Haliotis rufescens (red abalone): 124135729
Help
Entry
124135729 CDS
T07893
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
hrf
Haliotis rufescens (red abalone)
Pathway
hrf04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hrf00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
124135729
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hrf00536
]
124135729
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hrf00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
124135729
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Cadherin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124135729
NCBI-ProteinID:
XP_048252076
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2856 aa
AA seq
DB search
MMKLQEGVTMFVVLLVLLVLLQVEGRKSRPQRRSQIQNDGPSGRNTCPGPSRHKRRCCPG
WSQPNSSRRCIVPICISSCGTGGRCMRPNVCLCQNRQIGPSCSPCNQPCVNGGRCIGQDR
CSCPYGFTGKQCQQDYRTGPCFTQISDNMCRGQLTGVVCTKMLCCSTIGKAWGRPCEQCP
TSTHPCRRGYIPNPQGDTCIDVDECQAIPGLCVGGNCVNTLGSYRCECREGQTQNPITKV
CEDINECEIIPRICENGQCTNTEGSYFCTCNRGYEPNPDRSSCIDVKQGYCYTSVINLNC
QSRISEKTSFQDCCCMLGKGWGTGEQYCQPCPLKDTNSYDRLCRKGLPITDQFCAKFTML
CNNGRCVDTPSSFRCECNPGYRESNDNCLDIDECEQQGICRNGRCVNTQGSYTCECSPGF
VLSKTGSYCTDMNECAEEGMCPNGVCFNMDGSYKCRCNAGFKQSPNQEVCYDINECTENG
RLCKNGRCVNTDGSYRCECTPGYRLSPDGAFCLDYDECKTTGMCTNGNCINMDGSFKCVC
NPGYILGPSREICIDVNECSLGPDQCVNGQCINNQGSFRCECPQGFTLGEDRRTCRDTRR
NMCYPEVRNGRCLNPYSVLVTKSMCCCGLAGSLAWGQNCERCPTMMDPGFIKLCTHGKGR
DHDGKNINECKLRPDMCQNGACEDLDGGYRCICNDGYRPDSSGRECSDINECDINLMLCD
GGQCRNVPGSYRCICPEGLRFNHATRMCEDMNECETSPCVGGDCINTAGSFRCECTRPGT
MLDSTKRICIDNRRGACWLKYRNGVCERNINTMMLKSECCGTIGKAWGSPCEQCPPDSGL
RCPKGYAFTNGLNCGDVNECEVLPNICRSGGECVNTQGSFKCTCPAGLELDTTGRRCVDN
RKAQCYLDYNRGFCAREMMGLFNKHMCCCTMGKAWGESCESCPNKGTDEYEELCDGGEGM
YPDPDKPTDINECRMFPGMCLNGKCRNVMGSFICTCNPGFAKDDTGFNCTDINECLISSV
EICGLGECINMPGTFRCECAEGFRGVMMNQMCVDINECEENTGLCLGGSCRNVDGSYECD
CPDGHEVGPDGSTCKDVDECGSASSICSNGHCENYMGGYQCICSEGYKTNDQKTTCADID
ECRVRNGGCMGRCVNTPGSFSCGCESGYLLMIDGKTCIDVDECKETPDICRGGRCINQPG
SYRCTCTGGLSSSRDQKQCLDVDECLLNKNLCMTGVCQNTQGSFSCKCDTGFSVKRETGN
PGCTDDDECLEGNVCDSNAVCINTRGSFKCDCKPGFTGDGFTCRDANECIRANGGCDRDA
ACINMPGSFRCVCDEGFSGDGFQCIDADECSLDVTLCENGQCYNYPGGFRCECDMGFAPT
EDERACVDINECDMFHNLCVNGRCENVFGMFRCVCNQGYQLDNSGGNCTDIDECQNIDNC
QYGTCVNTQGGYLCQCPPDYELNPTGTGCVDKRLGSCYMDVPQFSRGGRMVVCTDSIAVD
ISRATCCCTVGKGWGDVPGLCEICPRNGTSEYNALCPGGPGFRPNTITLVVEDIDECAEV
DDVCKGGRCQNTFGSYVCVCPEGLELDSTRHRCVDVDECRTGQRKCGRGECVNTPGNYTC
ICPAGYEPMDGGRDCLDMRKGNCYMEYLNTTRPPYQVICEKPMSKQLTKRQCCCTIGAAW
NGPCEPCPLRNTREYRQLCLDSPMGGMDKINECRILPSLCENGRCIDTEGSFRCQCYPGY
