Helicobacter pylori OK113: HPOK113_0921
Help
Entry
HPOK113_0921 CDS
T02510
Symbol
alpA
Name
(GenBank) outer membrane protein AlpA
KO
K15843
outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hpyo
Helicobacter pylori OK113
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAM96829
LinkDB
All DBs
Position
973721..975268
Genome browser
AA seq
515 aa
AA seq
DB search
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGTKRDELARELNAGV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPEKLNGNDVSANALLGGAVGSGTCAAAG
TAGGSSLNTQSACTAAGYYWLPSLSNRVLSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAANVF
FNAMNKALETKNGASGTNGATGQNGQTYSQQAIQYLQNQQNILNNAANLLKQDELFLEAF
NSAVAANIGNKEFNSAVFTGLVQGIIDQSQSVYKELSKNPISGSAVNSAGINNSQANAVQ
GRANQLSNALYNVQVTLDKINALNNQVKSMPYLPQFRAGNSRATNILNGFYTKVGYKQFF
GKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMGFF
SGIQLAGETFQSTLRDDPNVKLHGKINNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHTVEF
GVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq
1548 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagatgatggagggtttttcaccgtcggttatcagctcgggcaggttatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcactaaaagagatgaactcgcaagagagcttaacgctggtgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcgttgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggggcgtatcccgagaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttagggggtgcggtaggcagtgggacttgtgcggctgcaggg
acggctggtggcagctctcttaacactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctcccaagcctttctaatagggttttaagcacgatcggcagccagactaactacggcacg
aacaccaatttccccaacatgcagcaacagctcacctacttgaatgcggcgaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaggctttagagaccaaaaatggagctagtggaactaatggtgcg
actggtcaaaatggtcaaacttactcccaacaagctatccaataccttcaaaaccaacaa
aatattctcaataacgcggctaacttgctcaagcaagatgaattgttcttagaagctttc
aactctgccgtagccgccaacattgggaataaggaattcaattcagccgtttttacaggt
ttggtgcaaggcattatcgatcaatcccaatcggtttataaggaactcagtaaaaacccc
attagcgggagcgcggttaatagcgctgggataaataacagccaagctaacgctgtgcaa
gggcgcgctaatcagctctctaacgctctttataacgtgcaagtaactttggataaaatc
aatgcgctcaacaatcaggtgaaaagcatgccttacttgccccaattcagagccgggaac
agccgcgcgacgaatattttaaacgggttttacactaaagtgggctataagcaattcttc
gggaagaaaaggaatatcggtttgcgctattatggtttcttttcttataacggagcgagc
gtgggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtggggactgat
gtgttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatgggctttttt
agcggtatccaattagccggtgagaccttccaatccacgctcagagatgaccccaatgtg
aaattgcatgggaaaatcaataacacgcacttccagttcctctttgacttcggtatgcga
atgaacttcggtaagttggacgggaaatccaaccgccacaaccagcacacggtggaattt
ggcgtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggactaccgtgaag
tatttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system