Helicobacter pylori SouthAfrica20: HPSA20_0977
Help
Entry
HPSA20_0977 CDS
T02807
Name
(GenBank) vacuolating cytotoxin family protein
Organism
hpys
Helicobacter pylori SouthAfrica20
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VacA2
GH115_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGT74210
UniProt:
T1UA04
LinkDB
All DBs
Position
915242..917350
Genome browser
AA seq
702 aa
AA seq
DB search
MTLKKAKLISGFISKRSFKLDKVSRKFFPLNRILKREKSLKRHKKALKPVKKPFNKNKSF
LKASVLLIGALGGLSHLRASDCKTWSWSSWTYQDNIASGANSPTHNSYCLFSSTQGSGTY
YLNTLTTYSSGGASFTQKFNGGTLDIGGNIRFGEGGYLGYITGAYDAQTINFNSSHIITG
NGWSGGGATLNFNATNNLTINQASFDNSHAGAQHSYMNFKGSNISVSGSSFKDDTNGGFS
FSGNNNSSTISFNQTSFNQGTYKFSNSASSSFDSSSFNQGTYNFNSDQSTFQNSSFNQGT
YKFSNSASFNNDTFNQGAYSFNTSKVSFSGTNTLNSSSPFASLKGGVSFGSNAIFNLNQT
LNANQTYDILTTNGAIQYGVYQSYLWDLINYKGDKAISHVEVGKNTYDVTFDVNGQDETL
QETFNSQSIIAQFLGDDLQQQAQKTYKDDVANSQSALKNATSDNQIASNDTDYTKSSNPA
VAKDAQSLEKTNQQIQQDEQALENDLTNIKQLANSTTGFNEQAFNQAQKQEQQDEQTLQS
DENAFNSEQEGLQKALANAKHVSPTPNPTPSPTKHTAQNTPPSKVPPTPPTQDLPKTNVW
NGVYNLQNQTYSKQGIYYIDPNNQTLYTYSSLGGSFGVNANNGTLIIGNDTENANTKGLI
QFGGMGWSGGDVGYITGTFNAANIYLTNNFKTGNSYSTKRFD
NT seq
2109 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgcttaaaaaggctaaattgatttctggatttatttcaaagagatctttcaaattg
gataaagtttcaaggaaatttttcccattgaatcggatcttaaagcgtgaaaaatccttg
aaacgccataaaaaagctttaaaacctgttaaaaagccctttaataaaaacaaatctttt
ttaaaagcttcggttttactgataggagcgttagggggattgtctcacttaagggctagc
gattgtaagacttggtcatggtcgtcttggacttatcaagacaatattgcaagcggtgct
aattcgcccacgcacaactcctattgtctttttagcagcactcaaggctctggaacttat
tatttaaacactcttaccacttatagcagtggtggggctagttttacgcaaaaattcaat
ggcggcacgcttgatataggggggaatatccgttttggagaaggaggttatttagggtat
atcacaggcgcttatgacgctcaaacgattaattttaactctagccatatcataaccgga
aatggttggagtggcggtggggccacactcaattttaatgcaaccaacaacctcaccatc
aatcaagcgagctttgataacagccatgcaggggcacaacactcttatatgaattttaaa
ggctctaacattagcgtcagtggctctagctttaaagatgacacgaatgggggctttagt
tttagcggtaataataatagtagcactatctccttcaatcaaacgagcttcaatcaaggg
acttataagtttagtaacagcgctagttcaagctttgatagtagcagtttcaatcaaggg
acttacaattttaacagcgatcaatccacctttcaaaacagctctttcaatcaaggcact
tataaatttagtaacagcgccagctttaataacgacacctttaaccaaggcgcttatagc
ttcaatacaagtaaggtgagtttttcaggcacgaacactttaaattcaagttcgcctttt
gctagtcttaaaggtggtgtttcttttggttctaatgcgatttttaacctcaatcaaacc
cttaatgctaaccaaacctatgacattctcaccacaaatggggcgatccaatatggggtt
tatcaaagctatttatgggatttgatcaactataagggcgataaagccattagccatgtt
gaagtgggtaagaatacttatgatgtaacctttgatgttaacggacaagatgaaacctta
caagaaacctttaatagccaatccatcatcgctcaattcttaggagatgatttacaacaa
caagctcaaaaaacttataaagatgatgtagctaattcccaaagcgctttaaagaatgca
actagcgacaatcagattgcaagcaacgatacagactacactaaaagcagtaatcctgct
gtcgctaaagacgctcaaagcttagaaaaaactaaccaacaaatccaacaagacgaacaa
gcgttagaaaacgatttgactaatatcaaacaattagccaactccacaacaggctttaac
gaacaagctttcaatcaagcgcaaaaacaagaacaacaagatgaacaaaccttacaaagt
gatgaaaacgcttttaatagtgagcaagaggggttacaaaaagcgttagctaacgctaaa
catgtaagccctacaccaaaccccacaccaagccccacaaagcacacagcgcaaaacaca
cctcctagtaaagttccgcccacaccccctactcaagatttacctaaaacaaatgtatgg
aatggagtctataatcttcaaaatcaaacctactcaaaacaaggcatttattacattgat
cctaacaatcaaacgctatacacctatagttcattgggaggaagttttggcgtcaatgct
aacaatggcactttgattatagggaatgatacagagaatgcaaacactaaaggtttgatt
cagtttgggggaatgggttggagtgggggcgatgtaggttatatcactgggacttttaat
gcggctaacatttacttgaccaataattttaaaaccggaaactcctattctacaaaaaga
tttgactaa
DBGET
integrated database retrieval system