Haliotis rubra (blacklip abalone): 124255850
Help
Entry
124255850 CDS
T07967
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
hrj
Haliotis rubra (blacklip abalone)
Pathway
hrj04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hrj00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
124255850
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hrj00536
]
124255850
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hrj00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
124255850
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Cadherin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124255850
NCBI-ProteinID:
XP_046545751
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2891 aa
AA seq
DB search
MMKLQEDVTMFVLLLLLVVVQAEGRKPSSQRRSQIQNDGPSGRNTCPGPSRFKRRCCPGW
SQPNNSRRCIVPICISGCGSGGRCMRPNVCLCQNRQIGPSCSPCNQPCVNGGRCIGQDRC
SCPYGFTGKQCQQDYRTGPCFTQISNNMCRGQLTGVVCTKMLCCSTIGKAWGRPCEQCPT
STHPCRRGYIPNPQGDTCIDVDECQAIPGLCVGGNCVNTLGSYRCECREGQTQNPITKVC
EDINECEIIPRICENGQCTNTEGSYFCTCNRGYEPNADRSSCIDVKQGYCYTSVINLNCQ
SRISEKTSFQDCCCMLGKGWGTGEQYCQPCPLKDTNSYDRLCRRGLPITDQFCAKFTMLC
NNGRCIDTPSSFRCECNPGYRESNDNCIDIDECEQQGICRNGRCVNTQGSYTCECSPGFV
LSKTGSYCTDMNECAEEGMCPNGVCFNMDGSYKCRCNAGFKQSPNQQVCYDINECTENGR
LCRNGRCVNTDGSYRCECSPGYRLSPDGAFCLDYDECKTTGMCTNGNCINMDGSFKCVCN
PGYILGPSREVCIGECVQPWLYLRSKQGGLYSVCNPGYILGPSREVCIDVNECSLGPDQC
VNGQCINNQGSFRCECPKGFTLGEDRRTCRDTRRNMCYPEVRNGRCLNPYSVLVTKSMCC
CGLAGSLAWGQNCERCPTMMDPKFIELCTHGKGRDHDGKNINECKLRPDMCQNGACEDLD
GGYRCICNDGYRPDASGRECSDINECDINLMLCDGGQCRNVPGSYRCICPEGLRFNHGTR
MCEDINECESSPCVGGDCINTAGSFRCECSRPGTMLDSTKRICIDNRRGACWQKYRNGVC
ESSINTMMLKSECCGTIGKAWGSPCEQCPSEGRLRCPKGYAFTNGLNCGDVNECEVIPNI
CKSGGECVNTQGSFKCTCPAGLDLDATGRRCVDNRKAQCYLDYNRGYCAREMMGLFNKHM
CCCTMGRAWGESCEACPRKGTNEYEELCNGGTGMHPDPDKPTDINECRMFPGMCLNGKCR
NVMGSFVCTCNPGFAKDDTGFNCTDINECLISSVEICGLGECINMPGTFRCECAEGFRGV
MMNQMCVDINECEENAGLCLGGSCRNVPGAYECDCPDGHEVGPDGSTCKDVDECGSASSI
CSNGHCENYMGGYQCICSEGYKTNNLKTTCIDIDECRERNGGCMGRCVNTPGSFSCGCES
GYLLMIDAKTCIDVDECKETPDICQGGRCINQPGTYRCTCTGGLSPSRDQKQCLDVDECQ
LNKNLCMTGVCQNTQGSFSCKCDTGFSVKQETGNPGCTDDDECLEGNVCDSNAVCINTRG
SFKCDCKPGFTGDGFTCRDANECIRANGGCDRDAACINMPGSFRCVCDEGFSGDGFQCID
ADECSLDVTLCENGQCYNYPGGFRCECDMGFAPTEDEHACVDINECDMFHNLCVNGRCEN
VFGMFRCVCNQGYQLDNSGGNCTDIDECQNIDNCQYGTCVNTQGGYLCQCPPDYELNPTG
TGCVDKRLGSCYMGVPQFSRGGRMVVCTDSIAVDISRATCCCTVGKGWGDVPGLCEICPR
NGTSEYNALCPGGPGFRPNTITLVVEDIDECAEVDDVCDGGRCQNTFGSYVCVCPEGLEL
DSTKHRCVDIDECRTGPRKCGRGECVNTPGNYTCICPVGYEPMDGGRDCLDMRKGNCYME
YLNTTRPPYHLICEKPMSKQLTKRQCCCTIGVAWNGPCEACPLRNTREYRQLCVESPMGG
