Helicobacter pylori UM032: K747_06355
Help
Entry
K747_06355 CDS
T02658
Name
(GenBank) membrane protein
KO
K15843
outer membrane protein HopC/AlpA
Organism
hpyr
Helicobacter pylori UM032
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGL67053
LinkDB
All DBs
Position
complement(1223160..1224704)
Genome browser
AA seq
514 aa
AA seq
DB search
MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGTKRDELERELNAGV
TNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPEKLNGNDVSANALLGGAVGSGTCAAAG
TAGGNSLTTQSACTAAGYYWLPSLSNRVLSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAANVF
FNAMNKALTKNGTSGTSGATGQNDQTYSQQAIQYLQDQQNILNNAANLLKQDELLLEAFN
SAVAANIGNKEFNSAVFTGLVQGIIDQSQSVYNELSKNPISGSAVNSTGIDSNQANAVQG
RANQLPNALYNVQVTLDKINALNNQVRSMPYLPQFRAGNSRATNILNGFYTKVGYKQFFG
KKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMGFFS
GIQLAGETFQSTLRDDPNVKLHGKINNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHTVEFG
VVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF
NT seq
1545 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaagaaaaatagaacgctgtttcttagtctagccctttgcgctagcataagttat
gccgaagatgatggagggtttttcaccgtcggttatcagctcggacaggttatgcaagat
gtccaaaacccaggcggcactaaaagagacgaactcgaaagagagcttaacgctggtgta
acgaacaacattttaaacaacaacaccggaggcaatgtcgcaggggcattgagtaacgct
ttctcccaatacctttattcgcttttaggggcgtatccagagaaactcaatggtaacgat
gtgtctgcgaacgctcttttagggggtgcggtaggcagtgggacttgtgcggctgcaggg
acggctggtggcaactctcttaccactcaaagcgcttgcaccgctgcgggctattactgg
ctcccaagcctttctaacagggttttaagcacgatcggcagccagactaactacggcaca
aacaccaatttccccaacatgcaacaacagctcacctacttgaatgcggcgaatgtgttt
tttaatgcgatgaataaggctttaaccaaaaatggaactagcggaactagtggtgcgact
ggtcaaaatgatcaaacttactcccaacaagctatccaataccttcaagaccaacaaaat
attctcaataacgcagccaacttgctcaagcaagatgaattgcttttagaagctttcaac
tctgccgtagccgccaacattgggaataaggaattcaattcagctgtttttaccggtttg
gtgcaaggcattattgatcaatcccaatcggtttataacgaactcagtaaaaaccccatt
agcgggagtgcggttaatagcactgggatagatagcaaccaagctaacgctgtgcaaggg
cgcgctaatcagctccctaacgctctttataacgtgcaagtaactttggataaaatcaat
gcactcaacaatcaggtgagaagcatgccttacttgccccaattcagagccgggaacagc
cgcgcgacgaatattttaaacgggttttacactaaagtgggctataagcaattcttcggg
aagaaaaggaatatcggtttgcgctattatggtttcttttcttataacggagcgagcgtg
ggctttagatccactcaaaataatgtagggttatacacttatggggtggggactgatgtg
ttgtataacatctttagccgctcctatcaaaaccgctctgtggatatgggcttttttagc
ggtatccaattagccggtgagaccttccaatccacgctcagagatgaccccaatgtgaaa
ttgcatgggaaaatcaataacacgcacttccagtttctctttgacttcggtatgaggatg
aacttcggtaagttggatgggaaatccaaccgccacaaccagcacacggtggaatttggc
gtagtggtgcctacgatttataacacttattacaaatcagcagggactaccgtgaagtat
ttccgtccttatagcgtttattggtcttatgggtattcattctaa
DBGET
integrated database retrieval system