KEGG   Haliotis rufescens (red abalone): 124140730
Entry
124140730         CDS       T07893                                 
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(III) chain-like
Organism
hrf  Haliotis rufescens (red abalone)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen
Other DBs
NCBI-GeneID: 124140730
NCBI-ProteinID: XP_048240790
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1361 aa
MWRPTGSRTLPEFTIFTGIARVAIATCEDEFQCMACGCSVHVVTVTLECQVATVTLECQV
VTVTLECQVVTVTLESQVVTVTLESQVVTVTLESQVVTVTLECQVVTVTLECQVVTVTLE
CQVVTVALECQVMTVTRERQVMTVTLECQVVTVTLESQVVTVTLERQVVTVTLECQVVTV
TLESQVVTVTLECQVVTVTLESQVVTVTLECQVVTVTLECQVVTVTLECQVATVTLECHV
VTVALECQVVTVTRERQVVTVTRECQVVTVTLECQVVTVTLESQVVTVTLECQVATVTRE
CQVVTVTLECGDSNKGVSGDDSNPGVSGGDSNTGVSGGDSNPGVSGGNINPGVSGDDSNP
GVSGDDSNPGVSGGDINPGVSGDDSNPGVSGDDSSHGVTGGDSNPGVSGDDNSPGVSGGD
SNPGGSGDDSNPGVSGGDINPGVSGDDSSPGVSGDDSNPGVSGDDSSPGVTGGDSNPGVS
GDDSSPGVTGGDSNKGVTGSDSNPEVSGGDSNKGVSGGDSNPGVTGGDSNTGVTGSDSNP
GVSGGDSNPGVSGGDSNPGAPGGDSNPGVSGDDSSPGASGGDSNPGVSGDDSDPGVSGGD
SNPGVSGGDSSPGVSGGDSNKGVSGGDSNKGVSGGDSSPGVSGGDSNPGVSGGDSNPGVS
GGDSNPGVSGGDSSPGVTGGDSNKGVSGGDSNPGVPGGDSSPGVSGGDSSPGVSGDDSNP
GASGGDSNPGVSGGDSNPGVSGGDSNPGVSGGDINPGVSGGDSNPGVSGGNINPGVSGDD
SNPGVSGGDINPGVSGDDSSPGVSGGDSNPGESGDDSNTGVSGSDSNPGVSGGDSNTGVL
GDDSNPGASGGDSNPGVSGGDSNPGVSGGNINPGVSGDDSNPGVSGDDSNPGVSGGDINP
GVSGDDSNPGVSGDDSSHGVTGGDSNPGVSGDDSSPGVSGGDSNPGGSGDDSNPGVSGGD
INPGVSGDDSSPGVSGDDSNPGVSGDDSSPGVTGGDSNPGVSGDDSSPGVTGGDSNKGVT
GSDSNPEVSGGDSNKGVSGGDSNPGVTGGDSNTGVTGSDSNPGVSGGDSNPGVSGGDSNP
GAPGGDSNPGVSGDDSSPGASGGDSNPGVSGDDSDPGVSGGDSNPGVSGGDSSPGVSGGD
SNKGVSGGDSNKGVSGGDSSPGVSGGDSNPGVSGGDSNPGVSGGDSNPGVSGGDSSPGVT
GGDSNKGVSGGDSNPGVPGGDSSPGVSGGDSSPGVSGDDRTLERQVVTVTLECQVVTVTL
ECQVVTVTLECQVVTLTLECQVVTVTLECQVVTLTLECQVMTVTRECQVVTLTLECQVMT
VALECQVVTVTLESQVMTVTRECQVVTVTLECQVVTVTREC
NT seq 4086 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtggcggcccaccggtagcaggactcttccagagtttactatttttaccggaattgcg
cgagttgccatagcaacctgtgaagatgagtttcaatgtatggcctgtggttgcagtgtg
catgtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggcgacagtaaccctggagtgtcaggtg
gtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagagtcaggtggtgaca
gtaaccctggagagtcaggtggtgacagtaaccctggagagtcaggtggtgacagtaacc
ctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggag
tgtcaggtggtgacagtagccctggagtgtcaggtgatgacagtaacccgggagcgtcag
gtgatgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagagtcaggtggtg
acagtaaccctggagcgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagta
accctggagagtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctg
gagagtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgt
caggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggcgacagtaaccctggagtgtcatgtg
gtgacagtagccctggagtgtcaggtggtgacagtaacacgggagcgtcaggtggtgaca
gtaacccgggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaacc
ctggagagtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggcgacagtaacccgggag
tgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtggtgacagtaacaagggagtgtcaggtgat
gacagtaacccgggagtgtcaggtggtgacagtaacacgggagtgtcaggtggtgacagt
aaccctggagtgtcaggtggtaacattaacccgggagtgtcaggtgatgacagtaaccct
ggagtgtcaggtgatgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacattaaccctggagtg
tcaggtgatgacagtaaccctggagtgtcaggtgatgacagtagccatggagtgacaggt