MDKINECRILPSLCENGRCIDTDTGFRCQCYPGYKYDRTTHVCEDEDECRGTLSPCVGNA
VCVNTEGSYECSCGDGYRLKPDRRSCQDINECLEDPEVCSNGDCVNTAGSFSCICHDGFR
LSSRRDSCSDIDECQAWPGRCRNGTCHNTIGSFRCTCNGGFQVTETGDCVDMDECRMLMG
ICQNGRCQNTLGSFRCQCQTGYTESSDRQNCRDIDECAEISGTCRRGTCQNTEGSYLCQC
LEGFQKSRRGDECVDVNECRTISNICYNGDCRNTVGGFVCTCPPGYVLSQDGQKCRDVRS
GLCFSRFDNGRCLAPKPLNMTKADCCCSMGQAWGAYSDCEVCPRAGEAGYEFLCPQGQGY
VITPGKFMTDMNECLKFPGVCVNGICVNTDGSFRCECRAGYTLDSTGLVCIDANECQDAF
MCGNGTCTNTEGSFQCSCRQGFAAGPHETCEDVDECSSPLNSCAFRCLNIPGSFRCVCPM
GYRVADDGVHCEDVDECLTPANNCKYDCKNIIGSFLCVCPEGFKQVGMDQCADINECATQ
RGLCQHGRCLNTRGGYRCRCNRGYEPSANGRACLDRRQDFCYPSLTAGRCVRTPTVSRTT
KAKCCCAMAAAWGSGCERCPSVNTIQYKQLCPQGPGYTPDGQDIDECADMPDACANGRCL
NTMGSYRCVCNKGYKTDASGKRCIDIDDCRLDPKPCEFTCQNTDGSFLCTCPRGYVLNPD
GKTCRDLDECTMMQHNCRDRCVNTPGSFECECPPGYRKGRTRQCDDIDECADSPNLCRPV
GTCRNTQGSFRCECPRGYRTSKDGSRCIDMDECEDGQCEGECENIPGSFRCECPPGYTQH
YSGQCYDENECMDQFLCGVAICINIPGSFDCQCNGGQTFDMQMSTCVDPNACGGNPCVFG
CSPTAQGFSCGCPNGYQPIGQGHCISTITPPGSSGREERVYPEGVQLPHEAGPSGGKLPP
GEGCYQCDHEFGDLPLTKRAKRSLPDFDEEEEEDLEAHIHKFEMNPKAEMEKYRSRQKRD
IYLQRKIHRHHKHKAANVTAPSGDIKTPEFRPIVLYLKRKQTRPKARVIKVLPSMRALQN
NVVYTIINGNEEGIFSMHKKKGISSLHFTRRLREKGEYRLEIECKPKHREDSKDKDVQLE
PYSIHVEIHVL
NT seq
8676 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaagttgcaggaagatgtgacgatgttcgttttgctgctattgctggtggtggtg
caagctgaaggcagaaaaccatcgtcgcaacgaagaagccagattcagaacgatggccct
tcaggacggaacacgtgtccaggccccagtagattcaagagaaggtgctgcccagggtgg
tctcagcccaacaacagtcggagatgcattgtccctatctgcatatctggctgtggatcc
ggtggtcgatgtatgcggccaaatgtctgcttgtgtcaaaacagacaaatcggaccttcc
tgttcaccctgtaatcagccctgtgtgaatggtggacggtgcattgggcaggaccgatgt
tcatgtccatatggttttacaggaaagcaatgccagcaagattatcgaacagggccctgt
ttcacccagatatccaacaatatgtgtcggggacagctaactggtgttgtgtgcacaaag
atgctatgttgttcaacaattggtaaggcttggggaaggccatgtgagcagtgcccaaca
tcaacccacccttgtcgaagagggtacatccccaacccccagggagacacttgtatagat
gttgatgaatgccaggctatccccggtctgtgtgtgggaggcaactgtgtcaacaccctg
gggtcttatcgctgtgaatgtcgagagggacagacacagaaccccataaccaaagtttgt
gaagatataaatgagtgcgagatcattccacggatatgtgagaacggacagtgtacaaac
acagaagggagctacttctgtacctgtaaccgtggatacgaaccaaatgctgaccgctct
tcttgtattgacgtgaaacagggctattgctacacaagtgtcatcaacttgaactgtcag
agtcgcatctcggagaagacatcattccaggactgttgctgtatgctgggcaaaggctgg
ggaacaggggaacaatactgccagccttgtccactcaaggacacaaattcctatgaccga
ctgtgccgaagaggtctcccgatcactgaccaattctgtgccaagttcaccatgctgtgt
aataatggccgctgtattgataccccaagctccttccgatgtgaatgcaacccaggatac
agggagtctaatgacaactgcatagatattgatgaatgtgagcagcagggaatctgtcgc
aatggccgctgtgtcaacacccagggaagctacacctgtgaatgtagtccaggctttgta
