KEGG   Helicobacter pylori OK113: HPOK113_0929
Entry
HPOK113_0929      CDS       T02510                                 
Name
(GenBank) toxin-like outer membrane protein
Organism
hpyo  Helicobacter pylori OK113
SSDB
Motif
Pfam: VacA2 DUF6252
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAM96837
LinkDB
Position
987253..994389
AA seq 2378 aa
MAFKKARLISKFILKGSFKLNKISKKIFKLNLILKREKPLSHKKTKSIKKPFNQNKSFLK
ASVLLIGALGGLSHLRASECRYWSWSSWSYHDNIESGSNSPTHNSYCLFNSAQGSGTYYL
NTLTTYSAGGASFTQKFNNGTLNVGGNIRFGGTGVNGGNVGYITGTYDAQTINFNSSRIT
TGNSFSTGGGATLNFNATNHITINQASFDNGDAGTQHSYMNFSSSNINVSASSFTDDTNG
GFSFSGNGANSNLSFDKTSFNQGTYKFTNSANLNFNNSAFNQGTYNFTDNTGLNFNNDTF
NQGTYSFNASKVSFSGANTLNSSSPFASLKGSVSFGSGAIFNLNQTLNSNQTYDILTTNK
TIQYGVYQSYLWDLINYKGDKAISHVEVGSNTYDVTFDINGQDETLQETFNNQSITTQFL
GDDLQAKAQATYQQDLSNSQSALNNATNDNKIASSDISYTNNQNTTIKKDAQSLESTSQQ
IAHDEQALQGDLDNLKQLASSTTGFNQQAFNQVQDKEKKDLQTLQGEENTFSSEQDGLKQ
ALANAKPTSPTPSPTPTPTKRTAPNTPPNKVPPTPPTQDLPATNVWNGVYWLQNQTYSKQ
GVYYIDPNLSGQSGQNGNTLSTYTANLLGRSFGVNIQNGTLIIGNNTERVNDNGLIWIGH
GGFGYITGTFNAANIYLTNNFKTGEGVSGSDGGGANITFKASDNITMDGLNYNDAETVTK
MIQTGASQHSYAAFDATNNISVTDSSFSDMTWGKFSFNAKNISFSNASFSGFTNPGGSSV
ISANAANSLSFNNSRLNGGAVYNLWANSLIFNNTQAVFNVLYSRGTSNFNATTQLLDNTS
FTLSSQSLLNFNGDTTLQNNANITLGNKSQATFKNSLTLDNNSNLSLDNQSVLNANGASA
FNNQASLNIYNGSQAIFNSLFFNGGILSLNANSKLNASSASFSNNTTINLDDSVLSASNT
SSLNANINFQGASQADFGGNTTIDTASFNFDSASSLSFNNLTANGALNFNGYAPSLSKAL
MSVSGQFVLGNNGDINLSDINIFDNITKSVTYNILNAQKGITGISGANGYEKILFYGMKI
QNATYSGNNNIQTWSFINPLNSSQIIQESIKNGDLTIEVLNNPNSASNTIFNIAPELYNY
QASKQNPTGYSYDYSDNQAGTYYLTSNIKGLFTPKGSQTPQIPGTYSPFNQPLNSLNIYN
KGFSSGNLKTLLGILSQNSATLKEMIESNQLDNITSINEVLQLLDEIKITPAQKQALLET
INHLTDNINQTFNNGNLVIGATQDNVTNSTSSIWFGGNGYSSPCTLDSATCSSFRNTYLG
QLLGSTSPYLGYINADFKAKSIYITGTLGSGNAFESGGSADVTFQSANNLVLDKANIEAQ
ATDNIFNLLGQEGIDKIFNQGNLANVLSQMAMEKIKQAGGLGNFVENALSPLSKELPTSL
QSETLGQLIGQNNLDDLLNNSGVMNAIQNIISKKLSIFGNFVTPSIIENYLAKQSLKSML
DDKGLLNFIGGYIDASELSSILSVVLKDITNPPTSLQKDIGVVANDLLNEFLGQDVVKTL
ENQGLVSNIINNIISQGGLSGIYNQGLGSVLPPSLQNALKENDLGALLSPRGLHDFWQKG
YFNFLSNGYVFVNNSSFSNATGGSLNFVANKSIIFNGDNTIDFSKYQGTLIFASNGVSNI
NITTLNATNGLSLNAGLNNVSVQKGEICVNLANCPTTKNSSSTNSSVTPTNESLSVRANN
FTFLGTIASNGAIDLSQVKNNSVIGTLNLNENATLQANNLTITNAFNNASNSTANINGNF
TLNQQATLSTNASGLNVMGNFNSYGDLVFNLSHSASHAIINAQGVATIMANNNNPLIQFN
TSSKEAGAYTLIDSAKAIYYGYNDQITGGNSLADYLKLYTLIDINGKRMAMTDNGLTYNG
QAVNIKDGGLIVGFKDSQNQYIYTFILYNKVKIAVSNDPINNLQAPTLKQYIAQIQGVQS
VDSIDQAGGTQAINWLNKIFETKGSPLFAPYYLESHSTKDLTTIAGDIANTLEVIANPDF
KNDATNILQINTYTQQMSRLAKLSDTSTFASADFHERLEALKNKRFADAIPNAMDVILKY
SQRNRVKNNVWATGVGGASFINGGTGTLYGINIGYDRFIKGVIVGGYAAYGYSGFHANIT
