Helicobacter pylori OK310: HPOK310_0623
Help
Entry
HPOK310_0623 CDS
T02542
Name
(GenBank) outer membrane protein
KO
K15848
outer membrane protein SabA
Organism
hpyl
Helicobacter pylori OK310
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
SabA_adhesion
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAM98051
LinkDB
All DBs
Position
633737..635686
Genome browser
AA seq
649 aa
AA seq
DB search
MKKRFLLSLSLVASLLCAEDNGFFVGAGYQIGEAVQMVKNTGELKNLNEKYEQLNQYLNQ
VASLKQSIQNANNISLVNSSLNDLKSFTENNYNSTTQSPIFNAVQAVITSVLGFWSLYAG
NYFTFFVGNKDTQKPAGVQGNPPFQTIIKNCSGIENCAMDQTTYDNMKKLAENLQAAQQN
SNTKANNLCALSGCATTQDQTPNSTVSSALSLAQQLMDLIANTKTAMMWKNIVINGVSNA
SGAITSTGYPTQYAVFNNIKAMIPILQQAVTLSQSNNSLSSKLQAQATGSQTNPEFAKDI
YNLAQNQKQVISYAQDIFNLFNSIPAEQYKYLEKAYLKIPNTGQTPTNPYRQVVNLNQEV
QTIKNNVSYYGNRLDSALSVAKDVYNLKSNQKEIVAAYNGAKNLSQEISQLPYNQVNTKD
IVTLPYDKNAPAAGQYNYQINQEQASNLSQALAAMSNNPFKKVGMISSQSNNGALNGLGV
QVGYKQFFGESKRWGLRYYGFFDYNHGYIKSSFFNSSSDVWTYGGGSDLLVNFINDSVTR
KNNKLSVGLFGGIQLAGTTWLNSQYVNLTALNNPYSAKVNTSNFQFLFNLGLRTNLATAK
KEDSEHSAQHGIELGIKIPTINTNYYSFLGAKLEYRRLYSVYLNYVFAY
NT seq
1950 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacgatttttactttctctatcccttgtggcgtcattactttgcgctgaagac
aacggcttttttgtgggcgcgggctatcaaatcggcgaagcggtgcaaatggtcaaaaac
accggcgaattgaaaaacttgaacgaaaaatacgagcaattaaaccagtatttaaatcaa
gtggcttcgctaaagcaaagcattcaaaatgccaacaacattagcttggtcaatagctct
ttaaacgatttaaaaagctttaccgaaaacaactataacagcaccacccaatcgcccatc
tttaacgctgtgcaagccgttatcacttcggtattgggtttttggagtctttatgcgggg
aactacttcactttttttgtgggtaataaggatactcaaaaacccgctggtgtccagggt
aaccctccttttcaaacgattatcaaaaactgctcaggaattgaaaactgcgctatggat
caaaccacttacgacaatatgaaaaaactcgctgaaaacctccaagcagctcaacaaaac
tctaatactaaagcgaacaatctttgcgctttatccggatgcgccacaacacaagaccaa
accccaaactcaaccgtaagcagcgctcttagcttggcgcaacagcttatggatttaatc
gcaaacactaagactgctatgatgtggaaaaatatcgtcatcaatggtgtttcaaacgcg
tccggtgctatcacatccactggttacccaacgcaatatgcggtgtttaacaacatcaag
gcgatgatacctatcttgcaacaagcggttacgctttctcaaagcaacaacagcctatct
tctaagttgcaagctcaagctacaggatctcaaacaaaccctgaattcgctaaagacatc
tacaatctcgctcaaaaccaaaagcaagtcatctcttacgctcaggatattttcaacctc
tttaattctatccctgcagagcagtataaatatctagagaaagcttatttgaaaataccc
aatacgggtcaaactcctactaacccttacagacaagtggtgaatttaaaccaagaagtt
cagacgattaaaaacaatgtgagttattatggcaatcggttggactcggctttaagtgtg
gctaaagatgtttataacctaaaatccaatcaaaaagagattgtagccgcttataacggt
gctaagaatttgagccaagagatttctcaactcccatacaatcaagtcaatacaaaagac
attgtcacactaccttatgataaaaacgctccagcagcgggccaatacaactaccaaatc
aaccaagagcaagcatccaatctttctcaagctttagcggcgatgagcaataaccccttt
aaaaaagtgggcatgatcagctctcaaagcaataacggtgctttgaatgggcttggcgtg
caagtgggttataagcaattctttggcgaaagcaaaagatggggattaaggtattatggc
ttctttgactacaaccacggctatatcaaatcaagcttttttaattcttcttctgatgta
tggacttatggcggtgggagcgatttgttagtgaattttatcaacgatagcgttacaaga
aagaacaacaagctttctgtgggtctctttggtggtatccaactagcagggactacatgg
cttaattctcaatacgtgaatttaacagcgctcaataatccttacagcgcgaaagtcaat
acttccaatttccaatttttgttcaatctcggtttgagaacgaatctcgctacagctaag
aaagaagacagcgaacattccgcacagcatggcatagaattgggcattaaaatccctacc
attaacacgaattactattctttcctaggcgctaagctagaataccgaagactctatagc
gtgtatctcaattatgtgtttgcttactaa
DBGET
integrated database retrieval system
