtcattctcgcaaaccttacggcagcttttaggggatcaaaaattc
tttgccgtgcaacaaaagctcttaaacgcaatgagtaacgccagaaacgcggtccaaaat
gcgcaaaatcaagccaatagttacggctctcaacccattttaagccagtatgcagccgct
aaaagcacccaacacggcatgagcaatggtttaggggttggtttgggctataaatacttc
tttggtaaggctaggaaattgggctttaggcattatcttttccttgattatggttatagt
cagatcggcgtggccaatcaaagcgtgaaaaccaatatctttgcttatgggctaggcacg
gattttttatggaatctattcaggaggacttttaacacaaaagcgctgaattttgggatc
tttactggggtccaactgggcggcacaacatggcttagctctttaaggcagcaaatcatt
gacaactgggggaatgacaaaaatatccagccggtaaatttccaagtggcgtttaatttt
ggattccgcaccaactttgcggagtttaagcgtttcgttaaaggctttcacgatcaaggg
gttttaagccaaaagagcgtggaatttgggatcaaagtgcctctcatcaatcaagcgtat
ttaagaagcgctggggctgatgtgagctacaggaggctttatactttctatatcaattac
atcatggggttttaa

DBGET integrated database retrieval system