QSGSNNVNMGVYSRAFIKRSELTMSLNETWGYNKTFINSYDPLLSIINQSYKYDTWTTDA
KINYGYDFMFKDKSVIFKPQIGLAYYYIGLSGLRGIMDDPIYNQFRANADPNKKSVLTIN
FALESRHYFNKNSYYFVIADVGRDLFINSMGDKMVRFIGNNTLSYRDGGRYNTFASIITG
GEIRLFKTFYVNAGIGARFGLDYKDINITGNIGMRYAF
NT seq 7137 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcgtttaaaaaggccagattgatttctaagtttattttaaagggatcttttaaatta
aataagatctcaaagaaaattttcaaattgaatctaatcttgaagcgtgaaaagccctta
agccataaaaaaacaaaatccattaaaaagccctttaatcaaaacaaatcttttttaaaa
gcttcagttttattgataggagcgttggggggattatcccacctaagggctagcgagtgc
cgttattggtcatggtcgtcttggagttatcatgacaatattgaaagcggttctaattcc
cccacgcacaactcttattgtctttttaatagtgctcaaggctctgggacttattatttg
aatacccttaccacttatagtgctggtggggctagtttcacgcaaaaattcaataatggc
acgcttaatgtgggagggaatatccgctttggaggcacgggtgttaatggaggtaatgta
gggtatatcacaggtacttatgacgctcaaacgattaattttaattctagccgtatcaca
accggcaactcattttctactggcggtggggccactctcaattttaatgcgactaaccat
atcactatcaatcaagcgagttttgataacggcgatgcagggacgcaacactcttacatg
aatttcagtagttctaacatcaatgtgagcgcttctagctttacagacgacaccaatggg
ggctttagtttcagcgggaatggggctaacagcaatctctcttttgacaaaacgagcttc
aatcaagggacttataaattcactaacagcgctaacttaaacttcaacaacagtgctttc
aatcaagggacttacaattttactgacaatacaggtttaaactttaataacgacaccttc
aatcaaggcacttatagctttaatgcaagcaaggtgagtttttcaggcgctaacacttta
aattcaagttcgccttttgctagccttaaaggcagtgtgtcttttggttctggtgcgatt
tttaacctcaatcaaacccttaatagcaatcaaacctatgacattctcaccacaaacaag
accatccagtatggggtttatcaaagctatttgtgggatttgatcaactataagggcgat
aaagctattagccatgttgaagtgggtagtaacacttatgatgtaacctttgacattaac
gggcaagatgaaaccttacaagaaacctttaacaatcagtccattaccacccaattttta
ggggacgatttacaagccaaagcccaagcaacctaccaacaagacttgagcaattcacaa
agtgctttaaataacgctactaatgataataagatcgcaagcagtgatataagctacacc
aacaatcaaaacaccactattaaaaaagacgctcaaagtttagaaagcactagccaacaa
atcgctcacgacgaacaagcgttacaaggagatttagacaatctcaaacaattagccagt
tccacaacaggctttaaccaacaagctttcaatcaagtgcaagataaagagaaaaaagat
ttacaaaccttacaaggcgaagaaaatacttttagtagcgagcaagatgggttaaaacaa
gcgttagctaacgctaagcctacaagcccaacaccaagccctacacccactcccacaaag
cgcacagcgccaaacactcctcctaataaagttccacccacgccccctactcaagattta
cccgcaacgaatgtgtggaatggggtttattggcttcaaaatcaaacttactcaaaacaa
ggcgtttattatattgatcccaatctttcaggacagagcggtcaaaacggcaacacgctc
agcacttatacagccaatttgttaggaagaagttttggcgtgaatatccaaaatggcact
ttgatcatagggaataacacagagagagtgaatgataatgggttgatttggatagggcat
ggaggctttggctatatcacggggacttttaatgcggctaatatttacttgaccaataat
tttaaaaccggtgaaggcgtttcaggctcagatggtgggggagcgaacatcacctttaaa
gcaagcgataatatcactatggatggcttgaattataatgacgctgaaaccgttactaaa
atgattcaaacgggggccagtcagcattcctatgccgcttttgacgctacaaacaatatc