KYDRTTHVCEDEDECRGTLSPCVGNAVCVNMEGSYECSCPDGYRLKPDRRSCQDINECLE
DPEVCSNGDCVNTAGSFSCICHDGFRLSARRDSCSDIDECQAWPGRCRNGTCQNTIGSFR
CSCNGGFQVTENGDCVDMDECRMLMGICQNGRCQNTLGSFRCQCQTGYTESSDRQNCRDV
DECAEISGTCRRGTCQNTEGSYICQCLEGFQKSRRGDECVDKNECRTIPNICYNGNCRNT
VGGFVCTCPQGFVLSQDGQKCRDVRSGLCFSRFDNGRCLAPKPLNMTKADCCCSMGQAWG
AYSDCEVCPRTGEAGYKFLCPQGQGYVITPGKFMTDMNECLKFPGICVNGICVNTDGSFR
CECRAGYTLDNTGHNCVDANECQDAFMCGNGTCTNTEGSFQCSCRQGFAPGPHETCEDVD
ECNSPMNACAFRCLNIPGSFRCVCPMGYRVADDGVHCEDVDECVTPANNCKYDCKNIIGS
FLCVCPEGFKQVGMDQCSDINECATQRGLCQHGRCVNTRGGYRCMCNRGYEPSANGRACL
DRRQDFCYPSLTAGRCVRSPTVSRTTKAKCCCAMAAAWGAGCERCPPVNTIQYKQLCPQG
PGYTPDGQDIDECADMPDACANGRCLNTMGSYRCVCNKGYKTDASGKRCVDIDECRLDPK
PCEFTCQNTDGSFLCTCPRGYVLNADGKTCRDLDECTTMQHNCRDRCINTPGSFECECPP
GYRKGRTRQCDDIDECADTPNLCGPVGTCRNTQGSFRCECPRGYKTSKDGSKCIDMDECE
DGQCEGECENVPGSFRCECPPGYTQHYSGQCYDENECMDQFLCGVAICINIPGSFDCQCS
GGQTFDMQMSSCVDPNACGGNPCVFGCSPTAQGFSCGCPNGYQPIGQGHCISTITPPGGS
GREERVYPEGVQLPHAAGPTGGKLPPGEGCYQCDHDFGDLPLTKRAKRSLPDFEDEEEDL
DAHIHKFELNPEAEMEKYRSRQKRDIYLQRRKLRHHKHKAVNVTAPSSDIKNPEFRPLVL
YLKRKQTRPKARVIKVLPSTRALLNNVEYTIINGNEEGIFSMHKKKGISSLHFTRRLREK
GEYRLEIECKPQHREDSNDKNVQLKSYSIHVEIHVL
NT seq
8571 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaagttgcaggaaggtgtgacgatgttcgtggtgctgctggtgctgctggtgctg
ctgcaagttgaaggcagaaaatcaaggccgcaaagaagaagccagattcagaacgatggc
ccttccggacggaacacgtgtccaggtcccagtcgacacaagaggaggtgctgcccgggg
tggtcccagcccaacagtagtcggagatgcattgtccctatctgcatatccagctgtgga
actggtggtcgttgtatgcggccaaatgtatgcttgtgtcaaaacagacaaatcggacct
tcctgttcaccctgtaatcagccttgtgtgaatggaggacggtgtattggacaagaccgg
tgttcctgtccatatggcttcactgggaagcaatgccaacaagattatcgaactgggccc
tgtttcacccagatatcagacaacatgtgtcgggggcagttaactggtgttgtttgcaca
aagatgctatgttgttcaacaattggtaaggcttggggaaggccatgcgaacagtgccca
acatcaactcacccctgtcggagagggtacatccccaacccccaaggcgacacttgtata
gatgttgatgaatgccaggctatccccggtctgtgtgtgggcggcaactgtgtcaacacc
ctggggtcttatcgctgtgaatgtcgagagggacagacacagaatccaataaccaaagtt
tgtgaagatataaatgagtgcgagatcattccacgtatttgtgaaaacggacagtgtaca
aacacagaagggagctatttctgtacctgtaaccgtggatacgaacccaatcctgaccgc
tcttcttgtattgacgtgaaacagggctattgctacacaagtgtcatcaacttgaactgt
caaagtcgaatctcagaaaaaacatcattccaggactgttgctgtatgctgggaaaaggc
tggggaacaggggagcaatactgccaaccctgtccactcaaagacacaaattcctacgac
cgactgtgccgaaaaggtctaccgatcactgaccaattctgtgccaagttcaccatgctg
tgtaataatggccgctgtgtggataccccaagttccttccgctgtgaatgcaacccggga
tacagggagtccaatgataactgccttgatattgatgaatgtgagcagcagggaatctgt
cgcaatggccgctgtgtcaacacacagggaagctacacctgtgaatgtagtccagggttt