ggtgacagtaaccctggagtgtcaggtgatgacaatagccctggagtgtcaggtggtgac
agtaaccctggagggtcaggtgatgacagtaacccgggagtgtcaggtggtgacattaac
cctggagtgtcaggtgatgacagtagccctggagtgtcaggtgatgacagtaaccctgga
gtgtcgggtgatgacagtagccctggagtgacaggtggtgacagtaaccctggagtgtca
ggtgatgacagtagccctggagtgacaggtggtgacagtaacaagggagtgacaggtagt
gacagtaaccctgaagtgtcaggtggtgacagtaacaagggagtgtcaggtggtgacagt
aaccctggagtgacaggtggtgacagtaacacgggagtgacaggtagtgacagtaaccct
ggagtgtcaggtggcgacagtaacccgggagtgtcaggtggtgacagtaacccgggagcg
ccaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtgatgacagtagccctggagcgtcaggt
ggagacagtaaccctggagtgtcaggtgatgacagtgaccctggagtgtcaggtggagac
agtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtagccctggagtgtcaggtggtgacagtaac
aagggagtgtcaggtggtgacagtaacaagggagtgtcaggtggtgacagtagccctgga
gtgtcaggtggagacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtca
ggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtagccctggagtgacaggtggt
gacagtaacaagggagtgtcaggtggtgacagtaacccgggagtgccaggtggtgacagt
agccctggagtgtcaggtggagacagtagccctggagtgtcaggtgatgacagtaaccct
ggagcgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagtg
tcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacattaaccctggagtgtcaggt
ggggacagtaaccctggagtgtcaggtggtaacattaaccctggagtgtcaggtgatgac
agtaacccgggagtgtcaggtggtgacattaaccctggagtgtcaggtgatgacagtagc
cctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagagtcaggtgatgacagtaacacggga
gtgtcaggtagtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaacacgggagtgtta
ggtgatgacagtaaccctggagcgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggt
gacagtaaccctggagtgtcaggtggtaacattaacccgggagtgtcaggtgatgacagt
aaccctggagtgtcaggtgatgacagtaacccgggagtgtcaggtggtgacattaaccct
ggagtgtcaggtgatgacagtaaccctggagtgtcaggtgatgacagtagccatggagtg
acaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtgatgacagtagccctggagtgtcaggt
ggtgacagtaaccctggagggtcaggtgatgacagtaacccgggagtgtcaggtggtgac
attaaccctggagtgtcaggtgatgacagtagccctggagtgtcaggtgatgacagtaac
cctggagtgtcgggtgatgacagtagccctggagtgacaggtggtgacagtaaccctgga
gtgtcaggtgatgacagtagccctggagtgacaggtggtgacagtaacaagggagtgaca
ggtagtgacagtaaccctgaagtgtcaggtggtgacagtaacaagggtgtgtcaggtggt
gacagtaaccctggagtgacaggtggtgacagtaacacgggagtgacaggtagtgacagt
aaccctggagtgtcaggtggcgacagtaacccgggagtgtcaggtggtgacagtaacccg
ggagcgccaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtgatgacagtagccctggagcg
tcaggtggagacagtaaccctggagtgtcaggtgatgacagtgaccctggagtgtcaggt
ggagacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtagccctggagtgtcaggtggtgac
agtaacaagggagtgtcaggtggtgacagtaacaagggagtgtcaggtggtgacagtagc
cctggagtgtcaggtggagacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctgga
gtgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtagccctggagtgaca
ggtggtgacagtaacaagggagtgtcaggtggtgacagtaacccgggagtgccaggtggt
gacagtagccctggagtgtcaggtggagacagtagccctggagtgtcaggtgatgacaga
accctggagcgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctg
gagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacattaaccctggagtgt
caggtggtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtaacattaaccctggagtgtcaggtg
atgacagtaacccgggagtgtcaggtggtgacattaaccctggagtgtcaggtgatgaca
gtagccctggagtgtcaggtggtgacagtaaccctggagagtcaggtgatgacagtaaca
cgggagtgtcaggtagtgacagtaaccctggagtgtcaggtggtgacagtaacacgggag
tgttag

DBGET integrated database retrieval system