agcgtgactgattccagctttagcgatatgacttgggggaaattcagttttaacgctaag
aatatttcgttttctaacgcttcgtttagtggctttacaaaccctggaggatcaagcgtg
atcagcgctaatgccgctaattctttaagctttaacaattctcgcttgaatgggggagcg
gtttataatttgtgggctaatagccttattttcaataacacgcaagcggtttttaatgtc
ttgtattctagggggacaagcaattttaacgctaccacacagcttttggacaacacgagt
tttacgctcagctctcaaagtttgctgaactttaatggcgatacaaccttgcaaaacaac
gccaatatcacgcttggcaataaaagtcaagccacttttaaaaattctttaacgcttgat
aataattctaatttaagcttagacaatcaaagcgttttgaatgccaatggtgcaagcgct
tttaacaatcaagcgagtctcaatatttataacgggagtcaagcaatctttaatagcctc
ttttttaatggcgggatactcagtcttaacgctaacagcaagctcaacgcttctagcgct
agtttctcaaacaacaccactatcaatttagacgatagcgttttatcggctagtaacaca
agctctttaaacgctaatatcaattttcaaggcgcaagccaggctgattttggaggcaac
acgactattgatacagcaagctttaattttgacagcgcaagctcattgagttttaataac
cttacggctaatggggcgttaaattttaatggttatgcaccctctttatctaaagcttta
atgagcgttagcgggcagtttgttttagggaataatggggatattaatttatctgacatc
aatatttttgacaacattacaaaatctgtaacctacaatatcctaaacgctcaaaaaggc
attactggcattagtggggctaatggctatgaaaaaatccttttttatggcatgaaaatc
caaaacgctacctatagcggcaataataacattcaaacttggtcgtttataaaccctctc
aattcttctcaaatcattcaagagagcattaaaaatggggatttaaccatagaagtttta
aataaccctaactcagcttctaacactatttttaatatcgctcctgagctttataattac
caagcttctaagcaaaatcctaccggttatagctatgattatagcgataaccaagcaggc
acttattacttgacaagcaacattaaaggtcttttcacccctaaaggctctcaaacgcct
caaatcccaggcacttatagcccgtttaaccagcctttgaatagtttgaatatctacaat
aagggtttttctagtggaaatttaaaaacgcttttagggattctttctcaaaattccgct
accttaaaagaaatgattgaatccaaccaattagacaatatcactagcatcaatgaagtg
ttgcaactcttagatgagattaagatcaccccagcacaaaagcaagcgctcctagaaacc
atcaaccatttgactgacaacatcaatcaaacctttaataacgggaatctcgtgataggc
gctactcaagataatgttacaaactctactagctctatatggtttgggggcaatggttat
agcagtccttgcacgctagatagcgccacttgttcttcttttagaaacacttacttgggg
caattattaggctcaacttccccctatttaggctacatcaacgctgattttaaagctaaa
agcatttatatcactggaacgcttggaagcggtaacgcctttgaaagcggagggagcgcg
gatgtaacctttcaaagcgctaataatttagtgttggataaagctaacatagaagctcaa
gccacagacaatatctttaatcttttgggtcaagaagggattgataaaatctttaatcaa
gggaatttagcgaatgtcctcagtcaaatggctatggaaaaaatcaagcaagccggcggt
ttagggaactttgtagaaaacgctctaagccctttgagtaaagaattacccactagcttg
caaagtgaaaccttaggccaacttataggtcaaaataatttagatgatttattgaataat
agtggggtcatgaatgcaatccaaaatattatcagtaaaaaactaagcatttttggtaat
tttgttaccccatccatcatagaaaactaccttgctaagcagtctttaaaaagcatgcta
gacgataaagggcttttgaatttcatcggtgggtatatagacgcttctgaattaagctct
attttaagcgtggttttaaaagacattactaatcctcctacaagcttgcaaaaagacatt
ggtgtggtggcgaacgacttgttgaacgagtttttaggacaagatgttgttaaaacgcta