gttctctcaaagacaggctcatactgcacagacatgaatgaatgtgctgaggaaggcatg
tgccccaatggggtgtgcttcaacatggatgggtcgtacaagtgccgatgtaatgcagga
tttaaacagtcaccaaaccaggaagtctgctatgacatcaacgaatgtacagagaatggt
cgactatgcaagaatggtcgctgtgtgaatactgatggaagctatcgttgtgaatgtacc
cctggatatcggttgtcaccagatggtgctttctgtctagattatgatgaatgtaagaca
acaggaatgtgcaccaatggcaactgtataaacatggatggcagtttcaagtgtgtctgc
aacccaggctatatcttaggtcccagtagggagatctgtatagatgtgaacgagtgctca
cttggtccagaccagtgtgtgaatggtcagtgtatcaacaaccagggcagcttccgctgc
gagtgcccccagggattcaccctgggtgaggacaggaggacatgcagagacacaaggagg
aacatgtgttaccccgaggtgcggaatggccgctgccttaacccctactctgtgctggtc
accaagtccatgtgttgttgtggccttgccggctccctggcctggggacaaaactgtgag
agatgtccaacaatgatggaccctggtttcatcaaactgtgtacccatgggaagggcaga
gatcacgatgggaagaacatcaacgagtgtaagttacgccctgacatgtgccagaacggg
gcatgtgaggacctggatgggggctacaggtgcatctgtaatgatggttacagacctgat
tcctcgggcagggaatgttcagacattaatgagtgtgacatcaacttgatgctgtgtgat
ggggggcagtgtagaaatgtgccaggaagctacaggtgcatctgtcccgagggacttcgc
ttcaaccatgccacaagaatgtgtgaagatatgaatgagtgtgaaacctcaccctgtgtt
ggaggtgattgtatcaacacggcggggagcttcagatgtgaatgcacaaggccagggact
atgctggactccaccaagagaatctgtattgacaaccgacgtggagcgtgttggctgaag
tacaggaatggggtgtgtgagaggaacatcaataccatgatgctaaagtctgaatgctgt
ggtaccattgggaaggcctggggaagtccctgcgagcagtgcccacctgacagtggactg
cgatgtccaaaggggtacgcttttacaaatggattaaactgtggcgatgtaaatgagtgt
gaggtcctccccaacatctgtaggagtggaggcgagtgtgtcaatacccagggttccttc
aagtgtacatgtccagctggccttgagctggacactactggacgcagatgtgtagacaac
aggaaagctcagtgctatttggattacaacagaggtttctgtgcccgtgaaatgatgggc
ctgttcaacaaacacatgtgctgctgcaccatggggaaggcttggggagagagctgtgaa
tcatgccccaacaagggaacagatgagtatgaagagctgtgtgatggaggtgaagggatg
tatcctgaccctgacaaaccaacagatatcaatgagtgccggatgtttcctggtatgtgt
ttaaatggaaagtgtcgcaacgtgatgggaagtttcatctgtacctgcaaccctgggttt
gccaaggatgacacaggattcaactgcactgatatcaatgagtgcctgatatcatcggta
gagatctgtggtttaggcgaatgtatcaatatgccggggacattccgctgtgagtgtgct
gagggcttcaggggtgtcatgatgaaccagatgtgtgttgacatcaatgagtgtgaggag
aatacaggcttgtgtctcggagggtcttgtcgcaacgtcgatggaagctacgagtgtgat
tgcccagatggccatgaagttggacctgatggctcaacttgtaaagatgtggatgagtgt
gggtcagcaagctccatctgctccaatggccactgtgaaaactacatggggggctaccag
tgcatctgctctgaaggctacaagaccaatgaccagaagactacatgtgctgacattgat
gaatgccgtgtgcgtaatggaggatgcatgggtcgatgcgtcaacactcccggaagcttc
tcttgcggctgtgaaagtggctacctcctcatgatagatggcaaaacctgcatagatgtt
gacgagtgtaaagaaacacccgacatctgtcgaggaggtcgatgtatcaaccagcctggc
tcctacagatgtacttgcacaggtggactctcctcgtccagggatcagaagcagtgtctg
gatgtggatgagtgtctgctgaacaagaacctgtgtatgacgggagtctgtcagaacaca
