Helicobacter pylori SouthAfrica20: HPSA20_1308
Help
Entry
HPSA20_1308 CDS
T02807
Name
(GenBank) ostA-like family protein
KO
K04744
LPS-assembly protein
Organism
hpys
Helicobacter pylori SouthAfrica20
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hpys00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hpys02000
]
HPSA20_1308
Transporters [BR:
hpys02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HPSA20_1308
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LptD
LptD_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGT74519
UniProt:
T1UB55
LinkDB
All DBs
Position
complement(1232358..1234658)
Genome browser
AA seq
766 aa
AA seq
DB search
MKKKAKVFWCCFNHDLLVLCGGVFLLSVLEAKEIAMQRFDKQNHKIFEILADKVSAKDNV
ITASGNAILLNYDVYILADKVSYDTKTKEALLEGNIRVYRGEGLLVKTDYVKLSLNEKYE
IIFPFYVQDSVSGIWVSADIASGKDQKYKVKNMSASGCSIDNPIWHVNATSGSFNMQKSH
LSMWNPKIYIGDIPILYLPYIFMSTSNKRTTGFLYPEFGTSNLDGFIYLQPFYLAPKNSW
DMTFTPQIRYKRGFGLNFEARYINSKDDRFLFNARYFRNYTPYVKRYDLRNQNIYGFEFL
SSSRDTLQKYFHLKSNIDNGHYIDFLYMNDLDYVRFEKVNKRITDATHMSRANYYLQTEN
NYYGLNIKYFLNLNKINNNRTFQSVPNLQYHKYLNSLYFKNLLYSVDYQFRNTAREIGYG
YVQNALNVPVGLQFSLFKKYLSLGLWNDLQLSNVALMQSKRSYVPSIPNESREFGNFVSS
NFSMYVNTDLAREYNKLFHTIQLEAIFNIPYYTFKNGLFSQDMYALSAQALNSYTSPLLR
DYDYQGRLYDSVWNPNSILPINASNKTVDLTLTQYLYGLGGQELLYFKISQLINLDDKVS
PFRMPLESKIGFSPLTGLNIFGNVFYSFYQNRLEEISVNANYQRKFLSFNLSYFLKNNFS
SGINSIVENPADYLKAGFSNDFGYFSMSADVGYDIRNNVVLNWNVGIYKKIRCFGIGFKF
VNQRRPILTGDPNQPIRVFENNYVKLELDFSPITKTNVTYRSLQRK
NT seq
2301 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaaaagcaaaagtcttttggtgttgttttaatcatgatttattggttttatgc
ggtggtgtttttttattgagcgttttagaggctaaagaaatcgctatgcaacggtttgac
aaacaaaaccataagatttttgaaatccttgcggataaagtgagcgctaaagacaatgtg
ataaccgcttcagggaatgcgatcttattgaattatgatgtgtatattttagcggacaag
gtgagctatgacactaagactaaagaagcgttgttagagggcaatattagggtttatagg
ggcgagggtttgctcgttaaaaccgattatgtgaaattgagcttgaatgaaaaatatgaa
atcattttccccttttatgttcaagatagcgtgagcgggatttgggtgagcgcggatatt
gctagcgggaaggatcaaaaatataaggttaaaaacatgagcgcttcagggtgcagcatt
gataaccctatttggcatgtcaatgcgacttctggctcattcaacatgcaaaaatcgcat
ctgtctatgtggaaccctaagatttatatcggcgatattcctatattgtatttgccctat
attttcatgtccacgagcaacaaacgcactaccggctttttataccctgagtttggcact
tctaacttggatgggtttatttatttgcaacccttttatttagcccccaaaaactcatgg
gatatgacctttaccccacaaatccgctacaaaaggggttttggcttgaattttgaagca
cgctacatcaactctaaagacgataggtttttattcaacgctcgttattttaggaattac
actccatatgtcaaacgctacgatttgaggaatcaaaacatctatggttttgaattttta
agctctagtagggacactttacagaaatattttcatcttaagtctaatattgacaacggg
cattacattgactttttatacatgaacgatttggactatgtgcgttttgaaaaggtcaat
aagcgcatcactgacgccacgcacatgtctagggcgaattactacttgcaaacagaaaac
aattactacggcttgaatatcaaatattttttaaacctaaacaaaatcaacaacaaccgc
actttccaatctgtccctaatttgcaataccataaatatctaaattctttgtattttaaa
aatttattgtattcggtggattatcagtttagaaacaccgcaagagagattggctatggc
tatgtgcaaaacgctttgaatgtcccggtgggtttgcaattttctttgtttaaaaagtat
ttgtctttagggctttggaatgatctccaattgtctaatgtggctttaatgcaatctaaa
agatcttatgtgccaagcattcctaatgaatcaagggaatttgggaattttgtgtcgtca
aatttttccatgtatgtcaatacggatttggctagagaatacaacaaacttttccacacg
atccaattggaagcgattttcaacatcccttattacacttttaaaaatggcttattttct
caagacatgtatgctttgagcgcgcaagccttaaacagctacacttcgcctttattaagg
gattatgattatcaagggcgtttgtatgactccgtgtggaatcctaacagcattttacct
atcaatgcgagcaacaagacagtggatttaaccctaacgcaatacctttatggtttaggg
gggcaggagttgttgtattttaaaatatcgcaactcatcaatcttgatgataaagtttcg
ccctttagaatgcctttagaaagcaagatcgggttttcgcccttaacaggattgaatatc
tttgggaatgtcttttattcattttatcaaaaccgcttagaagaaatctctgtgaatgcc
aattaccaacgcaaatttttaagctttaacctctcttattttttgaaaaacaattttagc
agtgggattaatagcatcgtagaaaatcctgcggattatttgaaagcgggttttagcaac
gattttggttatttttccatgagcgctgatgtgggttatgatattagaaataatgtggtg
ttaaactggaatgtagggatttataaaaaaatccgttgttttgggattggctttaaattc
gtcaaccaacgacgccccattctcaccggcgatcctaaccaacctataagggtgtttgaa
aataactatgttaagctagaattagacttttcaccgatcactaaaaccaatgtaacttac
cgctccttacagcgtaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system