ctctcaaagacaggctcatattgcacagacatgaatgaatgtgctgaggagggtatgtgc
cccaatggagtctgcttcaacatggatggatcatacaagtgccgctgtaatgcagggttt
aaacagtcaccaaaccaacaagtctgctatgacattaatgaatgtacggaaaatggtcga
ctgtgcaggaatggtcgctgtgttaatactgatggcagctatcgctgtgaatgttcacct
ggatatcggctgtcaccagatggtgctttctgtctagattatgatgaatgtaagacaaca
ggaatgtgcaccaatggcaactgtataaacatggatggcagtttcaagtgtgtgtgcaac
cctggctatatcttaggtcccagcagggaggtctgtataggtgagtgtgtgcaaccctgg
ctatatctcaggtccaagcagggaggtctgtacagtgtgtgcaaccctggctatatctta
ggtcccagtagggaggtctgtatagatgtgaacgagtgctcacttggccctgaccagtgt
gtgaatggtcagtgtatcaacaatcagggcagcttccgctgtgagtgtcccaagggattc
accctgggagaagacaggaggacctgcagagatacaaggaggaacatgtgctaccccgag
gtgcggaatggtcgctgcttgaacccctactctgtgctggtgaccaagtccatgtgttgc
tgtggcctggccggctccctggcgtggggacaaaactgtgagagatgccccacaatgatg
gacccaaagttcatcgaactgtgtacccatgggaagggcagggatcacgacggcaagaac
atcaatgagtgtaagttacggccagacatgtgccagaacggggcatgtgaagacctggat
gggggctacaggtgtatctgtaatgatggctacagacctgatgcctcaggcagggaatgt
tcagacataaacgagtgtgacatcaacttgatgctgtgtgatgggggacagtgcaggaat
gtgccaggaagctaccggtgcatctgtccagagggactccgcttcaatcatggcacaaga
atgtgtgaagatatcaatgagtgtgaaagctccccatgtgttgggggtgactgtatcaac
actgcagggagcttcaggtgtgaatgcagcaggccggggacaatgctggattccaccaag
aggatctgtattgacaaccggcgtggagcgtgctggcagaagtacaggaatggtgtatgt
gagagcagcatcaacaccatgatgctgaagtcggaatgctgtggtaccatcgggaaggcc
tggggaagtccctgcgagcagtgcccatctgaaggtagactgcgatgtccaaaggggtac
gcctttacaaatgggttgaactgtggtgatgtaaatgagtgtgaggtgatcccaaacatc
tgtaagagtggcggcgagtgtgtcaatacccagggttccttcaagtgtacgtgtccagct
ggccttgacctggacgctactggacgcagatgtgtagacaacaggaaggctcagtgttac
ttggattacaacagaggttactgtgcccgtgaaatgatgggtctgtttaacaaacacatg
tgctgctgcaccatgggaagagcttggggagagagctgtgaagcatgcccacggaaggga
acaaatgagtatgaagagctgtgtaatggaggaacggggatgcatcctgatcccgacaaa
ccaacagatatcaatgagtgcaggatgtttcctggtatgtgtctgaatggaaagtgtcgc
aacgtgatgggaagtttcgtctgtacctgcaaccctggctttgccaaggatgacacagga
ttcaactgcactgatatcaacgagtgcctgatatcatccgtggagatctgtggtttaggg
gagtgtatcaacatgccggggacattccggtgtgagtgtgctgagggcttcaggggtgtc
atgatgaaccagatgtgtgttgacataaatgagtgtgaggagaatgcaggcttgtgtctg
ggagggtcctgtcgtaacgtccccggagcctatgaatgtgattgcccagatggccatgaa
gttggacctgatggctcaacttgtaaagatgtggacgagtgtggatcagcaagctccatc
tgctccaacggccactgtgagaactacatggggggctaccagtgcatctgttctgaaggc
tacaagaccaataacttgaagactacatgtattgacattgatgaatgccgtgaacgtaat
ggaggatgcatgggtcgttgcgtcaacactcctggcagtttctcttgtggctgtgaaagt
ggctacctcctcatgatagatgccaaaacctgcatagatgttgacgagtgtaaagaaaca
cctgacatatgtcaaggaggtcgctgcatcaaccagcctggcacttacaggtgcacatgc
actggtggactctccccatctcgggaccagaagcagtgtctggatgtggatgagtgccag