caaggctccttctcctgcaagtgtgacactggtttctccgtcaagcgggagactggcaac
ccaggctgtacagatgatgacgagtgtctagagggtaacgtgtgtgacagcaatgctgtc
tgtatcaacaccagaggctccttcaagtgtgactgcaagccaggcttcacgggggacgga
ttcacatgtagagatgctaacgagtgtatccgtgccaacggtggatgtgaccgtgatgct
gcctgcatcaatatgccgggcagtttccgctgtgtctgtgacgaaggcttttctggtgat
ggcttccagtgcatcgatgctgatgagtgcagcttggatgtgactctgtgtgagaacggg
cagtgctacaactatccaggaggattccggtgtgaatgtgacatgggatttgcccccact
gaggatgaacgggcctgtgtcgatatcaatgaatgtgacatgttccacaacttatgtgtc
aatggccgctgtgaaaatgtgtttggtatgttccgatgtgtctgtaaccaaggttatcag
cttgataactcaggaggaaactgtacagacattgatgagtgtcagaacatagacaactgt
cagtacggcacctgtgtcaacacccagggagggtacctgtgtcagtgccccccagattac
gaactcaaccccacgggcacaggatgtgtggacaagagactgggctcctgctatatggat
gtcccccagttttcccgtggaggccgtatggtggtgtgcacagattcgatcgctgtggat
atatcccgagccacctgctgctgtactgtggggaaaggctggggggatgtccctgggctg
tgtgagatttgcccaaggaatggaacaagtgaatacaacgctctgtgtcccggggggcca
gggttcaggcctaacaccatcacactggtggtagaagatattgatgagtgtgctgaagtg
gacgatgtctgcaagggaggccgatgtcagaacacatttggcagctatgtgtgtgtgtgt
ccggagggcttagaactggacagcaccaggcaccgatgtgtggatgttgatgagtgtcgg
actgggcagaggaagtgtggcaggggtgagtgtgtcaacaccccgggcaactacacatgc
atctgtcctgcaggatacgaacccatggatgggggccgagactgcctcgacatgagaaag
ggcaactgctacatggagtacttgaacacaacacgcccgccgtatcaggtaatctgtgag
aagcccatgtccaaacagctgaccaagagacagtgctgctgcaccattggtgctgcctgg
aacggtccatgcgagccctgcccactgaggaacacacgagagtacagacaactctgtctg
gatagccccatgggaggaatggacaagatcaacgagtgtaggatcctccccagtctgtgt
gagaacggccgctgtattgacacggagggcagtttcagatgtcagtgctatcctggctac
aagtatgaccgtacaactcatgtttgtgaagatgaggatgagtgtcgtggaactctgtct
ccatgtgtgggcaatgcagtgtgtgtgaacatggagggcagttatgagtgttcctgcccc
gatggctacagactcaagccagaccggagaagctgccaggacataaatgaatgtttggag
gatccggaggtgtgtagcaatggcgactgtgtcaacactgccggcagcttcagctgcatc
tgccacgacggcttccgactgtctgcacgcagagactcctgctctgatattgatgagtgc
caggcttggccgggccgctgtaggaacggaacttgtcaaaacacaatcggcagcttcagg
tgcagctgcaatggtggattccaggtcacagagaatggagattgcgttgatatggatgag
tgtcgcatgctgatggggatctgtcaaaatggccgctgccagaacacactgggcagtttc
cgatgtcaatgtcaaacaggctatacagagtcatccgacagacagaactgcagagatgtt
gatgagtgtgcagagatcagtgggacctgcaggcggggcacctgtcagaacactgagggc
tcctacatctgtcagtgtctggaaggcttccagaagtcccgcaggggggatgaatgtgtt
gacaagaatgagtgccgcactatccccaacatctgttacaatgggaattgtcgcaacacc
gtcggtggcttcgtctgtacctgtcctcaaggttttgtcctcagccaggatggacagaag
tgcagagatgtgagaagtggactctgtttctctcggtttgacaatggtcgttgtctggct
ccaaagccactcaatatgacgaaggctgactgctgctgttccatgggccaggcgtgggga
gcgtactctgactgtgaggtctgtcctcgcacaggggaagctgggtacaaattcctatgt
