KEGG   Helicobacter pylori SouthAfrica20: HPSA20_1687
Entry
HPSA20_1687       CDS       T02807                                 
Name
(GenBank) uvrD/REP helicase family protein
Organism
hpys  Helicobacter pylori SouthAfrica20
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 PDDEXK_1 Cas_Cas4 AAA_22 DEAD AAA_30
Other DBs
NCBI-ProteinID: AGT74894
UniProt: T1UC30
LinkDB
Position
1570178..1573015
AA seq 945 aa
MDTKRQCMALKASAGSGKTFALSVRFLALLFKGANPSEILTLTFTKKATAEMKERILDYL
KILQKENSENEKEKSQNILKELEEKYNLNPSLVQDNAKKIYQRFLNAEIKISTIDAFFQS
ILRKFCWFVGLSANFEVNEDTEAYQQQLNESFLNALNSEQLEELSVFITRCLSYDSYGSD
SVLKQLRVLKNKLYLFDFNQQELAFDEEAFLKKLRDLNHQIQNTETASDTAKKAIKCESF
KEFLNSALTWLEKKSEYQYFKKLKDKIPTLESECEEIESDLKRYYDAREHALFKKFPKFI
QLYDSATSKIQALDFSTIKDKVHVLLDNQENSYKNGYEKMPAEFFYFRLDSRIAHILIDE
FQDTSLNDYKILAPFIDEIKAGIGQAKWQRSVFFVGDVKQSIYGFRGSFSSLFESVSKDF
YHDNLEFNHRSAPLIINYVNTIFKKAYQSYPTAYLEQKYPKTFEDKQTEGYVKISLVPNE
RELLLNQVLQEAKNLLKNHIDPKDITILCATNKDALEIKRHLQERLSEICPSTESSAKLS
QFVESKIIKNALEHALAEEPYKPFYKHSVLKLAGYLHDDTIALPSFNPKKESVANFVWRV
MEQFELYEECAQSCLELAVGCEDANEFLEKLEAKEIASFNAKGAQIMTIHGSKGMQFPYV
IVCERLGKPNSSPTSKFLEEYHGTELTRLYYRMKNRESVDKDYARALEKEEILKNHEEIN
VYYVAFTRAELGLIVMAKDKDKEMREKLDLAPLEVGKITPVTSSKKEPLIASTLIKPHAY
GDQVQEIEEEPDIDYEKNNDQEAINFGIALHKGLEYQYAYHIPKESVLKYLNYHYGFYGL
DNQALEESLELFKNDREIQTLFKNNALKGEVAFLFQGVVSRIDVLLWDRGQNVHVLDYKS
SQNYQQSHKAQVSHYAEFLQTQAPHLKIQAGIIYAHKRLLEKLWV
NT seq 2838 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatacaaaaagacaatgcatggcgttaaaagcttcagcaggaagcgggaaaactttc
gctttgagcgtgcggtttttagccctattgtttaagggggctaatcctagcgagatttta
acgctcactttcactaaaaaagccaccgccgaaatgaaagagcgcattttagattatttg
aaaattttgcaaaaagaaaactctgaaaatgaaaaagaaaaatcccaaaatatcctcaaa
gaattagaagaaaaatataatttaaaccctagtttagtgcaagacaacgccaaaaaaatc
taccaacgctttttaaacgccgaaattaaaatcagcaccattgatgcgttttttcaaagc
attttgaggaaattttgctggtttgtggggttgagtgcgaattttgaagtcaatgaagac
acagaagcgtaccaacaacagcttaatgaaagttttttgaacgctttaaatagcgagcag
cttgaagaattgagcgtttttatcactcgatgcttgagttatgatagttacgggagcgat
tcggttttgaagcagttgcgtgttttaaaaaacaaactctatttgtttgattttaatcag
caagaacttgcatttgatgaagaggcttttttaaaaaaattaagggatttaaaccaccaa
atccaaaacacagaaacagcgtcagatacagctaaaaaagccattaaatgcgagagtttt
aaagagtttttaaacagcgctttaacctggcttgaaaaaaagagcgagtatcaatatttc
aaaaaactcaaagataaaatccccactttagagagcgagtgcgaagaaattgaaagcgat
ctcaaacgctattatgacgctagagagcatgcgttgtttaaaaagttccctaaattcatc
cagctttatgatagtgccacttctaagatccaagccctagattttagcacgattaaagat
aaggtccatgttttgttggacaatcaggaaaacagctataaaaatggttatgaaaaaatg
ccggcggagtttttttatttcaggttggatagcaggattgcgcacattttgattgatgaa
tttcaagacacaagcttgaatgattataagattttagcccctttcattgatgagattaaa
gccgggatagggcaagctaaatggcaaaggagcgtgttttttgtgggcgatgtcaaacaa
agcatttatggctttagagggagtttcagctccttgtttgaaagcgtttctaaagatttt
taccacgataatttggaattcaaccaccgcagtgcgcctttaatcatcaattatgtgaac
accatctttaaaaaggcttatcaaagttatcccaccgcttatttggagcaaaaataccct
aaaacttttgaagacaagcagacagagggctatgttaaaatctcgttagtgcctaatgaa
agggagttgttattaaatcaagtcttgcaagaagctaaaaaccttttaaaaaatcatatt
gatcctaaagacattaccattttatgcgccaccaataaggacgctttagagatcaaacgc
catttgcaagagcgtttaagcgaaatttgccccagcacggaatctagcgcgaaattgtct
caatttgtagaatctaaaatcattaaaaacgccctagaacacgctttagctgaagaacct
tataagcctttttacaaacacagcgttttaaaactcgctggatatttgcatgatgacaca
atcgcgctccctagttttaaccccaaaaaagagagcgtggcaaactttgtgtggagggtg
atggagcaatttgagctttatgaagagtgcgcgcaaagttgtttggaattggcggttggg
tgcgaagatgcaaatgaatttttagaaaaattagaggctaaagagatcgcttctttcaat
gcaaaaggcgcacagattatgactatccatggatctaaaggcatgcaattcccttatgtg
atcgtgtgcgaacgcttgggtaagcctaactcaagccccacaagcaaatttcttgaagaa
tatcatggcacagaacttacgcgcctgtattacagaatgaaaaatcgtgaaagtgtggat
aaagattacgctagggctttagaaaaagaagaaatactcaaaaaccatgaagaaatcaat
gtgtattatgtcgcattcactagagccgagttaggattgattgtcatggctaaagacaaa
gataaagagatgcgtgaaaaattggatcttgcacctttagaggtgggaaaaattacgccg
gttacttcttctaaaaaagagcctttaatcgcaagcactctcatcaagccccatgcctat
ggcgatcaagtccaagagatagaagaagagccggacattgattatgaaaaaaataacgac
caagaagcgattaattttggtattgccttgcacaagggattagaataccaatacgcttat
catattcctaaagaaagcgttttaaaatatttgaactaccattatggtttttatggtttg
gataatcaagcgctagaagagagtttggagctttttaaaaacgatagggaaatccaaacg
ctttttaaaaacaacgccctaaaaggcgaagtggcgtttttattccaaggggttgtgtct
aggatagatgttttattgtgggatagggggcaaaatgtgcatgtgttagattataaaagc
tctcaaaattaccaacaaagccacaaagcgcaagtgtctcattacgccgagtttttgcaa
actcaagccccccatttgaagatacaagcgggcattatttacgctcataaaagactgctt
gaaaaattatgggtttga

DBGET integrated database retrieval system