gaaaatcaaggcttagtgagcaatatcattaataatattatttctcaaggcgggttaagc
ggcatttataatcaaggtttggggagcgtgttgccgccctctttacaaaacgcgctcaaa
gaaaacgatttaggtgctcttttatcgcctagaggcttgcatgatttttggcaaaaaggg
tattttaattttttaagcaatggctatgtttttgtcaataatagctcttttagcaacgct
acagggggcagtttgaattttgtcgccaacaagtctattatttttaatggcgataatacg
attgattttagcaagtatcaaggcacattgatttttgcttctaatggtgtttctaatatc
aatatcaccaccctaaacgctactaatggcttaagccttaatgcaggtttgaataatgtg
agcgttcaaaaaggggaaatttgtgtcaatttagccaattgccccacaaccaaaaacagc
tcttctacaaactctagcgtaacccccactaatgaatctttaagcgtgcgcgctaacaac
ttcactttcttaggcacaatagcttccaatggggctattgatttgtctcaagtaaaaaat
aatagcgttataggcacgctcaatcttaatgaaaatgcgaccttgcaagccaataattta
acgatcactaacgcttttaacaacgcctctaactctacagctaacattaatggtaatttc
accttaaaccaacaagcgactttaagcactaacgctagtggtttgaatgtcatggggaat
tttaatagctatggcgatttggtgtttaacctcagccattcagctagccatgccattatc
aacgctcaaggcgtagcgacgattatggctaataacaataaccccttaatccaattcaac
acttcttcaaaagaagcaggcgcttacacgctcattgatagcgctaaggccatttattac
ggatataacgaccaaatcacaggaggcaatagtctagccgattatctcaagctttacacg
ctcattgatattaatggcaagcgcatggcgatgactgataacggcttaacctataacggg
caagccgtgaatattaaagatggcggtttaattgtaggctttaaagactctcaaaatcaa
tacatttacactttcattctctataataaagtgaaaatcgctgtttctaatgatccgatc
aataacctacaagcccccactttaaaacaatatatcgctcaaattcagggcgttcaaagc
gtggatagcattgatcaagctggaggcactcaagcgattaattggctcaataaaatcttt
gaaactaagggaagtcctttattcgctccctattatttagaaagccattccacaaaagat
ttaaccacgatcgctggagacattgctaacactttagaagtcatcgctaaccctgatttt
aaaaatgatgccactaatattttacagatcaacacctacacgcaacaaatgagccgttta
gctaagctctctgacacttcaacctttgctagcgctgatttccatgagcgtttagaagcc
cttaaaaacaagcgattcgctgatgcgatccctaacgctatggatgtgattttaaaatac
tctcaaagaaacagagttaaaaataatgtgtgggcgacaggagttggaggggctagtttt
attaatggaggcactgggactttatatggtatcaatatagggtatgacaggtttattaag
ggcgtgattgtggggggttatgccgcttatgggtatagcgggtttcatgcaaacatcact
caatcaggctctaacaatgtcaatatgggtgtttatagccgagcctttatcaaaagaagc
gaattgacgatgagcttgaatgagacttggggatacaataagactttcatcaactcttat
gaccccctactctcaatcatcaaccagtcttacaaatacgacacctggacgactgacgct
aaaatcaattacggctatgatttcatgtttaaagataaaagcgttatttttaaacctcaa
ataggcttagcctattattacattggtttgtctggtttaaggggtattatggatgatcct
atctacaaccaattcagagccaatgctgaccctaataaaaaatccgttctaacgattaat
tttgccctagaaagtcggcactacttcaataaaaactcttattattttgtgattgcggat
gtgggcagagatttattcatcaattctatgggggataaaatggtgcgtttcatcggtaat
aacaccctaagctatagagatggtggcagatacaacacttttgctagcattatcacaggc
ggggagataagattattcaaaaccttttatgtgaatgctggcataggggctaggtttggg
cttgattataaagatattaatattaccggaaatattggtatgcgctatgctttttaa

DBGET integrated database retrieval system