cctcaaggtcaaggttatgttattactccggggaaattcatgacagatatgaacgagtgt
ttgaagttcccaggtatatgtgttaatggtatctgtgttaacacggatggttcattccgg
tgcgagtgtcgtgctggctacactctggacaacacaggacacaattgtgtcgatgctaac
gagtgtcaggatgcgttcatgtgtggtaatggtacctgcaccaacaccgagggcagcttc
cagtgttcgtgtagacagggctttgctcctgggccccatgagacatgtgaagatgtggat
gagtgtaacagtccaatgaatgcctgtgctttccgctgtttgaacatccctgggtctttc
cgctgtgtgtgtcctatgggatacagggtggctgacgatggggtccattgtgaagatgtt
gatgagtgtgtgaccccagccaacaactgtaaatacgactgtaagaacatcatcggctca
ttcctgtgtgtctgccctgagggattcaaacaggtcggcatggatcagtgctcagatatc
aatgagtgtgccacccagcgtggtttgtgtcagcatggtcgctgtgtcaacacaagggga
ggatacagatgcatgtgtaaccgtggatacgaacctagcgccaatggcagagcctgtctt
gatcgtcgtcaagacttctgctacccatctttgaccgctggccgctgtgtgcgttcacca
actgtatctcggacaaccaaggctaagtgctgctgtgccatggcagctgcctggggtgca
ggctgtgagaggtgcccccctgtcaacacaatccagtacaagcagctgtgtccacaaggt
cctggctacactccagatggacaagatattgatgagtgtgcagatatgcctgacgcttgt
gccaatggccgttgtctgaacacgatgggctcctacagatgcgtctgtaacaagggttac
aaaactgatgcttccggcaagagatgtgtggatattgatgagtgtcggcttgaccccaag
ccgtgtgagttcacatgtcagaacacagatgggagcttcttgtgtacttgtcctcgtgga
tatgttcttaacgctgatggcaagacgtgcagagatcttgatgagtgcaccacgatgcag
cacaactgccgagatcggtgtatcaacactcctggcagcttcgagtgtgagtgtcctccg
ggctacaggaaagggaggacgaggcaatgtgatgacattgacgagtgtgctgacacaccc
aacttgtgtgggcctgttggaacatgtcgcaacactcaaggcagtttccgctgtgagtgt
ccacgtggctacaagaccagcaaggatggcagcaagtgcatcgacatggatgagtgcgag
gatggtcagtgtgagggcgagtgcgagaacgttccgggcagcttcaggtgcgagtgtcca
ccaggatacacacaacactacagtggacagtgctatgatgagaatgagtgtatggaccag
ttcctgtgtggtgtcgccatctgcatcaatattcctggcagtttcgactgtcagtgttcc
ggtggacagacatttgacatgcagatgtcgtcttgtgtcgaccccaatgcctgtggcggc
aacccctgtgtgtttggctgttctcccactgcacagggcttctcttgtggctgtccaaat
ggataccaaccaataggacaaggtcactgcatctcaacaatcaccccgccgggcggcagt
ggcagagaggagagggtgtaccctgagggggtgcagctgccccatgcggctggccccacc
ggtgggaagctgcctccaggggaagggtgttaccagtgtgaccatgactttggggatctt
cctctgaccaagagagccaagagaagtttgcccgactttgaagatgaggaggaggacttg
gatgctcacatacacaagtttgagctgaatcctgaggctgaaatggagaaatatagaagc
aggcaaaagagggatatttatttacaacgtagaaaactcagacatcacaagcacaaagct
gtcaatgtgacagccccatccagtgacatcaagaacccagagttcagacctcttgtcctt
tatctgaagcggaaacaaactcgaccaaaggcacgtgtcatcaaagtcctgccatccacg
cgtgctctcctgaacaatgtggaatataccattattaacggaaatgaagagggaatattc
tccatgcataaaaagaaaggaattagctctttacattttactcgtaggttacgcgaaaaa
ggagaatatagactagaaattgaatgtaagccccagcacagagaggatagtaatgacaag
aatgtacagttgaagtcctattcaatacatgttgagattcatgtgctgtga
DBGET
integrated database retrieval system