ctgaacaagaacctgtgtatgactggcgtctgtcagaacacacaaggctccttctcctgc
aagtgtgacactggcttctccgtcaaacaggagactggcaacccaggatgtacagatgac
gacgagtgtctggagggtaacgtgtgtgacagtaatgctgtctgtatcaacaccagaggc
tccttcaagtgtgactgcaagcccggcttcacaggagatggattcacatgtagagatgcc
aatgagtgtatccgggcaaatggtggatgtgaccgtgatgcagcctgcatcaacatgcca
ggcagtttccgctgtgtctgtgatgaaggcttctctggtgatggcttccagtgcatcgac
gctgatgagtgcagcttggatgtgacgctgtgtgagaacggtcagtgctacaactaccca
ggaggattccggtgtgaatgtgacatgggatttgcccccactgaggatgaacacgcctgt
gtcgatatcaatgaatgtgacatgttccacaacttatgtgtcaatggccgctgtgaaaat
gtgtttggaatgttccgatgtgtctgtaaccaaggttaccagcttgacaactcaggagga
aactgtaccgacatcgacgagtgtcagaacatagacaactgtcagtatggcacctgtgtc
aacacgcagggaggctacctgtgtcagtgtcctccagattatgaactcaaccccactggc
acaggatgtgtagacaagagactgggctcttgctatatgggtgttccccagttttcccgt
ggaggccgcatggtggtgtgtactgactcgatcgcggtggatatatcacgggcaacctgc
tgctgtactgtggggaagggctggggggatgtccccgggctgtgtgagatatgccccagg
aatggaacaagtgaatacaatgctctgtgtcccggaggcccagggtttaggcccaacacc
atcacactggtggtggaagatattgacgagtgcgctgaagtggacgatgtctgtgatgga
ggccgatgtcagaacacatttggcagctatgtgtgcgtgtgtcccgagggtttagagctg
gacagcaccaagcaccgatgtgtggatattgatgagtgtcggacggggcccaggaagtgt
ggcaggggtgagtgtgtcaacaccccgggcaactacacatgcatctgtcccgtaggctac
gaacccatggatggtggccgtgactgtcttgatatgaggaagggcaactgctacatggag
tacctcaacacaacacggccaccatatcatctaatctgtgagaagcccatgtccaaacag
ctgaccaagagacagtgctgctgtaccattggtgttgcctggaatggtccatgcgaggcc
tgcccactgaggaacacccgggaatacagacaactctgtgtggaaagccctatgggagga
atggacaagatcaacgagtgccggatactccccagtctgtgtgagaatggccgttgtatt
gacacagacactggtttccgatgtcagtgttaccctggttacaagtacgaccgtacaact
catgtttgtgaagatgaggatgagtgtcgcggtactctgtcaccctgtgtgggcaatgct
gtgtgcgtgaacacggagggtagttacgagtgttcctgcggtgatgggtacagactcaag
ccagaccggagaagctgccaggacataaatgaatgtctggaggatccggaggtttgtagc
aatggtgactgtgtcaacactgccggcagcttcagctgtatctgccatgatggcttccga
ctgtcttcacgaagagattcctgttctgatattgatgaatgccaggcatggccggggcgg
tgtaggaacggaacttgtcacaacacaatcggcagcttcaggtgtacctgcaatggtgga
ttccaggttacagagacgggagactgcgttgatatggatgagtgtcgtatgctgatgggg
atctgtcagaatggccgctgccagaacacacttggcagtttccggtgccagtgtcagaca
ggctacactgagtcttctgacagacagaactgtagagatattgacgagtgtgcagagatc
agtgggacctgcaggcggggcacctgccagaacactgaggggtcctacttatgtcagtgt
ttagaaggcttccagaagtctcgcaggggggatgaatgtgttgatgtgaatgaatgccgc
actatctccaacatctgctacaacggggattgccgcaacactgttggtggatttgtctgt
acctgtcctccaggttatgtcctcagccaggacgggcagaagtgcagagatgtgagaagt
ggactctgcttctctcggtttgacaatggccgctgtctggccccgaagccactcaatatg
acaaaggctgactgttgttgttccatgggccaggcgtggggagcgtactctgactgtgag
gtgtgtcctcgtgctggagaagctggctatgaattcctatgtcctcaaggtcaaggttat
gttattactccagggaagttcatgacagatatgaatgagtgtttgaagttccccggtgta
tgtgtgaatggtatctgtgtcaacacggatggttcattccggtgcgagtgtcgtgctggc
tacaccctggacagcacaggactggtttgtatcgatgcgaacgagtgtcaggatgcattc
atgtgtggtaatggtacctgcaccaatacagaaggcagcttccagtgttcctgcaggcag
ggctttgctgcagggccccatgagacatgtgaagatgtggatgaatgtagcagtccattg
aattcctgtgctttccgctgtttgaacattcctgggtctttccgctgcgtgtgtcccatg
ggatacagggtggctgacgacggcgtccattgtgaagatgtggatgagtgtttgacccca
gccaacaactgtaaatatgactgtaagaacatcattggctcctttctctgtgtctgcccg
gagggattcaaacaggtcggcatggatcagtgtgcagatatcaatgagtgtgctacccag
cgtggtttatgtcagcacggtcgctgtctcaacacaaggggaggatacagatgcaggtgt
aaccgtggttacgaacctagcgccaatggcagggcctgtcttgatcgacgtcaagacttc
tgctacccatccttgactgctggccgctgtgtgcgtacaccaactgtatctcggacaacc
aaggccaagtgctgctgtgcaatggcagctgcatgggggtcaggctgtgagaggtgcccc
tctgtcaacacaatccagtacaagcagctgtgtccacaaggccctggctacactccagat
ggacaagatattgatgagtgtgcagatatgcctgatgcatgtgccaatggccgttgtctg
aacacgatgggctcctacagatgtgtctgtaacaagggctacaagactgatgcttctggc
aagagatgtattgatattgatgactgtcggcttgatcccaagccgtgtgagttcacgtgt
cagaacacagatgggagcttcctgtgtacttgtcctcgtggatatgttctcaaccctgac
ggcaagacatgcagagaccttgatgagtgcacaatgatgcagcacaactgccgggaccgg
tgtgtcaacactcctggcagcttcgagtgcgagtgtcctcctggctacaggaaaggcagg
accaggcaatgtgatgacattgatgagtgtgctgactcccccaacctgtgtagacctgtt
gggacctgtcgcaacactcagggcagcttccgctgtgagtgtccccggggctataggaca
agcaaggatggcagcaggtgcattgacatggacgagtgcgaggatggacagtgtgagggc
gagtgtgaaaacataccgggcagcttcagatgtgaatgtccaccaggctatacacaacac
tacagtggacagtgctacgatgagaatgaatgtatggaccagttcctgtgcggcgtcgcc
atctgcatcaacatacccggcagttttgactgtcagtgcaacggcggacagacatttgac
atgcagatgtccacttgtgtcgaccccaatgcctgtggcggcaacccatgtgtgtttggc
tgttctcccactgcacagggcttctcttgtgggtgtcctaatggataccaacccatagga
caaggtcactgcatctcgacgatcacccctccaggcagtagtggcagagaggagagagtg
taccctgagggggtgcagctgccccatgaggcaggcccctccggtgggaagctgcctcca
ggagaaggatgctaccagtgtgaccatgagtttggggatctccctctcaccaagagagcc
aagagaagtttgccagactttgatgaggaggaggaggaggacttggaggcacacatacac
aagtttgagatgaatcctaaggctgaaatggagaaatatagaagcaggcaaaagagggat
atatatttacaacgtaaaatacacagacatcacaagcacaaagctgccaatgtgacagcc
ccatccggtgacatcaagaccccagagttcagacctattgtcctttatctgaagcggaag
caaactcgaccaaaggctcgtgtcatcaaagtcctgccatctatgcgtgctctccagaac
aatgtggtgtataccattattaatggaaatgaagaaggaatattctcaatgcataaaaag
aagggaattagctctttacattttactcgtaggttacgcgagaaaggagagtatagacta
gaaattgaatgtaagcccaagcacagagaggatagcaaagacaaggatgtacaattggag
ccctattcaatacatgttgaaattcatgtgctgtga
DBGET
integrated database retrieval system
